- Omeprazole
- Concanamycin A
| Bafilomycin A1V-ATPase inhibitor,selective and reversible |
Sample solution is provided at 25 µL, 10mM.
Quality Control & MSDS
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- Purity = 98.00%
- COA (Certificate Of Analysis)
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Chemical structure
Related Biological Data
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| Description | Bafilomycin A1 isa selective and reversible inhibitor of vacuolar H+ ATPases (V-ATPases) with IC50 value of 4-400 nM. | |||||
| Targets | V-ATPases | |||||
| IC50 | 4-400 nM | |||||
| Cell experiment [1]: | |
Cell lines | HeLa cells |
Preparation method | The solubility of this compound in DMSO is > 10 mM. General tips for obtaining a higher concentration: Please warm the tube at 37 °C for 10 minutes and/or shake it in the ultrasonic bath for a while. Stock solution can be stored below - 20 °C for several months. |
Reacting condition | 0 ~ 20 nM |
Applications | Bafilomycin A1 dose-dependently inhibited the vacuolization of Hela cells induced by H. pylori, showing a 50% effect at 4 nM and a complete inhibition at 12.5 nM. In addition, Bafilomycin A1 also efficiently restored vacuolated cells to a normal appearance. |
| Animal experiment [2]: | |
Animal models | Young freshwater tilapias |
Dosage form | 0 ~ 10-5 mol/L; 30 mins |
Applications | In young tilapias, Bafilomycin A1 dose-dependently inhibited the rate of Na+ uptake with a Ki value of 1.6 × 10-7 mol/L. The inhibitory effect (20%) was observed at a concentration as low as 10-8 mol/L and increased linearly up to a concentration of 10-6 mol/L, after which it remained at approximately 90 % inhibition. |
Other notes | Please test the solubility of all compounds indoor, and the actual solubility may slightly differ with the theoretical value. This is caused by an experimental system error and it is normal. |
References: [1]. Papini E, Bugnoli M, De Bernard M, Figura N, Rappuoli R, Montecucco C. Bafilomycin A1 inhibits Helicobacter pylori-induced vacuolization of HeLa cells. Mol Microbiol. 1993 Jan;7(2):323-7. [2]. Fenwick JC, Wendelaar Bonga SE, Flik G. In vivo bafilomycin-sensitive Na(+) uptake in young freshwater fish. J Exp Biol. 1999 Dec;202 Pt 24:3659-66. | |
Bafilomycin A1 Dilution Calculator
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Bafilomycin A1 Molarity Calculator
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| Cas No. | 88899-55-2 | SDF | Download SDF |
| Synonyms | N/A | ||
| Chemical Name | (3Z,5E,7R,8S,9S,11E,13E,15S,16R)-16-[(2S,3R,4S)-4-[(2R,4R,5S,6R)-2,4-dihydroxy-5-methyl-6-propan-2-yloxan-2-yl]-3-hydroxypentan-2-yl]-8-hydroxy-3,15-dimethoxy-5,7,9,11-tetramethyl-1-oxacyclohexadeca-3,5,11,13-tetraen-2-one | ||
| Canonical SMILES | CC1CC(=CC=CC(C(OC(=O)C(=CC(=CC(C1O)C)C)OC)C(C)C(C(C)C2(CC(C(C(O2)C(C)C)C)O)O)O)OC)C | ||
| Formula | C35H58O9 | M.Wt | 622.84 |
| Solubility | Soluble in DMSO | Storage | Desiccate at -20°C |
| Physical Appearance | A crystalline solid | Shipping Condition | Evaluation sample solution : ship with blue ice.All other available size:ship with RT , or blue ice upon request |
| General tips | For obtaining a higher solubility , please warm the tube at 37 ℃ and shake it in the ultrasonic bath for a while.Stock solution can be stored below -20℃ for several months. | ||
Bafilomycin A1 is a selective inhibitor of vacuolar H+ ATPases (V-ATPases) with I50 values of 4-400 nmol/mg 1.
Bafilomycin A1 was treated to different types of membrane ATPases with the dependent I50 of 400 nmol/mg, 4 nmol/mg and 50 nmol/mg for the vacuolar ATPases of a fungus (N. crassa), a plant (Z. mays), and an animal (bovine abrenal medulla). In addition, the inhibitory effect of bafilomycin A1 on vacuolar ATPases was further determined by testing its influence on H+-pumping activity. H+ translocation was completely inhibited by 10 nM bafilomycin A1 1. Other study has shown that bafilomycin A1 strongly inhibited the pit-forming activity of osteoclasts. The subcellular localization of V-ATPase in osteoclasts was been treated with or without bafilomycin A1 by immunoelectron microscopy. These results suggested that disruption of V-ATPase localization to the ruffled border by bafilomycin A1 resulted in the lack of acidification of the dentine surface 2.
