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Kapa biosystems/KAPA Stranded mRNA-Seq Kits/KK8721/25 mL
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Kapa biosystems/KAPA Stranded mRNA-Seq Kits/KK8721/25 mL
品牌 / 
kapabiosystems
货号 / 
KK8721
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Description:

KAPAAdapterDilutionBuffer(25mL)

KAPAStrandedmRNA-SeqKits

Evendifficultmessagesshouldbeunderstood.

KAPAStrandedmRNA-SeqKitsincludealltheenzymesandbuffersrequiredforCDNAlibrarypreparationforIlluminaNext-GenerationSequencing,utilizing100ng–4µgoftotalRNA.KAPAmRNACaptureBeadsareincludedforisolationofpoly(A)-tailedRNA.Kitsprovideprecisemeasurementofstrandorientation(>99%),uniformcoverage,andhigh-confidencemappingofalternatetranscripts,andareoptimizedfortheimprovedcoverageofGC-richandlow-abundancetranscripts.*KitscontainKAPAHiFiforhigh-efficiencyandlow-biaslibraryamplification,aswellasKAPAmRNACaptureBeadsandastreamlined,“with-bead”protocol.

KAPAStrandedRNA-SeqKitsincludealltheenzymesandbuffersrequiredforcDNAlibrarypreparationforIlluminaNext-GenerationSequencing,butdonotcontaintheKAPAmRNACaptureBeads.Kitscanbeusedtopreparelibrariesfrom10–400ngofeitherpoly(A)-selected,ribosomallydepleted,ortotalRNA.

NEW!KAPADual-IndexedAdapterKitsarenowavailable.FormoreinformationonKAPAAdapterKits,scrolldowntotheOrderingsection,ordownloadtheKAPAAdapterandBeadCalculator.

Download AdapterandBeadCalculator

 

*Dataonfile.
ForResearchUseOnly.Notforuseindiagnosticprocedures.

ProductHighlights

Improved coverage of GC-rich transcripts. The 5

Uncoverchallengingtranscripts 

  • ImprovedcoverageofGC-richtranscripts
  • Enhancedidentificationofexonicregions
Improved coverage of low-abundance transcripts. GLTPD1, a lesser-expressed transcript, is covered more comprehensively with the KAPA Stranded mRNA-Seq Kit (green) at 500 ng input total RNA (outlined in red). In comparison, Illumina TruSeq Stranded mRNA Sample Prep Kit (orange) shows coverage gaps, even with higher inputs (4 μg). Data on file.

Detectlow-abundancetranscripts

  • Enablesidentificationoftranscriptsmissedbycompetitorkits,evenwithhighinput*
  • Highuniformityacrossvaryingamountsofsampleinput*
30M),KAPAStrandedmRNA-SeqlibrariesgenerateagreaterpercentageofmappedreadsandlowerduplicationratesthananalogouslibrariespreparedwiththeIlluminaStrandedmRNASamplePrepKitwhilemaintaining99%strandspecificity.Dataonfile.">Highly mapped reads and strand specificity enable sensitive detection of expressed genes. With similar numbers of filter-passed reads (>30M),KAPAStrandedmRNA-SeqlibrariesgenerateagreaterpercentageofmappedreadsandlowerduplicationratesthananalogouslibrariespreparedwiththeIlluminaStrandedmRNASamplePrepKitwhilemaintaining99%strandspecificity.Dataonfile.

Identifymoregenes

  • HigherpercentageofuniquelymappedreadscomparedtoIllumina TruSeq™StrandedmRNASamplePrepKits*
  • Lowerduplicationratesyieldbettercoverage
Minimal positional bias. With intact, high-quality RNA input, 3

Maintainhighcoverageuniformity

  • Minimal5’–3′biasacrosstranscripts
  • Moreuniformdistributionofreadsovereachtranscript

 

*Dataonfile.

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Sample QC

KAPAhgDNAQuantificationandQCKit

Library Amplification

KAPALibraryAmplificationKits

Library Preparation

KAPAHyperPrepKits

Library Quantification

KAPALibraryQuantificationKits

Applications:

Applications
  • Geneexpression
  • Singlenucleotidevariation(SNV)discovery
  • Post-transcriptionalSNVs
  • Fusiongeneidentification
  • Targetedtranscriptome
  • Wholetranscriptome

KitSpecificationsandContents/Storage:

KitSpecificationsandContents/Storage

Kitscanbestoredforupto8 months at-20˚C. KAPAmRNACaptureBeadscanbestoredforupto8months at-4˚C.

