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ZYMO RESEARCH/Quick-DNA Fecal/Soil Microbe Microprep/D6012
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Highlights
- Rapid method for the isolation of inhibitor-free, PCR-quality DNA from fecal samples in minutes, including those from humans, birds, rats, mice, cattle, etc.
- Ultra-high density BashingBeads are fracture resistant and chemically inert.
- Zymo-Spin column and unique filtration technologies effectively removes PCR inhibitors from the DNA product.
Description
| Applicable For | All sensitive downstream applications such as qPCR and Next-Generation Sequencing. |
|---|---|
| Elution Volume | ≥ 20 µl |
| Equipment | Microcentrifuge, vortex, cell disruptor/pulverizer |
| Processing Volume | ≤50 mg feces, ≤ 250 mg soil, ≤20 mg fungal/bacterial cells (wet weight) |
| Purity | A260/A280 nm ≥1.8. |
| Sample Source | Feces or soil |
| Sample Storage | DNA stored at ≤ -20°C. |
| Size Range | Capable of recovering genomic DNA up to and above 40 kb. In most instances, mitochondrial DNA and viral DNA (if present) will also be recovered. |
| Type | Total DNA |
| Yield | ≤ 5 µg total DNA |
Q1: My lysate seems viscous. What is causing this to happen? How can I fix this?
A viscous sample can indicate incomplete sample lysis. Try using less of your sample and optimize bead beating conditions (duration, speed, time) to ensure samples are thoroughly lysed. After bead beating, pellet the cell debris before moving on. Adding more Genomic Lysis buffer to the lysate can help dilute and deproteinate the sample, making the sample less viscous and more suitable for DNA recovery.
Q2: Are there any tips in optimzing bead beating conditions?
We have validated our kits with both high-speed homgenizers and low-speed disruptors. We highly recommend users to optimize their bead beating conditions for their own instruments. We recommend using a 2 ml-tube adapter to ensure that the bead beating is efficent (do not use adapters made of foam). For high-speed homogenizers, we recommend a total of 5 mins bead beating (1 min interval at 6.5 m/s with 5 mins rest, repeat 5 times). For low-speed cell disruptors, we recommend 30 mins at max speed.
Q3: What is the purpose of Zymo-Spin II-µHRC step?
Environmental samples often contain inhibitors such as polyphenolics, humic/fulvic acids, tannins, melanins, etc. that affect downstream applications such as PCR. Once the DNA is eluted off the binding column, the DNA is then passed through the Zymo-Spin II-µHRC to remove the PCR inhibitors, and the DNA is then ready for downstream applications. The Zymo-Spin II-µHRC does not bind DNA, it simply removes the PCR inhibitors.
Q4: Is it necessary to add beta-mercaptoethanol? Can this step be substituted or omitted?
Addition of beta-mercaptoethanol is recommended to enhance sample lysis, but can be substituted with dithiothreitol (DTT, final concentration of 10 mM). However, if bead beating is optimized and lysis is efficient, the addition of BME is not necessary and can be omitted.
Q5: When can an RNase A treatment be implemented in the protocol?
No additional RNase A treatment is required when processing samples within kit capacity. The selective chemistry allows for binding of double stranded DNA to the column and for RNA to flow through.
