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Kapa biosystems/KAPA RNA HyperPrep Kits with RiboErase (HMR)/KK8702/12 adapters x 40 µl each
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Kapa biosystems/KAPA RNA HyperPrep Kits with RiboErase (HMR)/KK8702/12 adapters x 40 µl each
品牌 / 
kapabiosystems
货号 / 
KK8702
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Description:

KAPASingle-IndexedAdapterKit,SetB(30µM)

KAPARNAHyperPrepKitswithRiboErase(HMR)

Single-DayRNA

TheKAPARNAHyperPrepKitswithRiboErase(HMR)utilizenovelchemistrythatenablesthecombinationofenzymaticstepsandfewerreactionpurifications,resultinginatrulystreamlinedsolutionforthepreparationofhigh-qualityrRNA-depletedRNA-seqlibraries.Byutilizingatargetedenzymaticmethodfordepletion,ourworkflowenablesefficientreductionofribosomalRNA(rRNA)andamorecompleterepresentationofthetranscriptome,includingprecursormRNAsandnon-codingRNA(ncRNA).Thestrand-specificworkflowisflexIBLe–supportinglibraryconstructionfromlower-inputamountsanddegradedsamples.KitscontainallreagentsrequiredforrRNAdepletionandlibrarypreparation,withtheexceptionofKAPAAdapters(availableseparately).Benefitsinclude:

  • single-daylibraryconstruction,inclusiveofrRNAdepletion
  • reducedhands-onandoveralltimethroughfewerenzymaticandreactioncleanups
  • flexibleinputof25ng–1µgtotalRNAfromhuman,mouse,orratspecies*
  • highersuccessrateswithlowerinputanddegradedsamples
  • maintainover99%strandspecificity*
  • KAPAPureBeadsincludedforreactionpurifications

NEW!KAPADual-IndexedAdapterKitsarenowavailable. FormoreinformationonKAPAAdapterKits,scrolldowntotheOrderingsection,ordownloadtheKAPAAdapterandBeadCalculator.DownloadourAdapterandBeadCalculator

 

*Dataonfile.
ForResearchUseOnly.Notforuseindiagnosticprocedures.

ProductHighlights

Sequencewhatmatters

  • WastefewerreadsduetothecombinationofrRNAcarryoverandPCRduplicates
  • Identifymoreuniquetranscriptsandgeneswithequivalentsequencing

Achievesuperiorcoverageuniformity

  • Obtainmoreuniformdistributionofreadsacrosstranscripts
  • ImprovecoverageofdifficultGC-richtranscripts

Generatehigh-qualitylibrariesfromdegradedsamples

  • Inputaslittleas25ngwithFFPEsamples,dependingontotalRNAquality
  • Achievelowduplicationratesandhighlyefficient,reproduciblerRNAremovalwithdegradedsamples
  • Identifymoreuniquetranscriptsandgeneswithequivalentsequencing

Achievereliableresultswithdegradedinputs

  • Attainahigh-degreeofexpressioncorrelationbetweenpairedFFPEandfreshfrozensampleswhichprovidesincreasedconfidenceinsequencedataaccuracy

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Library Amplification

KAPALibraryAmplificationKits

Library Preparation

KAPAHyperPrepKits

Library Quantification

KAPALibraryQuantificationKits

Applications:

Applications
  • Wholetranscriptome
  • Geneexpressionanalysis
  • Detectionofgenefusions,isoforms,andotherstructuralvariants
  • Noveltranscriptidentification,includingnoncodingtranscripts
  • SNVdiscovery

KitSpecificationsandContents/Storage:

KitSpecificationsandContents/Storage

EnzymesandbuffersforrRNAdepletion,CDNAsynthesis,andlibrarypreparationcanbestoredforupto10monthsat-20°C.KAPAPureBeadscanbestoredforupto10monthsat4°C.(USonly)

KitscontainHybridizationBuffer,HybridizationOligos(HMR),DepletionBuffer,RNaseH,DNaseBuffer,DNase,Fragment,PrimeandEluteBuffer(2X),1stStrandSynthesisBuffer,KAPAScript,2ndMarkingBuffer,2ndStrandSynthesis&A-TailingEnzymeMix,LigationBuffer,DNALigase,PEG/NaClSolution,KAPAPureBeads,LibraryAmplificationPrimerMix(10X),andKAPAHiFiHotStartReadyMix(2X).

