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流式的isotype对照（同型对照），就是使用相同标记，相同亚型的非特异性抗体，在另外一个管子的样本，采用同样的染色步骤染色。比如，你使用了小鼠IgG1,PE标记的特异性抗体，那就选用小鼠IgG1，PE标记的非特异性抗体。下面这个图，是一个比较典型的使用了同型对照的结果图灰色的曲线是未染色的样本，黄色是同型对照，红色是特异性抗体染色。由于细胞对抗体的非特异性结合，一般同型对照都会比未染色样本的荧光信号要强。所以设置阴性阈值的时候，要根据同型对照，而不是未染色的细胞。
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