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제품특징
□ 특징
● Library screening없이 신속하게 cDNA 확보 가능
● 귀찮은 single-stranded ligation 또는 tailing reactions 없음
● 동일한 template를 5" RACE와 3" RACE에 동시에 적용 가능
일반적인 RACE 제품들은 5’-RACE 또는 3’-RACE, 둘 중 하나의 실험에만 적용되도록 template가 제조된다. 그러나 Marathon cDNA Amplification Kit을 이용하면 동일한 template를 이용하여 5’-RACE와 3’-RACE 모두에 적용할 수 있으며 특화된 adaptor를 채용하여 background를 감소시킨다. Marathon cDNA amplification은 expressed sequence tags (ESTs), differential display, RNA fingerprinting, 그리고 cDNA subtraction과 같은 다양한 RNA 특성을 신속하게 파악하는데 사용할 수 있다. poly A+ RNA로부터 변형된 lock-docking oligo(dT) primer를 이용하여 Marathon cDNA 합성된다. 변형된 lock-docking oligo(dT) primer는 3’-end에 2개의 degenerate nucleotides를 갖고 있다. cDNA합성 후 blunt ends가 형성되고 Marathon adaptor가 double-stranded cDNA 양말단에 ligation된다. Clontech에서는 고품질의 프리미엄 poly A+ RNA를 이용해 합성된 double-stranded cDNA에 Marathon Adaptor가 ligation된 Marathon-Ready cDNAs를 판매하고 있다. 이 Marathon-Ready cDNA를 이용하면 간편하게 RACE를 수행할 수 있다.
□ applications
● ACE (Rapid Amplification of cDNA Ends)
● Identification of 3"/5" UTRs
● Full-length gene cloning
● Gene cloning and analysis
ebiomall.com






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另外还想问一下,还有其他可行的破碎方法吗
谢谢
问:1如才能提高柱子吸附蛋白量?
2样品中的核酸对吸附有无太大影响?
3我拟采用阴离子交换树脂,问pH8.0条件下除去核酸可否?
4怎么提高样品的澄清度?
以DNA凝胶电泳为例,电泳的操作步骤如下:
1、安装电泳槽
将有机玻璃的电泳凝胶床洗净,晾干,用胶带将两端的开口封好,放在水平的工作台上,插上样品梳。
2、琼脂糖凝胶的制备
称取琼脂糖溶解在电泳缓冲液中,(按0.3-1.5%的琼脂糖含量,1-25kb大小的DNA用1%的凝胶,20-100kb的DNA用0.5%的凝胶,200-2000bp的DNA用1.5%的凝胶)置微波炉或沸水浴中加热至完全溶化(不要加热至沸腾),取出摇匀。
3、灌胶
将冷却到60℃的琼脂糖溶液轻轻倒入电泳槽水平板上。
4、待琼脂糖胶凝固后,在电泳槽内加入电泳缓冲液,然后拔出梳子。
5、加样
将DNA样品(DNA样品是细胞破碎之后用离心管离心沉淀获得的)与加样缓冲液按4:1混匀后,用微量移液器将混合液加到样品槽中,每槽加10-20μl,记录样品的点样次序和加样量。
6、电泳
安装好电极导线,点样孔一端接负极,另一端接正极,打开电源,调电压至3-5V/cm,电泳1-3hr,当溴酚蓝移到距凝胶前沿1-2cm时,停止电泳。
7、染色和观察
