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2018-12-26
Interleukin 4 (IL-4) is a cytokine that can lead to development of Th2 cells. The 140 kD IL-4 Receptor (CD124) is found on many cell types, even those of non-h 查看更多
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2018-12-26
Oxidative stress is one factor that can trigger programmed cell death. Activated neutrophils responding to inflammatory stimulation produce reactive oxygen spe 查看更多
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2018-12-26
Erythropoietin functions to increase the number of red blood cells. Thus, it has found utility as a drug for those needing to replenish erythrocytes for a numb 查看更多
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Erythropoietin (Epo) is most commonly known as the cytokine secreted by the kidneys that stimulates red blood cell production and is used as a drug for the tre 查看更多
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2018-12-26
Rac-1 is a small G-protein in the Rho family that regulates cell motility in response to extracellular signals. Several changes in cytoskeletal structure and 查看更多
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2018-12-26
IL-5 is an inflammatory signaling molecule that primarily stimulates eosinophil proliferation, maturation and activation. Eosinophils are leukocytes involved i 查看更多
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HIV infection is associated with immunosuppression caused by a dramatic reduction in the helper T cell population. The loss of helper T cells may be caused by 查看更多
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2018-12-26
p38 MAPKs are members of the MAPK family that are activated by a variety of environmental stresses and inflammatory cytokines. Stress signals are delivered to 查看更多
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2021-07-27
