
- 10x Protein stock plate, 10 uL of each protein
- Protein dilution buffer, 2.5x concentrated solution (1.2 ml)
- Reaction buffer, 5x concentrated solution (1.1 ml)
- 5000x SYPRO Orange (8 uL)
- Control compound mix (5 uL)
- 100% DMSO (10 uL)
- 1x 384 well qPCR plate
- 1x Clear seal, large
- 1x Empty 96 well plate for reaction mix dispensing
- 96 well dispensing guide Optional pre-test:
- 5x Pre-test protein (30 uL)
- 1x Clear seal, small Components required but not supplied
- Centrifuge with plate compatible baskets
- Real time PCR/qPCR instrument
- Multichannel micropipettor
- 400x Stock(s) of Test Compound in DMSO
eactionBIOLOGy公司成立于2001年,是专门从事早期药物发现化验服务的公司,提供广泛的服务,包括用于激酶和表观遗传生物化学以及基于细胞的高通量筛选(HTS)和选择性化合物分析的稳定测定技术。我们还提供相关的HTS检测试剂,包括高度纯化和特征化的表观遗传蛋白。平均每年进行数百万次HTS和性能分析。在全球有超过750家公司(包括制药,生物技术,学术和非营利实验室)购买我们的产品。
MedicalDeviceDepot,Inc.(MDD)的成立基于一个简单的想法:改变全球医疗保健专业人员购买其医疗设备的方式。许多医疗设备供应商的员工常常缺乏充分满足客户需求并回答所有问题所需的培训和知识。对于繁忙的医师和其他寻求购买优质医疗设备的医疗保健专业人员而言,结果通常是一个缓慢,麻烦且令人沮丧的过程。医疗器械仓库有所不同。我们经验丰富的销售和服务代表经过全面培训,可以回答您有关我们广泛目录中产品的所有问题。我们的首要任务是确保您对每次购买都充满信心。我们致力于为您提供无忧的愉快体验。使用医疗设备仓库时,您可以期望得到以下结果:来自礼貌,知识渊博的代表的个性化服务-您将永远不会使用机器。如果您的代表在呼叫时与另一个客户一起工作,则在一个小时内返回的呼叫。每次互动中的诚实和透明。我们珍惜您的时间,并了解购买医疗设备时您有很多选择。医疗器械仓库保证了响应,高效,周到的服务,这是我们对您的承诺。我们期待着帮助您满足所有医疗设备需求。
ReactionBiology详细产品列表:货号产品价格(美元)HMT-11-376ASH1L(His)Methyltransferase325DMT-21-124DNMT1450DMT-21-125DNMT3aMethyltransferase450DMT-21-126 DNMT3b450HMT-11-101DOT1LMethyltransferase395HMT-25-115 EZH1Complex450HMT-25-114EZH2Complex799HMT-25-173EZH2-Y641FComplex799HMT-11-102G9aMethyltransferase(GST)(aa786-1210)299HMT-11-245G9aMethyltransferase(His)(aa913-1193)299HMT-12-104G9a/GLPComplexMethyltransferase325HMT-11-103GLPMethyltransferaseProtein299HMT-15-105MLL1Complex499HMT-15-106 MLL2Complex499HMT-15-107MLL3Complex499HMT-15-108 