| Cat # | Name | Size | Price | |
|---|---|---|---|---|
| D3004-1-100 | Genomic Lysis Buffer | 100 ml | $60.00 | |
| D3004-2-50 | g-DNA Wash Buffer | 50 ml | $18.00 | |
| D3004-4-10 | DNA Elution Buffer | 10 ml | $14.00 | |
| D3004-5-15 | DNA Pre-Wash Buffer | 15 ml | $10.00 | |
| D6001-3-40 | BashingBead Buffer | 40 ml | $29.00 | |
| D6035-1-30 | Prep Solution | 30 ml | $18.00 | |
| C1057-50 | Zymo-Spin III-F Filters | 50 Pack | $59.00 | |
| C1004-50 | Zymo-Spin IC Columns | 50 Pack | $53.00 | |
| C1059-50 | Zymo-Spin II-µHRC Filters | 50 Pack | $108.00 | |
| S6012-50 | ZR BashingBead Lysis Tubes (0.1 & 0.5 mm) | 50 Tubes | $101.00 |
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蚂蚁淘（www.ebiomall.cn）是中国大陆目前唯一的生物医疗科研用品B2B跨境交易平台，
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2018-12-26
第一向（等电点聚焦，IEF）1）凝胶条的准备1．以帽凝胶端（2个校准环：4mm和10mm）朝下，将4根玻璃管插入两个凝胶灌注装置的每个托架中，这样玻璃管恰好站在两个分隔室之一的“充填船”上。从玻璃管顶端到玻璃管底端拉入PP线（小心，线不易移动），否则以后将不能用它们将胶溶液拉上来。2．溶解 查看更多
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2018-08-06
微生物的细胞小且透明，在普通光学显微镜下不易识别，必须对它们进行染色，使经染色后的菌体与背景形成明显的色差，从而能更清楚地观察到其形态和结构。因此，微生物染色技术是观察微生物形态结构的重要手段。 (注：任何一项技术都不是完美无缺的。染色后的微生物标本是死的，在染色过程中微生物的形态与结构均会发生一些变化，不能完全代表其生活细胞的真实情况，染色观察时必须注意。) 查看更多
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2018-08-06
结缔组织广泛分布于入体和动物体内，而疏松结缔组织在组织损伤后的修复过程中，纤维细胞可转化为活跃的成纤维细胞。成纤维细胞能形成胶原纤维、弹力纤维和网状纤维以及基质等成分。致密结缔组织的间质内含有大量纤维，排列紧密，细胞和基质比较少，主要含有弹性纤维，又称为弹性致密结缔组织。网状结缔组织由网状细胞和网状纤维组成，其化学成分含有蛋白质和多糖。通过染色试剂，能够证明结缔组织纤维分类和纤维之间存在的相互关系。 查看更多
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2018-08-03
本实验来源「细胞实验指南」 黄培堂 等译。 查看更多
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通过轻微的切片复染，可观察切片样本的形态以及特异区域的特性。复染后，载玻片经脱水处理，压盖玻片固定，拭净后供显微镜观察。在所提供的以下方案中，吉姆萨染色在染细胞核上占有优势，苏木精/伊红染色可辨别细胞核和细胞质，甲苯胺蓝染色 是对细胞核和细胞质淡染的一个更简便方法。细胞核的Hoechst染色提供了一个可同时观察整个组织以及杂交区域的快速、简便、有效的途径。 查看更多
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2018-08-10
病原微生物的种类繁多，包括属于真核微生物的真菌、厉于原核微生物的细菌（抗酸杆菌）、来自病毒的乙型肝炎表面抗原（HBsAg）等。这些物质的化学成分中，含有不同的黏多糖、酸性蛋白和脂蛋白成分。染色后，通过氧化剂或直接加热条件下，可使染色剂与物质结合而形成牢固的复合物。 查看更多
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2021-08-21
本实验来源「实用流式细胞术彩色图谱」 王书奎、周振英主编。 查看更多
