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Boston Biochem/Thapsigargin/1138/1

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Boston Biochem

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1138/1

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Biological Activity

Potent inhibitor of sarco-endoplasmic reticulum Ca²⁺-ATPases. Causes ER stress; can be used to induce autophagy in mammalian cells.

Technical Data

M.Wt:

650.76

Formula:

C₃₄H₅₀O₁₂

Solubility:

Soluble to 100 mM in DMSO

Purity:

≥97%

Storage:

Desiccate at -20°C

CAS No:

67526-95-8

The technical data provided above is for guidance only.For batch specific data refer to the Certificate of Analysis.Tocris products are intended for laboratory research use only, unless stated otherwise.

Background References

Differential effects of endoplasmic reticulum stress-induced autophagy on cell survival.Ding et al.J.Biol.Chem., 2007;282:4702
Kinetics of thapsigargin-Ca²⁺-ATPase (sarcoplasmic reticulum) interaction reveals a two-step binding mechanism and picomolar inhibition.Davidson and VarholJ.Biol.Chem., 1995;270:11731
A tool coming of age: thapsigargin as an inhibitor of sarco-endoplasmic reticulum Ca²⁺-ATPases.Treiman et al.TiPS, 1998;19:131
Specific substitutions at amino acid 256 of the sarcoplasmic/endoplasmic reticulum Ca²⁺ transport ATPase mediate resistance to thapsigargin in thapsigargin-resistant hamster cells.Yu et al.J.Biol.Chem., 1998;273:3542

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Citations for Thapsigargin

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41Citations: Showing 1 - 10

Swelling-activated Ca2+ channels trigger Ca2+ signals in Merkel cells.Authors: Haeberle Et al.MBio;3:e1750
Caspase-mediated cleavage of IRE1 controls apoptotic cell commitment during endoplasmic reticulum stress.Authors: Shemorry Et al.Elife2019;8
Dysfunctional autophagy following exposure to pro-inflammatory cytokines contributes to pancreatic β-cell apoptosis.Authors: Lambelet Et al.Cell Death Dis2018;9:96
Hyperactivation of nuclear receptor coactivators induces PERK-dependent cell death.Authors: Hossain Et al.Oncotarget2018;9:11707
Mechanical regulation of stem-cell differentiation by the stretch-activated Piezo channel.Authors: He Et al.Nature2018;555:103
IP3 Receptors Preferentially Associate with ER-Lysosome Contact Sites and Selectively Deliver Ca²⁺ to Lysosomes.Authors: Atakpa Et al.Cell Rep2018;25:3180
Mitochondria-Derived Vesicles Deliver Antimicrobial Reactive Oxygen Species to Control Phagosome-Localized Staphylococcus aureus.Authors: Abuaita Et al.Cell Host Microbe2018;24:625
Increased sensitivity to apoptosis upon endoplasmic reticulum stress-induced activation of the unfolded protein response in chemotherapy-resistant malignant pleural mesothelioma.Authors: Xu Et al.Br J Cancer2018;119:65
Calcium-regulatory proteins as modulators of chemotherapy in human neuroblastoma.Authors: Florea Et al.Oncotarget2017;8:22876
Role of two sequence motifs of mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor in its survival-promoting activity.Authors: Mätlik Et al.Cell Death Dis2016;6:e2032

NCOA3 coactivator is a transcriptional target of XBP1 and regulates PERK-eIF2α-ATF4 signalling in breast cancer.Authors: Gupta Et al.Oncogene2016;35:5860

Presynaptic Spike Timing-Dependent Long-Term Depression in the Mouse Hippocampus.Authors: Andrade-Talavera Et al.Cereb Cortex2016;26:3637

Control of sensory neuron excitability by serotonin involves 5HT2C receptors and Ca2+-activated chloride channels.Authors: Salzer Et al.Neuropharmacology2016;110 (A):277

α-1 adrenoreceptors modulate GABA release onto ventral tegmental area DA neurons.Authors: Velásquez-Martínez Et al.Pflugers Arch2015;88:110

Binding of αherpesvirus Glycoprotein H to Surface α4β1-Integrins Activates Calcium-Signaling Pathways and Induces Phosphatidylserine Exposure on the Plasma Membrane.Authors: Azab Et al.Endocrinology2015;6