Notes: I50 values is umol of bafilomycin AI per mg of protein giving 50% inhibition of ATPase activity.
References:1. Bowman E J, Siebers A, Altendorf K. Bafilomycins: a class of inhibitors of membrane ATPases from microorganisms, animal cells, and plant cells[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 1988, 85(21): 7972-7976.2. Takami M, Suda K, Sahara T, et al. Involvement of vacuolar H+-ATPase in incorporation of risedronate into osteoclasts[J]. Bone, 2003, 32(4): 341-349.
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通常来说，整条信号通路上下游的关键信号蛋白很多，所以做信号通路变化的话，建议您用高通量的蛋白芯片技术对信号通路磷酸化水平进行检测。针对多条信号通路变化检测，可以选择信号通路磷酸化广谱筛选抗体芯片（PEX100），一次芯片实验即可实现多条信号通路的同步筛选和具体调变位点的清晰定位，为后续生物现象的深入探索提供明确的研究方向。针对单条信号通路，如MAPK，p53, mTOR等，同样有相对应的芯片产品，好像有个华盈生物，专门做蛋白芯片的，你可以咨询一下。 祝好。
→MAPKK→MAPK→进入细胞核→其它激酶或基因调控蛋白（转录因子） 的磷酸化修钸。
信号通路的组成： 配体――生长因子； RTK—酪氨酸；
接头蛋白（生长因子受体接头蛋白-2， GRB-2）； GRF－－鸟苷酸释放因子； Ras—GTP 结合蛋白； Raf――是丝氨酸/苏氨酸（Ser/Thr）
蛋白激酶（称 MAPKKK）。
主要功能： 调节细胞的增殖与分化， 促进细胞存活， 以及细胞代谢过程中的调节与校正。
我想测药物干预下P65信号通路激活情况，想问下需要像wb一样做一个磷酸化/总蛋白的比值吗，还是分别测出来比较就可以了呢。
请问哪种神经细胞可以代替原代海马神经元培养细胞？PC12?HT-22?SH-SY5Y?BV-2一般都适用于什么模型，大家一般用哪个呢
如题，实验小白，但是导师给了这个课题，对于这通路不是很了解，园子里也没找到关于非经典通路的，希望各位战友帮忙下，谢谢了
pathwaybuild
1) JAK与STAT蛋白
JAK-STAT信号通路是近年来发现的一条由细胞因子刺激的信号转导通路，参与细胞的增殖、分化、凋亡以及免疫调节等许多重要的生物学过程。与其它信号通路相比，这条信号通路的传递过程相对简单，它主要由三个成分组成，即酪氨酸激酶相关受体、酪氨酸激酶JAK和转录因子STAT。
(1) 酪氨酸激酶相关受体（tyrosine kinase associated receptor）
许多细胞因子和生长因子通过JAK-STAT信号通路来传导信号，这包括白介素2?7（IL-2?7）、GM-CSF（粒细胞/巨噬细胞集落刺激因子）、GH（生长激素）、EGF（表皮生长因子）、PDGF （血小板衍生因子）以及IFN（干扰素）等等。这些细胞因子和生长因子在细胞膜上有相应的受体。这些受体的共同特点是受体本身不具有激酶活性，但胞内段具有酪氨酸激酶JAK的结合位点。受体与配体结合后，通过与之相结合的JAK的活化，来磷酸化各种靶蛋白的酪氨酸残基以实现信号从胞外到胞内的转递。
(2) 酪氨酸激酶JAK（Janus kinase）
很多酪氨酸激酶都是细胞膜受体，它们统称为酪氨酸激酶受体（receptor
tyrosine kinase, RTK），而JAK却是一类非跨膜型的酪氨酸激酶。JAK是英文Janus kinase的缩写，Janus在罗马神话中是掌管开始和终结的两面神。之所以称为两面神激酶，是因为JAK既能磷酸化与其相结合的细胞因子受体，又能磷酸化多个含特定SH2结构域的信号分子。JAK蛋白家族共包括4个成员：JAK1、JAK2、JAK3以及Tyk2，它们在结构上有7个JAK同源结构域（JAK homology domain, JH），其中JH1结构域为激酶区、JH2结构域是“假”激酶区、JH6和JH7是受体结合区域。
