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Gentarget
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Pre-made β-Lactamase Lentiviralparticles expressingbeta-laztamase (TEM-1)underinducIBLsuCMVpromoter.AGFP-PuromycinfusionMarkerunder RSVpromoter,allowstosortorselecttransducedcellsforlongtermexpressionviaGFPsignalorvia Puromycinantibiotic(Dualselection).  GFPsignalprovidesaconvenient,realtimemonitoringthe particlesperformance.  Seeproductmanualfordetails(.pdf).

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Cat#:LVP335-GP

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Cdk5 is a cyclin dependent protein kinase involved in dopaminergic signaling in the neostriatal region of the brain. The role of cdk5 in dopamine responses oc 查看更多>
上海杰美基因医药科技有限公司在发布的SAGE基因表达文库构建技术服务供应信息,浏览与SAGE基因表达文库构建技术服务相关的产品或在搜索更多与SAGE基因表达文库构建技术服务相关的内容。 查看更多>
RT2 PCR Profiler Arrays可用于生物学和医学研究的各个领域,包括:癌症研究、炎症和细胞因子分析、干细胞研究、神经生物学、信号转导通路研究、细胞黏附和细胞迁移、生物标记分子筛选和验证, 查看更多>
上海杏园瑞民生物工程有限公司在发布的Inflammasomes PCR Array 炎性小体基因表达PCR芯片供应信息,浏览与Inflammasomes PCR Array 炎性小体基因表达PCR芯片相关的产品或在搜索更多与Inflammasomes PCR Array 炎性小体基因表达PCR芯片相关的内容。 查看更多>
PCRPolymerase Chain Reaction 1) Add the following to a microfuge tube:10 ul reaction buffer1 ul 15 uM forward primer1 ul 15 uM reverse primer1 ul template DNA5 查看更多>
转录(transcription) 也称为RNA 的生物合成,是以DNA 的一条链为模板,在DNA依赖的R NA 聚合酶( RNA polymerase) 催化下,以4 种NTP( ATP、CTP、GTP 和UTP)为原料,按碱基配对的方式合成一条RNA 分子的过程。对于有些RNA 病毒,RNA 也可以指导合成RNA。... 查看更多>
2021-07-20
中国将开发自主知识产权肿瘤基因表达谱芯片 查看更多>
国家人类基因组研究所(NHGRI)研究人员参加了与丹佛科罗拉多大学,加拿大蒙特利尔麦吉尔大学和瑞士苏黎世大学儿童医院同事的国际研究,他们描述了一种涉及身体缺陷的新疾病。处理维生素B12或维生素B12的能力。这种罕见的遗传性疾病仅在男孩身上发现,可引起严重的神经症状,包括发育迟缓,癫痫和脑畸形。对新生儿的钴胺素代谢缺陷进行了筛选,但新的疾病以前没有被区分为相关病症,即钴胺素C缺乏症或cblC。随着他们的发现,2013年9月5日发表在美国人类遗传学杂志 [cell.com]上,研究人员在X 查看更多>
细菌引起许多严重疾病,如食物中毒和肺炎。科学家们面临的挑战是,引起疾病的细菌是非常有弹性的。比如,当诸如大肠杆菌之类的细菌经历饥饿时,它们会大规模地重新组装它们的DNA,从而使得它们能够在应激条件下存活下来。 为了实现这一壮举及提高存活机会,大肠杆菌菌株显著增加一种被称作Dps的蛋白的数量。这种蛋白将细菌DNA压缩成致密的水晶状复合物并保护其免受损伤。虽然之前的研究已表明Dps保护细菌免受饥饿和其他的应激因素,但是科学家们并不知道这种... 查看更多>
考点速记——基因表达调控基因表达是基因转录及翻译的过程,即基因所携带的遗传信息表现为表型的过程。基因表达产物包括蛋白质、rRNA、tRNA等,当表达产物为蛋白质时,基因表达需经历转录及翻译过程,当表达产物为rRNA、tRNA时,基因表达只需经历转录过程。(2002N29A)基因表达具有:①时间特异性(又称阶段特异性),即基因表达按一定的时间顺序发生;②空间特异性(又称细胞特异性、组织特异性),即多细胞生物个体在特定生长发育阶段,同一基因... 查看更多>
原核基因表达调控乳糖操纵子核心的:▪没有乳糖,基因关闭。▪有乳糖,基因被诱导开放。▪有葡萄糖时,乳糖操纵子是不表达的。结构:调节方式:阻遏蛋白的负性调节:诱导剂:别乳糖,半乳糖,IPTG;2.CAP的正性调节:两种调节方式的关系:乳糖操纵子中有2道开关:▪CAP结合到CAP位点发挥正控作用▪乳糖诱导去阻遏只有两道开关同时打开时,基因才能转录。色氨酸(trp)操纵子核心的:有色氨酸不表达,无色氨酸表达结构:结构基因是合成色氨酸的。(理解上... 查看更多>
小鼠被广泛用于模拟人类代谢、疾病和药物应答,是医学研究中的一个基本工具。然而斯坦福大学的研究团队指出,人类和小鼠的基因表达存在着惊人的差异,不论是蛋白编码基因还是非编码基因。这项研究发表在十一月十七日的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。Michael Snyder及其同事在15种组织中比较了人类和小鼠的基因表达情况,包括大脑、心脏、肝脏、肾脏等等。他们发现,物种间的基因表达差异要大于组织间的差异。举例来说,小鼠肝脏与人类肝脏基因表达的相... 查看更多>
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一个基因要转录并表达,需要经过mRNA,如果知道基因序列,可以采用RT-PCR的方法鉴定mRNA是否表达,如果有mRNA一般就是表达蛋白,如果没有mRNA一般不表达蛋白。
转录组学的研究对象包括mRNA和非编码RNA等。新一代高通量测序技术可以全面快速地获得特定细胞或组织在某一个状态下几乎所有转录本的序列信息和表达信息,从而准确地分析基因表达差异、基因结构变异、筛选分子标记(SNPs或SSR)等生命科学的重要问题。