Calcium release through P2X4 activates calmodulin to promote endolysosomal membrane fusion.Authors: Cao Et al.PLoS One2015;209:879

Differential regulation of GnRH secretion in the preoptic area (POA) and the median eminence (ME) in male mice.Authors: Glanowska and MoenterNeuropharmacology2015;156:231

TMEM203 Is a Novel Regulator of Intracellular Calcium Homeostasis and Is Required for Spermatogenesis.Authors: Shambharkar Et al.J Cell Biol2015;10:e0127480

Caffeine Modulates Vesicle Release and Recovery at Cerebellar Parallel Fibre Terminals, Independently of Calcium and Cyclic AMP Signalling.Authors: Dobson Et al.J Neuroinflammation2015;10:e0125974

Orai1 and STIM1 mediate SOCE and contribute to apoptotic resistance of pancreatic adenocarcinoma.Authors: Kondratska Et al.PLoS One2014;1843:2263

Downregulation of BRCA1 protein in BCR-ABL1 leukemia cells depends on stress-triggered TIAR-mediated suppression of translation.Authors: Podszywalow-Bartnicka Et al.Biochim Biophys Acta2014;13:3727

Activation of ERK1/2 by store-operated calcium entry in rat parotid acinar cells.Authors: Soltoff and LannonPLoS One2013;8:e72881

Optogenetic probing and manipulation of the calyx-type presynaptic terminal in the embryonic chick ciliary ganglion.Authors: Egawa Et al.PLoS One2013;8:e59179

Endoplasmic reticulum membrane reorganization is regulated by ionic homeostasis.Authors: Varadarajan Et al.PLoS One2013;8:e56603

Activation of group I metabotropic glutamate receptors potentiates heteromeric kainate receptors.Authors: Rojas Et al.Mol Pharmacol2013;83:106

Recruitment of the intracellular Ca²⁺ by ultrashort electric stimuli: the impact of pulse duration.Authors: Semenov Et al.Cell Calcium2013;54:145

The expression and relaxant effect of bitter taste receptors in human bronchi.Authors: Grassin-Delyle Et al.Respir Res2013;14:134

Bradykinin-induced Ca²⁺ signaling in human subcutaneous fibroblasts involves ATP release via hemichannels leading to P2Y12 receptors activation.Authors: Pinheiro Et al.Cell Commun Signal2013;11:70

Asynchronous Ca²⁺ current conducted by voltage-gated Ca²⁺ (CaV)-2.1 and CaV2.2 channels and its implications for asynchronous neurotransmitter release.Authors: Few Et al.Proc Natl Acad Sci U S A2012;109:E452

ER stress induces anabolic resistance in muscle cells through PKB-induced blockade of mTORC1.Authors: Deldicque Et al.PLoS One2011;6:e20993

Associative, bidirectional changes in neural signaling utilizing NMDA receptor- and endocannabinoid-dependent mechanisms.Authors: Li and BurrellLearn Mem2011;18:545

β1-Adrenergic receptors activate two distinct signaling pathways in striatal neurons.Authors: Meitzen Et al.J Neurochem2011;116:984

Dysregulation of presynaptic calcium and synaptic plasticity in a mouse model of 22q11 deletion syndrome.Authors: Earls Et al.PLoS One2010;30:15843

Plasticity of burst firing induced by synergistic activation of metabotropic glutamate and acetylcholine receptors.Authors: Moore Et al.Neuron2009;61:287

Calcium homeostasis and cone signaling are regulated by interactions between calcium stores and plasma membrane ion channels.Authors: Szikra Et al.PLoS One2009;4:e6723

H(2)O(2)-mediated modulation of cytosolic signaling and organelle function in rat hippocampus.Authors: Gerich Et al.J Neurosci2009;458:937

A crucial role for cAMP and protein kinase A in D1 DA receptor regulated intracellular calcium transients.Authors: Dai Et al.Neurosignals2008;16:112

The role of protein kinase A in the ethanol-induced increase in spontaneous GABA release onto cerebellar Purkinje neurons.Authors: Kelm Et al.J Neurophysiol2008;100:3417

Calcium release from presynaptic internal stores is required for ethanol to increase spontaneousγ-aminobutyric acid release onto cerebellum Purkinje neurons.Authors: Kelm Et al.Cell Cycle2007;323:356