RNAHyperRibo_Component Chart

Specifications

Spec
Description
CompatiblePlatform
0616
LibraryType
RNA
StartingMaterial
High-qualityanddegradedtotalRNA
InputAmount
25ng–1µg
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1.一次制备,-80度保存,多次使用,免去每次转化都要制备裂殖酵母感应态细胞。 2.操作简单,单溶液制备,除酵母培养的时间外,整个操作只需30分钟。 3.主要用于裂殖酵母S.pombe,其他多种实验用酵母菌株最好选用酵母化学感受态细胞制备试剂(CAT#:81109)。 4.受体酵母可以不含质粒,也可用于携带有多种选择性的酵母(如双杂交体系中的酵母) 查看更多>
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本公司生产的Competent Cell Preparation Kit是一种方便、高效、快速制备感受态细胞的试剂盒。使用本试剂盒制备的感受态细胞可以满足大多数实验的需要,并且适用于几乎所有常用的大肠杆菌,例如:E.coli DH5α、JM109、HB101、xl-1blue、等,转化效率均可以达到1×106 cfu/μg pUC19以上(转化效率根据大肠杆菌细胞系及转化用DNA不同稍有差异)。 查看更多>
2018-07-11
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求助QIAGEN试剂盒提取总RNA的步骤
样品处理:
a. 植物组织:取新鲜或-70℃冻存100mg组织在液氮中研磨,把粉末加入到1ml裂解液中混匀。
b. 动物组织:取新鲜或-70℃冻存100mg组织加1ml裂解液,用组织研磨杵或匀浆器匀浆处理。
c. 贴壁细胞:直接在培养板中加入裂解液裂解细胞,每106细胞加1ml 裂解液。用取样器吹打混匀。
细菌RNA试剂盒提完后有DNA污染,去除DNA的方法:做普通pcr,看看条带对不对。DNase I 处理,酚氯仿抽,然后isopropanol沉淀,DEPC水溶。 不需专门灭火,因为在反转录前有一个步骤是加热变性。一般是75度5min 后面取不超过40%反转录体积的RNA用于反转录,但反转录前最好检测一下RNA质量,免得浪费反转录酶。
但是,这样做的前提的,RNA提得要好,浓度要高,这样免得RNA降解到不能用了。因为在有二价阳离子的(DNAseI buffer含有)情况下,RNA在60度以上时必然发生非酶促降解。
全长cDNA文库的构建方法123
doublehorses2021-08-08
我想构建一个细胞的全长CDNA文库,不知哪位大虾用过Clontech公司的SMARTcDNALibraryConstructionKit。效果怎么样?价位大约多少?还有无其它试剂盒?谢谢!!!
艾思进三种试剂盒中的一个,就这三种试剂盒,比较可以的。
众所周知,RNA是一种相当不稳定的分子,它在这一方面可比DNA差远了。我们大家在实验室里基本上都耳闻目睹过,处理这种核酸时发生的悲惨故事。幸运的是,随着RNA研究逐渐成为主流,可供选择的商业化工具也越来越丰富越来越成熟。
RNA制备过程中究竟有哪些问题需要注意,又有哪些工具可以助我们一臂之力呢,且听下文分解。
RNA制备的四大祸害碱性条件、金属离子和高温都会促使RNA分子水解。因此,RNA操作一般在0°C-4°C的中性或微酸性缓冲液中进行,人们也常常在其中添加螯合剂,比如0.1mMEDTA。有些应用不允许EDTA的存在,这时可以通过离子交换树脂来去除阳离子。
在制备RNA时,RNase一直是个令人头疼的大问题,因为这种酶基本上无处不在。生物样品本来就含有RNase,它们存在于细胞的小隔间里,当细胞被裂解时这些RNase就释放出来。另外,实验室操作也很容易引入RNase。“这种酶到处都是,我们皮肤细胞上就有。如果你戴着手套接触了脸或者手臂,也会沾到一些RNase,”Promega公司的产品经理EricVincent提醒道。
