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Boston Biochem/AQUApure Linear Di-Ub Chains (M1-linked) Protein, CF/UC-700B-025
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Boston Biochem/AQUApure Linear Di-Ub Chains (M1-linked) Protein, CF/UC-700B-025
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Boston Biochem
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UC-700B-025
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AQUApure Linear Di-Ub Chains (M1-linked) Protein, CF Summary

Purity
>95%, by SDS-PAGE under reducing conditions and visualized by Colloidal Coomassie® Blue stain.
Activity

Ubiquitin chains vary in length, linkage, and function. Linear (Met1)-linked Di-Ubiquitin Chains (Ub2) are ideal for investigating Ubiquitin-binding proteins and as substrates for Ubiquitin-specific isopeptidases. Reaction conditions will need to be optimized for each specific application. IMPORTANT: Heating this product in SDS-PAGE buffer or terminating reactions containing this product with heated SDS-PAGE buffer could lead to unexpected, high apparent molecular weight banding or smearing on gels that is not representative of product purity. For optimal results, we recommend incubation in SDS-PAGE buffer + DTT at <40 °c="" for="" 20="" minutes="" prior="" to="" gel="">

Source
E. coli-derived human Di-Ubiquitin protein
Accession #
P0CG47
Predicted Molecular Mass
17 kDa

Product Datasheets

Product Datasheet
COA

Carrier Free

What does CF mean?

CF stands for Carrier Free (CF). We typically add Bovine Serum Albumin (BSA) as a carrier protein to our recombinant proteins.Adding a carrier protein enhances protein stability, increases shelf-life, and allows the recombinant protein to be stored at a more dilute concentration.The carrier free version does not contain BSA.

What formulation is right for me?

In general, we advise purchasing the recombinant protein with BSA for use in cell or tissue culture, or as an ELISA standard.In contrast, the carrier free protein is recommended for applications, in which the presence of BSA could interfere.

UC-700B

Formulation

1 mg/ml (58 μM) in sterile, deionized water

ShippingThe product is shipped with polar packs. Upon receipt, store it immediately at the temperature recommended below.
Stability & Storage:Use a manual defrost freezer and avoid repeated freeze-thaw cycles.
  • 12 months from date of receipt, -20 to -70 °C as supplied.
  • 3 months, -20 to -70 °C under sterile conditions after opening.
Reconstitution Calculator

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=
÷

Background: Di-Ubiquitin

Linkage specific Poly-Ubiquitin chains may be used as a substrate for in vitro reactions with deubiquitinating enzymes ("DUB"s") that cleave the peptide or isopeptide linkage between adjacent Ubiquitin molecules. Poly-Ubiquitin chains can also be used to investigate mechanisms of binding and recognition between the chains and other proteins that contain Ubiquitin-Associated domains (UBAs), Ubiquitin-interacting motifs (UIMs), ZnF"s and/or other Ubiquitin-sensing elements.

Linear ("M1")-linked Di-Ubiquitin chains are manufactured using recombinant methods to avoid the potential for contaminating synthetic intermediates. The correctness of linkage and purity of each production lot is assessed using the Absolute Quantitation of Ubiquitin method (Ub-AQUA), an LCMS-based technique that provides extremely accurate information on the composition of Poly-Ubiquitin samples.

References
  1. Kirkpatrick D.S., et al. (2006) Nat Cell Biol. 8(7) : 700-10
  2. Ordureau, A., et al. (2014) Mol. Cell 56(3) : 360–375
  3. Ordureau, A., et al. (2015) Pro. Nat. Acad. of Sci. USA 112(21) : 6637–6642
  4. Phu L., et al. (2011) Mol Cell Proteomics 10(5) : M110.003756
Entrez Gene IDs
7314 (Human)
Alternate Names
DiUbiquitin; Di-Ubiquitin; HEL-S-50; Ub2; UBB; ubiquitin B

