
Unit Definition | One Weiss unit of T4 DNA Ligase converts 1 nmole of p32 from pyrophosphate into Norit-adsorbable material in 20 minutes at 37℃ in 33 mM Tris-acetate (pH 7.8), 66 mM potassium acetate, 10 mM magnesium acetate, 0.5 mM DTT, and 1 mM ATP. One Weiss unit equals approximately 200 cohesive- end ligation units. |
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Quality Control | T4 DNA Ligase is functionally tested in cloning assays and is free of detectable contaminating DNA exo- and endo-nuclease and RNase activities. |
Concentration | 1 Weiss unit/㎕ |
Storage Buffer | 50 mM Tris-HCl (pH 7.5), 0.1 M NaCl, 0.1 mM EDTA, 0.1% Triton X-100, and 1 mM DTT, 50% Glycerol |
10X Reaction buffer | composed of 400mM Tris-HCl, 100mM MgCl2, 100mM DTT, 5mM ATP (pH 7.8 at 25°C). |
Application | Cloning of restriction fragments |
Joining linkers and adapters to blunt-ended DNA |
T4 DNA Ligase is the most versatile and commonly used ligase for DNA cloning. This ATP-dependent enzyme covalently joins 5'-phosphates to 3'-hydroxy-lated termini at the blunt or compatible cohesive ends of double-stranded DNA fragments produced by restriction enzyme digestion or other enzymatic processes.
T4 DNA Ligase has no activity on single- stranded nucleic acids. Following a ligation reaction, T4 DNA Ligase may be inactivated by incubation at 65℃ for 10 minutes.
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逆转录(reverse transcription)是以RNA为模板合成DNA的过程,即RNA指导下的DNA合成。是RNA病毒的复制形式,需逆转录酶的催化。艾滋病病毒(HIV)就是一种典型的逆转录病毒。
逆转录与反转录严格意义上来说没有什么区别,但是逆转录是RNA类病毒自主行为,在整合到宿主细胞内以RNA为模板形成DNA的过程;反转录是进行基因工程过程中,人为地提取出所需要的目的基因的信使RNA,并以之为模板人工合成DNA的过程。二者虽同为RNA→DNA的过程,但地点不同,相对性的来说,逆转录在体内,反转录在体外。
2、取灭过菌且无核酸酶的0.2ml离心管,依次加入2~5μgRNAnμL
3、65℃保温5min,然后冰浴5min;
4、往3步骤中的0.2ml离心管依次加入下列组份
RNase抑制剂(40u/μL)0.5μL
10×M-MLVReactionBuffer2μL
DTT(200mM)1μL
逆转录酶(M-MLV)1μL
5、轻轻混匀后,然后2000rpm离心20s;
6、先在37℃保温1hr,然后70℃保温15min;
7、上述产物可立即进行下一步的PCR反应或-20℃保存。向左转|向右转
在进行RT反应之前,应考虑以下几个方面:
1、RNA
成功的cDNA合成来自高质量的RNA,高质量的RNA至少应保证全长并且不含逆转录酶的抑制剂,如EDTA或SDS。在提取RNA的过程中,要特别防止RNase的污染,同时在逆转录反应中经常加入RNase抑制剂以增加cDNA合成的长度和产量。RNase抑制剂要在第一链cDNA合成反应中,在缓冲液和还原剂(如DTT)存在的条件下加入,因为cDNA合成前的过程会使抑制剂变性,从而释放结合的可以降解RNA的RNase。蛋白RNase抑制剂仅防止RNaseA,B,C对RNA的降解,并不能防止皮肤上的RNase,因此尽管使用了这些抑制剂,也要小心不要从手指上引入RNase,实验过程中经常更换新手套。
2、引物的选择
OligodT
选择OligodT时,要求RNA必须有PolyA,所以真核生物的mRNA都适用。适合长链甚至全长mRNA的RT,所以对RNA样品的质量要求较高,最好不要有明显的DNA污染、RNA降解和RNA断裂。假如想探索新的mRNA进行RT反应,建议推荐使用OligodT引物。使用OligodT引物要比随机引物和特异性引物的稳定性要好。
随机引物
适合各种RNA的RT,尤其适合模板丰度很低的情况(比如某个gene表达量很低)。选择随机引物时,第一链cDNA合成反应中就是以所有的RNA为模板,然后进行PCR反应时设计引物进行特异性扩增。同时要注意随机引物的量和总RNA量之间的关系,一般建议每5μg总RNA的随机引物的用量为50ng,如果每5μg总RNA的随机引物的用量超过250ng,可能会导致小片段产物(<500bp)的增加和长片断、全长产物产物的降低。
特异性引物
特异性引物只能用你设计引物时的下游引物做RT,引物设计质量影响RT的结果,而且不同引物退火温度本来就不相同,所以按照说明书按照一个温度做不是最佳选择,一般不推荐。向左转|向右转