基因表达谱测序是直接对某一物种或特定细胞在某一功能状态下产生的mRNA进行高通量测序,可以用来研究基因的表达差异情况。该技术结合了转录组测序建库的实验方法,与转录组测序相比,基因表达谱测序要求的读长更短,测序通量更小,但仅可用于基因表达差异的研究。

转录组测序是RNA水平测序,相当于DNA水平的基因组测序,是一个框架。表达谱主要研究的是基因表达量的变化,上调或下降。先要有转录组或是基因组才可以做表达谱,否则没有Ref做参考。

转录组测序和表达谱测序其实都是通过高通量测序技术进行的,转录组测序主要是针对没有参考基因组(即基因组未完成测序)的物种,侧重于获得你材料的全部转录组信息;而表达谱则侧重于检测各个基因的表达量。
下列有关基因表达的叙述正确的是(  )A.基因表达包括转录和翻译两个过程,均发生在细胞核中B.转录的模板是基因的一条链,翻译的模板是tRNAC.转录和翻译的原料都是氨基酸,都需要消耗能量D.转录和翻译都需要酶的催化,但酶的种类和功能不同
某种转录因子有四种不同的亚型(N1N2N3N4),我想检测它们在某种细胞内的表达情况,能不能提取这种细胞的蛋白,然后跑western,通过敷育四种对应的抗体最后来确认哪种亚型表达得多,哪种亚型表达得少呀?我做了三次western,结果在对应的分子量区域都没有呈现条带出来!有前辈说这样做是无意义的,因为细胞可能对不同抗体的敏感性不同,所以跑western时用一种样本分别敷四种抗体的话是没有可比性的。真的是这样吗?我看文献里也有人做不同蛋白亚型在组织中的表达,他们能做出来条带。求各路大神指点啊!(抱拳)
准备做双荧光酶报告基因,设计了A转录因子过表达质粒,和启动子报告基因,考虑能不能直接用A转录因子蛋白代替A转录因子过表达质粒;这样用报告基因转染细胞再加A转录因子到细胞培养液中培养,这样能不能行得通?
生命活动丰富多彩、千变万化。但是万变不离其宗,不管如何变化都围绕着中心法则展开。核酸作为遗传物质指导蛋白质的表达,表达产生的一些特殊蛋白(如转录因子、调控蛋白)反过来又对DNA指导合成蛋白质的过程进行调控。对基因表达调控的研究一直是生物学研究热点,涉及到生命活动的各个过程,也是各类信号通路研究无法绕过的部分。
当面对某个基因表达调控研究时,第一个想到的研究对象是什么?没错,就是基因的启动子。通过启动子区域对基因表达进行调控是最直接有效的手段,所以也是研究基因表达调控的重点。现在的基因数据库信息丰富,拿到基因及其启动子序列非常简单。那么问题又来了,拿到启动子序列以后,下一步怎么找相关的调控蛋白/转录因子呢?生物信息学方法预测?你会得到很多可能的目标调控蛋白/转录因子,还要做实验一个一个验证。凝胶迁移(EMSA),染色质免疫共沉淀(ChIP)?只能针对已知能与启动子结合的调控蛋白/转录因子,而且还需要相应探针/抗体,对于大量筛选无能为力。
美国Signosis的转录因子(结合启动子)微孔板芯片检测试剂可以方便、高效地解决这一问题。该方法专门用于筛查与特定DNA序列(通常是含有转录因子结合位点的启动子序列)相互作用的调控蛋白/转录因子,获得目的基因的启动子序列后,使用该方法可以筛查48/96种常见的调控蛋白/转录因子与启动子序列结合情况。该方法利用转录因子与特定DNA序列结合的特点,针对每一种转录因子设计相应的生物素标记探针;当混合探针与核蛋白样本共同孵育时,探针与相应的转录因子结合形成转录因子/探针复合物;除去游离的探针,收集转录因子/探针复合物;分离复合物中的DNA探针,探针的量与探针的量与转录因子含量呈正相关。在探针混合物中同时加入启动子片段,如果DNA序列中含有转录因子结合位点,就会与生物素标记的探针竞争性结合转录因子,转录因子与相应探针形成的复合物减少。通过比较有无目的基因启动子片段中转录因子探针检测差异,可以分析出与无目的基因启动子片段相互作用的转录因子种类。
这种方法可以简单、快速地在48/96种常见转录因子筛选出与目的启动子片段相互作用的调控蛋白/转录因子,从而进一步探索目的基因的表达调控。待筛选的调控蛋白/转录因子都是在生命活动中起重要通的调控蛋白/转录因子,大大方便了后续的基因表调控、信号通路及其它方面的研究。
http://www.biomart.cn/infosupply/17197307.htm