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2021-09-13
微生物拟核体内体外染色观察实验的相关实验步骤、实验技巧、实验protocol、实验经验及常见问题。<link rel="stylesheet" type="text/css" href="/ueditor/themes/... 查看更多
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2018-12-26
Immunostaining of Cells Adherent to Coverslips1) Immerse 18 mm2 glass coverslips in EtOH. In the tissue culture hood, individually pull out and carefully flame 查看更多
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2018-08-10
免疫酶染色试验一般都由两部分组成，即一次或数次抗原和抗体的免疫学反应和一次酶促反应。第一步抗原抗体结合中，酶结合物起抗体作用，在第二步加入底物后，酶起到了催化的生物放大作用。该方法具有敏感性高，标本可长期保存，使用一般光学显微镜就能观察等优点，但有时也存在非特异性染色的问题。来源：《病毒学检验》 查看更多
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2021-08-09
所有的生物都是由细胞组成的，只是不同的生物体细胞的大小和形状有所不同。有的细胞人的眼睛可以看得见，如鸟类的蛋，最大的直径近10厘米（鸵鸟蛋）。 查看更多
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2018-08-06
显示染色体主要是显示分裂中期细胞。因细胞分裂处于中期时，染色体的长短和大小恰到好处，是研究染色体的最好阶段。内容来源：组织培养和分子细胞学技术。（北京出版社） 查看更多
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应用酸性染料比色法测定总生物碱的含量123
独脚金鸡2004-04-19
我想测定中药中总生物碱的含量，不知道用酸性染料法该注意哪些事项？
请各位大侠给予帮助！！
谢谢！！
请各位大侠给予帮助！！
谢谢！！
同一基因突变,为何向左为LQT3,向右为Brugada综合征?_心肌细胞123
第537位访客2018-02-18
在生物中，健那绿染液是专一性染线粒体的活细胞染料。
健那绿染液是一种活体染液，实验对象必须是活细胞，健那绿可以使活细胞中的线粒体呈现蓝绿色，而细胞质接近无色。
健那绿染液是一种活体染液，实验对象必须是活细胞，健那绿可以使活细胞中的线粒体呈现蓝绿色，而细胞质接近无色。
关于核酸染料的若干问题 实验方法123
fine082005-07-26
今天看到一个试剂公司的快讯，想换种毒害小些，灵敏度不错的染料！
1、快讯上是Invotrogen公司的SYRBGOLD，不过500ul/1390元，实在有点贵，为了查用量；
2、结果又查出赛百盛的GoldViewTMDNA染料1ml/100元；
3、还有一种在日光下即可看出DNA条带的上海华舜生物工程有限公司的LightBluedye；
为了一个EB，居然不小心查出三种染料，而对这三种染料的评价也褒贬不一，我个人希望找个毒害小些，而且灵敏度还不能低于EB，价格方面也能让老板接受的来。
而对这三个染料，我有三个问题：
1、SYRBGOLD的用量问题，500ul能用到200次吗（我一般一次用30ml的胶，配在胶中）？
2、GoldViewTMDNA染料的成分是否如有些人所说的就是丫啶橙（能举出确切证据吗）？
3、LightBluedye灵敏度如何？能比得过EB吗？
1、快讯上是Invotrogen公司的SYRBGOLD，不过500ul/1390元，实在有点贵，为了查用量；
2、结果又查出赛百盛的GoldViewTMDNA染料1ml/100元；
3、还有一种在日光下即可看出DNA条带的上海华舜生物工程有限公司的LightBluedye；
为了一个EB，居然不小心查出三种染料，而对这三种染料的评价也褒贬不一，我个人希望找个毒害小些，而且灵敏度还不能低于EB，价格方面也能让老板接受的来。
而对这三个染料，我有三个问题：
1、SYRBGOLD的用量问题，500ul能用到200次吗（我一般一次用30ml的胶，配在胶中）？
2、GoldViewTMDNA染料的成分是否如有些人所说的就是丫啶橙（能举出确切证据吗）？
3、LightBluedye灵敏度如何？能比得过EB吗？
【评论】谁知道赛百盛出品的GoldView核酸染料的具体情况123
