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Empire Genomics/ACSL6 Break Apart FISH Probe/ACSL6BA-20-ORGR/200 μL
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ACSL6BreakApartFISHProbe

EmpireGenomicshasdevelopedaACSL6BreakApartFISHProbeassaywhichcanbeusedtodetectACSL6geneaneusomy.Theprobecomeslabeledinorange,andyoumayalsochoosetocustomizetheprobetomeetyourneeds.

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senseprimer5`TGGGCAGCAACAGCATCT3`Tm57.6℃GC%55.6%
anti-senseprimer5`CAAGGACCTCAAAGTCACAGC3`Tm52.4℃GC%52.4%
probe5`CTTCCGAGACACGCACATCA3`Tm59.9℃GC%55.0%,
是以mRNA序列为目的基因,欲做RT-PCR
这是我第一次合成引物和探针,因此格外小心,还请各位高手帮助看一下.谢谢!
小弟最近在用realtimePCR扩增HPV16病毒(双链环状DNA病毒)的一个片段。引物和探针的设计都是参考文献的。东西设计完后做了几天实验一直不出实验结果,心中焦虑万分,怀疑是引物或是探针设计的问题。求教各位达人,能否帮小弟验证一下设计的引物和探针的合理性。
上游引物:5′-GAATGTGTGTACTGCAAGCA-3′
下游引物:5′-GTTGTATTGCTGTTCTAATGTTGT-3′
Taqman探针:5′-FAM-CAGCATATGGATTCCCATCTC-TAMRA-3′
扩增的产物长度是:195bp(nt188-382)
HPV16全长序列:贴在附件中

磕头跪谢!!!

HPV16.txt(9.91k)
请问为设计某病毒的荧光PCR引物和探针应事先搜集至少多少个相关病毒株基因序列,才能保证找到基因的保守区段以确保所设计的引物和探针的有效性和可靠性。谢谢。
我是一个新手,最近在做多重定量PCR,要设计引物和探针。看到很多地方将探针要尽量靠近上游引物,想请教一下大家探针可不可以在下游引物所在的链上?如果可以,探针位置还是靠近上游引物吗?请各位有经验的帮忙指教一下了,非常感谢!
我最近要做荧光定量PCR,不知道哪家公司设计引物,探针及PCR所用试剂比较好,谢谢各位提供帮助!
此数据库内有各种已经应用过的探针、引物,省大家费神
http://medgen.ugent.be/rtprimerdb/
是RNA探针。TaqMan 荧光探针是一种寡核苷酸探针,荧光基团连接在探针的5’末端,而淬灭剂则在3’末端。PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针,探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR扩增时,Taq酶的5'-3'外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,从而荧光监测系统可接收到荧光信号,即每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,实现了荧光信号的累积与PCR产物形成完全同步。常用的荧光基团是FAM,TET,VIC,HEX。 而新型TaqMan-MGB探针使该技术既可进行基因定量分析,又可分析基因突变(SNP),有望成为基因诊断和个体化用药分析的首选技术平台。
可以事先混合,混合液作为实时荧光用的最好还是现配现用,毕竟这是一个反应比较灵敏的实验。
用blast验证引物和探针的时候,结果什么样可以说明这对引物和探针合格啊?谢谢各位高手帮忙解答!!不胜感激!
两者间用的引物有什么区别,可以用一样的序列去设计吗