取出凝胶,放在含有溴化乙锭的染色液中染色30min,即可在254nm的紫外灯下观察,有橙红色荧光条带的位置,即为DNA条带,或在紫外灯下照相记录电泳图谱。溴化乙锭是致癌剂,操作时要小心,必须戴手套。
扩展知识:
在外加直流电源的作用下,胶体微粒在分散介质里向阴极或阳极作定向移动,这种现象叫做电泳。利用电泳现象使物质分离,这种技术也叫做电泳。
凝胶电泳通常用于分析用途,但也可以作为制备技术,在采用某些方法(如质谱(MS)、聚合酶链式反应(PCR)、克隆技术、DNA测序或者免疫印迹)检测之前部分提纯分子。
琼脂糖 ( Agarose ) 是一种线性多糖聚合物 , 系从红色海藻产物琼脂中提取而来的。当琼脂糖溶液加热到沸点后冷却凝固便会形成良好的 电泳介 质 , 其密 度是由 琼脂 糖的浓 度决 定的。经过化学修饰的低熔点 (LMP) 的琼脂糖 , 在结构上比较脆弱 , 因此在较低的温度下便会熔化 , 可用于DNA片段的制备电泳。
聚丙烯酰胺凝胶主要有两种方式 : 一是用于分离和纯化双链DNA片段的非变性聚丙烯酰胺凝胶。在未变凝胶中分离 DNA的缺点是DNA的迁移 率受碱 基组成和序列的影响。由于无法得知未知DNA的迁移是否反常 , 故不能用未变性的聚丙烯酰胺凝胶电泳确定双链DNA的大小。二是用于分离及纯化单链DNA片 段的变性聚丙烯 酰胺凝 胶。这类聚丙烯酰胺凝胶是在核苷酸碱基配对抑制剂 ( 尿素或甲酰胺 ) 的存在下聚合而成 , 变性DNA的移动速度同其碱基组成及序列几乎完全无关 , 故可用于分离及纯化单链DNA片段和DNA测序等。
快速细胞破碎法鉴定转化子DNA(分离效果一般,二者要相差比较大才行,我常用前者,一般T载体上的要五百bp以上,一千bp以上最好!)
快速细胞破碎法鉴定转化子DNA
1、转化子菌落接种于相应的抗性培养基2.0ml,过夜培养。(要求设立对照!)
2、制备0.8%琼脂糖胶。
3、取1.5ml过夜培养物离心,15kr/min,1min;弃上清。(剩余保种!)
4、加水重悬,离心如上。留沉淀。
5、每管加50—100µl破碎细胞缓冲液(见后配方),充分涡旋,使菌体悬浮均匀
6、水浴37℃,15min。
7、离心15kr/min,15min。
8、立即取20-30µl上清点样进行电泳,4—6V/cm。
9、电泳,当溴酚蓝到达凝胶板的2/3时,停止电泳。
10、染胶15—30min。
配方:50mMTris-HCl(pH6.8);1%SDS;2mMEDTA;400mM蔗糖;0.01%溴酚兰
配法:1MTris-HCl(pH6.8),10ml;20%SDS,10ml;250mMEDTA,1.6ml;蔗糖27.2g;1.2%溴酚兰1.67ml加水至200ml;
煮沸法快速分析转化子DNA
1、挑单菌落于2.0ml相应抗生素液体培养基中,37℃振荡过夜(约16小时)。
2、取1.5ml过夜培养物于离心管中,15kr/min,1min。(剩余保种!)
3、弃上清,倒扣、流尽。
4、加入350µl由下列试剂组成溶液,混匀。
(8%蔗糖、0.5%TritonX-100、50mMEDTA(pH8.0)、10mMTris-HCl(pH8.0))
5、加入25µl新鲜配制的10mg/ml的溶菌酶(溶于10mMTris-HClpH8.0中),涡旋3--5sec。
6、立即将离心管浸入沸水浴40sec。
7、离心15kr/min,10min。
8、转移上清至另一离心管,加入2.5MNaAc40µl,加入异丙醇420µl,混匀后冰浴15min,沉淀DNA。
9、离心15kr/min,15min,将上层异丙醇弃去,真空抽干。
10、加入50µlTE缓冲液重悬,(含Rnase50µg/ml)。37℃保温10min。
11、取10µl样品点样,电泳,染胶。观察质粒DNA的区带位置。(要求有对照电泳!)
平常都是用超声破清洗器水浴超声破碎大约20分钟,然后上样的
但是一方面,常温超声不知道会不会造成蛋白降解破坏,因为发现加冰以后超声会变得非常弱,所以都么加冰。另一方面,因为水浴超声声强是不均匀的,如果样品多的话,会发现有些已经超碎DNA,但有些还是一团。
不知道是否有其他更好的方法?