Accuracy of manual counts with an hemacytometer depend on: accurate mixing of the sample (no bubbles!) number of chambers counted number of cells counted (prac 查看更多
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2021-07-18
细胞信号转导是指细胞通过胞膜或胞内受体感受信息分子的刺激，经细胞内信号转导系统转换，从而影响细胞生物学功能的过程。水溶性信息分子及前列腺素类（脂溶性）必须首先与胞膜受体结合，启动细胞内信号转导的级联反应，将细胞外的信号跨膜转导至胞内；脂溶性信息分子可进入胞内，与胞浆... 查看更多
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2021-08-19
MaterialsNUNC-Immuno Plate IIF. Horseradish Peroxidase-Streptavidin (Zymed; 43-4323) PBS or Balanced Salt Solution (BSS). Do not use RPMI or any medium that co 查看更多
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Exercise 12.7 - Viability Cell CountMaterials Suspension culture of cellsSterile transfer pipettesStock 0.2% (w/v) Trypan blueHemacytometer and microscope Proc 查看更多
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[转载]如何确定某种因子在信号传导通路的上游或下游?_BILL_新浪...123
lynnli20102018-01-25
请教大家，如何确定某种因子在信号传导通路的上游或下游，前提是不清楚该信号传导通路的路径，请回答的详细一些，十分谢谢！
最近实验要做MAPK靶点的信号通路,哪位大神给介绍下相关抑制剂啊...123
可靠的嘀嘀嘀2018-02-06
关于MAPK：丝裂原活化蛋白激酶（mitogen-activated protein kinase，MAPK）是一组能被不同的细胞外刺激，如细胞因子、神经递质、激素、细胞应激及细胞黏附等激活的丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶。由于MAPK是培养细胞在收到生长因子等丝裂原刺激时被激活而被鉴定的，因而得名。所有的真核细胞都能表达MAPK。MAPK通路的基本组成是一种从酵母到人类都保守的三级激酶模式，包括MAPK激酶激酶（MAP kinasekinase kinase，MKKK）、MAPK激酶（MAP kinase kinase，MKK）和MAPK，这三种激酶能依次激活，共同调节着细胞的生长、分化、对环境的应激适应、炎症反应等多种重要的细胞生理/病理过程。
信号通路图：向左转|向右转
相关抑制剂：Selumetinib(AZD6244)是一种有效，高选择性的MEK1抑制剂，IC50为14 nM，也抑制ERK1/2磷酸化，IC50为10 nM，对p38α， MKK6， EGFR， ErbB2， ERK2， B-Raf等没有抑制作用。Phase 3。Vemurafenib(PLX4032, RG7204)是一种新型有效的B-RafV600E抑制剂，IC50为31 nM。SB203580是一种p38 MAPK抑制剂，IC50为0.3-0.5 μM，与SAPK3(106T)和SAPK4(106T)相比选择性低10倍，且抑制PKB磷酸化，IC50为3-5 μM。参考：www.selleck.cn/pharmacological_MAPK.html
信号通路图：向左转|向右转
相关抑制剂：Selumetinib(AZD6244)是一种有效，高选择性的MEK1抑制剂，IC50为14 nM，也抑制ERK1/2磷酸化，IC50为10 nM，对p38α， MKK6， EGFR， ErbB2， ERK2， B-Raf等没有抑制作用。Phase 3。Vemurafenib(PLX4032, RG7204)是一种新型有效的B-RafV600E抑制剂，IC50为31 nM。SB203580是一种p38 MAPK抑制剂，IC50为0.3-0.5 μM，与SAPK3(106T)和SAPK4(106T)相比选择性低10倍，且抑制PKB磷酸化，IC50为3-5 μM。参考：www.selleck.cn/pharmacological_MAPK.html
