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Omega Bio-Tek/E-Z 96® Plant RNA Kit/free-sample/R1027-00S
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Omega Bio-Tek/E-Z 96® Plant RNA Kit/free-sample/R1027-00S
品牌 / 
Omega Bio-Tek
货号 / 
R1027-00S
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Overview

Based on the same principle of E.Z.N.A.® Plant RNA Kit, the E-Z 96® Plant RNA kit is designed for isolation of plant RNA in a 96-well plate format. The E-Z 96® Plant RNA Kit provides a convenient and rapid method for the isolation of total RNA from a variety of plant samples. The kit includes a homogenization plate to efficiently remove cell debris and simultaneously homogenize the lysate. In combination with the HiBind RNA plate, this kit permits purification of high-quality RNA from as much as 40 mg seed tissue or up to 100 mg plant tissue. The system is also efficient enough to allow isolation of total RNA from as little as 0.5 mg tissue. Purified RNA is suitable for RT-PCR, Northern analysis, differential display, and poly A+ RNA selection.

Specifications

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

FeaturesSpecifications
Downstream ApplicationPCR, qPCR, real-time RT-PCR, microarray, Northern blot, poly-A purification
Elution Volume50-100 μL
Starting MaterialPlant tissue
Starting Amount<100>
RNA Yieldup to 100 µg, >200 nt
Processing ModeSpin column
Throughput1 - 24
RNA Binding TechnologySilica technology
Binding Capacity100 µg

Protocol and Resources

Product Documentation & Literature

PROTOCOL

R1027 E-Z 96® Plant RNA Kit

SDS

R1027 SDS

Product Data

Total RNA purified from various plant samples using E.Z.N.A.® Plant RNA Kit.

Figure 1. Purified total RNA from 8 of 50 mg plant samples was isolated with the E-Z 96® Plant RNA Kit. RNA was extracted from plant samples as follows: picture 1 from 50 mg maize seeds, picture 2 from 50 mg tomato leaves. Total RNA (10% of total purified RNA) was analyzed on denaturing formaldehyde gel to demonstrate yield and quality of the RNA.

