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ZYMO RESEARCH/Quick-DNA Fecal/Soil Microbe Microprep/D6012

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ZYMO RESEARCH/Quick-DNA Fecal/Soil Microbe Microprep/D6012

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ZYMO RESEARCH

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D6012

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Extract high quality, inhibitor-free metagenomic DNA from feces, soil, water, etc.

Highlights

Rapid method for the isolation of inhibitor-free, PCR-quality DNA from fecal samples in minutes, including those from humans, birds, rats, mice, cattle, etc.
Ultra-high density BashingBeads are fracture resistant and chemically inert.
Zymo-Spin column and unique filtration technologies effectively removes PCR inhibitors from the DNA product.

Description

The Quick-DNA Fecal/Soil Microbe Microprep Kit is a fecal and soil DNA extraction kit designed for the simple and rapid isolation of inhibitor-free, PCR-quality host cell and microbial DNA from a variety of sample sources, including humans, birds, rats, mice, cattle, etc. The procedure is easy and can be completed in minutes: fecal samples are rapidly and efficiently lysed by bead beating with our state of the art, ultra-high density BashingBeads. Zymo-Spin column technology is then used to isolate the DNA which is subsequently filtered to remove humic acids/polyphenols that can inhibit PCR. Eluted DNA is ideal for downstream molecular-based applications including PCR, arrays, genotyping, methylation detection, etc.

Applicable For	All sensitive downstream applications such as qPCR and Next-Generation Sequencing.
Elution Volume	≥ 20 µl
Equipment	Microcentrifuge, vortex, cell disruptor/pulverizer
Processing Volume	≤50 mg feces, ≤ 250 mg soil, ≤20 mg fungal/bacterial cells (wet weight)
Purity	A260/A280 nm ≥1.8.
Sample Source	Feces or soil
Sample Storage	DNA stored at ≤ -20°C.
Size Range	Capable of recovering genomic DNA up to and above 40 kb. In most instances, mitochondrial DNA and viral DNA (if present) will also be recovered.
Type	Total DNA
Yield	≤ 5 µg total DNA

Q1: My lysate seems viscous. What is causing this to happen? How can I fix this?

A viscous sample can indicate incomplete sample lysis. Try using less of your sample and optimize bead beating conditions (duration, speed, time) to ensure samples are thoroughly lysed. After bead beating, pellet the cell debris before moving on. Adding more Genomic Lysis buffer to the lysate can help dilute and deproteinate the sample, making the sample less viscous and more suitable for DNA recovery.

Q2: Are there any tips in optimzing bead beating conditions?

We have validated our kits with both high-speed homgenizers and low-speed disruptors. We highly recommend users to optimize their bead beating conditions for their own instruments. We recommend using a 2 ml-tube adapter to ensure that the bead beating is efficent (do not use adapters made of foam). For high-speed homogenizers, we recommend a total of 5 mins bead beating (1 min interval at 6.5 m/s with 5 mins rest, repeat 5 times). For low-speed cell disruptors, we recommend 30 mins at max speed.

Q3: What is the purpose of Zymo-Spin II-µHRC step?

Environmental samples often contain inhibitors such as polyphenolics, humic/fulvic acids, tannins, melanins, etc. that affect downstream applications such as PCR. Once the DNA is eluted off the binding column, the DNA is then passed through the Zymo-Spin II-µHRC to remove the PCR inhibitors, and the DNA is then ready for downstream applications. The Zymo-Spin II-µHRC does not bind DNA, it simply removes the PCR inhibitors.

Q4: Is it necessary to add beta-mercaptoethanol? Can this step be substituted or omitted?

Addition of beta-mercaptoethanol is recommended to enhance sample lysis, but can be substituted with dithiothreitol (DTT, final concentration of 10 mM). However, if bead beating is optimized and lysis is efficient, the addition of BME is not necessary and can be omitted.

Q5: When can an RNase A treatment be implemented in the protocol?