Mechanism of graded persistent cellular activity of entorhinal cortex layer v neurons.Authors: Fransen Et al.Neuron2006;49:735

Two coincidence detectors for spike timing-dependent plasticity in somatosensory cortex.Authors: Bender Et al.J Neurosci2006;26:4166

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Usage Information

By Anonymouson 06/20/2020

Application: Species:Human

100 nM

PMID: 31453810Reference

Thapsigargin Blocks Re-Uptake of Ca2+ Into ER leading to increased T-cell activation by IFNg

By Li Zhuon 01/23/2019

Application: Species:Human

Thapsigargin was used to block SERCA in activated CD8+ T-cells. This maintained high intracellular Ca2+, leading to increased activation of CD8+ T-cells as measured by IFNg production via intracellular flow cytometry.

Intracellular calcium depletion

By Anonymouson 11/19/2018

Application: Species:Mouse

This compound is often used to deplete intracellular calcium stores in cell culture or other applications. It worked as expected in our tissue preparations.

Thapsigargin elicits store-operated Ca2+ entry after ER store depletion in RBL-2H3 cells.

By Niroj Shresthaon 10/27/2018

Application: Species:Rat

Cytosolic Ca2+ sensitive indicator, Fura-2 was loaded in RBL-2H3 cells and excited alternately at 340 and 380 nm and fluorescence was captured at 510 nm.ER store was depleted with 500 nM thapsigargin which promotes store-operated Ca2+ entry via STIM1/Orai1 pathway into the cells upon addition of 2 mM extracellular Ca2+.RBL-2H3 cells were loaded with FURA-2AM (2 μM) and Pluronic F127 (0.02%) for 30 min followed by washing with normal-Tyrode solution. Cells were stimulated at 1 Hz frequency and fluorescence intensities were measured.

XBP1 splicing

By Preethi Vijayarajon 05/01/2018

Application: Species:Human

Used it as a positive control to test if the mechanism of a novel small molecule (compound x) was to reduce ER stress.Cells were treated with 5um Thapsigargin for 24 hours, and splicing of XBP1 was determined by semi-quantitative RT-PCR

Thapsigargin calcium assay

By Anonymouson 12/12/2017

Application: Species:Human

for calcium release from the ER

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2018-10-04

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2021-07-17

2013年6月21日在上海举行的“第二代基因工程酶与二代测序技术专题研讨会”圆满的落下了帷幕。此次活动是由美国KAPABiosystems公司，上海希匹吉生物技术有限公司与生物３６０携手举办的一次全球最新DNA聚合酶开发技术与二代测序技术讲座，同时也是美国KAPABiosystems公司第1次在中国上海举办技术研讨会。本次活动为期半天，在学术气氛浓厚的中科院上海生命科学信息中心隆重召开。来自KAPABiosyst... 查看更多>

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2021-08-19

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2019-03-14

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2019-03-06

第二代DNA测序技术查看更多>

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2021-09-07

“微小残留病 (Minimal Residual Disease, MRD) 是指白血病/淋巴瘤/骨髓瘤患者经治疗缓释后，体内仍残留少量癌细胞的状态，其最终可能会引起疾病复发。因残留的癌细胞数量较少，不易察觉，所以需要一个更灵敏的MRD检测手段，这是实现个体化治疗的重要步骤。”围绕微小残留病（MRD）检测的争议之一是其评估的最佳技术。纽约纪念斯隆凯特琳癌症中心的Landgren教授在2017年美国血液学会（ASH）年会中接受采访，就MR... 查看更多>

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2021-08-09

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2021-08-27

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2019-01-29

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2021-08-24

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传染和免疫复习浙教版_

2018-10-28

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免疫组化一抗二抗如何选择

2019-04-24

【易文献】亲，酒虽好，千万不要和microRNA一起用哦！来源：查看手机网址扫一扫!扫一扫! ... 查看更多>

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【容量瓶能否贮存溶液】123

鳄鱼妹2021-07-27

构建重组质粒，在pSET4S质粒上插入一段基因的上下游同源臂，双酶切验证正确，同时以重组质粒为模板PCR扩增插入的片段，均与阳性对照一致，但测序结果进行NCBI比对，发现插入的一段序列不正确。而且这个重组质粒曾经构建出来过，因其中一个碱基突变所以重新构建，使用了primestar重新构建却总是测序不正确或者酶切不正确

