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ApexBio/CID 2745687/5mg/B7635
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ApexBio/CID 2745687/5mg/B7635
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CID 2745687GPR35 antagonist

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Publications citing ApexBio Products

Nature.2017 Jan 19;541(7637):417-420.
Nature.2018 Nov;563(7731):407-411.
Nature.2018 Jun 13.
Nature.2018 Jun 27.
Nature.2018 Mar 29;555(7698):673-677.
Nature.2017 Sep 7;549(7670):96-100.
Nature.2016 Apr 21;532(7599):398-401.
Science.2016 Aug 5;353(6299)594-8
Nat Nanotechnol.2017 Dec;12(12):1190-1198.
Nature Biotechnology.2017 Jun;35(6):569-576
Nat Med.2018 Sep 17.
Cell.2018 Dec 21. pii: S0092-8674(18)31561-7.
Cell.Available online 25 October 2018.
Cell.2018 Sep 27. pii: S0092-8674(18)31183-8.
Cell.2018 Jun 28;174(1):172-186.e21.
Cell.2018 Feb 22;172(5):1007-1021.e17.
Cell.2017 Nov 30;171(6):1284-1300.e21.
Cell.2017 Aug 17. pii: S0092-8674(17)30869-3.
Cell.2017 Jul 13;170(2):312-323
Nat Med.2018 Jan 29.
Nat Med.2017 Nov;23(11):1342-1351.
Cell.2017 Apr 6;169(2):286-300.
Cell.2015 Aug 27;162(5):987-1002.
Cell.2015 Feb 12;160(4):729-44.
Nature Medicine.2017 Apr;23(4):493-500.
Cancer Cell.2018 May 14;33(5):905-921.e5.
Cancer Cell.2018 Apr 9;33(4):752-769.e8.
Cancer Cell.2018 Mar 12;33(3):401-416.e8.
Cancer Cell.2017 Aug 14;32(2):253-267.e5.
Nat Methods.2018 Jul;15(7):523-526.
Cell Stem Cell.2018 May 3;22(5):769-778.e4.
Cell Stem Cell.2017 Nov 20. pii: S1934-5909(17)30375-2.

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CID 2745687

CID 2745687 Dilution Calculator

Concentration (start)
x
Volume (start)
=
Concentration (final)
x
Volume (final)
C1
V1
C2
V2

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CID 2745687 Molarity Calculator

Mass
=
Concentration
x
Volume
x
MW*
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calculate

Chemical Properties

Cas No. 264233-05-8SDF Download SDF
Synonyms N/A
Chemical Name (E)-methyl 5-((2-(tert-butylcarbamothioyl)hydrazono)methyl)-1-(2,4-difluorophenyl)-1H-pyrazole-4-carboxylate
Canonical SMILES S=C(N/N=C/C1=C(C(OC)=O)C=NN1C(C(F)=C2)=CC=C2F)NC(C)(C)C
Formula C17H19F2N5O2S M.Wt 395.43
Solubility Soluble in DMSO Storage Store at -20°C
Physical AppearanceA crystalline solidShipping ConditionEvaluation sample solution : ship with blue ice.All other available size:ship with RT , or blue ice upon request
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Background

pIC50: 6.70 for human GPR35

CID-2745687 is a GPR35 antagonist. GPR35 is a poorly characterized member of the rhodopsinlike, class A subfamily of G protein-coupled receptors (GPCRs). GPCRs, based on the expression pattern, has been considered as a possible therapeutic target in conditions including diabetes, cardiovascular disease, as well as inflammation and pain.

In vitro: Previous study indicated that both CID-2745687 and ML-145 could competitively inhibit the effects of cromolyn disodium and zaprinast (two agonists sharing an overlapping binding site) on human GPR35. In contrast, though ML-145 antagonized the effects of pamoate competitively, CID-2745687 showed a noncompetitive fashion. Additionally, neither ML-145 nor CID-2745687 was able to antagonize the agonist effects at rodent ortholog of GPR35 [1].

In vivo: To test whether GPR35 contributes to the metabolic effect of Zaprinast, the retina from Cngb1/ mice was preincubated with a GPR35 antagonist, CID-2745687, followed by an additional Zaprinast treatment. Results showed that CID-2745687 did not block the effect of Zaprinast on glutamate and aspartate. Moreover, pamoic acid, the GPR35 agonist, did not change aspartate or glutamate levels [1].

Clinical trial: N/A

References:[1] Jenkins L,Harries N,Lappin JE,MacKenzie AE,Neetoo-Isseljee Z,Southern C,McIver EG,Nicklin SA,Taylor DL,Milligan G.  Antagonists of GPR35 display high species ortholog selectivity and varying modes of action. J Pharmacol Exp Ther.2012 Dec;343(3):683-95. [2] Du J,Cleghorn WM,Contreras L,Lindsay K,Rountree AM,Chertov AO,Turner SJ,Sahaboglu A,Linton J,Sadilek M,Satrústegui J,Sweet IR,Paquet-Durand F,Hurley JB.  Inhibition of mitochondrial pyruvate transport by zaprinast causes massive accumulation of aspartate at the expense of glutamate in the retina. J Biol Chem.2013 Dec 13;288(50):36129-40.

