Description:
10X41bpPrimerPremixonlyKAPAhgDNAQuantificationandQCKit
Qualitymatters.
KAPAhgDNAQuantificationandQCKitscontainallthereagentsneededfortheqPCR-basedquantificationandqualityassessmentofhumangenomicDNAsamplespriortoNGSlibraryconstruction.
KitscontainKAPASYBR®FASTqPCRMasterMix,optimizedforhigh-performanceSYBRGreenI-basedqPCR,aswellasapre-dilutedsetofDNAstandardsandprimerpremixestargetingdifferentportionsofahighlyconservedsingle-copyhumanlocus.Absolutequantificationisachievedwiththeprimerpairdefiningtheshortestfragment,whereastheadditionalprimersareusedtoderiveinformationabouttheamountofamplifiabletemplateintheDNAsample.Qualityscores(orQ-ratios)generatedwiththekitmaybeusedtopredicttheoutcomeoflibraryconstruction,ortailorworkflowsforsamplesofvariablequality,particularlyFFPEDNA.
ThemethodiseasytoautomateandcanbeappliedtoanyprocessorworkflowthatrequiresaccuratequantificationofdiluteDNAsamples,orsamplesthatmaycontainahighproportionofDNAthatisrecalcitranttoPCRamplification.
Downloadour KAPAhgDNAQuantificationandQCDataAnalysisTemplate.
ForResearchUseOnly.Notforuseindiagnosticprocedures.
ProductHighlights
Obtainconcentrationandqualityinformationwithasingleassay
- AllowsforaccuratequantificationofdiluteDNAsamples
- QuantificationwithanadditionalprimerpairprovidesaQ-ratiothatisindicativeofsamplequality
Employqualityscores intheanalysisofNGSlibraryconstructionworkflows
- Q-ratioscanprovidevaluableinsightsintothebottlenecksinNGSlibraryconstructionworkflows
- ForFFPEsamples,libraryandsequencequalityisprimarilylimitedbyinefficientconversionofinputDNAtoadapter-ligatedlibrary
- 0.4yieldedlibrariesthatmetminimumsequencequalityrequirements.Dataonfile.">
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Obtainactionabledataforsamplepreparation
- Q-ratioscorrelatewithkeysequencingmetricssuchasduplicationratesandmeantargetcoverage
- FFPEsampleswithaQscore>0.4yieldlibrariesofacceptablequalitywhenprocessedinstandardsamplepreparationsfortargetcapture
Applications:
Applications- FFPEsamples
- Free-circulatingDNAfromplasmaorserum
- Samplesobtainedbylaser-capturemicrodissectionoffresh,frozenorFFPEtissue
- Forensicsamples
- Cellscollectedbyflowcytometry
- Anyotherlimitingorpreciousclinicalsample
KitSpecificationsandContents/Storage:
KitSpecificationsandContents/StorageKitscanbestoredforupto12months at-20˚C.
Complete(MasterMix)kitsincludeKAPASYBRFASTqPCRMasterMix(2X),PrimerPremix(41bp,129bpand305bp,10X)andasetof5DNAStandards.PrimerPremixesandDNAStandardsarealsosoldseparately.
Components
Specifications
- SpecDescription
- CompatIBLePlatformAllNGSplatforms
- CompatibleSamplesHumangenomicDNA
- SamplesourcesFFPEtissueCellscollectedbylaser-capturemicrodissectionFlow-sortedcellsFree-circulatingDNAfromplasmaorserumForensicsamplesClinicalsamples
- Standardcurveconcentrationrange2.5ng/µL–10pg/µLor3,080–12copies
- SequencingApplicationsWholeGenomeSequencingWholeExomeSequencingTargetedSequencing(custompanels)AmpliconSequencing
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在非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳时,它们的迁移率各不相同,从而获得单倍型特异的电泳带格局即PCR指纹。也有人用人工合成的短寡核苷酸片段作为探针,同经过酶切的人体DNA作Southern blot,可以得出长度不等的杂交带,杂交带的数目和分子量的大小具有个体特异性,除非同卵双生,几乎没有两个人是完全相同的,就象人的指纹一样,人们把这种杂交带图形称为基因指纹(gene finger-printing)。
基因芯片法:又称为DNA 微探针阵列(Micro array)。它是集成了大量的密集排列的大量已知的序列探针,通过与被标记的若干靶核酸序列互补匹配,与芯片特定位点上的探针杂交,利用基因芯片杂交图象,确定杂交探针的位置,便可根据碱基互补匹配的原理确定靶基因的序列。这一技术已用于基因多态性的检测。对多态性和突变检测型基因芯片采用多色荧光探针杂交技术可以大大提高芯片的准确性、定量及检测范围。应用高密度基因芯片检测单碱基多态性,为分析SNPs提供了便捷的方法。
数据分析的小白一枚,最近开始学习二代测序仪IONTORRENT出来的靶向基因检测位点的数据分析。由于完全没有涉猎过这个领域,会有很多不懂得地方,望大神们不吝赐教!