概述受体酪氨酸激酶介导的信号通路的组成、特点及其主要功能...123
2018-02-13
RTK- Ras 信号通路： 配体→RTK→ adaptor ←GRF→Ras→Raf（MAPKKK）
→MAPKK→MAPK→进入细胞核→其它激酶或基因调控蛋白（转录因子） 的磷酸化修钸。
信号通路的组成： 配体――生长因子； RTK—酪氨酸；
接头蛋白（生长因子受体接头蛋白-2， GRB-2）； GRF－－鸟苷酸释放因子； Ras—GTP 结合蛋白； Raf――是丝氨酸/苏氨酸（Ser/Thr）
蛋白激酶（称 MAPKKK）。
主要功能： 调节细胞的增殖与分化， 促进细胞存活， 以及细胞代谢过程中的调节与校正。
→MAPKK→MAPK→进入细胞核→其它激酶或基因调控蛋白（转录因子） 的磷酸化修钸。
信号通路的组成： 配体――生长因子； RTK—酪氨酸；
接头蛋白（生长因子受体接头蛋白-2， GRB-2）； GRF－－鸟苷酸释放因子； Ras—GTP 结合蛋白； Raf――是丝氨酸/苏氨酸（Ser/Thr）
蛋白激酶（称 MAPKKK）。
主要功能： 调节细胞的增殖与分化， 促进细胞存活， 以及细胞代谢过程中的调节与校正。
哪种神经细胞适合研究信号通路?PC12? HT22 ?SHSY5Y? 神经生物...123
一水之隔far2017-12-20
请问哪种神经细胞可以代替原代海马神经元培养细胞？PC12?HT-22?SH-SY5Y?BV-2一般都适用于什么模型，大家一般用哪个呢
【资源】"这边的战友看过来"很有价值的信号通路分析平台方法! ...123
kaige882021-07-20
偶然读到张新宇兄"生物信息学在肿瘤研究中的应用"PPT,发现其中对信号通路的论述很有启发,特奉献给细胞信号转导讨论版爱好者:
细胞信号转导分析的生物信息学方法:
a)选择关键词，从GO数据库中寻找相关基因，比如extracellular表示为分泌蛋白
b)通过GO,BioCarta和Kegg信号通路数据分析给定基因所属的信号通路，功能分类等
c)比较多组基因按功能，通路分组在统计学上的差异，从而得到各组基因的功能差异
d)新信号通路的分析
回复：【资源】很有价值的信号通路分析平台方法!-丁香园论坛
细胞信号转导分析的生物信息学方法:
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b)通过GO,BioCarta和Kegg信号通路数据分析给定基因所属的信号通路，功能分类等
c)比较多组基因按功能，通路分组在统计学上的差异，从而得到各组基因的功能差异
d)新信号通路的分析
回复：【资源】很有价值的信号通路分析平台方法!-丁香园论坛
wnt信号通路图 WNT信号通路123
dentist922017-11-22
如题，实验小白，但是导师给了这个课题，对于这通路不是很了解，园子里也没找到关于非经典通路的，希望各位战友帮忙下，谢谢了
【求助】信号通路和信号转导有区别吗? 实验方法 123
zhengrp20102018-01-16
【1】信号转导更大一点，包括分子结构调节、活性调节、蛋白表达等等。信号通路是信号转导的具体过程，从上游到下游。
【2】信号：信号是数据的电磁编码或电子编码。和数据一样，信号也分为模拟信号和数字信号。模拟信号是指电信号的参量是连续取值的，其特点是幅度连续。常见的模拟信号有电话、传真和电视信号等。数字信号是离散的，从一个值到另一个值的改变是瞬时的，就像开启和关闭电源一样。数字信号的特点是幅度被限制在有限个数值之内。常见的数字信号有电报符号、数字数据等。信号是运载消息的工具，是消息的载体。从广义上讲，它包含光信号、声信号和电信号等。
【2】信号：信号是数据的电磁编码或电子编码。和数据一样，信号也分为模拟信号和数字信号。模拟信号是指电信号的参量是连续取值的，其特点是幅度连续。常见的模拟信号有电话、传真和电视信号等。数字信号是离散的，从一个值到另一个值的改变是瞬时的，就像开启和关闭电源一样。数字信号的特点是幅度被限制在有限个数值之内。常见的数字信号有电报符号、数字数据等。信号是运载消息的工具，是消息的载体。从广义上讲，它包含光信号、声信号和电信号等。
细胞信号通路研究方法 信号通路研究思路123
2018-02-04
一种生物效应的出现往往存在多条信号通路的同步活化，可逆的磷酸化修饰反应则是细胞内部最为普遍和节能的信号蛋白活化调节方式。因此，找到激活的信号通路乃至发生磷酸化调变的通路蛋白，往往成生命科学研究的起点。
