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ROMER/AgraStrip® LL Bulk Grain - TraitChek/100/Number of wells/10001324 (7000043)
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ROMER
货号 / 
10001324(7000043)
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Description & Properties

Description

The AgraStrip® LL Bulk Grain Strip Test is a ready-to-use lateral flow device (LFD) for on-site testing that detects the PAT protein in corn, sugarbeet, canola and soybean.

Properties

Properties
Item nameAgraStrip® LL Bulk Grain - TraitChek
Storage temperature2°C - 25°C
Limit of detection0.9% in corn and sugabeet, 2% in canola, 0.5% in LL27 soybeans
TraitPAT
Materials

Materials supplied in the standard product

  • AgraStrip® LL Bulk Grain Strip Test- TraitChek
  • conical microtubes 1.5 mL
  • transfer pipettes

Materials required but not supplied

  • conical microtube rack
  • timer
  • graduated cylinder 50 mL
  • balance 400 g
  • blender
  • blender blade with gasket set
  • TraitChek Sample Buffer (for sugarbeet)
  • add. required for quantitative analysis:
  • quantitative extraction buffer
  • 1 L nalgene bottle
  • 4 L cubitainer
  • 20 L cubitainer
  • AgraVisionTM Reader and GMO tray
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【摘要】目的:探讨BAI1mRNA表达水平与不同级别胶质瘤间的关系。方法:选取病理分级为WHOⅡ、Ⅲ、Ⅳ级脑胶质瘤标本依次为12例、12例、14例,正常脑组织标本6例;提取总RNA,用半定量RT-PCR法检测BAI1基因的转录表达情况。结果:BAI1mRNA在所有正常脑组织和26例(68.4%)胶质瘤中表达。正常脑组织的BAI1基因转录表达水平高于胶质瘤组,P<0.05;各级胶质瘤间BAI1基因转录表达水平差异没有统计学意义。结论:BA... 查看更多>
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IQ测试和某些基因的活性有关么?来自德国查尔特-柏林医科大学的研究人员已经发现修饰一个特殊基因的结构可以对人的IQ测试表现产生负面影响。这意味着环境诱导的基因的表观遗传学变化对我们智力的影响比之前认为的更大。这项研究于近日发表在《Translational Psychiatry》上。 查看更多>
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蝙蝠腺病毒复制过程中基因表达动态分布近期,中科院武汉病毒所石正丽研究员领导的科研团队采用第二代高通量测序技术,对蝙蝠腺病毒BtAdV-TJM感染蝙蝠细胞系的转录谱做了系统的分析,提供了一套完整的蝙蝠腺病毒复制过程中病毒基因表达的动态分布。结 查看更多>
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摘要:SOD的催化使超氧自由基(O2-)被破坏,并针对氧毒性筑起了第一道防线。SOD的活性及其检测技术与许多不同领域都息息相关,如医药、生化、植物生理、食品工程等。在过去的几十年中,人们已经发现了各种各样的SOD检测方法,但是,这些方法在选择性、检测速度、价格、简便程度上都存在各自的缺 查看更多>