Components

mRNA_Component Chart

Specifications

Spec
Description
CompatIBLePlatform
IlluminaHiSeq,NextSeq,MiSeqandGAIIx
StartingMaterial
TotalRNA,mRNA,orribosomaldepletedRNA
InputAmount
StrandedmRNA-SeqKits:100ng–4µgStrandedRNA-SeqKits:10ng–400ng
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2018-05-08
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Paragon Genomics/816007/CleanPlex™ 测序文库制备试剂盒/现货,基于CleanPlex, Paragon Genomics已经开发出一整套二代测序靶向基因文库制备解决方案及产品。CleanPlex文库制备试剂盒与其独特设计的引物面板(定制或者目录面板)共同使用时,具有快速简便、高均一性、高覆盖率等特点。因为CleanPlex使用的引物无需做任何化学修饰,其合成成本也可以比其他方法低4-6倍。下面是CleanPlex的主要特点。 查看更多>
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产品及特点: 本试剂盒是基于Inoue方法的、高效快速E.coli感受态细胞制备试剂盒。本产品具有下列特点: 1. 一步式操作,离心后重悬细胞即可,非常简单。 2. 转化率高,转化效率一般都在10E8/ug质粒以上。 3. 重复性好,可用于各种E.coli菌种,包括K12系(如JM109、DH5a等)和B系(如BL21系列菌种)。 4. 适用于低、中、高拷贝的各种质粒。 5. 本试剂盒足够20次制备,每次可以制备可以用50 mL菌液制备80管感受态细胞。 查看更多>
1) 用酸性酚-硫氰酸胍-氯仿提取纯化组织和细胞中的RNA1. 选取从组织细胞或细胞中提取RNA的适宜方法组织a. 分离组织并立即置于液氮中。b. 将约100 mg冰冻组织含液氮的研钵中,用研棒研磨。研磨过程中可加入液氮使组织保持冰冻状态。c. 将组织碎末移入含3 ml溶液D的管中。D溶液(变性液)4 mol/L 硫 查看更多>
注意事项: 1. 制作感受态细胞时应使用专用的玻璃器皿或塑料容器。洗刷这些玻璃器皿或塑料容器时应尽量洗净。由于微量的洗涤剂或污染物都可能降低感受态细胞的转化效率,因此在洗刷完用于制作感受态细胞的专用玻璃器皿或塑料容器后,最好用去离子水浸泡一晚,然后再充分洗净。 2. 制作感受态细胞时使用的菌种,不应使用4℃或常温保存的传代细菌。应使用-70℃保存的菌种,在LB/抗生素平板培养基上分级划线培养后,挑取单菌落。使用这种菌种制作的感受态细胞,能提高转化效率。 查看更多>
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tRNA大部分区域仍为单链结构 在其三叶草形状的叶柄和茎上存在双链结构
人教版高中生物必修二有这个图
DNA转录先变成tRNA还是mRNA_123
xinxianyongqi2021-08-07
如题,有人提DNA时加入tRNA吗
我在一些文献上看到说,要加入tRNA as carrier,但是这句话不好理解
有没有人用过,跟我讲讲tRNA到底有什么用
多谢指教
RNA提取试剂盒很多家都有 都不错 楼主可以看看呢本数据来源于百度地图,最终结果以百度地图最新数据为准。
【求助】rna提取疑问123
woodyqlee2021-08-05
各位大侠好,我想做有关CDNA文库构建的东西,但是不知道改用何种方法提取mRNA,现在好像流行用trazol提RNA,但是不知道提取出来的RNA质量如何,能不能保证其中的没有剪切之前的mRNA的内含子不被降解?如果不行,那用什么办法好?多谢了。
另外还有,提完RNA后用RNase-freeDNase处理RNA会不会影响RNA的质量?