转录因子(启动子结合)微孔板阵列检测试剂I(FA-2001_Promoter-binding_TF_profiling_assay_I).pdf(91.72k)
应该就是基因表达谱。翻译表达谱的话,就是蛋白表达谱

表达谱差异分析(differential expression profiling)主要包括基因表达谱(gene expression profiling) 和蛋白质表达谱(protein expression profiling) 。大规模表达谱分析已经成为认识疾病分子机制的有利方法,在癌症研究等方面取得了一定的进展。成功的表达谱分析基于实验及其过程分析的有机结合。实验过程从关注的疾病开始,首先收集大量的疾病相关组织样本,样本数量可从10 多个到数百个,但必须足以对每一组织类型及个体差异进行比较分析,而且许多情况下不能仅简单地分为正常和疾病组织。例如,在对糖尿病的研究中,所收集的样本来自健康人、胰岛素耐受和糖尿病病人的不同试验阶段,如胰岛素治疗前后。样品还应包括其他器官的取材,以便进行基因表达的组织分布研究。为了便于对后来的实验数据进行分析管理,需采集并储存所有的组织样本和临床参数。接下来进行组织样本的处理,利用生物芯片(寡核苷酸芯片、cDNA 芯片或全基因组芯片) 进行表达谱测定,并进行生物信息学分析。
通常,表达谱的分析结果需进一步的实验加以证实。定量RT2PCR 是最灵敏的确证方法,该方法还可以将确证实验的范围扩大到原测组织以外的更广泛的组织和组织类型,揭示基因表达的组织分布情况。
确证实验揭示了疾病相关基因。据此,可以进行进一步研究,探索这些基因的功能,开发新的治疗手段。例如,对于正常和疾病组织中表达有显著性变化的基因,可以进行新治疗靶点的鉴定和确定研究,或利用实验和分析工具研究分析其功能;对于疾病组织中活性升高的酶,可以当作前药活化酶进行鉴定研究。典型的表达谱能够显示疾病过程中有大量的已知基因表达的改变,而许多已知基因的代谢通路、表达产物酶学分类和蛋白质功能业已发表,将两者对照分析,可以鉴定出酶活性,选择其中可能成为前药活化酶的部分进行进一步研究;对于疾病特异的蛋白质,可以进行抗原表型分析,决定疫苗的开发策略。
寻找差异表达基因的方法除芯片技术外,一些新的检测方法如差异显示PCR ( differential display PCR, DD-PCR) 、消减杂交( suppression subreactive hy bridization , SSH) 等也相继得到结合应用。
是的,必须,rna病毒需要逆转录成DNA之后进行这个步骤,朊病毒需要逆转两次之后进行。但是注意这是必须的两步,不是只有两步。
比较转录和复制的异同点_123
栤葑惡魔2018-02-27
表达包括转录和翻译
我想研究转录因子A对B物质表达有无影响,先构建转录因子A的真核表达载体和含B物质全长启动子区的荧光素酶报告质粒,那么转染时细胞是否加1.A表达载体 2.B荧光素酶报告质粒 3.作为reference的内参质粒?请教有哪位高手做过?可以这么做吗?