Citations for AQUApure Linear Di-Ub Chains (M1-linked) Protein, CF

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  1. Post-translational Modification of OTULIN Regulates Ubiquitin Dynamics and Cell DeathAuthors: T Douglas, M SalehCell Rep, 2019;29(11):3652-3663.e5.Species: HumanSample Types: ProteinApplications: Bioassay
  2. ZUFSP Deubiquitylates K63-Linked Polyubiquitin Chains to Promote Genome StabilityAuthors: P Haahr, N Borgermann, X Guo, D Typas, D Achuthanku, S Hoffmann, R Shearer, TK Sixma, N MailandMol. Cell, 2018;0(0):.Species: HumanSample Types: Cell LysatesApplications: Bioassay
  3. Cholesterol and fatty acids regulate cysteine ubiquitylation of ACAT2 through competitive oxidationAuthors: YJ Wang, Y Bian, J Luo, M Lu, Y Xiong, SY Guo, HY Yin, X Lin, Q Li, CCY Chang, TY Chang, BL Li, BL SongNat. Cell Biol., 2017;19(7):808-819.Species: N/ASample Types: Applications: Control
  4. Myosin VI Contains a Compact Structural Motif that Binds to Ubiquitin ChainsAuthors: F He, HP Wollscheid, U Nowicka, M Biancospin, E Valentini, A Ehlinger, F Acconcia, E Magistrati, S Polo, KJ WaltersCell Rep, 2016;14(11):2683-94.Species: HumanSample Types: Recombinant ProteinApplications: Bioassay
  5. USP45 deubiquitylase controls ERCC1-XPF endonuclease-mediated DNA damageresponses.Authors: Perez-Oliva A, Lachaud C, Szyniarowski P, Munoz I, Macartney T, Hickson I, Rouse J, Alessi DEMBO J, 2015;34(3):326-43.
  6. Deubiquitinase-based analysis of ubiquitin chain architecture using Ubiquitin Chain Restriction (UbiCRest).Authors: Hospenthal, Manuela, Mevissen, Tycho E, Komander, DavidNat Protoc, 2015;10(2):349-61.Species: HumanSample Types: Protein

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近日,国家药品监督管理局经审查,批准了北京纳捷诊断试剂有限公司研制的创新产品“丙型肝炎病毒核酸测定试剂盒(PCR-荧光探针法)”的注册。该产品基于自主创新的一管法的PCR专利技术,用于体外定量测定血清样本中的丙型肝炎病毒(HCV)核酸(RNA)。该产品适用于需要进行HCV感染检测的患者和接受抗病毒治疗的丙型肝炎患者。国家药品监督管理局鼓励支持医疗器械产业创新发展,进一步做好创新医疗器械审查。食品药品监管部门将加强产品上市后质量监管,保障公众用械安全,确保医疗器械产业的健康有序发展。 查看更多>
2018-10-22
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These are basically Tim's procedures and have been used successfully by numerous members of our lab and by others around us. A. Checking Peptide Thiol GroupsDo 查看更多>
MicroRNA (miRNA) 是一类由内源基因编码的长度约为 21-24 个核苷酸的非编码 RNA 分子,它们通过调控基因表达参与动植物中众多的生长发育和疾病发生。miRNA 的产生在动植物中非常保守,已知 miRNA 由具有颈环结构的初级转录本经过 Dicer 复合物的切割产生的。近年来围绕 Dicer 复合物组分的鉴定及其识别茎环结构底物的分子机制研究进展迅速,但关于 Dicer 复合物本身的调控以及如何整合环境信号来协调 ... 查看更多>
聚合酶链反应即PCR技术,因为其对基因或特定核酸序列在短时间内的极大的扩增效率,已在感染性疾病、肿瘤、遗传病、寄生虫病、法医学、动植物和考古等的诊断和研究中得到了广泛的应用,并在某些方面几乎是难以替代的。但是,像自然界的任何事物一样,PCR也有其局限性,稍不注意,就很容易造成 查看更多>
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差减cDNA文库法[第一条链cDNA合成]1.合成第一条cDNA链时,所有试剂应按下列顺序依次加入:10×第一条链合成缓冲液 5.0μl10mM dNTP Mix(1.4μg/μl) 2.5μl(终浓度1.25mM)Linker primer(1.4μl,终浓度100μg/μl)DEPc H2ORNase block 查看更多>
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OverviewMatirgel is considered as basement membrane and generated from EHS sarcoma. Matrigel contains not only basement membrane components (collagens, laminin 查看更多>
分别配制一定浓度的BSA、小分子药物、两者偶联物的溶液。分别测定AAam、AAbm、ABam、ABbm、ACam和ACbm(A a、B b、C c分别指小分子药物、BSA和 查看更多>
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我正在用clontech公司的SMART技术构建CDNA文库,我RNA提取用的TRIZOL,取的癌组织,标本离体后放冰盒,一小时后按比例加TRIZOL用剪刀剪碎,放-20过夜,其他步骤完全按说明进行.提的RNA跑胶还可以,ss-cDNA也还可以,可LD-PCR时就出不来.想请高手帮帮小弟.现附上电泳图.
通常不会通用的。除了引物设计的一些基本原则以外,他俩的引物设计要求是不一样的。
原位杂交引物要求:

1. 为了避免检测mRNA时基因组序列的干扰,设计探针时尽量选择在跨内含子的部位。
2. 通常探针的长度(既PCR产物长度)以100-400bp为宜,过长不易穿透组织,杂交效率减低;过短特异性低。

而Realtime引物设计:
1.产物长度80-150bp为宜,可延伸到300bp。
而且你做实时定量的时候,还要做标准曲线,确定引物的扩增效率好不好。
cDNA文库构建SMART法 123
2519455062021-08-18

CDNASizeFractionation做完后的电泳检测,发现条带的大小都在5000bp左右,感觉是哪里有问题。前面步骤检测很好。不知道有问题没有?请哪位高人指点一下。
我用获得的线粒体全基因组序列在网上预测tRNA,预测用的软件为tRNAscan-SE1.21(http://lowelab.ucsc.edu/tRNAscan-SE/)。
我是这样进行预测的:在“SearchMode:”中选择“rRNAscanonly:”,在“sorce”中选择“mito/chloroplast”,粘贴序列,运行程序。得到了21个tRNA,而鱼中应该是22个tRNA,我觉得很奇怪,在“SearchMode:”和“rRNAscanonly:”中进行其它的设置,都不能得到22个tRNA.
我看的一篇文献“CompletemitochondrialDNAsequenceoftheJapanese
flyingfishCypselurushiraii”中也是说22个tRNA,但是我把文章提交的序列(Genbank号为AB182653.)拿到网上提交,只有21个tRNA,我觉得很奇怪。
不知道是怎么回事?请高手指点,那个软件好像是比较权威的。
在普通探针基础上MGB修饰的探针,它的杂交能力更强,更稳定。
使用计算机预测植物miRNA靶基因比较简单,因为在植物中miRNA与靶基因几乎还是以完全互补配对的方式结合,预测不需要复杂的算法。而预测动物miRNA靶基因则存在一定的困难,主要是目前已知的miRNA靶基因及其确切靶点不多,在算法编写时没有足够的已知样本可供参考。但是,miRNA与靶基因间的相互作用仍然具有一定的规律性。目前常规的算法主要遵循以下几个常用原则:(a)miRNA与靶基因的互补性;(b)miRNA靶位点在不同物种之间的保守性;(c)miRNA-mRNA双链之间的热稳定性;(d)miRNA靶位点不会有复杂的二级结构;(e)miRNA 5’端于靶基因的结合能力强于3’端。除了这些基本原则以外,不同的预测方法还会根据各自总结的规律对算法进行限制和优化。
基因工程中标记基因必不可少,基因工程的核心步骤,构建基因表达载体,中用标记基因检测重组质粒是否已经导入受体细胞中,从而区分己导入细胞和未导入细胞。(标记基因通常是抗生素基因。)
似乎都是鉴定目的基因是否导入受体细胞 没有鉴定是否成功导入质粒的 鉴定目的基因是否导入受体细胞有四个层次 1 直接鉴定受体细胞中是否有目的基因 用DNA分子杂交 2 鉴定目的基因是否转录 分子杂交(mRNA) 3 目的基因是否表达 抗原-抗体 (蛋白质) 4 看受体细胞发育成的个体是否表现出相关性状
1、病毒易于培养和分离纯化;
2、人体病灶细胞或者分泌型细胞有载体病毒受体;
3、DNA病毒,且酶切改造后具有复制能力;
4、表达产物对载体病毒没有抑制作用。

不知道是否准确,希望对你有帮助。
有人做这方面的吗?共同交流
提总RNA
为什么我连Marker都跑不好?请教各位大神
点了3ulDS2000,为什么Marker条带是连着的?

是RNA探针。TaqMan 荧光探针是一种寡核苷酸探针,荧光基团连接在探针的5’末端,而淬灭剂则在3’末端。PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针,探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR扩增时,Taq酶的5'-3'外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,从而荧光监测系统可接收到荧光信号,即每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,实现了荧光信号的累积与PCR产物形成完全同步。常用的荧光基团是FAM,TET,VIC,HEX。 而新型TaqMan-MGB探针使该技术既可进行基因定量分析,又可分析基因突变(SNP),有望成为基因诊断和个体化用药分析的首选技术平台。
如图,这是我的反应,BOC茶氨酸和4氨基哌莫硝唑反应。反应用DMF做溶剂,按标注的顺序加的原料,反应两天后点板如图,处理反应,水洗去DMF,乙酸乙酯萃取,然后稀硝酸萃取一遍,饱和氯化钠萃取两遍。旋蒸。得不到产物。希望懂得人给分析一下。谢谢了。


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