MLL4Complex499MT-11-359NNMT(GST)(NicotinamideN-Methyltransferase)299MT-11-358NNMT(His)(NicotinamideN-Methyltransferase)299HMT-11-319NRMT1(GST)325HMT-21-139NSD1Methyltransferase450HMT-21-1380NSD2(His)Methyltransferase450HMT-21-122 NSD2Methyltransferase550HMT-11-377NSD2SET(His)325HMT-21-159NSD2-E1099KMethyltransferase599HMT-11-378NSD2-E1099K-SET(His)325HMT-21-181NSD2-T1150AMethyltransferase450HMT-11-379NSD2-T1150A-SET(His)325HMT-11-132 NSD3Methyltransferase325HMT-21-348PRDM2Methyltransferase325HMT-21-152PRDM9Methyltransferase450HMT-11-119PRMT1Methyltransferase325HMT-11-113PRMT3Methyltransferase325HMT-11-120PRMT4Methyltransferase399HMT-21-172PRMT5Methyltransferase450HMT-22-434PRMT5(C449S)/MEP50799HMT-22-148PRMT5/MEP50Complex799HMT-11-121PRMT6Methyltransferase(GST)325HMT-21-380PRMT6Methyltransferase(His)325HMT-21-382PRMT7(His)450HMT-11-135PRMT8Methyltransferase325MT-11-356s-COMT(His)(SolubleCatechol-O-Methyltransferase)299MT-11-357s-COMT(V108M)(His)(SolubleCatechol-O-Methyltransferase)299HMT-15-116 SET1AComplex(5-subunits)499HMT-15-117SET1BComplex(5-subunits)499HMT-11-133SET7/9Methyltransferase299HMT-11-476SET8(GST)299HMT-11-118 SET8Methyltransferase299HMT-11-128 SETD2(GST)Methyltransferase299HMT-11-129SETD2(His)Methyltransferase299HMT-11-110SMYD2Methyltransferase325HMT-11-111SUV39H1Methyltransferase299HMT-11-418SUV39H2(GST)Methyltransferase299HMT-11-112SUV39H2(His)Methyltransferase299HMT-21-149SUV420H1-tv1Methyltransferase450HMT-21-150SUV420H1-tv2Methyltransferase450HMT-21-349SUV420H2Methyltransferase325HMT-14-109WRAD2375HMT-14-438(H3.3-H4)2Tetramer325HMT-35-435CoreHistones(Chicken)250HMT-11-184Fibrillarin(GST)325HMT-11-183Fibrillarin(His)325HMT-11-137GST-GAR299HMT-12-316H2A/H2Bdimers325HMT-11-180HistoneH1.050HMT-11-146HistoneH2A50HMT-11-147HistoneH2B50HMT-11-134 HistoneH3.350HMT-35-179Nucleosomes(ChickenMono/Di)280HMT-35-182Nucleosomes(ChickenOligo/PolyH5Enriched)280
ebiomall.com






>
>
>
>
>
>
>
>
>
>
>
>
请采纳。。。。