(3) 转录因子STAT（signal transducer and activator of transcription） STAT被称为“信号转导子和转录激活子”。顾名思义，STAT在信号转导和转录激活上发挥了关键性的作用。目前已发现STAT家族的六个成员，即STAT1-STAT6。STAT蛋白在结构上可分为以下几个功能区段：N-端保守序列、DNA结合区、SH3结构域、SH2结构域及C-端的转录激活区。其中，序列上最保守和功能上最重要的区段是SH2结构域，它具有与酪氨酸激酶Src的SH2结构域完全相同的核心序列“GTFLLRFSS”。
2) JAK-STAT信号通路
与其它信号通路相比，JAK-STAT信号通路的传递过程相对简单。信号传递过程如下：细胞因子与相应的受体结合后引起受体分子的二聚化，这使得与受体偶联的JAK激酶相互接近并通过交互的酪氨酸磷酸化作用而活化。JAK激活后催化受体上的酪氨酸残基发生磷酸化修饰，继而这些磷酸化的酪氨酸位点与周围的氨基酸序列形成“停泊位点”（docking site），同时含有SH2结构域的STAT蛋白被招募到这个“停泊位点”。最后，激酶JAK催化结合在受体上的STAT蛋白发生磷酸化修饰，活化的STAT蛋白以二聚体的形式进入细胞核内与靶基因结合，调控基因的转录。值得一提的是，一种JAK激酶可以参与多种细胞因子的信号转导过程，一种细胞因子的信号通路也可以激活多个JAK激酶，但细胞因子对激活的STAT分子却具有一定的选择性。例如IL-4激活STAT6，而IL-12却特异性激活STAT4。
2 p53信号
1) p53基因的发现
p53基因是迄今发现与肿瘤相关性最高的基因。1979年，Lane和Crawford在感染了SV40的小鼠细胞内分离获得一个与SV40大T抗原相互作用的蛋白，因其分子量为53 kDa，故而取名为p53（人的基因称为TP53）[3]。起初，p53被误认为是癌基因，直到上个世纪90年代，人们才认识到引起肿瘤形成或细胞癌变的p53蛋白是p53基因的突变产物。野生型p53基因是一种重要的抑癌基因，它是细胞生长周期中的负调节因子，在细胞周期调控、DNA损伤修复、细胞分化、凋亡和衰老等许多过程中发挥了重要的生物学功能，因而被誉为“细胞卫士”。随着研究的深入，人、猴、鸡、大鼠、非洲爪蟾和斑马鱼等多种模式动物的p53基因也相继被克隆。
其中，人类TP53基因定位于染色体17P13.1，小鼠p53基因被定位在11号染色体上，并在14号染色体上发现无功能的假基因。在这些进化程度迥异的动物中，它们的p53基因结构却异常保守，基因全长16-20kb，都由11个外显子和10个内含子组成。其中第1个外显子不编码结构域，外显子2、4、5、7、8则分别编码5个进化上高度保守的结构域，转录形成约2.5 kb的mRNA。之后，在基因同源性的基础上又陆续发现了p53家族的其它成员，分别是p73和p63，它们也因各自的分子量而得名，具有和p53相似的结构和功能。
2) p53信号通路
p53基因受多种信号因子的调控。例如：当细胞中的DNA损伤或细胞增殖异常时，p53基因被激活，导致细胞周期停滞并启动DNA修复机制，使损伤的DNA得以修复。然而，当DNA损伤过度而无法被修复时，作为转录因子的p53还可进一步激活下游促凋亡基因的转录，诱导细胞凋亡并杀死有DNA损伤的细胞。不然，这些DNA损伤的细胞就可能逐渐脱离正常的调控，有可能最终形成肿瘤。
虽然正常状态下p53的mRNA水平很高，而且有大量蛋白质合成，但p53蛋白容易降解，所以正常细胞内p53蛋白水平很低。蛋白的泛素化（ubiquitination）修饰是细胞内蛋白代谢过程中的最普通的降解方式，p53蛋白的降解也是通过泛素化来实现的。MDM2是一种特异性针对p53的泛素化E3连接酶，它可直接与p53蛋白结合来促进p53蛋白的泛素化降解，并在细胞内p53蛋白动态平衡中发挥关键的作用。MDM2本身也可被p53蛋白激活，因此MDM2是p53通路中重要的负反馈调节因子（negative feedback regulator）。