以前只要提到基因表达分析,人们就会想到荧光定量PCR;只要提到高通量基因表达分析,人们会首先想到基因芯片。虽然荧光定量PCR仪几乎每个实验室都有,但是做芯片就不一定每个实验室都具备这个条件了。 查看更多>
低温电子显微镜技术 - 本月早些时候MRC科学家Richard Henderson博士获得诺贝尔奖 - 现已被用于解决对基因表达至关重要的蛋白质复合物的结构。在新窗口发表于Scienceopens的论文中,研究人员表示,该结构指出人类流感病毒如何能够破坏细胞的基因表达机制。该研究由Lori Passmoreopens博士在MRC分子生物学实验室的新窗口中领导,是第一个揭示蛋白质重要部分结构的研究,称为裂解和聚腺苷酸化因子(CPF)。CPF是由许多亚基组成的复合酶。冷冻电子显微镜已经彻底 查看更多>
描述了 cDNA 芯片在人类基因表达分析中的用途。制备 cDNA 芯片的方法之一是用一个特制的打印机将扩增的 cDNA 转移至显微镜载(玻)片上。标记 cDNA 探针的制备以及与芯片的杂交也有所描述。 查看更多>
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转录组分析概述123
杀生丸EIO2018-02-26
转录组是指某个物种或特定细胞在某一生理功能状态下,细胞内所有转录的mRNA产物的集合,包含了时间和空间的限定,是连接基因组遗传信息与生物功能的蛋白质组的必然纽带。转录水平的调控是目前研究最多的,也是生物体最重要的调控方式。
  应用高通量技术进行转录组测序是一种快捷可靠的获取转录组信息的方法。mRNA的转录本表达分析,通过获得研究对象基因组转录区域的信息,鉴定转录发生位点,可变剪切等,其精确的计数方法更可对基因进行精确的定量分析。
翻译,基因表达调控123
爪机粉丝008B22021-07-30
这句话翻译成英文是:Genes are expressed by transcription and translation, and what controls transcription
基因转录是指DNA分子转录成RNA
翻译是指mRNA在核糖体的帮助下翻译成肽链
基因表达则是二者的统一,即DNA转录成RNA,RNA翻译成肽链,并最终折叠成有意义的蛋白质
蛋白质在细胞中的丰度变化很大程度上决定了不同组织如脑和肌肉,以及健康和不健康人类细胞之间的差异。长期以来人们都认为转录,这一控制遗传信息从DNA流向RNA的过程,对决定细胞内蛋白质的数量起主导作用。但在过去的十年里,有许多的研究则提出RNA翻译为蛋白质的速度差异是一个更为重要的因素。
近期发表在《科学》(Science)以及其他杂志上的一些新研究证实,转录实际上是决定蛋白质丰度中最具影响力的步骤。
例如,近期来自哈佛-麻省理工Broad研究所的Marko Jovanovic等在Science杂志上发表文章,称检测了处于稳定状态和响应细菌脂多糖(LPS)时的小鼠骨髓树突细胞。他们发现在稳定状态时,mRNA水平、翻译速度和蛋白质降解速度可分别解释68%、26%和8%的蛋白质表达差异。当用LPS刺激细胞时,mRNA水平似乎可以解释90%的蛋白质表达差异,而翻译和蛋白质降解只能解释4%和6%的差异。Jovanovic等发现,在LPS处理的情况下,核糖体、线粒体以及其他一些高表达管家蛋白的翻译和蛋白质降解速度发生了更多改变,表明这两个步骤在控制一些过程中发挥了重要的作用。
来自加州大学洛杉矶分校统计学和人类遗传学助理教授Jingyi Jessica Li,和劳伦斯伯克利国家实验室的Mark Biggin,则在PeerJ杂志的一篇论文中用两种方法重新分析了2011年一项Nature研究的数据,说明了一些检测错误。他们证实采用第一种方法结果表明mRNA水平差异可以解释最小56%的蛋白质水平差异,而第二种方法表明mRNA水平可以解释84%的蛋白质表达差异,其中转录占73%,RNA降解占11%,而翻译和蛋白质降解各自仅占8%。
在3月6日,发表在Science杂志上的一篇题为“Statistics requantitates the central dogma”的文章中,Li和Biggin综述了上述这些近期的研究,得出了转录是蛋白质丰度最大贡献者这一结论。他们认为,他们自身以及近期其他一些研究工作都采用了更细致的统计学方法,来评估或是减少了实验性检测错误。Li和Biggin认为,早期的一些研究得到的有关翻译影响的结果实际上是由于实验错误所导致。
研究人员提出,科学家们精确地模拟基因表达需要采用更准确的测量和分析方法。他们的研究对于鉴别出可以有效治疗各种疾病的药物具有重要的影响。
原文链接:Statistics requantitates the central dogma
Dynamic profiling of the protein life cycle in response to pathogens
基因转录1123
2021-07-21
我想知道什么是转录基因?