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2018-07-16
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2018-12-26
Her2 or ERBB2 belongs to a class of proteins having high homology with epidermal growth factor receptor (EGFR or ERBB1). It encodes a protein with the molecul 查看更多>
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  自从1985年PCR技术首次应用于遗传病基因诊断以来,已有近百种遗传病可用PCR 技术进行诊断和产前诊断,利用PCR技术诊断遗传病的途径有五个,①基因突变位点 的直接检出②筛查与遗传病③④有关的点突变③遗传多态性标记连锁分析间接诊断④ 利用cmRNA逆转录为cDNA进行分析或直接分析cmRNA.  传统的 查看更多>
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实时荧光定量PCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。
PCR(聚合酶链式反应)是利用DNA在体外摄氏95°高温时变性会变成单链,低温(经常是60°C左右)时引物与单链按碱基互补配对的原则结合,再调温度至DNA聚合酶最适反应温度(72°C左右),DNA聚合酶沿着磷酸到五碳糖(5'-3')的方向合成互补链。
恒温PCR和实时荧光定量PCR的不同,是不同在实时荧光定量PCR的系统中加入了荧光染料(SYBR Green 或Taqman 探针等等)。以SYBR Green为例,这种染料可以结合在双链的DNA上,当PCR不断进行时,每一次退火生成的双链DNA也在增加,荧光染料结合也越多,荧光也越强。在机器中有一个探测荧光的探头,可以定量检测荧光的强度,转换成数值。这样就可以实时记录反映体系中DNA的反应情况。
荧光PCR更有优势,因为荧光PCR灵敏度高于恒温PCR,同样价格也高一些。

请教园友:

一般做mRNA表达的时候,需要注意提取的RNA中是否有DNA污染,或者通过设计跨内含子的引物来解决。那么,检测MmiRNA的时候,需要注意RNA中DNA污染的问题么?

实时荧光定量PCR溶解曲线杂乱是什么原因?调退火温度有用吗?怎么能改善啊

荧光定量PCR是通过荧光染料或荧光标记的特异性的探针,对PCR产物进行标记跟踪,实时在线监控反应过程,结合相应的软件可以对产物进行分析,计算待测样品模板的初始浓度。|||原理不同:荧光定量pcr实时监测与dna结合的荧光染料激发的荧光;普通pcr通过检测插入dna中核算染料的量来测定pcr最终产物量,一般是紫外光。反应要求:荧光定量对扩增片段有较高的要求,一般为100-300bp;普通定量可以扩增长点的片段。如果不需要检测产物分子量大小,荧光定量可以不进行电泳就对产物进行定量分析,普通pcr必须电泳。结果:荧光定量可以实现精确定量,普通pcr则不行。荧光定量体现可以看到整个扩增过程,可以看到扩增效率,溶解温度,直接得到的标准曲线等,这些是普通pcr无法实现的。|||这个还真不大清楚|||貌似前者是定量,后者属于半定量。|||简单的讲PCR技术最早是用于扩增一段特异的PCR片段,用于克隆、测序等实验,后来也将其用于样本中特异的PCR片段有无或非很粗的相对定量,而荧光定量PCR技术则是为了测定样本中特异的PCR片段相对及绝对量,是一种测定特异的PCR片段含量的方式。如测定病人样本中病原体的含量、实验样本中某一特定的mRNA的含量等。前些年有人讲过普通PCR后,通过电泳也可以进行定量,其实是将PCR产物的定量与PCR样本中模板定量相混了。近两年没有人再讲这类的话了。|||引物设计是sybr定量PCR法的最大难点,机会好的话,设计一对引物就能得到很好的结果,机会不好的话7、8对引物也出不来,我就遇到过这样的问题,我在prime5.0上设计了8对引物,符合实验要求的一对也没有,我把退火温度提高到了68度也没能把引物二聚体搞定,后来我想通了,可能我这对引物把其它序列扩增出来了,而且扩增效率很高(我一个同学设计了十几对才找到一对好用的)。记住primer5.0设计出来的100%好的引物,到了定量PCR上不一定好使,这是我最大的经验。定量pCR的引物对匹配度要求不高,我现在使用的引物就有几个碱基不匹配,但实验结果很好。有一个办法可以帮助我们绕过引物设计这道坎,直接到罗氏网站上专区上找引物。罗氏网站在线有一个引物设计软件,你只要找好你目的基因的种属,输入你的片段序列就可以得到你要的引物。这个软件有很大的好处,他会自动地把你的种属序列背景扣除,最大限度地去除引物二聚体产生的可以。
普通的PCR大多数是定性实验,而实时荧光定量PCR则定量和定性都可以做。应用领域也不一样,普通PCR一般应用于基因组克隆、DNA测序、RNA反转录等,而实时荧光定量PCR一般应用于mRNA表达量分析、绝对定量、蛋白表达、SNP分析、阴阳性解析等领域。不是定量PCR比PCR好,而是两者应用与不同的领域,起到了不同的作用。
荧光定量PCR较普通PCR不同的一点就是可以实时检测PCR扩增产物,从而可进行绝对定量或者相对定量。
普通的PCR大多数是定性实验,而实时荧光定量PCR则定量和定性都可以做。应用领域也不一样,普通PCR一般应用于基因组克隆、DNA测序、RNA反转录等,而实时荧光定量PCR一般应用于mRNA表达量分析、绝对定量、蛋白表达、SNP分析、阴阳性解析等领域。不是定量PCR比PCR好,而是两者应用与不同的领域,起到了不同的作用。
荧光定量PCR较普通PCR不同的一点就是可以实时检测PCR扩增产物,从而可进行绝对定量或者相对定量。
厚百搜查:Taq DNA Polymerase(5u/μl)500U 1091171000U,5000U快速型Fast Taq DNA Polymerase(5 U/μl)都厚百面查查看图" class="ikqb_img_alink">图" class="ikqb_img_alink">希望能帮啥疑问欢迎追问厚百holdbio提供试剂、耗材等全面实验室用品及实验技术服务科研整体服务(课题设计-实验-SCI)