在收获组织或细胞时,“提取RNA要越快越好,或者就想办法令RNase失活,”NEB公司的RNA研究带头人BretRobb指出。
如果不能立刻提取RNA,就应当通过速冻来稳定样本,或者将样本储存在特殊的RNA保存液中,比如AllProtectTissueReagent、RNAlater。此外,PreAnalytiX公司的PAXgeneBloodRNATube也很适合保存这样的样本,“不仅能确保RNA的安全,而且让细胞不会因为温度或缓冲液条件的改变表达任何转录本,”Qiagen公司的MartinSchlumpberger介绍道。PreAnalytiX是BD和QIAGEN的一个合资公司。
绝大多数RNA分离试剂盒中的裂解缓冲液(例如Qiagen公司的RNAEasy),“可以失活任何样本所带的RNAse,”Schlumpberger解释道。“这些产品对于RNA来说是相当安全的。”如果你更喜欢自己DIY,那么异硫氰酸胍、酚/氯仿和SDS都能帮你保护样本中的RNA。
据介绍,RNA纯化之后对环境中的RNAse最为敏感,这个时候需要特别注意预防RNAse的污染。
可不可以做到万无一失如何才能保证RNA实验的成功,这已经是一个老生常谈的问题了。RNA操作时应该戴上一次性手套,并且在专门的空间里进行,尤其要与质粒制备和细菌操作分开。操作者尽量不要接触洁净度不能令人百分百放心的物品。
我们来看看NEB公司是如何做到万无一失的。NEB公司的RNA实验室统一使用RNA专用的一次性耗材。他们认为高压灭菌会使溶液中的微生物释放出RNase,而这些RNase会在灭菌之后复性。因此NEB公司只信任经过认证的无RNAse器皿,抛弃了高压灭菌过程。Robb介绍道,目前市面上有许多经过认证的RNA专用产品(试剂盒、试剂和耗材),进行RNA实验已经比十几年前容易得多了。
“过去人们在配制溶液的时候总是胆战心惊,恨不得屏住呼吸进行称量和搅拌,以免把RNase带到样本中去,”他解释道。而现在,你可以很方面的买到各种无RNAse的试剂,从水、1MTris到5MNaCl。“使用这些试剂可以为RNA实验提供额外的保障。”
许多无核酶的塑料产品都经过了第三方的检测和认证,MoBioLaboratories就提供这样的服务。“我们可以帮助制造商建立始终如一的无污染生产线,”培训操作者如何识别和消除污染源,MoBio公司的CarlTsang介绍道。
我国大多数实验室还是使用玻璃器皿,这些器皿至少需要在180°C的条件下烘烤几个小时,才能确保将RNAse永久性地摧毁。之后,研究者们可以通过商业化的试剂盒进行RNAse检测,比如NEB公司的RNAse污染分析试剂盒。
添加剂的使用DEPC(Diethylpyrocarbonate)一直被用于处理水和溶液,失活其中的RNAse。“多余的DEPC可以在高压锅中去除,因为DEPC在高温下很不稳定,会释放出CO2然后消失,”Schlumpberger说。不过许多人并不爱和这种可能致癌的化合物打交道,Schlumpberger强调,如果没有正确处理,残余的DEPC也会使RNA失活。
对于那些不能高压灭菌的器物,我们可以用RNaseAway试剂处理,然而将其浸泡在无RNAse的水里。
Vincent指出,RNAse抑制剂的使用应当成为常规。以Promega公司的RNAsin为例,RNAse抑制剂能够特异性结合并抑制实验室中常见的RNAse,包括RNAseA、B、C和人胎盘RNAse。“等你发现引入了RNAse时往往已经太迟了,多加一层保险是很有必要的,”他说。
只要我们了解威胁RNA的主要因素(高pH、高温、金属离子和内切酶),就能够想办法一一化解。这时你会发现,RNA制备其实并没有那么难。
http://seq.cn/article-10584-1.html
tRNA的种类和功能123
Qzhaotingting2017-10-12
tRNA(又叫转运RNA)约含70~100个核苷酸残基,是分子量最小的RNA,占RNA总量的16%,现已发现有100多种。tRNA的主要生物学功能是转运活化了的氨基酸,参与蛋白质的生物合成。
