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Kapa biosystems/KAPA RNA HyperPrep Kits with RiboErase (HMR)/KK8561/96 libraries

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Kapa biosystems/KAPA RNA HyperPrep Kits with RiboErase (HMR)/KK8561/96 libraries

品牌 /

kapabiosystems

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KK8561

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CompleteKit

KAPARNAHyperPrepKitswithRiboErase(HMR)

Single-DayRNA

TheKAPARNAHyperPrepKitswithRiboErase(HMR)utilizenovelchemistrythatenablesthecombinationofenzymaticstepsandfewerreactionpurifications,resultinginatrulystreamlinedsolutionforthepreparationofhigh-qualityrRNA-depletedRNA-seqlibraries.Byutilizingatargetedenzymaticmethodfordepletion,ourworkflowenablesefficientreductionofribosomalRNA(rRNA)andamorecompleterepresentationofthetranscriptome,includingprecursormRNAsandnon-codingRNA(ncRNA).Thestrand-specificworkflowisflexIBLe–supportinglibraryconstructionfromlower-inputamountsanddegradedsamples.KitscontainallreagentsrequiredforrRNAdepletionandlibrarypreparation,withtheexceptionofKAPAAdapters(availableseparately).Benefitsinclude:

single-daylibraryconstruction,inclusiveofrRNAdepletion
reducedhands-onandoveralltimethroughfewerenzymaticandreactioncleanups
flexibleinputof25ng–1µgtotalRNAfromhuman,mouse,orratspecies*
highersuccessrateswithlowerinputanddegradedsamples
maintainover99%strandspecificity*
KAPAPureBeadsincludedforreactionpurifications

NEW!KAPADual-IndexedAdapterKitsarenowavailable. FormoreinformationonKAPAAdapterKits,scrolldowntotheOrderingsection,ordownloadtheKAPAAdapterandBeadCalculator.DownloadourAdapterandBeadCalculator

^*Dataonfile.ForResearchUseOnly.Notforuseindiagnosticprocedures.

ProductHighlights

The KAPA RNA Hyper Prep Kit with RiboErase (HMR) results in a reduction in the total number of reads wasted due to both PCR duplicates and alignment to rRNA loci in comparison to the TruSeq and NEBNext kits. Libraries were generated in quadruplicate with 25 ng of high-quality Universal Human Reference (UHR) RNA using the manufacturers’ standard recommendations per workflow, where possible. Sequencing was performed using an Illumina HiSeq® 2500 in High Output mode with v4 chemistry and 2 x 100 bp read length. Reads aligning to rRNA were removed and paired reads were randomly subsampled to 14M for comparative analyses, including marked duplicates. Data on file.

Better utilize sequencing capacity. (B) Libraries were generated in quadruplicate with 25 ng (rRNA depletion) and 50 ng (mRNA capture) of high-quality UHR RNA using the manufacturers’ standard recommendations per workflow, where possible. Data on file.

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Sequencewhatmatters

WastefewerreadsduetothecombinationofrRNAcarryoverandPCRduplicates
Identifymoreuniquetranscriptsandgeneswithequivalentsequencing

Improved coverage uniformity. For the top 1000 transcripts, the KAPA RNA HyperPrep workflows result in more even coverage across transcript lengths, as assessed by both a normalized coverage plot and coverage coefficient of variation (CV), in comparison to competitor workflows. (A) Libraries were generated with 25 ng (rRNA depletion) and 50 ng (mRNA capture) of high-quality UHR RNA using the manufacturers’ standard recommendations per workflow, where possible. Data on file.

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Achievesuperiorcoverageuniformity

Obtainmoreuniformdistributionofreadsacrosstranscripts
ImprovecoverageofdifficultGC-richtranscripts

Identify more genes and transcripts. With equivalent sequencing, the KAPA RNA HyperPrep Kit with RiboErase (HMR) in comparison to competitor workflows identified more genes and transcripts. Data on file.

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Generatehigh-qualitylibrariesfromdegradedsamples

Inputaslittleas25ngwithFFPEsamples,dependingontotalRNAquality
Achievelowduplicationratesandhighlyefficient,reproduciblerRNAremovalwithdegradedsamples
Identifymoreuniquetranscriptsandgeneswithequivalentsequencing

High-level of agreement between paired FFPE and fresh frozen expression data, in transcripts per million (TPM). Pearson correlation coefficients show a higher degree of agreement with the KAPA RNA Hyper Prep Kit with RiboErase in comparison to the TruSeq Stranded Total RNA Library Prep with Ribo-zero Gold and NEBNext Ultra Directional Library Preparation with the rRNA Depletion Kit. Libraries were generated in duplicate using 100 ng inputs of paired FFPE-derived and fresh frozen breast tumor total RNA samples using the manufacturers’ standard recommendations per workflow. Sequencing was performed using an Illumina HiSeq® 2500 in High Output mode with v4 chemistry and 2 x 100 bp read length. Reads aligning to rRNA were removed and paired reads were randomly subsampled to 14M for comparative analyses, including marked duplicates. Data on file.