No additional RNase A treatment is required when processing samples within kit capacity. The selective chemistry allows for binding of double stranded DNA to the column and for RNA to flow through.

Cat #	Name	Size	Price
D3004-1-100	Genomic Lysis Buffer	100 ml	$60.00
D3004-2-50	g-DNA Wash Buffer	50 ml	$18.00
D3004-4-10	DNA Elution Buffer	10 ml	$14.00
D3004-5-15	DNA Pre-Wash Buffer	15 ml	$10.00
D6001-3-40	BashingBead Buffer	40 ml	$29.00
D6035-1-30	Prep Solution	30 ml	$18.00
C1057-50	Zymo-Spin III-F Filters	50 Pack	$59.00
C1004-50	Zymo-Spin IC Columns	50 Pack	$53.00
C1059-50	Zymo-Spin II-µHRC Filters	50 Pack	$108.00
S6012-50	ZR BashingBead Lysis Tubes (0.1 & 0.5 mm)	50 Tubes	$101.00

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RIA试剂盒选择的重要性

2018-08-05

来源：《遗传学实验教程》查看更多>

铁染色实验ppt课件

2021-09-02

骨髓内的铁蛋白及含铁血黄素（细胞外铁）和幼稚红细胞的铁粒（细胞内铁）在盐酸环境下与亚铁氰化钾作用生成亚铁氰化铁，即普鲁士蓝反应．本实验来源于牡丹江医学院本科 5 年制检验专业实验指导查看更多>

移液器和移液枪的正确使用方法

2018-12-26

前言血小板活化试验，对于血小板功能、心血管疾病的研究，有重要意义。使用流式细胞仪进行多参数分析，可以特异灵敏地检测血小板表面标记，了解血小板的活化状态和反应性，并同时获得更多关于血小板的信息。在疾病监测、抗血小板治疗病人的筛选及治疗监测、预测并发症等方面有良好的应用前查看更多>

染色体GTG标本制备实验资讯

2021-08-05

非显带染色体除可根据形态分辨部分染色体，其他多数染色体难以确认，而显带技术则可使染色体纵向长度上出现不同带纹，以辨认全部染色体。GTG即G 带，Trypsin（胰酶），Giemsa的简写。Giemsa染料是噻嗪——曙红染料，染色体的着色有赖于在原位形成噻嗪--曙红（2∶1）的沉淀物。查看更多>

[精品]去垢剂在膜蛋白研究中的应用

2018-11-22

Neogen Corporation产品介绍【代理商代购现货】查看更多>

与DNA结合蛋白相作用的启动子序列的鉴定实验方法

2018-12-26

番茄子叶细胞核的分离提取为例子进行实验步骤2～7须在4℃下使用高压灭菌过的设备进行。1．将番茄种子种在灭菌的水饱和滤纸上，置于小盆内，用薄膜封口后，培养7天。用刀片切下番茄子叶后收集备用。2．将40～50g新鲜组织放入300ml匀浆缓冲液，用韦林氏搅切器先1×4秒而后6×1秒。3．过滤匀浆混合液，查看更多>

Quick Preparation of Plasmid DNA from Yeast 组分提取...

2018-08-06

糖的分类较为复杂，单糖和双糖易溶于水，所以在固定液中易被溶解。多糖又分为淀粉、纤维素和糖原。黏多糖通常分为中性黏多糖和酸性黏多糖。糖蛋白是多糖和蛋白质结合的复合物。根据染色目的，选用对应的染料和试剂，分别进行染色，可判明不同的组织形态结构，对于诊断与实验性研究，具有一定的实用意义。查看更多>