通常来说，整条信号通路上下游的关键信号蛋白很多，所以做信号通路变化的话，建议您用高通量的蛋白芯片技术对信号通路磷酸化水平进行检测。针对多条信号通路变化检测，可以选择信号通路磷酸化广谱筛选抗体芯片（PEX100），一次芯片实验即可实现多条信号通路的同步筛选和具体调变位点的清晰定位，为后续生物现象的深入探索提供明确的研究方向。针对单条信号通路，如MAPK，p53, mTOR等，同样有相对应的芯片产品，好像有个华盈生物，专门做蛋白芯片的，你可以咨询一下。 祝好。
通常来说，整条信号通路上下游的关键信号蛋白很多，所以做信号通路变化的话，建议您用高通量的蛋白芯片技术对信号通路磷酸化水平进行检测。针对多条信号通路变化检测，可以选择信号通路磷酸化广谱筛选抗体芯片（PEX100），一次芯片实验即可实现多条信号通路的同步筛选和具体调变位点的清晰定位，为后续生物现象的深入探索提供明确的研究方向。针对单条信号通路，如MAPK，p53, mTOR等，同样有相对应的芯片产品，好像有个华盈生物，专门做蛋白芯片的，你可以咨询一下。 祝好。
人肝癌细胞系HLE中是否存在TLR4信号通路? 细胞生物学和信号...123
dxy_51iix0i72021-07-25
细胞信号通路常用抑制剂之SrcbcrAbl篇 分子生物 核酸提取...123
飞翔的小小鹰2017-11-09
求教nfkb信号通路方面的问题 细胞生物学和信号转导版论坛123
迷途中寻找归途2017-11-21
请问nf-kb被激活后其上游的TNRF,TAk1,RIP水平会升高吗？用什么方法测最好。有叮当奖励，求各位大神帮帮忙
Nat Commun:北京大学陶伟课题组揭示表观遗传信号通路在细胞衰老和...123
顿官2018-02-04
1 JAK-STAT信号通路
1) JAK与STAT蛋白
JAK-STAT信号通路是近年来发现的一条由细胞因子刺激的信号转导通路，参与细胞的增殖、分化、凋亡以及免疫调节等许多重要的生物学过程。与其它信号通路相比，这条信号通路的传递过程相对简单，它主要由三个成分组成，即酪氨酸激酶相关受体、酪氨酸激酶JAK和转录因子STAT。
(1) 酪氨酸激酶相关受体（tyrosine kinase associated receptor）
许多细胞因子和生长因子通过JAK-STAT信号通路来传导信号，这包括白介素2?7（IL-2?7）、GM-CSF（粒细胞/巨噬细胞集落刺激因子）、GH（生长激素）、EGF（表皮生长因子）、PDGF （血小板衍生因子）以及IFN（干扰素）等等。这些细胞因子和生长因子在细胞膜上有相应的受体。这些受体的共同特点是受体本身不具有激酶活性，但胞内段具有酪氨酸激酶JAK的结合位点。受体与配体结合后，通过与之相结合的JAK的活化，来磷酸化各种靶蛋白的酪氨酸残基以实现信号从胞外到胞内的转递。
(2) 酪氨酸激酶JAK（Janus kinase）
很多酪氨酸激酶都是细胞膜受体，它们统称为酪氨酸激酶受体（receptor
tyrosine kinase, RTK），而JAK却是一类非跨膜型的酪氨酸激酶。JAK是英文Janus kinase的缩写，Janus在罗马神话中是掌管开始和终结的两面神。之所以称为两面神激酶，是因为JAK既能磷酸化与其相结合的细胞因子受体，又能磷酸化多个含特定SH2结构域的信号分子。JAK蛋白家族共包括4个成员：JAK1、JAK2、JAK3以及Tyk2，它们在结构上有7个JAK同源结构域（JAK homology domain, JH），其中JH1结构域为激酶区、JH2结构域是“假”激酶区、JH6和JH7是受体结合区域。
(3) 转录因子STAT（signal transducer and activator of transcription） STAT被称为“信号转导子和转录激活子”。顾名思义，STAT在信号转导和转录激活上发挥了关键性的作用。目前已发现STAT家族的六个成员，即STAT1-STAT6。STAT蛋白在结构上可分为以下几个功能区段：N-端保守序列、DNA结合区、SH3结构域、SH2结构域及C-端的转录激活区。其中，序列上最保守和功能上最重要的区段是SH2结构域，它具有与酪氨酸激酶Src的SH2结构域完全相同的核心序列“GTFLLRFSS”。
2) JAK-STAT信号通路