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Achievereliableresultswithdegradedinputs

Attainahigh-degreeofexpressioncorrelationbetweenpairedFFPEandfreshfrozensampleswhichprovidesincreasedconfidenceinsequencedataaccuracy

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Applications:

Applications

Wholetranscriptome
Geneexpressionanalysis
Detectionofgenefusions,isoforms,andotherstructuralvariants
Noveltranscriptidentification,includingnoncodingtranscripts
SNVdiscovery

KitSpecificationsandContents/Storage:

KitSpecificationsandContents/Storage

EnzymesandbuffersforrRNAdepletion,CDNAsynthesis,andlibrarypreparationcanbestoredforupto10monthsat-20°C.KAPAPureBeadscanbestoredforupto10monthsat4°C.(USonly)

KitscontainHybridizationBuffer,HybridizationOligos(HMR),DepletionBuffer,RNaseH,DNaseBuffer,DNase,Fragment,PrimeandEluteBuffer(2X),1stStrandSynthesisBuffer,KAPAScript,2ndMarkingBuffer,2ndStrandSynthesis&A-TailingEnzymeMix,LigationBuffer,DNALigase,PEG/NaClSolution,KAPAPureBeads,LibraryAmplificationPrimerMix(10X),andKAPAHiFiHotStartReadyMix(2X).

RNAHyperRibo_Component Chart

Specifications

CompatiblePlatform

0616

LibraryType

RNA

StartingMaterial

High-qualityanddegradedtotalRNA

InputAmount

25ng–1µg

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Java中的Infinity和NaN_码小农_java infinity

2019-01-23

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QQ在线状态

2018-08-27

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AxyPrep 细菌基因组 DNA

2021-07-25

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2018-07-11

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2021-08-01

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兔心脏取血

2021-08-05

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2021-09-03

Paragon Genomics/816008/CleanPlex™ 测序文库制备试剂盒/现货，Paragon Genomics是一家位于美国硅谷的生命科技初创公司。我们致力于开发具有突破性且易于使用的超高多重PCR技术, 用于基因组分析和临床诊断市场。我们的核心技术将首先应用于下一代基因测序文库制备市场，从而实现更准确, 更快, 并且更便宜的DNA测序样品制备和个体化医疗。查看更多>

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NEBNext Small RNA 多样本文库制备试剂盒 Illumina(试剂盒 1)

2018-03-24

Enzymatics国内代理面议上海市苏州蚂蚁淘实验试剂有限公司 2016-11-24 在线询价>猜你喜欢人白细胞分化抗原30(CD30)ELISA试剂盒本生(天津)健康科技有限公司人... 查看更多>

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2019-02-04

罗氏诊断产品（上海）有限公司在发布的 KAPA DNA Hyper Prep文库制备试剂盒供应信息，浏览与 KAPA DNA Hyper Prep文库制备试剂盒相关的产品或在搜索更多与 KAPA DNA Hyper Prep文库制备试剂盒相关的内容。查看更多>

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关于tRNA和氨基酸的对应问题生理生化与组织胚胎123

kewanhai2021-08-17

众所周知，氨基酸和那个密码子，只是通过那个密码子表的对应关系，对应起来的。但是呢，氨基酸和tRNA反密码子，对应又是通过那个氨基酰-tRNA合成酶催化作用产生的，为什么那个酶有那么大的功能呢，有没有那个文献解释？

QIAGEN RNeasy Plant Mini试剂盒提取总RNA123

西子IK56TR492017-10-12

求助QIAGEN试剂盒提取总RNA的步骤
植物材料用最精确的方法，称取不超过100mg的植物材料，置于处理过的研钵，加入液氮进行研磨将研磨得到的粉末，快速转移至无RNase，并经过液氮冷却的2mL离心管(自备)，

tRNA的种类和功能123

Qzhaotingting2017-10-12

tRNA（又叫转运RNA）约含70~100个核苷酸残基，是分子量最小的RNA，占RNA总量的16%，现已发现有100多种。tRNA的主要生物学功能是转运活化了的氨基酸，参与蛋白质的生物合成。
各种tRNA的一级结构互不相同，但它们的二级结构都呈三叶草形。这种三叶草形结构的主要特征是，含有四个螺旋区、三个环和一个附加叉。四个螺旋区构成四个臂，其中含有3′末端的螺旋区称为氨基酸臂，因为此臂的3′-末端都是C-C-A-OH序列，可与氨基酸连接。三个环分别用Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ表示。环Ⅰ含有5，6二氢尿嘧啶，称为二氢尿嘧啶环（DHU环）。环Ⅱ顶端含有由三个碱基组成的反密码子，称为反密码环；反密码子可识别mRNA分子上的密码子，在蛋白质生物合成中起重要的翻译作用。环Ⅲ含有胸苷（T）、假尿苷（ψ）、胞苷（C），称为TψC环；此环可能与结合核糖体有关。tRNA在二级结构的基础上进一步折叠成为倒“L”字母形的三级结构（图3-2-6）。
tRNA分子中稀有碱基的数量是所有核酸分子中比例最高的，这些稀有碱基的来源是转录之后经过加工修饰形成的。
tRNA共有61种，对应61种氨基酸的密码子（64种密码子中，2个是起始密码子，且对应一定氨基酸；3个是终止密码子，不对应氨基酸）

