【资源】"这边的战友看过来"-很有价值的信号通路分析平台方法![精华]
2021-07-20
问题描述:
偶然读到张新宇兄"生物信息学在肿瘤研究中的应用"PPT,发现其中对信号通路的论述很有启发,特奉献给细胞信号转导讨论版爱好者:
细胞信号转导分析的生物信息学方法:
a)选择关键词,从GO数据库中寻找相关基因,比如extracellular表示为分泌蛋白
b)通过GO,BioCarta和Kegg信号通路数据分析给定基因所属的信号通路,功能分类等
c)比较多组基因按功能,通路分组在统计学上的差异,从而得到各组基因的功能差异
d)新信号通路的分析
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Gene Ontology Pathway Network特点:DAG (非循环),可用数据库表达
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BioCartaCellCyclePathway
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KEGG酮体代谢Pathway
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