Format

96-well filter plate

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【摘要】目的:探讨BAI1mRNA表达水平与不同级别胶质瘤间的关系。方法:选取病理分级为WHOⅡ、Ⅲ、Ⅳ级脑胶质瘤标本依次为12例、12例、14例,正常脑组织标本6例;提取总RNA,用半定量RT-PCR法检测BAI1基因的转录表达情况。结果:BAI1mRNA在所有正常脑组织和26例(68.4%)胶质瘤中表达。正常脑组织的BAI1基因转录表达水平高于胶质瘤组,P<0.05;各级胶质瘤间BAI1基因转录表达水平差异没有统计学意义。结论:BA... 查看更多>
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在水中浓度非常低的汞集中在整个食物链中,从藻类到浮游动物,再到小鱼,再到最大的鱼 - 我们吃的鱼。对于食用高度污染鱼类的人来说,汞会导致严重且不可逆转的神经系统疾病。虽然我们知道该元素的极端毒性,但在食物链的下游会发生什么,一直到第一级的微藻和汞的门户?瑞士日内瓦大学(UNIGE)的一个研究小组首次使用分子生物学工具解决了这个问题。科学家测量了汞对藻类基因表达的影响方式,即使其在水中的浓度非常低,与欧洲环境保护标准相当。科学报告。UNIGE研究团队由环境生物地球化学和生态毒理学教授Ve 查看更多>
玉米果穗顶部籽秕粒瘪或未结籽粒,称之为秃顶,又叫“秃尖”,是玉米生产中常见的现象,一般会导致玉米减产5%~10%,严重的甚至在30%以上。造成玉米秃尖有品种的遗传因素,但也受到种植密度和干旱胁迫等环境条件的影响。近日,为了解析玉米秃尖的分子生理机制,阿根廷布宜诺斯艾利斯大学的科研人员系统研究了杂交品种、播种密度和灌溉条件对玉米秃尖的影响。进一步地,研究人员在同步人工授粉后的2-6天内,收集果穗籽粒样本研究其基因表达模式并分析籽粒的糖份含... 查看更多>
基因转录是在细胞核和细胞质内进行的。它是指以DNA的一条链为模板,按照碱基互补配对原则,合成RNA的过程。基因转录有正调控和负调控之分。如细菌基因的负调控机制是当一种阻遏蛋白(repressor protein)结合在受调控的基因上时,基因不表达;而从靶基因上去除阻遏蛋白后,RNA聚合酶识别受调控基因的... 查看更多>
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细菌引起许多严重疾病,如食物中毒和肺炎。科学家们面临的挑战是,引起疾病的细菌是非常有弹性的。比如,当诸如大肠杆菌之类的细菌经历饥饿时,它们会大规模地重新组装它们的DNA,从而使得它们能够在应激条件下存活下来。 为了实现这一壮举及提高存活机会,大肠杆菌菌株显著增加一种被称作Dps的蛋白的数量。这种蛋白将细菌DNA压缩成致密的水晶状复合物并保护其免受损伤。虽然之前的研究已表明Dps保护细菌免受饥饿和其他的应激因素,但是科学家们并不知道这种... 查看更多>
RT2 PCR Profiler Arrays可用于生物学和医学研究的各个领域,包括:癌症研究、炎症和细胞因子分析、干细胞研究、神经生物学、信号转导通路研究、细胞黏附和细胞迁移、生物标记分子筛选和验证, 查看更多>
Clusterin是一种由CLU基因编码的蛋白质,它在大多数人体组织中表达,特别是在压力下,它有助于保护细胞。 由开罗大学男科和性学系的Taymour Mostafa领导的一个埃及研究小组发现,不育男性的精子中CLU的表达要高得多。 Mostafa和他的同事检查了124名男性的精液样本,其中一些人的精子活力降低,精子细胞形状异常或精子数量低。与健康精子的男性相比,他们发现精子功能障碍男性的凝聚素蛋白及其mRNA前体水平显着升高。他们还发现凝聚素水平与精子质量密切相关,因此CLU的表达越 查看更多>
什么是基因表达? 基因表达(gene expression)是指细胞在生命过程中,把储存在DNA顺序中遗传信息经过转录和翻译,转变成具有生物活性的蛋白质分子。生物体内的各种功能蛋白质和酶都是 查看更多>
让基因表达分析实现高通量之操作流程&结果分析 RT2 Profiler PCR Array操作流程 查看更多>
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如何在转录水平 检测某基因的表达
1.基因丢失:体细胞分化过程必须将某些基因永久性的关闭,最简单有效的方式就是将其丢失.2.基因扩增:发育分化、环境条件的改变,对某些产物的需要量急剧增加--增加该基因的拷贝数.3、基因重排:某些基因片段改变原来的书顺序重新排列.4、甲基化修饰,脊椎动物,DNA上特定的CpG序列的C处可发生甲基化修饰.5、染色质结构的修饰.
检测目的基因是否转录通常采用分子杂交的方法。 基因表达分为转录及翻译两阶段,转录是以DNA(基因)为模板生成mRNA的过程,翻译是以mRNA为模板生成蛋白质的过程,检测外源基因的表达就是检测特异mRNA及特异蛋白质的生成。
transcribe
这个词表示“将思想文字化”或是“用本国语言将外语抄写、誊录”

最近导师要求做一个关于PARP家族蛋白在肝癌和癌旁组织中转录以及表达情况的初步研究,以确定目前的课题是否有很大价值。我之前一直在做湿实验,没有生信背景,所以对这个工作比较头疼。我不会编程,所以直接上网查找有没有可以在网上直接进行分析的网站。我一开始是上cbioportal上对肝癌的mRNA转录谱进行分析,但网站里面提供的对照是一个所谓的标准正常人。我没查到这个所谓的标准正常人是什么,而且导师说肝癌可能存在个体差异,所以要求用肝癌及其对应的癌旁组织的转录谱和表达谱进行分析。我上GEO搜索癌旁组织(paracanceroustissue),根本什么想要的结果都没有。我现在完全是一头雾水,无从下手,希望有做相关领域工作的前辈们或是做与之类似的工作的前辈们提供指导,非常感谢!

