SmartChip Probe qPCR Master Mix is optimized for performing probe-based gene expression and SNP genotyping on the SmartChip Real-Time PCR System. The 2X formulation has been optimized for uniform dispensing using the SmartChip MultiSample NanoDispenser (MSND), as well as reproducible PCR amplification with SmartChip MyDesign Kits. The mix has been designed to provide superior sensitivity and consistency for probe-based gene expression assays, as well as superior accuracy and consistent calling, even when working with rare alleles.
ebiomall.com
>
>
>
>
>
>
>
>
>
>
>
PCR(聚合酶链式反应）是利用DNA在体外摄氏95°高温时变性会变成单链，低温（经常是60°C左右）时引物与单链按碱基互补配对的原则结合，再调温度至DNA聚合酶最适反应温度（72°C左右），DNA聚合酶沿着磷酸到五碳糖(5'-3')的方向合成互补链。
恒温PCR和实时荧光定量PCR的不同，是不同在实时荧光定量PCR的系统中加入了荧光染料（SYBR Green 或Taqman 探针等等）。以SYBR Green为例，这种染料可以结合在双链的DNA上，当PCR不断进行时，每一次退火生成的双链DNA也在增加，荧光染料结合也越多，荧光也越强。在机器中有一个探测荧光的探头，可以定量检测荧光的强度，转换成数值。这样就可以实时记录反映体系中DNA的反应情况。
荧光PCR更有优势，因为荧光PCR灵敏度高于恒温PCR，同样价格也高一些。
荧光定量PCR较普通PCR不同的一点就是可以实时检测PCR扩增产物，从而可进行绝对定量或者相对定量。
荧光定量PCR数据如下表，想通过GraphPadPrism5软件构建柱状图，但不知道是将2-△△Ct数据导入GraphPadPrism5软件，还是将Mean和SD导入GraphPadPrism5软件中。请大神赐教。另外Mean和SD是求的△△Ct的还是2-△△Ct的？
半定量反转录－聚合酶链反应（semi-quantitative reverse transcription and polymerase Chain reaction ,SqRT-PCR）是近年来常用的一种简捷、特异的定量RNA测定方法，通过mRNA反转录成cDNA，再进行PCR扩增，并测定PCR产物的数量，可以推测样品中特异mRNA的相对数量。
定量RT-PCR（quantitative reverse transcription and polymerase Chain reaction ,qRT-PCR）是在用一步法或两步法，在PCR反应体系中加入荧光基团，利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程，最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。
半定量RT-PCR需要跑电泳，根据条带亮度的强弱来判断模板拷贝数的高低或者是表达量的高低，而定量RT-PCR则无需电泳可以实时监测整个PCR的全程并且由给出的Ct值及Standard Curve来判断gene拷贝数的高低。
一般说来，应选用口碑较好的经过大量客户实验验证的荧光定量PCR试剂盒，因为只有选对了试剂盒才能够做成漂亮的实验结果来，特别是对于一些珍贵的样品更不能因为节约一些蝇头小利而糟蹋了样品本身。OneShineSybrGreenpreMix试剂盒在研发之初就考虑到了一般科研环境中方方面面的影响，例如我们就光照强度、光照时间对本产品的影响做了严苛的实验论证，得到1ml本产品盛装于1.5ml离心管中放置在2000Lux光照强度下可以保存12h，超过12h产品性能则会下降。
OneShineSybrGreenpreMix这款试剂盒除了价格适中外，还主要有以下优点：
1、适用于RealTimePCR反应，可以快速、准确地对目的基因进行定量检测。
2、在2×OneShineSybrGreenpreMix中，预先混有SybrGreen，PCR体系配制时只需入模板、引物、ddH2O即可，操作方便快捷。
3、含有更耐高温并持续稳定的DNAPolymerase，可以维持更多的循环数，提供了选择循环数更大的空间。更大的Ct值选择范围就意味着可以支持微量目的基因检测，检测范围fM-nM。
4、反应的Buffer更适合，使反应的基线更水平，无荧光污染信号。使线性期更陡峭，避免了Ct值的无效浮动。使平台期更平直。也确保了引物与模板能够更特异地结合。
5、SybrGreen更耐高温更足量，确保只要扩增反应在进行，目的DNA双链在增加，就有线性强度的荧光产生。
6、dNTPs更足量，确保反应有更高的平台期荧光信号。
7、Mg2+浓度更适合，确保线性期有爆发式的目的DNA片段合成，提高了线性期反应体系的扩增系数和线性期的长度。
8、更高的仪器适配性，SybrGreen染料可以被各大主流仪器的激发光所激发，产生明亮的荧光信号，有利于仪器对信号的捕捉和处理。
我们的产品与市面上目前常见的一种产品相比较有如下区别：
A公司的产品没有熔解温度，或者熔解温度太高。但是A公司的产品Ct值出现略早，这是因为A公司使用了一种小分子量的DNA聚合酶，这种酶与模板和引物的结合较快和较松散，但是扩增的效率和扩增的特异性就不能保证了，类似于温水煮青蛙不温不火的；这种酶还有一个弱点就是不耐冻融。我们使用的是Taq酶，是一种分子量较大的DNA聚合酶，这种酶与模板和引物结合比较慢，但是慢工出细活，这种酶的特异性较好，一旦激活便呈现爆发式的扩增，类似于不鸣则已一鸣惊人。我们产品熔解温度是A公司不可比拟的，线性范围和斜率也是A公司不可比拟的。详见下图：
一般有ROX Reference Dye和ROX Reference Dye II两种,针对不同的PCR仪.一般ABI PRISM 7000/7700/7900HT和7300 Real-Time PCR System使用ROX Reference Dye,而7500 Real-Time PCR System和7500 Fast Real-Time PCR System使用ROX Reference Dye II.其它牌子如Thermal Cycler Dice Real Time System、LightCycler 等Real Time PCR扩增仪时不必使用.
在另外的一组管子中，加入已知拷贝数的DNA同时扩增，每个管子中加入的数量是不同的，但是从最小数目到最大数目的这个范围涵盖了样本中DNA拷贝数。
PCR反应完成后，把已知拷贝数DNA的量和PCR荧光Ct值制成标准曲线，再把待测样本的CT值和该标准曲线比对，就可以得到样本中的起始拷贝数了
这样设想的前提是因为，普通Taq酶也具有5‘－3’外切酶活性，如果可以的话，与普通PCR相比，反应体系需要做什么样的改动呢？
用的是ABI的机器。