拜求各位高手,我在构建CDNA文库的时候总是有rRNA,请问怎样去除?
谢谢了!
请问有关线粒体基因组研究中,发表文章的tRNA二级结构图是用什么软件做的.例如:
谁在用Thermo 的K1622反转录试剂盒123
小灰灰_淘惹52021-08-01
Thermo 反转录试剂盒K1622使用说明Thermo Scientific RevertAid First Strand cDNA Synthesis Kit是一套用于以RNA为模板高效合成第一链cDNA的完整系统,可合成长达13kb的cDNA。试剂盒配套提供的RiboLockRNase Inhibitor,可有效防止RNA模板的降解。试剂盒配套提供oligo(dT)18引物和随机六聚体引物。oligo(dT)18引物可以选择性地 与mRNA中的poly (A)尾结合。随机六聚体引物无需poly (A)尾,因此可转录mRNA 5’-端区域,也可以无poly (A)尾的RNA (如micoRNA)为模板合成cDNA。该试剂盒也可使用基因特异性引物。Thermo 反转录试剂盒K1622使用说明优点:• 合成全长的第一链cDNA,最长可合成13kb的cDNA• 最佳反应温度为42℃• 完全一提供RT反应所需的所有组分应用:• 第一链cDNA合成,作为RT-PCR和实时RT-qPCR的模板• 构建全长cDNA文库• 反义RNA合成Thermo 反转录试剂盒K1622使用说明RevertAid First Strand cDNA Synthesis Kit合成全长cDNA1 μg小鼠心脏总RNA作为模板,用oligo(dT)18 引物进行逆转录反应。由此合成的cDNA,再作为Taq DNA Polymerase后续PCR扩增的模板。末端2024 bp片段的成功扩增,表明长度为13.8 kb的全长RN***段得到成功的逆转录。
不管是扫描的图片或文本格式,只要简明且扼要
rizol和试剂盒提rna的区别目的掌握RNA提取的基本技术,了解RNA提取过程中的各种注意事项、原理RNA提取是分子生物学实验中难度较大的实验技术,因为它们都是核酸,都具有较好的水溶性。二,然后用提取液将RNA溶出。RNA提取和DNA提取有类似的地方。提取RNA首先破碎细胞
是否需要纯化,还需进一步检测才能确定
1、测浓度和纯度,是否达标
2、跑电泳看条带是否与测的数据相互印证
如果上述两点满足,就不需要纯化,否则需要进一步纯化。
不过根据经验,一般都不需要,我们实验室用的是GNT系列的试剂盒,提取结果就直接进入下游实验了,效果挺稳定
质粒是真核细胞细胞核外或原核生物拟核区外能够进行自主复制的遗传单位,包括真核生物的细胞器(主要指线粒体和叶绿体)中和细菌细胞拟核区以外的环状脱氧核糖核酸(DNA)分子.现在习惯上用来专指细菌(大肠杆菌)、酵母菌和放线菌等生物中细胞核或拟核中的DNA以外的DNA分子.
小鼠没有叶绿体,你可以直接参照小鼠线粒体的提取方法进行提取.
天跟试剂盒提取多糖多酚植物总rna浓度一直很低是什么原因
用醌指纹法描述微生物群落的参数[7]有:(1)醌的类型和不同类型的醌的数目;(2)占优势的醌及其摩尔分数含量;(3)总的泛醌和总的甲基萘醌的摩尔分数之比;(4)醌的多样性和均匀性;(5)醌的总量等。对两个不同的群落,由上述分析所得数据可以计算出另一个参数____非相似性指数(D),用于定量比较两个群落结构的差异。
醌指纹法具有简单快速的特点,近几年来广泛用于各种环境微生物样品(如土壤,活性污泥和其它水生环境群落)的分析。
众所周知,RNA是一种相当不稳定的分子,它在这一方面可比DNA差远了。我们大家在实验室里基本上都耳闻目睹过,处理这种核酸时发生的悲惨故事。幸运的是,随着RNA研究逐渐成为主流,可供选择的商业化工具也越来越丰富越来越成熟。
RNA制备过程中究竟有哪些问题需要注意,又有哪些工具可以助我们一臂之力呢,且听下文分解。
RNA制备的四大祸害碱性条件、金属离子和高温都会促使RNA分子水解。因此,RNA操作一般在0°C-4°C的中性或微酸性缓冲液中进行,人们也常常在其中添加螯合剂,比如0.1mMEDTA。有些应用不允许EDTA的存在,这时可以通过离子交换树脂来去除阳离子。