arpe06202007-04-09
谁知道赛百盛出品的GoldView核酸染料的具体情况
前一阵子实验室开始使用一种新的核酸染料-goldview,取代原先用的溴化乙锭-EB.goldview现在是由赛百盛出售.以下摘自官方网站:
GoldViewTM核酸染料——使用说明
概述
GoldViewTM是一种可代替溴化乙锭（EB）的新型核酸染料，采用琼脂糖电泳检测DNA时，GoldViewTM与核酸结合后能产生很强的荧光信号，其灵敏度与EB相当，使用方法与之完全相同。在紫外透射光下双链DNA呈现绿色荧光，而单链DNA呈红色荧光。GoldView不仅能染DNA，也可用于染RNA。
通过Ames试验、小鼠骨髓嗜多染红细胞微核试验、小鼠睾丸精母细胞染色体畸变试验，致突变性结果均为阴性；而溴化乙锭（EB）是一种强致癌剂。因此用GoldviewTM代替EB不失为一种明智的选择。
使用方法
1.将100ml琼脂糖凝胶溶液（浓度一般为0.8%~2%）在微波炉中融化。
2.加入5µlGoldView，轻轻摇匀，避免产生气泡。
3.冷却至不烫手时倒胶，待琼脂糖凝胶完全凝固后上样电泳。
4.电泳完毕在紫外灯下观察。若使用数码相机照像记录，则关闭相机的闪光灯，放在自动档即可；若使用凝胶成像系统照相，通过调节光圈、曝光时间，选择合适的滤光片，可得到成像清晰、背景较低的照片。
注意事项
1.胶厚度不宜超过0.5cm，胶太厚会影响检测的灵敏度。
2.加入GoldView的琼脂糖凝胶反复融化可能会对核酸检测的灵敏度产生一定影响，但不明显。
3.通过凝胶电泳回收DNA片段时，建议使用GoldView染色，在自然光下切割DNA条带，避免紫外线与EB对目的DNA产生的损伤，可明显提高克隆、转化、转录等分子生物学下游操作的效率。
4.虽然未发现GoldView有致癌作用，但对皮肤、眼睛会有一定的刺激，操作时应戴上手套。
电泳结果显示GV灵敏度与EB相当
问题1.Goldview到底是不是丫啶橙？
2.赛百盛不公布其成分的原因是害怕其为丫啶橙还是出于技术保密？
前一阵子实验室开始使用一种新的核酸染料-goldview,取代原先用的溴化乙锭-EB.goldview现在是由赛百盛出售.以下摘自官方网站:
GoldViewTM核酸染料——使用说明
概述
GoldViewTM是一种可代替溴化乙锭（EB）的新型核酸染料，采用琼脂糖电泳检测DNA时，GoldViewTM与核酸结合后能产生很强的荧光信号，其灵敏度与EB相当，使用方法与之完全相同。在紫外透射光下双链DNA呈现绿色荧光，而单链DNA呈红色荧光。GoldView不仅能染DNA，也可用于染RNA。
通过Ames试验、小鼠骨髓嗜多染红细胞微核试验、小鼠睾丸精母细胞染色体畸变试验，致突变性结果均为阴性；而溴化乙锭（EB）是一种强致癌剂。因此用GoldviewTM代替EB不失为一种明智的选择。
使用方法
1.将100ml琼脂糖凝胶溶液（浓度一般为0.8%~2%）在微波炉中融化。
2.加入5µlGoldView，轻轻摇匀，避免产生气泡。
3.冷却至不烫手时倒胶，待琼脂糖凝胶完全凝固后上样电泳。
4.电泳完毕在紫外灯下观察。若使用数码相机照像记录，则关闭相机的闪光灯，放在自动档即可；若使用凝胶成像系统照相，通过调节光圈、曝光时间，选择合适的滤光片，可得到成像清晰、背景较低的照片。
注意事项
1.胶厚度不宜超过0.5cm，胶太厚会影响检测的灵敏度。
2.加入GoldView的琼脂糖凝胶反复融化可能会对核酸检测的灵敏度产生一定影响，但不明显。
3.通过凝胶电泳回收DNA片段时，建议使用GoldView染色，在自然光下切割DNA条带，避免紫外线与EB对目的DNA产生的损伤，可明显提高克隆、转化、转录等分子生物学下游操作的效率。
4.虽然未发现GoldView有致癌作用，但对皮肤、眼睛会有一定的刺激，操作时应戴上手套。
电泳结果显示GV灵敏度与EB相当
问题1.Goldview到底是不是丫啶橙？
2.赛百盛不公布其成分的原因是害怕其为丫啶橙还是出于技术保密？
【求助】酸性染料比色法测定总生物碱含量中遇到的问题123
防风半夏2007-03-31
我在做中药提取物中总生物碱含量测定,用的是酸性染料比色法,两次试验在处理样品时,同样的重量,同样的溶剂量,只是最后在调节PH值时一次用的是氨水调到9-10,一次用的氢氧化钠溶液调到9-10,但是发现用氨水调的溶液测定值明显比氢氧化钠调的要高得多,这是怎么回事呢?有同学说氨水可能有部分也与酸性染料形成络合物了,但是我的供试液是经三氯甲烷萃取,挥掉三氯甲烷,再用无水乙醇定容的,应该不会存在这种可能的.请教各位大侠,这是什么原因呢?
【分享】酸性染料比色法测定生物碱含量时为什么硫酸钠会变为蓝色？...123
小帅帅5162021-07-21
我在用酸性染料比色法测定生物碱含量时发现加入的无水硫酸钠变为蓝色了,这是为什么啊
而且样品中的无水硫酸钠未变色,而做标准曲线的五个和空白对照的变为蓝色了,请高手指教,多谢!