比如上面这个搜索结果,就是根据一起出来的数据,也就是一个位点的rs号进行检索出来的界面,但是完全不知道如何下手,也不是很清楚具体模块的作用,我能得到什么结果。虽然在网上能看到一些说明,但是仍然一知半解的!
最后,还是想说,大神们快快带我入门吧,非常迫切!跪谢!
2 单细胞测序是指单个细胞水平上对基因组进行测序。
3、靶向测序步骤为 样品准备、探针/引物设计、目标序列捕获、文库制备、上机测序、数据分析。
4、单细胞的分离--DNA/RNA的提取和扩增(全基因组扩增和全转录组扩增)---测序以及后续的分析和应用。
相同:使用二代测序
不同:样本处理,文库构建,检测的区域,数据分析流程
三博基因检测方法是一代Sanger测序法。公司暂未开展芯片业务。Sanger测序法准确度大大高于芯片和二代测序。三博基因所用仪器是法医和亲子鉴定专用仪器。Sanger测序法是目前基因检测的国际金标准,检测准确率高达99.9999%。三博基因拥有美国ABI公司的最新3730型全自动遗传分析仪,是经过国际和国家认证的仪器,可重复性达到100%。
Sanger测序法优点是准确,不会出现假阳性假阴性,而且可进行个性化基因检测,是疾病确诊和大夫用药的唯一指定方法。
三博基因检测的实力雄厚,基因检测集科研、生产、销售、实验、报告一条龙服务
北京三博远志生物技术有限责任公司,2000年成立,是北京市中关村高新技术企业。公司实体部门有五个:DNA合成部、DNA测序部、基因体检部、基因工程课题服务部、分子生物学试剂盒生产部。北京三博远志是国内基因合成、测序知名企业,16年科研服务为国内基因研究作出了巨大贡献。
多年为医院临床大夫提供癌症疾病诊断和临床治疗用药指导服务,为科研单位新药研发提供服务等。做基因体检我们有更多的发言权。
Sanger测序法不仅准确,而且适合小套餐检测
二代测序和芯片适合多基因、多位点、高通量、大数据的检测,新一代测序除了准确度不够以外,样品数量小数据量少价格也不具备优势,Sanger测序不仅准确,小规模测序Sanger测序有价格优势。我公司研发的基因检测服务,在全球科学家研究的基础上,我们选择热点靠谱的基因,精确定位,靶向精准测序,是我们多年协同医院及科研单位反复验证总结出来的,已经相当成熟、完善。我们的检测结果最大特点就是,与实际情况非常吻合,经得起实践和时间的考验,有非常好的健康管理价值和临床意义。
Sanger测序是指定目标的靶向检测没有臃冗的检测所以有价格优势,我们能够提供准确、实用、物美价廉的服务,小套餐和个性化靶向基因检测服务我们相当成熟、完善。
有用的、可信的、真实可见的检测,详实的有数据支撑的报告,具体的医疗保健指导建议
三博基因只做癌症、心脑血管、遗传病、代谢、儿童天赋、用药指导、疾病诊断等有用的,研究透彻的基因检测。多年科研和临床检测积累值得信赖,不炒作基因概念,很实在。
三博基因不使用芯片检测,杜绝假阳性、假阴性,检测报告真实可见(附带:基因检测峰图),
详实的《人体基因检测健康管理说明书》,健康管理很实用。
三博基因开展的基因检测位点是经过科学家和临床医生2万个以上验证案例作为数据支撑,主效的,而且也是经过我公司几年上万个临床案例验证,经过多次筛选得出的,很靠谱。
检测速度快
7-10个工作日可以完成基因检测项目。由于是单独检测所以不需要凑板等时间,即使只有几个样本,也可以随时检测。
检测报告制作完成后可以发送到指定邮箱或者网站在线查阅。
在2个工作日内安排专家进行一对一的电话解读或者来我公司现场讲解。
周到的服务、完善的客服平台和培训体系
公司具有完善的客户服务系统,不论是电话、QQ、QQ群、微信、网站留言、还是邮箱咨询,均有专业的人员予以第一时间解答和支持。对于顾客投诉,均在1小时之内给予回复解决。
我公司可以配合合作单位的业务需求,定期的对内部人员进行基因检测服务专业培训以及面对大众的基因检测讲座服务。
先谢了