Overview:
WNK1 is a member of the WNK subfamily of serine/threonine protein kinases that is a key regulator of blood pressure by controlling the transport of sodium and chloride ions. Mutations in WNK1 have been associated with pseudohypoaldosteronism type II and hereditary sensory neuropathy type II. WNK1 is a regulator of blood pressure and deficiency of this protein in mice lowers the blood pressure (1). WNK1 can regulate the Ca(2+) sensing and the subsequent Ca(2+)-dependent interactions mediated by synaptotagmin C2 domains and WNK1 exhibits additive CFTR inhibition (2).
Gene Aliases:
HSAN2; HSN2; KDP; KIAA0344; MGC163339; MGC163341; p65; PRKWNK1; PSK
Genbank Number:
NM_018979
References:
1. Zambrowicz, B. P. et.al: Wnk1 kinase deficiency lowers blood pressure in mice: a gene-trap screen to identify potential targets for therapeutic intervention. Proc. Nat. Acad. Sci. 100: 14109-14114, 2003. 2. Lee, B.-H. et.al: WNK1 phosphorylates synaptotagmin 2 and modulates its membrane binding. Molec. Cell 15: 741-751, 2004.
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这里有关于miRNA专题报道,可以看看
氯仿萃取RNA
异丙醇沉淀RNA
酒精清洗
总RNA提取试剂盒(TRIzol法)
RIpure试剂是直接从细胞或组织中提取总RNA的试剂。它在破碎和溶解细胞时能保持RNA的完整性。加入氯仿后离心,样品分成水样层和有机层。RNA存在于水样层中。收集上面的的水样层后,RNA可以通过异丙醇沉淀来还原。在除去水样层后,样品中的DNA和蛋白也能相继以沉淀的方式还原。乙醇沉淀能析出中间层的DNA,在有机层中加入异丙醇能沉淀出蛋白。共纯化DNA对于样品间标准化RNA的产量十分有用。
无论是人、动物、植物还是细菌组织,该方法对少量的组织(50-100mg)和细胞(5×106)以及大量的组织(≥1g)和细胞(>107)均有较好的分离效果。TRIPURE试剂操作上的简单性允许同时处理多个的样品。所有的操作可以在一小时内完成。TRIPURE抽提的总RNA能够避免DNA和蛋白的污染。故而能够作RNA印迹分析、斑点杂交、poly(A)+选择、体外翻译、RNA酶保护分析和分子克隆。如果是用于PCR,当两条引物位于单一外显子内时,建议用扩增级的DNase I来处理抽提的总RNA。
TRIpure试剂能促进不同种属不同分子量大小的多种RNA的析出。例如,从大鼠肝脏抽提的RNA琼脂糖凝胶电泳并用溴化乙啶染色,可见许多介于7 kb和15 kb之间不连续的高分子量条带(mRNA和hnRNA成分),两条优势核糖体~5 kb (28S)和~2 kb(18S),低分子量RNA介于0.1和0.3 kb之间 (tRNA, 5S)。当抽提的RNA用TE稀释时其A260/A280比值≥1.8。
求助:最近要提取血浆中的RNA,不知道用哪种试剂好,查了好多资料,有用Trizol,TrizolLS,RNAisoBlood和天根。但我从没做过,求各位大神给点意见。提取的RNA用于qPCR。
准备RNA用的试剂:70%乙醇(用DEPC处理后的水稀释新开封的无水乙醇),DEPC处理后的水,新开封的三氯甲烷等,
容器:玻璃试剂瓶需要180度,8个小时以上烘烤
Eppendorf管和“枪头”:RNase-free的管子和“枪头”(可以直接买到);或者普通的ep管和“枪头”,但是需要DEPC水浸泡后,高温灭菌(121度,20-40分钟)。
如果需要使用研钵和药品匙,研钵和药品匙也是需要180度,8小时以上的烘烤。
还需要没开封的手套,提取RNA时,尽量勤换手套,少说话,尽量不要对着样品吹气。
RNA提取对于科研人员来说并不陌生,但是要得到好的结果却不是一件很容易的事情。事实上,现在市面上的丰富的RNA提取试剂基本上可以满足科研人员的需要,为什么往往提取的RNA却容易失败呢?
RNA提取失败的主要现象有三个:提取的RNA降解、提取的RNA量偏低以及提取的RNA纯度低。究竟怎样才能确保RNA提取的成功率呢?
首先,要确定材料的可用性。尽管现有的RNA提取试剂都用抑制RNase的成分,但提取的材料仍需谨慎处理。提取的材料的新鲜度是获取完整RNA的关键,但是由于种种原因无法立即从新鲜材料中提取RNA时,使用Takara公司的样品保护剂SampleProtectorforRNA/DNA可以免去使用液氮或超低温冰箱的不便,同时也可以有效解决组织、细胞样品的短时间保存及运输问题。此外,如果将不同时期收集的样品都预先存放于本试剂中,可以做到立即终止并固定RNA表达的时序变化,减少实验组间的误差。
其次,选择合适的提取试剂是最重要的一步。好的提取试剂在确保成功的同时,操作方便且经济实用。对于动物组织、简单的植物材料、各种微生物、培养细胞的totalRNA提取,Takara公司的RNAisoPlus具有诸多的成功案例。随着2013年7月柱型提取试剂TaKaRaMiniBESTUniversalTotalRNAExtractionKit的成功上市,进一步丰富了TakaraRNA提取的产品线。该产品采用了独特的细胞裂解系统,无需苯酚氯仿抽提等步骤,简单快捷。组织或细胞裂解后,提取操作仅需20分钟便可完成。
对于富含多糖多酚的植物类组织提取是个难点,Takara精心研发的柱型提取试剂TaKaRaMiniBESTPlantRNAExtractionKit可以轻松解决这个问题。TaKaRaMiniBESTPlantRNAExtractionKit可以高效地从各种简单的植物组织材料(叶片、茎、幼苗等)、富含多糖多酚的植物组织材料(果实、种子等)、真菌提取高纯度的TotalRNA,适用范围广泛。按照标准流程,本试剂盒可以有效地提取分子量大于200nt的RNA,也可以按照可选步骤提取得到包含SmallRNA(<200nt)的TotalRNA。试剂盒中包含了RNA提取所需的全部试剂,无需额外购买其它试剂。
Trizol法和试剂盒提取组织中的RNA,哪个方法更可靠和精确呢?谢谢!
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