应该就是基因表达谱。翻译表达谱的话,就是蛋白表达谱

表达谱差异分析(differential expression profiling)主要包括基因表达谱(gene expression profiling) 和蛋白质表达谱(protein expression profiling) 。大规模表达谱分析已经成为认识疾病分子机制的有利方法,在癌症研究等方面取得了一定的进展。成功的表达谱分析基于实验及其过程分析的有机结合。实验过程从关注的疾病开始,首先收集大量的疾病相关组织样本,样本数量可从10 多个到数百个,但必须足以对每一组织类型及个体差异进行比较分析,而且许多情况下不能仅简单地分为正常和疾病组织。例如,在对糖尿病的研究中,所收集的样本来自健康人、胰岛素耐受和糖尿病病人的不同试验阶段,如胰岛素治疗前后。样品还应包括其他器官的取材,以便进行基因表达的组织分布研究。为了便于对后来的实验数据进行分析管理,需采集并储存所有的组织样本和临床参数。接下来进行组织样本的处理,利用生物芯片(寡核苷酸芯片、cDNA 芯片或全基因组芯片) 进行表达谱测定,并进行生物信息学分析。
通常,表达谱的分析结果需进一步的实验加以证实。定量RT2PCR 是最灵敏的确证方法,该方法还可以将确证实验的范围扩大到原测组织以外的更广泛的组织和组织类型,揭示基因表达的组织分布情况。
确证实验揭示了疾病相关基因。据此,可以进行进一步研究,探索这些基因的功能,开发新的治疗手段。例如,对于正常和疾病组织中表达有显著性变化的基因,可以进行新治疗靶点的鉴定和确定研究,或利用实验和分析工具研究分析其功能;对于疾病组织中活性升高的酶,可以当作前药活化酶进行鉴定研究。典型的表达谱能够显示疾病过程中有大量的已知基因表达的改变,而许多已知基因的代谢通路、表达产物酶学分类和蛋白质功能业已发表,将两者对照分析,可以鉴定出酶活性,选择其中可能成为前药活化酶的部分进行进一步研究;对于疾病特异的蛋白质,可以进行抗原表型分析,决定疫苗的开发策略。
寻找差异表达基因的方法除芯片技术外,一些新的检测方法如差异显示PCR ( differential display PCR, DD-PCR) 、消减杂交( suppression subreactive hy bridization , SSH) 等也相继得到结合应用。

大家好,本人实验小白一枚,目前在寻找自己的毕业课题,有个实验问题想请教论坛里面的各位大侠。前期的实验证明某个转录因子具有抑癌作用,在正常肝脏组织中高表达,在肝癌组织中低表达,在HepG2,SMMC-7721等肝癌细胞株中缺失表达。我现在想用染色质免疫共沉淀结合高通量测序的方法筛选它的下游基因,由于在肝癌细胞株中缺失表达,我可以构建一个过表达转录因子的质粒到肝癌细胞株中做染色质免疫共沉淀吗?或者还有更好的方法筛选下游基因吗?谢谢!

1.模板不同:复制的模板是DNA的两条链,转录的模板是DNA的一条链。2.产物不同:复制的产物是DNA,转录的产物是RNA。3.原料不同:复制需要的原料是脱氧核苷酸,转录的原料是核糖核苷酸。4.需要的酶不一样:复制需要DNA聚合酶,转录需要RNA聚合酶。
转录组数据中,RPKM是Reads Per Kilo bases per Million reads的缩写,代表每百万reads中来自于某基因每千碱基长度的reads数。