与其它信号通路相比，JAK-STAT信号通路的传递过程相对简单。信号传递过程如下：细胞因子与相应的受体结合后引起受体分子的二聚化，这使得与受体偶联的JAK激酶相互接近并通过交互的酪氨酸磷酸化作用而活化。JAK激活后催化受体上的酪氨酸残基发生磷酸化修饰，继而这些磷酸化的酪氨酸位点与周围的氨基酸序列形成“停泊位点”（docking site），同时含有SH2结构域的STAT蛋白被招募到这个“停泊位点”。最后，激酶JAK催化结合在受体上的STAT蛋白发生磷酸化修饰，活化的STAT蛋白以二聚体的形式进入细胞核内与靶基因结合，调控基因的转录。值得一提的是，一种JAK激酶可以参与多种细胞因子的信号转导过程，一种细胞因子的信号通路也可以激活多个JAK激酶，但细胞因子对激活的STAT分子却具有一定的选择性。例如IL-4激活STAT6，而IL-12却特异性激活STAT4。
2 p53信号
1) p53基因的发现
p53基因是迄今发现与肿瘤相关性最高的基因。1979年，Lane和Crawford在感染了SV40的小鼠细胞内分离获得一个与SV40大T抗原相互作用的蛋白，因其分子量为53 kDa，故而取名为p53（人的基因称为TP53）[3]。起初，p53被误认为是癌基因，直到上个世纪90年代，人们才认识到引起肿瘤形成或细胞癌变的p53蛋白是p53基因的突变产物。野生型p53基因是一种重要的抑癌基因，它是细胞生长周期中的负调节因子，在细胞周期调控、DNA损伤修复、细胞分化、凋亡和衰老等许多过程中发挥了重要的生物学功能，因而被誉为“细胞卫士”。随着研究的深入，人、猴、鸡、大鼠、非洲爪蟾和斑马鱼等多种模式动物的p53基因也相继被克隆。
其中，人类TP53基因定位于染色体17P13.1，小鼠p53基因被定位在11号染色体上，并在14号染色体上发现无功能的假基因。在这些进化程度迥异的动物中，它们的p53基因结构却异常保守，基因全长16-20kb，都由11个外显子和10个内含子组成。其中第1个外显子不编码结构域，外显子2、4、5、7、8则分别编码5个进化上高度保守的结构域，转录形成约2.5 kb的mRNA。之后，在基因同源性的基础上又陆续发现了p53家族的其它成员，分别是p73和p63，它们也因各自的分子量而得名，具有和p53相似的结构和功能。
2) p53信号通路
p53基因受多种信号因子的调控。例如：当细胞中的DNA损伤或细胞增殖异常时，p53基因被激活，导致细胞周期停滞并启动DNA修复机制，使损伤的DNA得以修复。然而，当DNA损伤过度而无法被修复时，作为转录因子的p53还可进一步激活下游促凋亡基因的转录，诱导细胞凋亡并杀死有DNA损伤的细胞。不然，这些DNA损伤的细胞就可能逐渐脱离正常的调控，有可能最终形成肿瘤。
虽然正常状态下p53的mRNA水平很高，而且有大量蛋白质合成，但p53蛋白容易降解，所以正常细胞内p53蛋白水平很低。蛋白的泛素化（ubiquitination）修饰是细胞内蛋白代谢过程中的最普通的降解方式，p53蛋白的降解也是通过泛素化来实现的。MDM2是一种特异性针对p53的泛素化E3连接酶，它可直接与p53蛋白结合来促进p53蛋白的泛素化降解，并在细胞内p53蛋白动态平衡中发挥关键的作用。MDM2本身也可被p53蛋白激活，因此MDM2是p53通路中重要的负反馈调节因子（negative feedback regulator）。
1) JAK与STAT蛋白
JAK-STAT信号通路是近年来发现的一条由细胞因子刺激的信号转导通路，参与细胞的增殖、分化、凋亡以及免疫调节等许多重要的生物学过程。与其它信号通路相比，这条信号通路的传递过程相对简单，它主要由三个成分组成，即酪氨酸激酶相关受体、酪氨酸激酶JAK和转录因子STAT。
(1) 酪氨酸激酶相关受体（tyrosine kinase associated receptor）
许多细胞因子和生长因子通过JAK-STAT信号通路来传导信号，这包括白介素2?7（IL-2?7）、GM-CSF（粒细胞/巨噬细胞集落刺激因子）、GH（生长激素）、EGF（表皮生长因子）、PDGF （血小板衍生因子）以及IFN（干扰素）等等。这些细胞因子和生长因子在细胞膜上有相应的受体。这些受体的共同特点是受体本身不具有激酶活性，但胞内段具有酪氨酸激酶JAK的结合位点。受体与配体结合后，通过与之相结合的JAK的活化，来磷酸化各种靶蛋白的酪氨酸残基以实现信号从胞外到胞内的转递。
(2) 酪氨酸激酶JAK（Janus kinase）
很多酪氨酸激酶都是细胞膜受体，它们统称为酪氨酸激酶受体（receptor