【求助】Takara 的cDNA文库构建试剂盒?? 核酸基因技术讨论版...123

txm10212007-05-22

本人要构建一个CDNA文库，现在不知道如何选择
请问各位战友们，有没有用过Takara的cDNA文库构建试剂盒啊？效果如何呀？

谢谢各位指导！

天根DP441多糖多酚植物总RNA提取试剂盒123

陪着我就好__╰2017-10-12

是否需要纯化，还需进一步检测才能确定
1、测浓度和纯度，是否达标
2、跑电泳看条带是否与测的数据相互印证
如果上述两点满足，就不需要纯化，否则需要进一步纯化。
不过根据经验，一般都不需要，我们实验室用的是GNT系列的试剂盒，提取结果就直接进入下游实验了，效果挺稳定
质粒是真核细胞细胞核外或原核生物拟核区外能够进行自主复制的遗传单位,包括真核生物的细胞器（主要指线粒体和叶绿体）中和细菌细胞拟核区以外的环状脱氧核糖核酸(DNA)分子.现在习惯上用来专指细菌(大肠杆菌）、酵母菌和放线菌等生物中细胞核或拟核中的DNA以外的DNA分子.
小鼠没有叶绿体,你可以直接参照小鼠线粒体的提取方法进行提取.

全长cDNA文库的构建方法123

doublehorses2021-08-08

我想构建一个细胞的全长CDNA文库，不知哪位大虾用过Clontech公司的SMARTcDNALibraryConstructionKit。效果怎么样？价位大约多少？还有无其它试剂盒？谢谢！！！

cDNA文库构建实验方法 123

zengyuzhen2021-08-20

非常欢迎您经常来到核酸版！请您下次发帖时规范发帖！老战友了就不要被标记为“不规范发帖”，规范了应助的人就会很多的。谢谢了。

实验非常不顺，想构建CDNA文库，但是从mRNA开始屡次失败，考虑主要是纯化过程中损失过多。想从总RNA入手，但是不知道实验步骤。不知那位大侠能提供总RNA建库的实验步骤。另外我现在手头有OligoDT,RT酶，苦于没有第二连合成 试剂盒，不知道能否用普通PCR试剂盒Teq酶替代第二链合成过程中的DNA聚合酶I。好像有种方法合成第二链时，不需要另外的引物，利用降解的RNA作引物即可，我想直接设定PCR两个循环，合成第二链，不知方法可行否？愁啊，等着毕业，时间紧急，恳请帮忙。谢谢。

用Trizol法和试剂盒哪种提RNA更好？核酸基因技术123

许子瑜V5GDW2017-10-12

rizol和试剂盒提rna的区别目的掌握RNA提取的基本技术，了解RNA提取过程中的各种注意事项、原理RNA提取是分子生物学实验中难度较大的实验技术，因为它们都是核酸，都具有较好的水溶性。二，然后用提取液将RNA溶出。RNA提取和DNA提取有类似的地方。提取RNA首先破碎细胞

【交流/求助】质粒提取试剂盒溶液1中RNA酶的浓度是多少? 分子...123

Ydfvgddvi2021-08-16

RNase指需要加在solution 1里面,就是悬浮菌液的那种液体.裂解液2和酸性溶液3不用加. 不同的盒子加的量多少是不一样的,其实多加点少加点关系也不大.

实验一、RNA提取方法及原理123

温柔_踿2隤2017-10-10

beta-巯基乙醇是还原剂，可以还原蛋白高级结构中的二硫键，解开蛋白的高级结构，有一些裂解液中加入beta-巯基乙醇以后，裂解液的保质期会变短。

请教:TRNA保存于20度(未加DEPCH2o),安全吗、? PCR技术讨论版...123

smilingfish2021-07-28

TRNA保存于－20度（未加DEPC－H2o），安全吗、？可以保存多长时间？

总RNA提取试剂盒使用说明 123

小豪25162017-11-07

提取总RNA的方法现在主要的就是用商用试剂盒，比如凯杰，欧米伽等厂家，还有就是用传统的酚氯仿，trizol提取，一般trizol提取的质量相对比较好，但是操作起来比较麻烦，全程冰上操作，包括离心，这要看你们实验室有没有相应的试剂或仪器了，如果用商用试剂盒的话，通常是针对比较特殊的要求的样本的，比如石蜡样本，植物样本等，你需要根据你的样本类型选择不同的试剂，你可以咨询一下凯杰生物的技术支持