转录是遗传信息由DNA转换到RNA的过程。作为蛋白质生物合成的第一步,转录是mRNA以及非编码RNA(tRNA、rRNA等)的合成步骤。是遗传信息从DNA流向RNA的过程。即以双链DNA中的确定的一条链(模板链用于转录,编码链不用于转录)为模板,以ATP、CTP、GTP、UTP四种核苷三磷酸为原料,在RNA聚合酶催化下合成RNA的过程。
转录组分析概述123
杀生丸EIO2018-02-26
转录组是指某个物种或特定细胞在某一生理功能状态下,细胞内所有转录的mRNA产物的集合,包含了时间和空间的限定,是连接基因组遗传信息与生物功能的蛋白质组的必然纽带。转录水平的调控是目前研究最多的,也是生物体最重要的调控方式。
  应用高通量技术进行转录组测序是一种快捷可靠的获取转录组信息的方法。mRNA的转录本表达分析,通过获得研究对象基因组转录区域的信息,鉴定转录发生位点,可变剪切等,其精确的计数方法更可对基因进行精确的定量分析。
生命活动丰富多彩、千变万化。但是万变不离其宗,不管如何变化都围绕着中心法则展开。核酸作为遗传物质指导蛋白质的表达,表达产生的一些特殊蛋白(如转录因子、调控蛋白)反过来又对DNA指导合成蛋白质的过程进行调控。对基因表达调控的研究一直是生物学研究热点,涉及到生命活动的各个过程,也是各类信号通路研究无法绕过的部分。
当面对某个基因表达调控研究时,第一个想到的研究对象是什么?没错,就是基因的启动子。通过启动子区域对基因表达进行调控是最直接有效的手段,所以也是研究基因表达调控的重点。现在的基因数据库信息丰富,拿到基因及其启动子序列非常简单。那么问题又来了,拿到启动子序列以后,下一步怎么找相关的调控蛋白/转录因子呢?生物信息学方法预测?你会得到很多可能的目标调控蛋白/转录因子,还要做实验一个一个验证。凝胶迁移(EMSA),染色质免疫共沉淀(ChIP)?只能针对已知能与启动子结合的调控蛋白/转录因子,而且还需要相应探针/抗体,对于大量筛选无能为力。
美国Signosis的转录因子(结合启动子)微孔板芯片检测试剂可以方便、高效地解决这一问题。该方法专门用于筛查与特定DNA序列(通常是含有转录因子结合位点的启动子序列)相互作用的调控蛋白/转录因子,获得目的基因的启动子序列后,使用该方法可以筛查48/96种常见的调控蛋白/转录因子与启动子序列结合情况。该方法利用转录因子与特定DNA序列结合的特点,针对每一种转录因子设计相应的生物素标记探针;当混合探针与核蛋白样本共同孵育时,探针与相应的转录因子结合形成转录因子/探针复合物;除去游离的探针,收集转录因子/探针复合物;分离复合物中的DNA探针,探针的量与探针的量与转录因子含量呈正相关。在探针混合物中同时加入启动子片段,如果DNA序列中含有转录因子结合位点,就会与生物素标记的探针竞争性结合转录因子,转录因子与相应探针形成的复合物减少。通过比较有无目的基因启动子片段中转录因子探针检测差异,可以分析出与无目的基因启动子片段相互作用的转录因子种类。
这种方法可以简单、快速地在48/96种常见转录因子筛选出与目的启动子片段相互作用的调控蛋白/转录因子,从而进一步探索目的基因的表达调控。待筛选的调控蛋白/转录因子都是在生命活动中起重要通的调控蛋白/转录因子,大大方便了后续的基因表调控、信号通路及其它方面的研究。
http://www.biomart.cn/infosupply/17197307.htm

转录因子(启动子结合)微孔板阵列检测试剂I(FA-2001_Promoter-binding_TF_profiling_assay_I).pdf(91.72k)
不一样。
基因表达(gene expression)是指细胞在生命过程中,把储存在DNA顺序中遗传信息经过转录和翻译,转变成具有生物活性的蛋白质分子。
即表达=转录+翻译
转录量和拷贝数是相等的(产生的RNA),但和表达量(蛋白质,最终产物)不同意思,只是表达的第一步,只有转录的也都同样顺利翻译成蛋白质才有同时满足的可能。
转录增加 不等于 表达增加表达增加 也不等于 转录增加成功转录 不代表 成功表达成功表达 说明 成功转录

最近导师要求做一个关于PARP家族蛋白在肝癌和癌旁组织中转录以及表达情况的初步研究,以确定目前的课题是否有很大价值。我之前一直在做湿实验,没有生信背景,所以对这个工作比较头疼。我不会编程(只有很浅薄的R基础),而且没有统计学基础,所以直接上网查找有没有可以在网上直接进行分析的网站。我一开始是上cbioportal上对肝癌的mRNA转录谱进行分析(我只会看网站上红得蓝的表达上调下调的标记,不会看zscore什么的。。。),但网站里面提供的对照是一个所谓的标准正常人。我没查到这个所谓的标准正常人是什么,而且导师说肝癌可能存在个体差异,所以要求用肝癌及其对应的癌旁组织的转录谱和表达谱进行分析。我上GEO搜索癌旁组织(paracanceroustissue),根本什么想要的结果都没有。我现在完全是一头雾水,无从下手,希望有做相关领域工作的前辈们或是做与之类似的工作的前辈们提供指导,非常感谢!

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