还有,是否变蓝对测定结果有影响吗?
谢了哈
欢迎你！请下次规范发贴:)
而且样品中的无水硫酸钠未变色,而做标准曲线的五个和空白对照的变为蓝色了,请高手指教,多谢!
还有,是否变蓝对测定结果有影响吗?
谢了哈
欢迎你！请下次规范发贴:)
Lumiprobe』动物活体成像用染料|活体成像|性能参数,报价/价格,...123
cnbio62172021-07-22
lumiprobeCorporation是美国一家高品质生物技术公司，专业提供分子生物学研究用的活性荧光染料。从2006年开始，公司生产并销售生命科学研究和诊断学应用的优质化学药品。产品主要有：活性染料(ReactiveDye)和SYBRGreenI染料，用于寡核苷酸合成的亚磷酰胺，点击化学和其它试剂。
产品主要应用：点击化学(Clickchemistry)、蛋白质组学研究中的双向荧光差异凝胶电泳(2DDIGE)和实时荧光定量PCR(RealtimePCR)。
氨基类染料是包含自由氨基的活性染料，染料可与活化羧酸衍生物和其他亲电子的试剂结合。比如：氨基与EDC-活化的羧基结合。
相关产品如下：
中文名英文名产品编号分子结构Cy7.5胺Cy7.5amineAGF1350A[img]/KindEditor_4.0.1/attached/image/20130704/20130704110804_5250.jpg[/img]Cy5胺Cy5amineAGF1332A[img]/KindEditor_4.0.1/attached/image/20130704/20130704110715_7750.jpg[/img]相似系列产品：
抗体、核酸、蛋白质等生物分子标记染料
羰基活性荧光染料
巯基反应性染料
羧酸类染料
产品主要应用：点击化学(Clickchemistry)、蛋白质组学研究中的双向荧光差异凝胶电泳(2DDIGE)和实时荧光定量PCR(RealtimePCR)。
氨基类染料是包含自由氨基的活性染料，染料可与活化羧酸衍生物和其他亲电子的试剂结合。比如：氨基与EDC-活化的羧基结合。
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中文名英文名产品编号分子结构Cy7.5胺Cy7.5amineAGF1350A[img]/KindEditor_4.0.1/attached/image/20130704/20130704110804_5250.jpg[/img]Cy5胺Cy5amineAGF1332A[img]/KindEditor_4.0.1/attached/image/20130704/20130704110715_7750.jpg[/img]相似系列产品：
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羰基活性荧光染料
巯基反应性染料
羧酸类染料
【资源】蛋白质、多肽、核酸等生物分子标记染料_问答123
cnbio62172014-05-23
lumiprobeCorporation是美国一家高品质生物技术公司，专业提供分子生物学研究用的活性荧光染料。从2006年开始，公司生产并销售生命科学研究和诊断学应用的优质化学药品。产品主要有：活性染料(ReactiveDye)和SYBRGreenI染料，用于寡核苷酸合成的亚磷酰胺，点击化学和其它试剂。
产品主要应用：点击化学(Clickchemistry)、蛋白质组学研究中的双向荧光差异凝胶电泳(2DDIGE)和实时荧光定量PCR(RealtimePCR)。
N-羟基琥珀酰亚胺酯类活性染料 罗丹明类化合物是以氧杂蕙为母体的碱性咕吨染料，由于特殊的结构及相应的荧光特性，使罗丹明类荧光染料成为化学和生物分析领域中研究较为广泛的课题。与其他常用的荧光染料相比，罗丹明类荧光染料具有光稳定性好、对PH不敏感、较宽的波长范围和较高的荧光量子产率等优点，因此被广泛应用在医学、生物学、环境化学等方面，是分析化学和生物技术领域中最常用的荧光染料。
菁染料是性能优良的荧光标记染料，摩尔吸光系数在荧光染料中是最高的。N-羟基琥珀酰亚胺酯是最常用的脂肪氨基标记试剂，广泛用于蛋白质、氨基酸多肽、抗体、核酸及其他生物分子的标记和检测。通过改变次甲基链的长度,可改变其荧光发射波长，每增加一个双键，按照Huoffman规则正好红移约100nm。
菁染料Cy3和Cy5已成为基因芯片的首选荧光标记物；另外,Cy5,Cy5.5和Cy7，Cy7.5的吸收在近红外区背景非常低，是荧光强度最高、最稳定的长波长染料，特别适合于活体小动物体内成像。但由于菁染料,尤其是不对称菁染料的合成副反应多,副产物极性相近,产物的分离提纯相当困难。菁染料特别是水溶性菁染料分子极性大,分离提纯越加困难。Lumiprobe供应脂溶性和水溶性菁染料。