最近导师要求做一个关于PARP家族蛋白在肝癌和癌旁组织中转录以及表达情况的初步研究,以确定目前的课题是否有很大价值。我之前一直在做湿实验,没有生信背景,所以对这个工作比较头疼。我不会编程,所以直接上网查找有没有可以在网上直接进行分析的网站。我一开始是上cbioportal上对肝癌的mRNA转录谱进行分析,但网站里面提供的对照是一个所谓的标准正常人。我没查到这个所谓的标准正常人是什么,而且导师说肝癌可能存在个体差异,所以要求用肝癌及其对应的癌旁组织的转录谱和表达谱进行分析。我上GEO搜索癌旁组织(paracanceroustissue),根本什么想要的结果都没有。我现在完全是一头雾水,无从下手,希望有做相关领域工作的前辈们或是做与之类似的工作的前辈们提供指导,非常感谢!

蛋白质在细胞中的丰度变化很大程度上决定了不同组织如脑和肌肉,以及健康和不健康人类细胞之间的差异。长期以来人们都认为转录,这一控制遗传信息从DNA流向RNA的过程,对决定细胞内蛋白质的数量起主导作用。但在过去的十年里,有许多的研究则提出RNA翻译为蛋白质的速度差异是一个更为重要的因素。
近期发表在《科学》(Science)以及其他杂志上的一些新研究证实,转录实际上是决定蛋白质丰度中最具影响力的步骤。
例如,近期来自哈佛-麻省理工Broad研究所的Marko Jovanovic等在Science杂志上发表文章,称检测了处于稳定状态和响应细菌脂多糖(LPS)时的小鼠骨髓树突细胞。他们发现在稳定状态时,mRNA水平、翻译速度和蛋白质降解速度可分别解释68%、26%和8%的蛋白质表达差异。当用LPS刺激细胞时,mRNA水平似乎可以解释90%的蛋白质表达差异,而翻译和蛋白质降解只能解释4%和6%的差异。Jovanovic等发现,在LPS处理的情况下,核糖体、线粒体以及其他一些高表达管家蛋白的翻译和蛋白质降解速度发生了更多改变,表明这两个步骤在控制一些过程中发挥了重要的作用。
来自加州大学洛杉矶分校统计学和人类遗传学助理教授Jingyi Jessica Li,和劳伦斯伯克利国家实验室的Mark Biggin,则在PeerJ杂志的一篇论文中用两种方法重新分析了2011年一项Nature研究的数据,说明了一些检测错误。他们证实采用第一种方法结果表明mRNA水平差异可以解释最小56%的蛋白质水平差异,而第二种方法表明mRNA水平可以解释84%的蛋白质表达差异,其中转录占73%,RNA降解占11%,而翻译和蛋白质降解各自仅占8%。
在3月6日,发表在Science杂志上的一篇题为“Statistics requantitates the central dogma”的文章中,Li和Biggin综述了上述这些近期的研究,得出了转录是蛋白质丰度最大贡献者这一结论。他们认为,他们自身以及近期其他一些研究工作都采用了更细致的统计学方法,来评估或是减少了实验性检测错误。Li和Biggin认为,早期的一些研究得到的有关翻译影响的结果实际上是由于实验错误所导致。
研究人员提出,科学家们精确地模拟基因表达需要采用更准确的测量和分析方法。他们的研究对于鉴别出可以有效治疗各种疾病的药物具有重要的影响。
原文链接:Statistics requantitates the central dogma
Dynamic profiling of the protein life cycle in response to pathogens