最近导师要求做一个关于PARP家族蛋白在肝癌和癌旁组织中转录以及表达情况的初步研究,以确定目前的课题是否有很大价值。我之前一直在做湿实验,没有生信背景,所以对这个工作比较头疼。我不会编程,所以直接上网查找有没有可以在网上直接进行分析的网站。我一开始是上cbioportal上对肝癌的mRNA转录谱进行分析,但网站里面提供的对照是一个所谓的标准正常人。我没查到这个所谓的标准正常人是什么,而且导师说肝癌可能存在个体差异,所以要求用肝癌及其对应的癌旁组织的转录谱和表达谱进行分析。我上GEO搜索癌旁组织(paracanceroustissue),根本什么想要的结果都没有。我现在完全是一头雾水,无从下手,希望有做相关领域工作的前辈们或是做与之类似的工作的前辈们提供指导,非常感谢!

我请请教一下,如何验证一个转录因子在细胞内是否表达。我将细胞抽提RNA,逆转录后扩出该转录因子的基因,是否就可以表明该转录因子在该细胞内是表达的?因为是菜鸟,很多都不懂。请各位多多指教,不胜感激。
基因转录 123
罗特DSkn32021-07-26
在RNA聚合酶的催化下,以DNA为模板合成mRNA的过程称为转录(transcription)。在双链DNA中,作为转录模板的链称为模板链(template strand)或反义链(antisense strand);而不作为转录模板的链称为编码链(coding strand)或有义链(sense strand),编码链与模板链互补,它与转录产物的差异仅在于DNA中的胸腺嘧啶(T)变为RNA中的尿嘧啶(U)。在含许多基因的DNA双链中,每个基因的模板链并不总是在同一条链上,亦即可作为某些基因模板链的一条链,同时也可以是另外一些基因的编码链。
转录后要进行加工,转录后的加工包括: 几乎全部的真核 mRNA 端都具“帽子”结构。虽然真核生物的mRNA的转录以嘌呤核苷酸三磷酸(pppAG或pppG)领头,但在5’端的一个核苷酸总是7-甲基鸟核苷三磷酸(m7GpppAGpNp)。mRNA 5’端的这种结构称为帽子(cap)。不同真核生物的mRNA具有不同的帽子。
mRNA的帽结构功能:①能被核糖体小亚基识别,促使mRNA和核糖体的结合;②m7Gppp结构能有效地封闭RNA 5’末端,以保护mRNA免疫5’核酸外切酶的降解,增强mRNA的稳定性。 (postranslational processing):从核糖体上释放出来的多肽需要进一步加工修饰才能形成具有生物活性的蛋白质。翻译后的肽链加工包括肽链切断,某些氨基酸的羟基化、磷酸化、乙酰化、糖基化等。真核生物在新生手肽链翻译后将甲硫氨酸裂解掉。有一类基因的翻译产物前体含有多种氨基酸顺序,可以切断为不同的蛋白质或肽,称为多蛋白质(polyprotein)。例如胰岛素(insulin)是先合成86个氨基酸的初级翻译产物,称为胰岛素原(proinsulin),胰岛素原包括A、B、C三段,经过加工,切去其中无活性的C肽段,并在A肽和B肽之间形成二硫键,这样才得到由51个氨基酸组成的有活性的胰岛素。向左转|向右转
转录组学的研究对象包括mRNA和非编码RNA等。新一代高通量测序技术可以全面快速地获得特定细胞或组织在某一个状态下几乎所有转录本的序列信息和表达信息,从而准确地分析基因表达差异、基因结构变异、筛选分子标记(SNPs或SSR)等生命科学的重要问题。

基因表达谱测序是直接对某一物种或特定细胞在某一功能状态下产生的mRNA进行高通量测序,可以用来研究基因的表达差异情况。该技术结合了转录组测序建库的实验方法,与转录组测序相比,基因表达谱测序要求的读长更短,测序通量更小,但仅可用于基因表达差异的研究。

转录组测序是RNA水平测序,相当于DNA水平的基因组测序,是一个框架。表达谱主要研究的是基因表达量的变化,上调或下降。先要有转录组或是基因组才可以做表达谱,否则没有Ref做参考。

转录组测序和表达谱测序其实都是通过高通量测序技术进行的,转录组测序主要是针对没有参考基因组(即基因组未完成测序)的物种,侧重于获得你材料的全部转录组信息;而表达谱则侧重于检测各个基因的表达量。

请教各位,我是做在体实验,在体给予刺激30分钟后观察蛋白的表达变化,结果是蛋白表达升高,但有人质疑30分钟这么短的时间能否真的引起蛋白表达的明显变化,所以请教各位,一般蛋白从转录到表达需要多长时间?

大家好,本人实验小白一枚,目前在寻找自己的毕业课题,有个实验问题想请教论坛里面的各位大侠。前期的实验证明某个转录因子具有抑癌作用,在正常肝脏组织中高表达,在肝癌组织中低表达,在HepG2,SMMC-7721等肝癌细胞株中缺失表达。我现在想用染色质免疫共沉淀结合高通量测序的方法筛选它的下游基因,由于在肝癌细胞株中缺失表达,我可以构建一个过表达转录因子的质粒到肝癌细胞株中做染色质免疫共沉淀吗?或者还有更好的方法筛选下游基因吗?谢谢!

我想研究转录因子A对B物质表达有无影响,先构建转录因子A的真核表达载体和含B物质全长启动子区的荧光素酶报告质粒,那么转染时细胞是否加1.A表达载体 2.B荧光素酶报告质粒 3.作为reference的内参质粒?请教有哪位高手做过?可以这么做吗?