通过检测SNP位点确定等位基因的基因型的方法与流程123

地球军54612017-10-02

测序常见问题解答常见问题解答通用生物123

假面04512017-09-29

在基因组研究领域，人们对数据的可信度有一个基本的要求：单个碱基越准确越好，对单个碱基的覆盖深度越多倍越好，对整个基因组测得越完整越好，测序的“缺口(Gap)”越少越好。

　　以这些标准看，目前的基因组测序结果，还没有一个是完美的。
人类基因组：缺点在哪里?
　　首先，人类基因组还不够精确。人是“二倍体”，也就是有一半遗传物质来自父亲，一半遗传物质来自母亲，且在受精卵形成过程中，还会发生基因重组，这是人类遗传多样性的来源之一。科学家们需要更精确的“单倍型”数据，这样基因组才够“完美”，而这种“完美”正是研究者们追求的目标。
　　其次，人类基因组还不够多元。
　　按照传统的人种分类，人类按照肤色黑白黄棕，被粗分为四大类：尼格罗人种、高加索人种、蒙古人种、澳大利亚人种。基因组测序数据是从高加索人种开始的，人类基因组计划是人类的标准参考基因组，也是高加索人种的标准参考基因组。文特尔的基因组，测序对象是他自己，同样是高加索人种。
　　然而，从基因组研究的角度，为了尽可能地包括各种遗传背景，需要为更多族裔建立自己的参考基因组。

资料来源：http://www.mv163.cn/jkgl/news/2015/1224/5227.html

二代测序过程使用哪些酶? 生物信息学专业医生社区,医学...123

小天才DM00L2017-10-03

没有专门的“测序酶”的说法。
你所说的“测序酶”在一般情况下就是“聚合酶”。
因为目前的的测序方法主要就是借助聚合反应。
当然，有些测序方法（比如曾经的SOLiD系统）是利用连接反应，那么它用的“测序酶”肯定是连接酶。
估计，也就是这个原因有人把它。

质粒分别酶切均有正确条带,但双酶切只有一条条带,这是怎么回事?123

sunshinewfu2021-08-05

两个基因大小分别230kb和450kb，酶切后，450kb的有目的条带，但很弱，230kb的质粒条带亮，其下方有一很微弱条带，用的酶分别是：Ncol和Spel体系是（Takara，两个酶切体系不同，用的官网推荐体系）：

