实验步骤 | 一、材料1细胞培养和裂解(1)小鼠脑垂体AtT20和AtT20(proSAAS)细胞系。AtT20.(proSAAS)细胞系通过用包含一个新霉素抗性基因的proSAAS表达载体转染AtT20细胞,再利用该基因对细胞毒性药物G418的抗性挑选阳性细胞得到(11)。 (2)含有10%胎牛血清(WisentInc.,Quebec,Canada)和30pg/mL硫酸双生霉素的DMEM培养基(Gibco/BLR,Grandlsland,NY),含或不含500pg/mL的G418(Gibco/BLR)。 (3)磷酸盐缓冲盐溶液(PBS):1.35mol/L的NaCU28mmol/L的KC1,80mmol/L的Na2HPO4•7H20,15mmol/L的KH2PO4,pH7.2。 (4)Versine:含0.Immol/LEDTA的PBS。 (5)缓冲液B:10mmol/L羟乙基哌嗪乙磺酸(HEPES)-KOH,pH7.4,10mmol/LKC1,I.5mmol/LMgCl2,0.5mmol,』LEGTA钠,Immol/L二硫苏 (6)蛋白酶抑制剂(PIC)片剂(RocheDiagnosticsGmbH,Mannheim,Germany):一片溶于10mL缓冲液B (7)Corning细胞刮刀(Sigma-Aldrich,StLouise,MO)。 (8)注射器(3mL)和针头(26目)。 (9)蛋白质浓度测定试剂盒(Bio-Rad,Hercules,CA)。 2双向凝胶电泳(1)IPGphor胶条槽,18cm(AmershamBiosciences,Piscataway,NJ)。 (2)IPGphor等电聚焦系统(AmershamBiosciences)。 (3)HoefferDALT电泳系统(AmershamBiosciences)。 (4)pH4〜7L的固相pH梯度(IPG)胶条,18cm(AmershamBiosciences,Uppsala,Sweden)。保存于一20°C。 (5)水化上样缓冲液(RB):7mol/L尿素,2mol/L硫脲,4%CHAPS,1%DTT (6)BiaLyte3/10两性电解质(Bio^Rad)。保存于4°C。 (7)矿物油(Bio——Rad)。 (8)IPG胶条平衡缓冲液(EBl):50mmol/LTris-HCl,pH8.8,6mol/L尿素,30%(V/V)甘油,2%十二烷基磺酸钠(SDS),1%DTT,1X10-4%溴酚蓝。 (9)IPG胶条平衡缓冲液(EB2):50mmol/LTris-HCl,pH8.8,6mol/L尿素,30%(V/V)甘油,2%SDS,4%碘乙酰胺,1X10-4%溴酚蓝。 (10)甲叉双丙烯酰胺溶液(30_8%T)(神经毒,戴手套!):30%丙烯酰胺,0.8% (11)10%SDS。 (12)10%过硫酸胺。 (13)四甲基乙二胺(TEMED,BitRad)。 (14)SDS电泳缓冲液:25mmol/LTris,192mmol/L甘氨酸,0.1%SDS。 (15)低熔点琼脂糖(LMT)(Gibco/BLR)。通过微波炉加热溶解1%LMT至SDS电泳缓冲液中。在使用前保持50°C。 (16)银染溶液:a固定液:30%乙醇,5%乙酸;b敏化液:0.02%硫代硫酸钠;c银染试剂:0.2%硝酸银。d显影液:4%碳酸钾,0.025%甲醛(37%);e停显试剂:4%Tris碱,2%乙酸。 (17)UmaxPowerlook1100扫描仪(UmaxTechnologies,Dallas,TX)。 3基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱(MALDI-TOFMS)(1)胰蛋白酶(cat.no.V5111,Promega,MADIson,WI)。 (2)ZipTip(:18移液吸头(Millipore,Bedford,MA)。 (3)基质溶液:10mg/mL的a-氰-4-羟基肉桂酸溶于含〇.1%三氟乙酸的50%乙腈。 (4)VoyagerDETm-PRO基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱(MALDI-TOF)(PerSeptiveBiosystems,Framingham,MA)。 (5)MALDI板(PerSeptiveBiosystems,Framingham,MA)。 4免疫印迹(1)硝酸纤维素膜(Bio-Rad)。 (2)Towbin缓冲液:25mmol/LTris,192mmol/L甘氨酸,0.1%SDS,20%(V/V)甲醇。 (3)IXTris缓冲盐溶液(1XTBS):10mmol/LTris-.HCl,pH8_0,150mmol/LNaCl (4)TBS——T:IXTBS,0.1%Tween-20。 (5)5%脱脂牛奶溶液:TBS^T,5%脱脂牛奶。 (6)ECL™抗兔抗体,辣根过氧化物酶链接的FUb’)2片段(来自驴)(AmershamBiosciences)„ (7)WesternLightning化学发光试剂(Perkinelmer,Boston,MA)。 二、方法1样本制备(1)将AtT20和AtT20(proSAAS)细胞用150mm的培养皿培养(每种细胞3盘),加人DMEM,在37°C,5%C02-95%空气的润湿环境中生长至满。AtT20(proSAAS)的培养基添加了500fxg/mL的G418。 (2)每次用10mL的PBS漂洗单层细胞3次。 (3)用Versine覆盖细胞;用细胞刮刀将细胞从板上刮下,将细胞悬液转移到离心管中。 (4)4°C1300g离心5min沉淀细胞。移出并丢弃上清液。 (5)如上所述再次离心来移去残留的Versine。 (6)用0.5mL的含PIC的缓冲液B重悬细胞,用带有26目针头的注射器推拉30次来破裂细胞。 (7)将裂解产物4°C,IOOOg离心7min。将上清液转移到新管子中并丢弃沉淀。 (8)4°C下l〇V离心上清30min,将上清液(细胞质成分)转移到新的管子中并保 (9)加3倍体积的丙酮到每份细胞质成分中并置于一20°Clh,沉淀蛋白质。4°C下15800g离心15min。弃去上清液,保留沉淀。 (10)用超声处理法将每份细胞质沉淀或微粒体蛋白溶于500的RB中(见注释1) (11)使用Bio——Rad蛋白质浓度测定试剂盒,Bradford法确定蛋白质浓度。 2双向电泳2.1等电聚焦(IEF)2.2十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝肢电泳(SDS^PAGE)3银染(19)3.1银染(见注释7) 以下步骤在振荡中进行。 (2)更换固定液再振荡30min。 (3)用水漂洗凝胶5次,每次5min。 (4)在敏化液中孵育凝胶lmin。 (5)用水漂洗凝胶2次,每次lmin。 (6)在银染试剂中孵育凝胶30min。 (7)用水漂洗凝胶2次,每次lmin。 (8)在显影液中孵育凝胶直到蛋白质斑点出现。 (9)用停显试剂终止显影30min。 (10)用水漂洗凝胶3次,每次5min。 3.22D图像获取 银染凝胶在UmaxPowerlook1100扫描仪(图1)上扫描,保存数子图像。 4银染胶脱色(20)(1)切取感兴趣的凝胶斑点。 (2)按1:1的比例混合30mmol/L的铁氰化钾和100mmol/L的硫代硫酸納。 (3)用100uL以上溶液覆盖凝胶片。 (4)室温下振荡直到银染去除。 (5)每次用500uL水漂洗凝胶片,并更换水数次直到黄色试剂去除。 (6)在200uL200mmol/L的碳酸氢氨中孵育凝胶片20min并振荡。 (7)用500水漂洗凝胶片2次,每次lmin。 (8)离心并除去水。 5胰酶消化(21,22)(1)将凝胶片在200uLCH3CN中孵育10min。 (2)离心并除去CH3CN。 (3)SpeedVac真空离心蒸发浓缩凝胶片15min。 (4)56°C下在100)nL100mmol/LNH4HCO3,10mmol/LDTT中孵育凝胶片45min (5)离心并除去DTT溶液 (6)加100100mmol/LNH4HCO3,55mpol/L碘乙酰胺,并在室温下黑暗中孵育30min。 (7)离心并除去碘乙酰胺溶液。 (8)在100100mmol/LNH4HCO3中振荡漂洗凝胶片lOmin。 (9)离心并除去NH4HCCV溶液。 (10)室温下在100pLCH3CN中脱水凝胶片5min。 (11)离心并除去CH3CN (12)在100uL100mmol/LNH4HCO3中振荡漂洗凝胶片5min。 (13)离心并除去NH4HCO3溶液。 (14)室温下在100uLCH3CN中脱水凝胶片5min。 (15)离心并除去CH3CN。 (16)SpeedVac真空离心蒸发浓缩凝胶片15min。 (17)在冰上用20含500ng胰酶的50mmol/LNH4HCO3泡胀凝胶片30min。 (18)去除残留的胰酶溶液,并加50mmol/L无胰酶的NH4HCO3覆盖凝胶片。 (19)37°C下消化凝胶中的蛋白质过夜。 (20)离心并将上清转移到新會子中。 (21)加50uL50%CH3CN,0.1%三氟乙酸到凝胶片上并在冷水浴中超声处理3min。 (22)离心并转移上清到最初的上清中。 (23)再重复步骤21和22两次。 (24)SpeedVac真空离心蒸发浓缩上清液直到体积小于10uL。 (25)加0.1%三氟乙酸至10uL。 6胰蛋白酶肽段MALDI-TOF质谱分析(1)在MALDI-TOF分析之前,按照制造商说明书用ZipTipC18移液吸头纯化胰蛋白酶消化的肽段。 (2)将纯化的肽段用2uL基质点在MALDI板上。 (3)用以下仪器设定采用延迟提取和反射模式进行质谱分析:20kV加速电压,150ns延迟时间,70%栅极电压,0.05%导向线电压,128激光发射,激光强度2000,质量门从800到2800。m/z842.51和m/z1045.56的胰酶自降解产物用于内部质量校准(图2)。 (4)选择单同位素峰的质量,通过使用搜索引擎PeptIdent(http://www.expasy.ch/tools/peptident.html)搜索Swiss-Prot和TrEMBL数据库,与相应理论质量匹配在50ppm®之内来鉴定蛋白质。 72D免疫印迹(1)如3.2所述重复制备2D凝胶。 (2)根据制造商用户手册,在含Towbm缓冲液的HoeferSE600槽中将蛋白质点从未染色的凝胶上转移到硝酸纤维素膜上。 (3)用5%脱脂牛奶溶液封闭膜。 (4)室温下将膜在含抗-EphA2—抗的5¼脱脂牛奶中孵育lh。 (5)在TBS”T中漂洗膜4次,每次5min。 (6)在含HRP-结合的驴抗兔IgG的抗体的脱脂牛奶溶液中孵育膜lh。 (7)在TBST中漂洗膜4次,每次5min。 (8)根据制造商方案,用WesternLightning化学发光试剂显示免疫反应斑点(图3)。 |
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注意事项 | (1)样品蛋白的完全增溶、去解聚、变性和还原是用2D凝胶分离蛋白质能否成功的关键。因此,蛋白质沉淀需在RB中用超声处理至少3min以溶解。因为尿素在较高温度下可以降解为异腈酸盐,导致蛋白质氨甲基化,所以超声处理在冰水浴冷却下用cuphorn超声仪进行。 (2)IPG胶条槽是用陶瓷制成的,使用时小心。 (3)为了避免污染,带手套工作。不要让IPG胶条下存留气泡。 (4)这里用来制备溶液的水必须拥有以上的电阻率。 (5)20cm长带盖子的玻璃管用于平衡很理想。 (6)避免在IPG胶条和SDS胶之间存留气泡。 (7)银染是最敏感的可视化方法。为得到高质量的结果,应使用高纯度的试剂并戴手套以避免污染。 |