台盼蓝(trypan blue)排斥实验_实验⽅法_

2018-08-10

台盼蓝是细胞活性染料，常用于检测细胞膜的完整性。还常用于检测细胞是否存活。活细胞不会被染成蓝色，而死细胞会被染成淡蓝色。查看更多>

流式细胞术之免疫表型分析如何染色

2021-08-21

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酸性高锰酸钾化学发光体系测定针剂中的头孢噻肟钠

2018-12-26

染料染色法测定细胞数1）结晶紫检测法1．在96孔细胞培养板各孔中加0.1ml含5×104～10×4 WEHI-164细胞的培养液（含10％小牛血清的RPMI-1640培养液），37℃ 5％ CO2的二氧化碳培养箱中培养2～3小时，让细胞帖壁。2．用RPMI-1640培养液10倍递次稀释TNF标准品，根据需要3～5倍递查看更多>

免疫印迹试验(westernblot)异常结果分析资讯

2018-08-10

免疫酶染色试验一般都由两部分组成，即一次或数次抗原和抗体的免疫学反应和一次酶促反应。第一步抗原抗体结合中，酶结合物起抗体作用，在第二步加入底物后，酶起到了催化的生物放大作用。该方法具有敏感性高，标本可长期保存，使用一般光学显微镜就能观察等优点，但有时也存在非特异性染色的问题。来源：《病毒学检验》查看更多>

投资组合 / 投资方向 / Healthcare_凯风创投官网

2021-09-06

本实验来源「实用流式细胞术彩色图谱」王书奎、周振英主编。查看更多>

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关于核酸染料的若干问题实验方法123

fine082005-07-26

今天看到一个试剂公司的快讯，想换种毒害小些，灵敏度不错的染料！
1、快讯上是Invotrogen公司的SYRBGOLD，不过500ul/1390元，实在有点贵，为了查用量；
2、结果又查出赛百盛的GoldViewTMDNA染料1ml/100元；
3、还有一种在日光下即可看出DNA条带的上海华舜生物工程有限公司的LightBluedye；

为了一个EB，居然不小心查出三种染料，而对这三种染料的评价也褒贬不一，我个人希望找个毒害小些，而且灵敏度还不能低于EB，价格方面也能让老板接受的来。
而对这三个染料，我有三个问题：
1、SYRBGOLD的用量问题，500ul能用到200次吗（我一般一次用30ml的胶，配在胶中）？
2、GoldViewTMDNA染料的成分是否如有些人所说的就是丫啶橙（能举出确切证据吗）？
3、LightBluedye灵敏度如何？能比得过EB吗？

【资源】蛋白质、多肽、核酸等生物分子标记染料_问答123

cnbio62172014-05-23

lumiprobeCorporation是美国一家高品质生物技术公司，专业提供分子生物学研究用的活性荧光染料。从2006年开始，公司生产并销售生命科学研究和诊断学应用的优质化学药品。产品主要有：活性染料(ReactiveDye)和SYBRGreenI染料，用于寡核苷酸合成的亚磷酰胺，点击化学和其它试剂。
产品主要应用：点击化学(Clickchemistry)、蛋白质组学研究中的双向荧光差异凝胶电泳(2DDIGE)和实时荧光定量PCR(RealtimePCR)。
N-羟基琥珀酰亚胺酯类活性染料罗丹明类化合物是以氧杂蕙为母体的碱性咕吨染料，由于特殊的结构及相应的荧光特性，使罗丹明类荧光染料成为化学和生物分析领域中研究较为广泛的课题。与其他常用的荧光染料相比，罗丹明类荧光染料具有光稳定性好、对PH不敏感、较宽的波长范围和较高的荧光量子产率等优点，因此被广泛应用在医学、生物学、环境化学等方面，是分析化学和生物技术领域中最常用的荧光染料。
菁染料是性能优良的荧光标记染料，摩尔吸光系数在荧光染料中是最高的。N-羟基琥珀酰亚胺酯是最常用的脂肪氨基标记试剂，广泛用于蛋白质、氨基酸多肽、抗体、核酸及其他生物分子的标记和检测。通过改变次甲基链的长度,可改变其荧光发射波长，每增加一个双键，按照Huoffman规则正好红移约100nm。
菁染料Cy3和Cy5已成为基因芯片的首选荧光标记物；另外,Cy5,Cy5.5和Cy7，Cy7.5的吸收在近红外区背景非常低，是荧光强度最高、最稳定的长波长染料，特别适合于活体小动物体内成像。但由于菁染料,尤其是不对称菁染料的合成副反应多,副产物极性相近,产物的分离提纯相当困难。菁染料特别是水溶性菁染料分子极性大,分离提纯越加困难。Lumiprobe供应脂溶性和水溶性菁染料。
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Akce的个人空间 ( ゜゜)つロ乾杯~ Bilibili123