各种tRNA的一级结构互不相同,但它们的二级结构都呈三叶草形。这种三叶草形结构的主要特征是,含有四个螺旋区、三个环和一个附加叉。四个螺旋区构成四个臂,其中含有3′末端的螺旋区称为氨基酸臂,因为此臂的3′-末端都是C-C-A-OH序列,可与氨基酸连接。三个环分别用Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ表示。环Ⅰ含有5,6二氢尿嘧啶,称为二氢尿嘧啶环(DHU环)。环Ⅱ顶端含有由三个碱基组成的反密码子,称为反密码环;反密码子可识别mRNA分子上的密码子,在蛋白质生物合成中起重要的翻译作用。环Ⅲ含有胸苷(T)、假尿苷(ψ)、胞苷(C),称为TψC环;此环可能与结合核糖体有关。tRNA在二级结构的基础上进一步折叠成为倒“L”字母形的三级结构(图3-2-6)。
tRNA分子中稀有碱基的数量是所有核酸分子中比例最高的,这些稀有碱基的来源是转录之后经过加工修饰形成的。
tRNA共有61种,对应61种氨基酸的密码子(64种密码子中,2个是起始密码子,且对应一定氨基酸;3个是终止密码子,不对应氨基酸)
各位大哥大姐,我要构建文库,要分离mRNA,因为是第一次做,所以很多都不清楚,请问哪种从总RNA中分离mRNA的试剂盒比较好用一点?能否推荐一下?:?)
【求助】rna提取疑问123
woodyqlee2021-08-05
各位大侠好,我想做有关CDNA文库构建的东西,但是不知道改用何种方法提取mRNA,现在好像流行用trazol提RNA,但是不知道提取出来的RNA质量如何,能不能保证其中的没有剪切之前的mRNA的内含子不被降解?如果不行,那用什么办法好?多谢了。
另外还有,提完RNA后用RNase-freeDNase处理RNA会不会影响RNA的质量?
不管是扫描的图片或文本格式,只要简明且扼要
谁在用Thermo 的K1622反转录试剂盒123
小灰灰_淘惹52021-08-01
Thermo 反转录试剂盒K1622使用说明Thermo Scientific RevertAid First Strand cDNA Synthesis Kit是一套用于以RNA为模板高效合成第一链cDNA的完整系统,可合成长达13kb的cDNA。试剂盒配套提供的RiboLockRNase Inhibitor,可有效防止RNA模板的降解。试剂盒配套提供oligo(dT)18引物和随机六聚体引物。oligo(dT)18引物可以选择性地 与mRNA中的poly (A)尾结合。随机六聚体引物无需poly (A)尾,因此可转录mRNA 5’-端区域,也可以无poly (A)尾的RNA (如micoRNA)为模板合成cDNA。该试剂盒也可使用基因特异性引物。Thermo 反转录试剂盒K1622使用说明优点:• 合成全长的第一链cDNA,最长可合成13kb的cDNA• 最佳反应温度为42℃• 完全一提供RT反应所需的所有组分应用:• 第一链cDNA合成,作为RT-PCR和实时RT-qPCR的模板• 构建全长cDNA文库• 反义RNA合成Thermo 反转录试剂盒K1622使用说明RevertAid First Strand cDNA Synthesis Kit合成全长cDNA1 μg小鼠心脏总RNA作为模板,用oligo(dT)18 引物进行逆转录反应。由此合成的cDNA,再作为Taq DNA Polymerase后续PCR扩增的模板。末端2024 bp片段的成功扩增,表明长度为13.8 kb的全长RN***段得到成功的逆转录。
天跟试剂盒提取多糖多酚植物总rna浓度一直很低是什么原因
用醌指纹法描述微生物群落的参数[7]有:(1)醌的类型和不同类型的醌的数目;(2)占优势的醌及其摩尔分数含量;(3)总的泛醌和总的甲基萘醌的摩尔分数之比;(4)醌的多样性和均匀性;(5)醌的总量等。对两个不同的群落,由上述分析所得数据可以计算出另一个参数____非相似性指数(D),用于定量比较两个群落结构的差异。
醌指纹法具有简单快速的特点,近几年来广泛用于各种环境微生物样品(如土壤,活性污泥和其它水生环境群落)的分析。