Clonerepetitivesequencesandlentivirallibraries
- StABIlizedirectrepeatsandcreatelentiviralconstructs
- GeneratelentiviralguideRNAlibraries
- RecommendedinCRISPRGeCKOlibraryprotocols
- Chooseelectrocompetentorchemicallycompetentcells
- Highestefficiencycommerciallyavailablecellsforlentiviralcloning: over1×107cfu/µg(chem)or1×1010cfu/µg(electro)
TransformationofEnduraElectrocompetentCellswithGeCKOlentivirallibrariesmayrequireextraRecoveryMedium. OrderextraRecoveryMediumbelow.
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Conserveclonesthatcontainunstablesequences!
MaintainunstableDNA.Lucigen’sEnduraCompetentCellsareacommonlyusedstrainforcloningsequencesthatsufferunwantedrecombinationeventsinotherstrains.Cloneswithinvertedrepeatsorothersequencespronetorecombinationarecommonlyfoundinretroviralgenes,andrequirecellssuchasEnduratobepropagatedstably.
Excellentvalueandefficiency!SwitchtoEnduracellstodayandexperienceahigherlevelofefficiencyandasavingsinyourcloningbudget.
ChemicalorElectrocompetent.Whichevermethodoftransformationyouprefer,Lucigencangiveyoubetterefficiencyand/orbetterprices.
Figure1.Costperreactionofchemicallycompetentcellsofclone-stabilizingstrainsfromothersuppliers.
Figure2.Transformationefficienciesofelectrocompetentclone-stabilizingstrains.
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Endura™CompetentCellsincludeControlDNAandRecoveryMedium,andarepackagedas SOLOs (1transformationpertube)orDUOs (2transformationspertube)asindicated.EnduraElectrocompetentcellsareprovidedinDUOsformatonly.RecoveryMediumisalsoavailableseparately.ThespecifiedtransformationefficienciesarewithpUCDNA,unlessindicatedotherwise.
PLEASENOTE: Bulkquantities(10timeslargerthanthelargestretailpackagesizebelow)and/orcustompackagingareavailableatveryattractivepricesforallLucigenCompetentCells. PleasecontactLucigen.
NOTE: TransformationofEnduraElectrocompetentCellswithGeCKOlentivirallibrariesmayrequireextraRecoveryMedium. TheZhanglabprotocol(availablefromAddgene)recommends~2mLofRecoveryMediumpertransformation. LucigenEndurakitsprovide1mLofRecoveryMediumpertransformation. OrderextraRecoveryMediumaboveorvisittheRecoveryMediumproductpagehere!
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客户提供：
1.目的基因信息(GenBankAccessionnumber、GeneID、或关键词)。
2.细胞系和培养条件
缺点：质粒仍然较大，转染难度相对较大。具有碱基识别偏好性，局限了基因编辑的运用范围，而且会导致不同基因位点编辑效率不同。筛选仍然需要较大工作量。
http://www.nature.com/nature/journal/v520/n7546/full/nature14299.html
请教各位大神，CRISPR/Cas9基因敲除的小鼠（完全性敲除）构建后，鉴定的方法是不是只要PCR扩增进行基因型鉴定就可以了？核型鉴定及southernblot检测需不需要呢？谢谢！
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近年来，CRISPR/Cas9风暴席卷全球。这项基因组编辑技术在短短几年内迅速应用于世界各地的实验室，并催生了上千篇文章的发表。然而，麻省理工学院（MIT）的《Technology Review》杂志提出了一个问题，谁才是CRISPR技术的所有者？生物通 www.ebiotrade.com
一个月前，“科学突破奖”（Breakthrough Prize）揭晓。加州大学伯克利分校的Jennifer Doudna和德国亥姆霍兹传染研究中心的Emmanuelle Charpentier因在CRISPR技术方面的重要贡献而获奖，且每人获得了300万美元的奖金。