各位战友

我实验室用的是Therimosci公司的SYBR试剂盒,说明书上要求DNA的量<500ng

但是测得CDNA浓度都在1000-2000多ng/ul

我第一次没注意500ng的问题就直接加了2ulcDNA结果CT值非常高

如果按500ng算,加的就不到1ul的量了,这样CT不是更高了嘛这样加对吗??

求助各位大侠,最近做的荧光定量PCR,标准曲线稀释一直不好,请教各位,

采用的标准品是自己提的细胞基因组,浓度最高从125ng/uL,5倍稀释,到最低0.2ng/uL,问题如下:

1.最后一个浓度做出来的扩增曲线重复性非常差,而且与前一个浓度梯度CT值差值约为5左右,稀释过程与前几个浓度时操作一致。

2.待测样品中目标基因若含量高,则重复性尚可,若含量略低,Ct值在30及以上,重复性也很差。


说明,

1、每个标准曲线浓度的稀释操作均一致,涡旋混匀时间>15s

2、所用移液枪无问题,枪头为低吸附枪头

3、操作移液枪无问题

实验不顺,甚是不爽,各位大侠出手解救


定量PCR方法及数据分析123
有木有3803722021-08-06
你所说的PCR应该就是最常规的PCR,以DNA为模板,通过上下游引物,实现DNA的扩增RT-PCR一般情况下是指反转录PCR(reversetranscription),尽管有些资料上说实时荧光定量PCR也(realtimefluores-cencequantitativePCR)也简称RT-PCR,但是我觉得这是不对的,不推荐。基本操作过程是将所提取的RNA进行反转录,然后将所获得的cDNA作为模板,设计引物进行扩增,是一种检测基因表达的常用方法。实时荧光定量PCR也就是Real-TimePCR,原理有点多,请自行百度百科,其最大的作用是检测样品中的初始DNA浓度。至于三者的关系,RT-PCR和实时定量PCR应该都属于PCR,在RNA实验中,这二者都会应用到。例如你要比较2个组织中的某基因的表达差异,首先你要提取2个组织的总RNA,然后通过RT-PCR检测该基因是否在2个组织中有表达,然后通过实时定量PCR测定该基因在2个组织中的表达量是否具有显著性差异。
如果有标准曲线,按照标准曲线计算。
一般都是相对量。则用delta delta CT方法来计算。举例如下:
对照组基因A的CT值为20, 内参(比如βactin)CT值15。实验组基因A CT值18,内参CT值14。
首先算加样量:delta CT=15-14=1。2的1次方是2。也就是说实验组的加样量是对照组的2倍。
基因A: delta CT=20-18=2。2的2次方是4。也就是说基因A的量在实验组是对照组的4倍。但是由于加样量是2倍,所以4处以2=2,最后的相对量是2倍。

几点注意:
1。必须确定扩增的特异性
2。 只有相同目标的CT值才能相减(扩增效率有可能不同)
3。 2的某次方只是理论值,实际扩增效率低于2。
4。 最好不用Syber Green
所谓Ct值,就是最先出现超过阈值信号的那个循环数。或者说是到了第几个循环才出现超过阈值的信号。

C代表的是cycle,循环数目,T代表的是threshold,阈值。

所以表达量越少的话,需要越多的循环才能扩增出来。也就是CT值越高
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