tyrosine kinase, RTK），而JAK却是一类非跨膜型的酪氨酸激酶。JAK是英文Janus kinase的缩写，Janus在罗马神话中是掌管开始和终结的两面神。之所以称为两面神激酶，是因为JAK既能磷酸化与其相结合的细胞因子受体，又能磷酸化多个含特定SH2结构域的信号分子。JAK蛋白家族共包括4个成员：JAK1、JAK2、JAK3以及Tyk2，它们在结构上有7个JAK同源结构域（JAK homology domain, JH），其中JH1结构域为激酶区、JH2结构域是“假”激酶区、JH6和JH7是受体结合区域。
(3) 转录因子STAT（signal transducer and activator of transcription） STAT被称为“信号转导子和转录激活子”。顾名思义，STAT在信号转导和转录激活上发挥了关键性的作用。目前已发现STAT家族的六个成员，即STAT1-STAT6。STAT蛋白在结构上可分为以下几个功能区段：N-端保守序列、DNA结合区、SH3结构域、SH2结构域及C-端的转录激活区。其中，序列上最保守和功能上最重要的区段是SH2结构域，它具有与酪氨酸激酶Src的SH2结构域完全相同的核心序列“GTFLLRFSS”。
2) JAK-STAT信号通路
与其它信号通路相比，JAK-STAT信号通路的传递过程相对简单。信号传递过程如下：细胞因子与相应的受体结合后引起受体分子的二聚化，这使得与受体偶联的JAK激酶相互接近并通过交互的酪氨酸磷酸化作用而活化。JAK激活后催化受体上的酪氨酸残基发生磷酸化修饰，继而这些磷酸化的酪氨酸位点与周围的氨基酸序列形成“停泊位点”（docking site），同时含有SH2结构域的STAT蛋白被招募到这个“停泊位点”。最后，激酶JAK催化结合在受体上的STAT蛋白发生磷酸化修饰，活化的STAT蛋白以二聚体的形式进入细胞核内与靶基因结合，调控基因的转录。值得一提的是，一种JAK激酶可以参与多种细胞因子的信号转导过程，一种细胞因子的信号通路也可以激活多个JAK激酶，但细胞因子对激活的STAT分子却具有一定的选择性。例如IL-4激活STAT6，而IL-12却特异性激活STAT4。
2 p53信号
1) p53基因的发现
p53基因是迄今发现与肿瘤相关性最高的基因。1979年，Lane和Crawford在感染了SV40的小鼠细胞内分离获得一个与SV40大T抗原相互作用的蛋白，因其分子量为53 kDa，故而取名为p53（人的基因称为TP53）[3]。起初，p53被误认为是癌基因，直到上个世纪90年代，人们才认识到引起肿瘤形成或细胞癌变的p53蛋白是p53基因的突变产物。野生型p53基因是一种重要的抑癌基因，它是细胞生长周期中的负调节因子，在细胞周期调控、DNA损伤修复、细胞分化、凋亡和衰老等许多过程中发挥了重要的生物学功能，因而被誉为“细胞卫士”。随着研究的深入，人、猴、鸡、大鼠、非洲爪蟾和斑马鱼等多种模式动物的p53基因也相继被克隆。
其中，人类TP53基因定位于染色体17P13.1，小鼠p53基因被定位在11号染色体上，并在14号染色体上发现无功能的假基因。在这些进化程度迥异的动物中，它们的p53基因结构却异常保守，基因全长16-20kb，都由11个外显子和10个内含子组成。其中第1个外显子不编码结构域，外显子2、4、5、7、8则分别编码5个进化上高度保守的结构域，转录形成约2.5 kb的mRNA。之后，在基因同源性的基础上又陆续发现了p53家族的其它成员，分别是p73和p63，它们也因各自的分子量而得名，具有和p53相似的结构和功能。
2) p53信号通路
p53基因受多种信号因子的调控。例如：当细胞中的DNA损伤或细胞增殖异常时，p53基因被激活，导致细胞周期停滞并启动DNA修复机制，使损伤的DNA得以修复。然而，当DNA损伤过度而无法被修复时，作为转录因子的p53还可进一步激活下游促凋亡基因的转录，诱导细胞凋亡并杀死有DNA损伤的细胞。不然，这些DNA损伤的细胞就可能逐渐脱离正常的调控，有可能最终形成肿瘤。
虽然正常状态下p53的mRNA水平很高，而且有大量蛋白质合成，但p53蛋白容易降解，所以正常细胞内p53蛋白水平很低。蛋白的泛素化（ubiquitination）修饰是细胞内蛋白代谢过程中的最普通的降解方式，p53蛋白的降解也是通过泛素化来实现的。MDM2是一种特异性针对p53的泛素化E3连接酶，它可直接与p53蛋白结合来促进p53蛋白的泛素化降解，并在细胞内p53蛋白动态平衡中发挥关键的作用。MDM2本身也可被p53蛋白激活，因此MDM2是p53通路中重要的负反馈调节因子（negative feedback regulator）。
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