Vial Rack, Solid Aluminum, for 2 ml Microvials
This solid aluminum vial rack for 2ml vials offers superior temperature control during beadbeating than bead mill cell disrupters relying on flowing air chilled by dry-ice or refrigeration. It is well-known that chilled air has much poorer heat conductivity than chilled metal. The block is pre-cooled in a deep freezer or, to cryo-temperatures with dry-ice or liquid nitrogen. Having dimensions of a standard deep-well microplate, it is compatible with not only our MiniBeadbeater-96 but with several competitor microplate shakers.
Our Price : $0.00
An important accessory for the MiniBeadbeater-96 when temperature control is a concern**. Typically, a vial filled with beads, sample and extraction media warms up ~10 degrees per minute of beadbeating. Our 2 ml vial holder (capacity 48 vials) is machined out of high-heat-conductivity aluminum.
The vial holder is pre-cooled to low temperatures inside a refrigerator, a -80º C freezer, or with liquid nitrogen. During the beadbeating process, the chilled vial holder keeps the sample temperature at desired low temperatures.
A related application is 'dry' bead-grinding of fresh tissue by the cryopulverization technique. The sample, beads, vials, and vial holder are all pre-chilled to liquid nitrogen temperatures before being processed in a Mini-BeadBeater-96.
** Helpful Note: Nucleic acid extraction of microorganisms or tissues in the presence of nucleic acid extraction media generally does not require the above temperature control.
Dimensions: 5 x 3.375 x 1.625 inches
Weight: 1.15 pounds
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accctcccgccccccccgtat
(互补碱基不写了）
那么一般来说,你就要导入以accctc结尾的引物使得增幅继续下去,具体方法和注意事项楼主可以看gee_an大侠的资料.
查了一下测序公司的网页,如果要同定微生物,楼主需要准备如下东东：
1、待测菌体.试管或培养皿都可以,但必须是纯粹的待测菌体,不能含有其他的微生物.
2、提纯的DNA.如果1有致病性或传染性,那么楼主就得自己提纯DNA再交给测序公司.DNA纯度要求可以做PCR.
我们在设计pcr引物的时候，经常需要将设计好的正反向引物与基因组DNA序列进行比对验证，但是因为反向引物是反向互补的，所以有些麻烦。因此，在这里介绍两个非常的小工具，一个是在线的模拟PCR，一个是本地运行的程序包，我会以附件形式上传，不需要蚁豆即可下载。两个都写得非常详细，相信大家都能看懂。不知道这个帖子能不能加分？希望版主看到后给予加分奖励
方法一：UCSC中的In-SilicoPCR
1、登录UCSC，网址链接http://www.genome.ucsc.edu/index.html，点击右侧工具的In-SilicoPCR，或者在Tools下拉框中点击In-SilicoPCR，如下所示：
2、点击In-SilicoPCR后，出现如下界面，我们需要将自己设计好的正向引物和反向引物分别粘贴至各自空白框，点击submit。对其它几个参数做点说明吧，MaxProductSize是指被放大区域的最大长度，MinPerfectMatch是指和引物的3‘末端PerfectMatch的最小碱基数目，MinGoodMatch:是指和引物的3‘末端GoodMatch的最小碱基数目，GoodMatch是3个碱基里最少匹配2个，FlipReversePrimer:反向引物反向互补。
3、我用自己设计的基因举例说明：HNF-1α的EXON2，参考序列：NM_000545，正向引物5’-3‘：CAGCCCTTGCTGAGCAGATCC，反向引物5’-3‘：CCACTGACTTCCTTTCCATCTACC。正向引物和反向引物分别粘贴至各自空白框，点击submit。出现如下结果，其中第一个红色标记指染色体位置，第二个红色标记指长度，第三个红色标记是我们输入的正反向引物，第四个标记可以直接链接至Primer3在线设计引物，网址http://primer3.ut.ee/。比对染色体位置就可以知道我们设计的引物是否包括HNF-1α的EXON2。
方法二：Reverse程序
这个程序是一位程序员朋友专门为我们编写的，操作非常简单，输入反向互补的引物序列后，就可以得到原始碱基序列。文件夹内一共才3个文件。
举例说明，HNF-1α的EXON2，参考序列：NM_000545，正向引物5’-3‘：CAGCCCTTGCTGAGCAGATCC，反向引物5’-3‘：CCACTGACTTCCTTTCCATCTACC。
1、点击target，粘贴反向引物序列。
2、点击右上角关闭键，这时候会弹出对话框，点击保存。
3、打开文件夹中的reverse_complement应用程度，按任意键即可自动关闭。
4、打开文件夹中的result，就可以得到反向互补引物序列对应的原始序列。
5、这时候就可以将正向序列和刚刚得到的原始序列一起代入HNF-1α的EXON2中检验我们设计的引物是否覆盖了目标片段。
好了，就这两个小工具了，非常实用，希望大家有所收获。有什么疑问可以给我留言或者私信我，支持我的战友就请给我投票吧。版主能给予我加分奖励吗？
reverse_complement.rar(95.82k)
非要说差别，可能就在测序引物是让片段线性增加，PCR引物是让片段指数增加。
需要在片段5‘端和3’端分别设计引物去扩增。
所以，对应的上游5‘端，我们习惯叫做”上游引物“，即forward primer，简称for；
对应序列的3’端，我们叫做下游引物，reverse primer，简称rev。