相关产品：
产品分子结构可替代染料编号：AGF1371A
6-ROX-N-羟基琥珀酰亚胺酯
ROXNHSester,pure6-isomer[img]/KindEditor_4.0.1/attached/image/20130704/20130704102819_7906.jpg[/img]AlexaFluor568编号：AGF1326A
Cy3-N-羟基琥珀酰亚胺酯
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DyLight649NHSester
编号：AGF1345A
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Cy5.5NHSester[img]/KindEditor_4.0.1/attached/image/20130704/20130704103557_5875.jpg[/img]AlexaFluor680NHSester
DyLight680NHSester
编号：AGF1349A
Cy7-N-羟基琥珀酰亚胺酯
Cy7NHSester[img]/KindEditor_4.0.1/attached/image/20130704/20130704103713_8843.jpg[/img]编号：AGF1356A
Cy7.5-N-羟基琥珀酰亚胺酯
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磺酸基-Cy3-N-羟基琥珀酰亚胺酯
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DyLight549
编号：AGF1377A
磺酸基-Cy5-N-羟基琥珀酰亚胺酯
Sulfo-Cy5NHSester[img]/KindEditor_4.0.1/attached/image/20130705/20130705095752_6656.jpg[/img]AlexaFluor647
DyLight649
编号：AGF1379A
磺酸基-Cy7-N-羟基琥珀酰亚胺酯
Sulfo-Cy7NHSester[img]/KindEditor_4.0.1/attached/image/20130704/20130704104047_6968.jpg[/img]相似系列产品：
羰基活性荧光染料
氨基类染料
巯基反应性染料
羧酸类染料
产品主要应用：点击化学(Clickchemistry)、蛋白质组学研究中的双向荧光差异凝胶电泳(2DDIGE)和实时荧光定量PCR(RealtimePCR)。
菁染料是性能优良的荧光标记染料，摩尔吸光系数在荧光染料中是最高的。N-羟基琥珀酰亚胺酯是最常用的脂肪氨基标记试剂，广泛用于蛋白质、氨基酸多肽、抗体、核酸及其他生物分子的标记和检测。通过改变次甲基链的长度,可改变其荧光发射波长，每增加一个双键，按照Huoffman规则正好红移约100nm。
菁染料Cy3和Cy5已成为基因芯片的首选荧光标记物；另外,Cy5,Cy5.5和Cy7，Cy7.5的吸收在近红外区背景非常低，是荧光强度最高、最稳定的长波长染料，特别适合于活体小动物体内成像。但由于菁染料,尤其是不对称菁染料的合成副反应多,副产物极性相近,产物的分离提纯相当困难。菁染料特别是水溶性菁染料分子极性大,分离提纯越加困难。Lumiprobe供应脂溶性和水溶性菁染料。
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Sulfo-Cy3NHSester[img]/KindEditor_4.0.1/attached/image/20130704/20130704103830_1656.jpg[/img]AlexaFluor546
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取片剂一片，照溶出度测定法（中国药典2000年版二部附录ⅩC第三法），以水250ml为溶剂，转速为每分钟50转，依法操作，分别经15、30、45、60、75、210分钟取溶液滤过，精密量取续滤液5ml于分液漏斗中，加入pH7.4磷酸盐缓冲液5ml，5ml0.3%溴麝香草酚蓝溶液，用15ml氯仿分两次萃取，合并萃取液，加入0.4g无水硫酸钠，照分光光度法（中国药典2000年版二部附录ⅥA），在410nm波长处测得溶出A值。现15、30、45、60、75、210分钟溶出A值分别为0.0413、0.0544、0.0437、0.0479、0.0394、0.0302。（测定吸收度偏小是否不准，有影响。）
请各位站友指教。
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