这一领域的另一位风云人物，Broad研究院的张锋（Feng Zhang）虽然没有获得科学突破奖，但在今年4月获得了CRISPR/Cas9的首个专利。他的研究中心控制着这一技术的每个重要商业应用。生物通 www.ebiotrade.com
那么问题来了，这个备受瞩目的奖项和专利为何会落入不同人的手中？究竟是谁发明了它？“这一领域的知识产权相当复杂，”CRISPR Therapeutics公司的CEO Rodger Novak谈道。Emmanuelle Charpentier是这家公司的创始人之一。
Tech Review的记者Antonio Regalado指出，张锋与Doudna共同创立了Editas Medicine公司，它获得了Broad的技术授权。不过，在张锋成功申请专利之后，Doudna就与该公司断绝了关系。她将她的知识产权（专利申请中）授予了另一家竞争性的公司Intellia Therapeutics。然而，让事情更加复杂的是，Charpentier又将她在同一专利申请中的权利出售给了CRISPR Therapeutics。生物通 www.ebiotrade.com
此外，围绕这一技术的科学信用，那也是错综复杂。2012年夏天，Doudna、Charpentier及她们的团队发表了一篇文章，证明CRISPR/Cas9系统可以作为一种可编程的DNA编辑工具。半年后，张锋博士以及哈佛大学的George Church发表文章称它可应用于人类细胞，不久后，Doudna也发表了类似的结果。
但是，张锋表示他对Doudna和Charpentier的工作知之甚少。为了支持他的专利申请，他提交了实验室笔记本的照片，表示他在2012年年初就开始了这方面的研究，早于Doudna和Charpentier。生物通 www.ebiotrade.com
Charpentier表示：“我可以说的是，我和Jennifer Doudna是在我的实验室中开展研究。这里的一切都很夸张，因为这是一项人们很容易学会的技术。事情发生得太快了。”
Regalado在文中写道：“目前还没有CRISPR药物。但是如果CRISPR真的如科学家想象得那么重要，对这一基本技术的商业控制将价值数十亿美元。”也许，这场专利之战才刚刚开始。（生物通 薄荷）
基因敲除、阳性单克隆筛选、真核细胞、斑马鱼、基因组、植物
CRISPR（ClusteredRegularlyInterspacedShortPalindromicRepeats）RNA，是最近几年才发现的原核生物中的调控RNA，用以抵御病毒和质粒入侵。在II型CRISPR系统中，CRISPRRNA（crRNA）与转录激活crRNA（Trans-activatingcrRNA,tracrRNA）退火形成的复合物能特异识别基因组序列，引导Cas9核酸内切酶在目的片段生成DNA双链断裂（double-strandbreaks,DSBs）。CRISPR-Cas系统的高效基因组编辑功能已被应用于多种生物，包括人、小鼠、大鼠、斑马鱼、秀丽隐杆线虫、植物及细菌。多个科研小组的研究都显示，与锌指核酸酶（ZFNs）和转录激活样效应核酸酶（Transcriptionactivator-likeeffectornucleases,TALEN）相比较，CRISPR-Cas系统介导的基因组靶向实验在真核细胞中具有相似甚至更高的效率。
剪刀手生物专注于基因编辑多年，最新推出基因组编辑工具CRISPR/Cas9专家系统，该系统灵活简单、可以对特定基因组位点进行切割置换，特异性高、细胞毒性低。CRISPR/Cas9系统可广泛应用于基因组工程，如基因抑制，基因敲除，基因敲入，基因修复等。CRISPR-Cas9体系为基因组工程研究提供了一项简便而强大的工具。
作为一种新的基因编辑技术，CRISPR/Cas9有以下特点和优势：
1、操作简单，靶向精确性更高。
2、CRISPR/Cas9系统是由RNA调控的对DNA的修饰，其基因修饰可遗传。
3、基因修饰率高，基因调控方式多样，例如敲除、插入、抑制、激活等
4、可实现对靶基因多个位点同时敲除。
5、无物种限制。
6、实验周期短，最快仅需1个月，节省大量时间和成本。
CRISPR/Cas9的应用中，活性检测或是突变效率的检测：
错配酶法靶序列经Cas/sgRNA切割后由于缺乏修复模板，将主要以非同源重组的方式进行修复，或多或少会插入或删除一些碱基。因此将靶序列PCR扩增后经变性、退火，将形成错配。错配酶将识别错配的杂合双链并剪切。产物跑电泳，比较切割条带与未切割条带的比例，即可反映出Cas/sgRNA的活性。
http://www.addgene.org/crispr/guide/
一、Cas9简介
二、如何设计gRNA
三、如何快速克隆gRNA
四、如何制作基因敲除、基因敲入和条件性敲除
A
B
C条件性敲除
目前的条件性敲除小鼠主要是基于Cre-LoxP系统的。Cre-LoxP系统是源于P1噬菌体的一个DNA重组体系,由Cre酶和相应的LoxP位点组成,它能导致重组发生在特定的DNA序列处(LoxP位点),该系统可以将外源基因定点整合到染色体上或将特定DNA片段删除。
传统的条件性敲除
基于Cre-LoxP的基因打靶要分两步来进行。
传统方法，首先要在胚胎干细胞的基因组中引入LoxP序列，这一步可以通过打靶载体的设计和对同源重组子的筛选来实现。
第二步，通过Cre介导的重组来实现靶基因的遗传修饰或改变。在细胞水平上，可以用Cre重组酶表达质粒转染中靶细胞，通过识别LoxP位点将抗性标记基因切除；在个体水平上将重组杂合子小鼠与Cre转基因小鼠杂交，筛选子代小鼠就可得到删除外源标记基因的条件性敲除小鼠。将Cre基因置于可诱导的启动子控制下，通过诱导表达Cre重组酶而将LoxP位点之间的基因切除（诱导性基因敲除），实现特定基因在特定时间或者组织中的失活。
一般需要一年以上的时间，价格在15-20万不等。
基于Cas9系统的条件性敲除
原理上和传统的条件性敲除类似，差别在于利用OptimizedCas9/CRISPRSystem(OCAS)技术在基因组上加入loxp序列，可以快速获得Loxp位点插入的小鼠。
一般只需要4-5个月。价格也比传统方法大大降低。
五、如何制作基因敲除小鼠
因为技术和仪器的缺陷，一般实验室都不太会做到这一步。
mark先定格框架慢慢写
还开了另外一个帖子讲Cas9技术本身及在细胞生物学上的应用。也欢迎交流。
Cas9基因敲除技术详述-蚂蚁淘论坛