NcoI1μl

Spel1μl

10×KBuffer2μl
0.1%BSA2μl
DNA3ul
灭菌水upto20μl37℃4h电泳1h

SNP基因分型的常见方法有哪些? 123

猫璃ocew2017-10-01

1.TaqMan探针法　针对染色体上的不同SNP位点分别设计PCR引物和TaqMan探针，进行实时荧光PCR扩增。探针的5’-端和3’-端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。当溶液中存在PCR产物时，该探针与模板退火，即产生了适合于核酸外切酶活性的底物，从而将探针5’-端连接的荧光分子从探针上切割下来，破坏两荧光分子间的PRET，发出荧光。通常用于少量SNP位点分析。
2.SNaPshot法　该技术由美国应用生物公司（ABI）开发，是基于荧光标记单碱基延伸原理的分型技术，也称小测序，主要针对中等通量的SNP分型项目。在一个含有测序酶、四种荧光标记ddNTP、紧临多态位点5’-端的不同长度延伸引物和PCR产物模板的反应体系中，引物延伸一个碱基即终止，经ABI测序仪检测后，根据峰的移动位置确定该延伸产物对应的SNP位点，根据峰的颜色可得知掺入的碱基种类，从而确定该样本的基因型。对于PCR产物模板可通过多重PCR反应体系来获得。通常用于10-30个SNP位点分析。
3.HRM法　高分辨率熔解曲线分析（HRM）是近几年兴起的SNP研究工具，它通过实时监测升温过程中双链DNA荧光染料与PCR扩增产物的结合情况，来判断是否存在SNP，而且不同SNP位点、是否是杂合子等都会影响熔解曲线的峰形，因此HRM分析能够有效区分不同SNP位点与不同基因型。这种检测方法不受突变碱基位点与类型的局限，无需序列特异性探针，在PCR结束后直接运行高分辨率熔解，即可完成对样品基因型的分析。该方法无需设计探针，操作简便、快速，成本低，结果准确，并且实现了真正的闭管操作。
4.Mass Array法　MassARRAY分子量阵列技术是Sequenom公司推出的世界上领先的基因分析工具，通过引物延伸或切割反应与灵敏、可靠的MALDI-TOF-MS技术相结合，实现基因分型检测。基于MassARRAY平台的iPLEX GOLD技术可以设计最高达40重的PCR反应和基因型检测，实验设计灵活，分型结果准确性高。根据应用需要，对数十到数百个SNP位点进行数百至数千份样本检测时，MassARRAY具有最佳的性价比，特别适合于对全基因组研究发现的结果进行验证，或者是有限数量的研究位点已经确定的情况。
5.Illumina BeadXpress法　采用Illumina公司的BeadXpress系统进行批量SNP位点检测，可以同时检测1-384个SNP位点，往往用于基因组芯片结果确认，适合高通量检测。微珠芯片具有高密度、高重复性、高灵敏度、低上样量、定制灵活等特点，极高的集成密度，从而获得极高的检测筛选速度，在高通量筛选时可显著降低成本。向左转|向右转

SNP数据构建系统进化树123

爆儿███2b揯2017-10-02

蛋白质的酶水解过程研究123

℡欠诚灬2017-10-03

●目前用于蛋白质肽链断裂的蛋白水解酶（proteolytic enzyme）或称蛋白酶（proteinase）已有十多种。
●应用酶水解多肽不会破坏氨基酸，也不会发生消旋化。水解的产物为较小的肽段。向左转|向右转

如果是pcr产物直接测序,纯合位点合杂合位点的峰形将有何区别_问答...123

玜爐2017-10-01

1.TaqMan探针　针染色体同SNP位点别设计PCR引物TaqMan探针进行实荧光PCR扩增探针5’-端3’-端别标记报告荧光基团淬灭荧光基团溶液存PCR产物该探针与模板退火即产适合于核酸外切酶性底物探针5’-端连接荧光探针切割破坏两荧光间PRET发荧光通用于少量SNP位点析
2.SNaPshot　该技术由美应用物公司（ABI）发基于荧光标记单碱基延伸原理型技术称测序主要针等通量SNP型项目含测序酶、四种荧光标记ddNTP、紧临态位点5’-端同度延伸引物PCR产物模板反应体系引物延伸碱基即终止经ABI测序仪检测根据峰移位置确定该延伸产物应SNP位点根据峰颜色知掺入碱基种类确定该本基型于PCR产物模板通重PCR反应体系获通用于10-30SNP位点析

...继续往后面做,测序显示目的基因已连在载体上,菌落PCR也可以P出...123

dxy_20y4ry492021-07-28

1、目的基因与质粒载体（pET21b）双酶切连接，转DH5a感受态细胞，挑取单菌落，菌落PCR可以P出目的条带（引物是pET21b载体上设计的），扩大培养，提取质粒，但是双酶切只有一条带，测序显示目的基因已连在载体上，双酶切了很多次，都切不出来目的条带，也不是酶切体系（20-100ul都尝试过）和酶切时间（3-4h,过夜都试过）的问题。

求高手指点，到底哪里出问题了！！！

请问重组质粒PCR有目的条带双酶切没有目的条带是什么原因? 实验...123

momo6022018792021-08-01

利用NheI和HindIII双酶切插入目的片段，为什么双酶切有目的片段和切开的质粒，测序却没有？

并且测序后在NheI位点后的序列变成了-GGCTAGGTAC-Kpn位点（CGTTTAAACTTAAGCTTG消失。之前和之后的序列都相符），之间的怎么都没了？

PCR技术要求使用耐高温的DNA聚合酶,这种酶要能忍受93℃左右的...123

末日审判丶济璬2017-10-03

PCR程延伸阶段温度升72摄氏度左右高温度所溶液四种脱氧核苷酸需要耐高温Taq DNA聚合酶作用据碱基互补配原则合新DNA链