定制肽库 - ProImmune - 掌握免疫 _ MHC 五聚体、CD1d 四聚体、定制肽合成、免疫测定、T 细胞表位发现、HLA 组织分型、细胞分析、配体结合测定、免疫应答
我们的技术和应用支持团队可以提供有关库设计以及实验设置和分析的建议。在设计方面，我们可以就您的目标应用中使用的肽的最佳重叠或偏移提出建议，然后使用您的全长蛋白质序列，我们可以为您的文库生成肽列表。可为 ELISPOT、细胞培养、细胞内细胞因子染色和流式细胞术等应用提供实验设置和分析方面的协助。
Prospector® 肽库技术可用于多种不同类型的库:> 重叠肽库> 丙氨酸扫描库> 截断库> 随机库y> 位置扫描库
重叠肽库重叠肽库最常用于线性、连续表位作图，其目的是生成特定长度和特定偏移的重叠肽序列库，以覆盖整个天然蛋白质序列。适当的肽长度和偏移数的选择取决于肽的应用，并且还会影响肽组的成本和从实验中获得的数据的有用性。所选应用的设计参数示例如下所示：
ApplicationLengthOffsetELISPOTCD4+ 和 CD8+ T 细胞表位映射CD8+ T 细胞表位映射15-208-151-51-5MHC-肽结合测定CD4+ T 细胞表位映射CD8+ T 细胞表位映射159-101-31B细胞表位作图（另请参见下面的截断库）5-201肽长度和偏移数之间不同组合的潜在影响总结：偏移数短肽 S序列长肽序列短偏移编号1。需要合成最多数量的肽2。较短的肽更容易合成，并且通常会产生更高的纯度3。多个表位命中的机会更多1。需要合成更多的肽2。较长的肽更难合成，并且可能导致纯度较低3。多个表位命中的最大机会是长偏移数 1。需要合成更少的肽2。较短的肽更容易合成，并且通常会产生更高的纯度3。多个表位命中的最小机会1。需要合成最少数量的肽2。较长的肽更难合成，并且可能导致纯度较低3。多个表位命中的机会较小图 1 中的两种极端情况说明了选择适当的肽长度和偏移量的重要性。如果选择偏移量为 2 的 10 聚体，则至少有 3 个肽序列会跨越表位（\"命中”） \'），并且 6 个 10 聚体需要 to 被创造。如果选择偏移量为 4 的 6mer，则需要合成的肽较少，但表位可能会被完全遗漏，如果假设的表位跨越序列 HIKLMN，就会出现这种情况，请参见下文。
图 1.选择肽库序列的策略示例。虚线框内的残基位于假设的活性位点或表位中。最后一个肽序列必须满足以下所有三个要求：（1）它必须包含天然序列中的最后一个残基，（2）它必须具有比\"偏移”n更多的氨基酸(3) 它必须至少有 6 个残基，这是可能形成表位的最小数量。
表位鉴定后进行研究，以证明肽序列的结构和功能关系，通常是通过肽序列优化和结构稳定。合成替代类型的肽库可以极大地帮助序列优化过程。
系统地将丙氨酸替换到已识别表位中的每个氨基酸位置。该策略鉴定了天然序列中对于活性至关重要的氨基酸。必需氨基酸的取代会导致肽活性降低，活性降低的程度通常被视为被取代氨基酸重要性的相对衡量标准。
B.截短文库该策略通过生成一组对侧翼残基进行系统截短的肽来确定最佳肽活性所需的最小长度。如果必需氨基酸已知，则可以围绕它们选择截断方向，而不是从肽序列的两端系统截断。
C.随机库肽序列中选定的残基（摆动）同时被替换全部 20 种氨基酸的混合物，或特定氨基酸的混合物。在实践中，该策略通常用于初步识别一组活性序列，然后重新合成以验证初始结果。
D.位置扫描文库将肽序列中选定的一个或多个位置系统地替换为不同的氨基酸，以确定这些位置的优选氨基酸残基，并通过相应的活性增加来测量。
联系技术支持团队讨论您的文库设计需求；我们很高兴为您需要的库格式生成肽列表。
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溶解 PEPscreen® 的建议：定制肽库肽的完全溶解对于成功非常重要肽活性的筛选。肽只有完全溶解并能够呈现正确的构象才能完全发挥活性与它们的受体结合。随着一组中肽的数量增加，该组中肽的潜在溶解度变化也增加。因此，为了获得准确可靠的肽活性数据，应特别注意溶解肽组的过程。
溶解PEPscreen®肽组以及任何其他Prospector®的策略文库不同于溶解单个肽。对于单个肽，根据给定的肽序列选择最佳溶解度的条件。然而，对于肽组，选择条件是为了在第一次溶解尝试中溶解尽可能多的肽组中的肽。建议的常用策略示意如下：
上述步骤的完整详情：溶解肽组指南 (PDF)
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