cDNA完整序列的获得对基因结构、蛋白质表达、基因功能的研究至关重要。
完整的cDNA 序列可以通过文库的筛选和末端克隆技术获得。
末端克隆技术是20世纪80年代发展起来的。RACE(rapid-amplification of cDNA ends)是通过PCR进行cDNA末端快速克隆的技术。
RACE的优点
与筛库法相比较,有许多方面的优点
1)此方法是通过PCR技术实现的,无须建立cDNA文库,可以在很短的时间内获得有利用价值的信息。
2)节约了实验所花费的经费和时间。
3)只要引物设计正确,在初级产物的基础上可以获得大量的感兴趣基因的全长。
实验室现有的RACE试剂盒的简介
RACE是一种从一个相同的cDNA模板进行5‘和3‘末端快速克隆的方法。此方法会产生较少的错误条带。此过程中使用的酶混合物非常适合长链PCR。
使用此方法的要求是必须知道至少23-28个核苷酸序列信息,以此来设计5’末端和3‘末端RACE反应的基因特异性引物(GSPs)。
RACE引物的设计:
基因特异性引物(GSPs)应该是:
23-28nt
50-70%GC
Tm值≥65度,Tm值≥70度可以获得好的结果
需要实验者根据已有的基因序列设计5‘和3‘RACE反应的基因特异性引物(GSP1和GSP2).由于两个引物的存在,PCR的产物是特异性的。
反应中涉及到的一些事项
cDNA的合成起始于polyA RNA。如果使用其它的基因组DNA或总RNA,背景会很高。
RACE PCR的效率还取决于总的mRNA中目的mRNA的量和不同的引物有不同的退火和延伸温度。
在进行5‘和3’RACE PCR的时候应该使用热启动。
表4中给出了所有引物的相互关系。重叠引物的设计会对全长的产生有帮助。另外,重叠的引物可以为PCR反应提供一个对照。并不是绝对的要利用设计的引物产生重叠片段。
引物GSP中的GC含量要在50-70%之间。这样可以使用降落PCR。避免使用自身互补性的引物序列,否则会产生回折和
如果要用重叠片段来检测设计的引物,GSp1和GSp2之间至少是100-200碱基。只有这样才可以用扩增的产物来鉴定设计的引物是否正确。
降落PCR可以明显的增加RACE PCR产物的特异性。在最开始的循环中,退火温度高于AP1引物的Tm值,可以增加对特异性条带的扩增。随后的退火和延伸的温度降回到AP1的温度,可以进行随后的PCR循环。
形成分子内氢键。另外,避免使用与AP1互补的引物,尤其是在3‘末端。
验证基因特异性引物的对照:
单个引物的阴性对照:只用一个引物GSP来进行阴性对照。这样不应该产生任何的条带。如果可以看到明显的产物,应该改变循环的参数,或重新设计原始引物。
利用两个GSPS进行阳性对照:(只有两个GSP可以产生重叠的时候才可以采用此步。)为了确定RNA样品中目的基因确实表达,利用两个GSP和接头连接的cDNA来产生阳性对照。可以产生两个引物之间的重叠大小的片段。如果没有这个片段,应该重复cDNA的合成,或者从一个不同的组织或细胞来源进行cDNA的合成。
制备和抽提polyA RNA
不要使用DEPC处理过的水。
纯化完mRNA之后,利用琼脂糖凝胶电泳检测mRNA的质量。哺乳动物的mRNA样品是0.5-12kb的拖带,在其中有4.5和1.9kb的rRNA的条带。非哺乳动物的mRNA应略小。
具体的实验步骤
cDNA第一条链的合成:
我们建议进行cDNA合成的对照反应,这样可以对样品的cDNA的合成进行鉴定。加入各种试剂之后,在气浴中42度保温一个小时。
注意: 在水浴或酒精浴中保温回减少反应体积,从而降低第一链的合成效率。
将管放于冰上,以终止第一链的合成反应。
直接进行第二链的合成。
cDNA第二链的合成:
第二链合成的酶混合物中,含有聚合酶、RNaseH和连接酶。T4 DNA聚合酶的功能是补平dscDNA的末端。我们建议做阳性对照,试剂盒中提供人类骨骼肌的mRNA。
建议进行阳性对照,cDNA的质量取决于制备的polyA RNA的质量。非哺乳动物样品的mRNA大约在0.5-3kb之间。
通过电泳检测cDNA的产量,与对照进行对比,这样可以有利于在以后的步骤中对cDNA进行稀释。
接头的连接及连接产物的稀释
按照程序进行连接反应。
如果没有对比样品和对照的产量,利用Tricine-EDTA buffer制备接头连接的ds cDNA的1/50和1/250的稀释物,用两种稀释物进行以下的RACE PCR反应,直到鉴定出哪一种稀释可以得到好的效果。