在制备RNA时,RNase一直是个令人头疼的大问题,因为这种酶基本上无处不在。生物样品本来就含有RNase,它们存在于细胞的小隔间里,当细胞被裂解时这些RNase就释放出来。另外,实验室操作也很容易引入RNase。“这种酶到处都是,我们皮肤细胞上就有。如果你戴着手套接触了脸或者手臂,也会沾到一些RNase,”Promega公司的产品经理EricVincent提醒道。
在收获组织或细胞时,“提取RNA要越快越好,或者就想办法令RNase失活,”NEB公司的RNA研究带头人BretRobb指出。
如果不能立刻提取RNA,就应当通过速冻来稳定样本,或者将样本储存在特殊的RNA保存液中,比如AllProtectTissueReagent、RNAlater。此外,PreAnalytiX公司的PAXgeneBloodRNATube也很适合保存这样的样本,“不仅能确保RNA的安全,而且让细胞不会因为温度或缓冲液条件的改变表达任何转录本,”Qiagen公司的MartinSchlumpberger介绍道。PreAnalytiX是BD和QIAGEN的一个合资公司。
绝大多数RNA分离试剂盒中的裂解缓冲液(例如Qiagen公司的RNAEasy),“可以失活任何样本所带的RNAse,”Schlumpberger解释道。“这些产品对于RNA来说是相当安全的。”如果你更喜欢自己DIY,那么异硫氰酸胍、酚/氯仿和SDS都能帮你保护样本中的RNA。
据介绍,RNA纯化之后对环境中的RNAse最为敏感,这个时候需要特别注意预防RNAse的污染。
可不可以做到万无一失如何才能保证RNA实验的成功,这已经是一个老生常谈的问题了。RNA操作时应该戴上一次性手套,并且在专门的空间里进行,尤其要与质粒制备和细菌操作分开。操作者尽量不要接触洁净度不能令人百分百放心的物品。
我们来看看NEB公司是如何做到万无一失的。NEB公司的RNA实验室统一使用RNA专用的一次性耗材。他们认为高压灭菌会使溶液中的微生物释放出RNase,而这些RNase会在灭菌之后复性。因此NEB公司只信任经过认证的无RNAse器皿,抛弃了高压灭菌过程。Robb介绍道,目前市面上有许多经过认证的RNA专用产品(试剂盒、试剂和耗材),进行RNA实验已经比十几年前容易得多了。
“过去人们在配制溶液的时候总是胆战心惊,恨不得屏住呼吸进行称量和搅拌,以免把RNase带到样本中去,”他解释道。而现在,你可以很方面的买到各种无RNAse的试剂,从水、1MTris到5MNaCl。“使用这些试剂可以为RNA实验提供额外的保障。”
许多无核酶的塑料产品都经过了第三方的检测和认证,MoBioLaboratories就提供这样的服务。“我们可以帮助制造商建立始终如一的无污染生产线,”培训操作者如何识别和消除污染源,MoBio公司的CarlTsang介绍道。
我国大多数实验室还是使用玻璃器皿,这些器皿至少需要在180°C的条件下烘烤几个小时,才能确保将RNAse永久性地摧毁。之后,研究者们可以通过商业化的试剂盒进行RNAse检测,比如NEB公司的RNAse污染分析试剂盒。
添加剂的使用DEPC(Diethylpyrocarbonate)一直被用于处理水和溶液,失活其中的RNAse。“多余的DEPC可以在高压锅中去除,因为DEPC在高温下很不稳定,会释放出CO2然后消失,”Schlumpberger说。不过许多人并不爱和这种可能致癌的化合物打交道,Schlumpberger强调,如果没有正确处理,残余的DEPC也会使RNA失活。
对于那些不能高压灭菌的器物,我们可以用RNaseAway试剂处理,然而将其浸泡在无RNAse的水里。
Vincent指出,RNAse抑制剂的使用应当成为常规。以Promega公司的RNAsin为例,RNAse抑制剂能够特异性结合并抑制实验室中常见的RNAse,包括RNAseA、B、C和人胎盘RNAse。“等你发现引入了RNAse时往往已经太迟了,多加一层保险是很有必要的,”他说。
只要我们了解威胁RNA的主要因素(高pH、高温、金属离子和内切酶),就能够想办法一一化解。这时你会发现,RNA制备其实并没有那么难。
http://seq.cn/article-10584-1.html