td哥哥69262018-02-18

PCR生物实验常用的染料有哪些
分子生物学实验的染料主要涉及到核酸染料和蛋白质染料.核酸染料主要有EB（溴化乙锭,高致癌性）,goldview,sybr green（实时定量PCR时常用染料）.这些染料可以和核酸双链分子特异性结合发出强荧光而被检测到.蛋白质染料最常用的是考马斯亮蓝 R-250,硝酸银.其中硝酸银有时也用于核酸染色.
染料分为天然染料和人工染料两种。天然染料有胭脂虫红、地衣素、石蕊和苏木素等，它们多从植物体中提取得到，其成分复杂，有些至今还未搞清楚。目前主要采用人工染料，也称煤焦油染料，多从煤焦油中提取获得，是苯的衍生物。多数染料为带色的有机酸或碱类，难溶于水，而易溶于有机溶剂中。为使它们易溶于水，通常制成盐类。
染料可按其电离后染料离子所带电荷的性质，分为酸性染料、碱性染料、中性（复合）染料和单纯染料四大类。标本干燥后即进行固定，固定的目的有三个：
1）杀死微生物，固定细胞结构。
2）保证菌体能更牢的粘附在载玻片上，防止标本被水冲洗掉。
3）改变染料对细胞的通透性，因为死的原生质比活的原生质易于染色。

生物质燃料的类型有哪些123

小海8792018-03-01

一般分固体成型燃料、气体燃料和液体燃料

DNA显示中三种染色方法的比较123

haolixx2018-01-29

高中生物，老师貌似说了有三种染料都可以染色dna。而且用处不一样
二苯胺
甲基绿派洛宁
还有一种忘了。
假期没法联系老师呵呵。
这三种的作用都是什么。

荧光染料标准品_标准品_生化试剂_知道_生物信息网123

matsukoko2021-07-23

求助各位同僚：
体内诊断用的荧光染料类药物，注册报批该走药品注册流程，还是诊断试剂（医疗器械）流程？
咨询了一些专业人士，有说按照药品的，也有说按照生物制剂的（但本身只属于小分子荧光染料，有点不沾边啊）。查询了国家局的文件，大多都是关于体外诊断试剂的，体内的相当少。
在此请教各位，能否给一些意见。最好能附上国家局相应文件。
感激！

DNA重组与转化_实验方法123

丿宏旭丶MaGe灬2018-02-24

高中学的只有健那绿染线粒体的

高中生物实验所有染色剂及其性质详解(完整版)123

枫岛LO03392018-02-18

1、菲林试剂还原糖砖红色沉淀（需水域）
2、苏丹三脂肪橙红
3、苏丹四脂肪红
4、双缩脲蛋白质紫
5、龙胆紫染色质紫
6、碘淀粉蓝
7、健那绿线粒体绿
8、甲基绿 DNA 绿
9、吡罗红 RNA 红
10、溴麝香草酚蓝 CO2 由蓝变绿再变黄
11、重铬酸钾酒精酸性条件下由橙色变成灰绿
12、醋酸洋红（龙胆紫、改良苯酚品红）染色质红
13、台盼蓝检验活死细胞死细胞会被染成蓝色（不常用）

Lumiprobe』动物活体成像用染料|活体成像|性能参数,报价/价格,...123

cnbio62172021-07-22