RACE-PCR扩增
进行5’和3’的RACE-PCR扩增。
利用以下的程序进行降落PCR反应:
注意:
我们建议使用降落PCR反应,这就要求GSP的Tm值≥70度。
当循环结束时,利用1.2%琼脂糖凝胶电泳分析每一个管中的产物5μl,使用适当的分子量marker。
可以根据你的基因的特异性来设计最理想的循环参数。如果看不到带或者只有微弱的带,在68度多加5个循环。最佳的延伸时间取决于扩增条带的长度。如果片断的长度在2-5kb的时候,经常使用4min,0.2-2kb的时候将延伸时间减到2-3min,对于5-10kb的条带,延伸时间增加到10min。
RACE产物的验证:
应该对RACE的片段进行验证,以此来确定是否已经扩增了理想的产物。如果得到的是多条带或者研究的是多基因家族的成员,验证是非常有用的。
有3种验证RACE产物的方法:
(1)比较由GSP和NGSP获得RACE产物。
(2)Southern blot
(3)克隆并测序
我们建议最好测得RACE产物的部分序列。有的时候需要嵌套引物的存在。
比较由GSP和NGSP获得RACE产物
对于5‘末端的RACE产物,比较由AP1和GSP1扩增出来的产物和由AP1和NGSP1扩增出来的产物。
对于3‘末端的RACE产物,比较由AP1和GSP2扩增出来的产物和由AP1和NGSP2扩增出来的产物。这对于鉴定多条带是否是上一个PCR的特异性产物是非常有用的。
如果条带是正确的,在嵌套PCR反应中的条带应该是略微小一些。基本PCR和嵌套PCR产物的迁移率的不同取决于cDNA结构中GSP1和嵌套引物的位置。
RACE产物的克隆和测序:
可以利用胶回收试剂盒来回收RACE产物,此试剂盒适合回收2.5kb以下的RACE产物;对于长的片段,可以通过电洗脱获得好的结果。如果你选择使用其他的纯化方法,最后用Tricine-EDTA buffer 30μl重新悬浮DNA样品。
电泳5μl回收的样品来鉴定回收的质量。
将回收的PCR产物直接克隆到/A型的PCR克隆载体中。另外还可以利用接头和/或cDNA合成引物中的Not1、Srf1、Xma1、ECOR1等酶切位点,将产物克隆到常规载体中.
对于5‘端的RACE产物,我们建议挑取至少8-10个不同的克隆以获得5‘端的最大可能性的序列。(反转录并不总是进行到mRNA模板的5’末端,尤其是长模板。另外,T4 DNA聚合酶会移走5‘末端的0-20个碱基。)
一旦鉴定了含有插入片断的克隆,应该获得多的序列信息。理想的是,可以对整个开放读码框进行测序。包括5‘和3‘的非翻译区。
全长cDNA的获得
通过部分或全部测序鉴定了RACE产物后,可以通过两种选择获得全长的cDNA。
通过PCR的方法获得全长cDNA:
扩增长的cDNA需要较长的延伸时间,但是如果延伸的时间过长,可以产生拖带,所以要慎重的设计引物。
根据从5‘和3‘RACE产物获得序列信息设计5’和3‘GSP引物。这些引物应该来自cDNA的3’或者5‘的末端,应该是23-28nt长。不应该在引物的末端加上限制性位点,这样会导致高背景。在某些时候可以设计3’和5‘的嵌套引物。但是还是应该先利用一对引物进行PCR反应。
进行如下的热循环:
94度 30秒
25个循环 94度 5秒
72度 2-15分钟
延伸的时间应该等于预期的cDNA长度加上2分钟。例如:预期得到6kb的条带,用6+2=8分钟的延伸时间。
注意:如果没有条带或者条带弱,增加5个循环;或者优化PCR的条件。
在1.2%的琼脂糖凝胶上分析5μl的样品。通常情况下,可以见到一条单一带,如果这样,利用胶来纯化全长的cDNA。
制备1.2%的TAE buffer制备琼脂糖凝胶。不使用TBE buffer,TBE的胶很难制备全长的cDNA。
将剩下的45μl反应物点样,选用适当的marker。
利用长波紫外观察cDNA(≥300nm)切下全长的cDNA。注意:应该尽量减少紫外对cDNA的照射。
利用胶回收试剂盒回收cDNA。此试剂盒适合回收2.5kb以下的RACE产物;对于长的片段,可以通过电洗脱获得好的结果。如果你选择使用其他的纯化方法,最后用Tricine-EDTA buffer 30μl重新悬浮DNA样品。
将全长的cDNA克隆到T/A型的 PCR克隆载体中。
takara的做得出来不,请各位高手指教,谢谢了!
步骤:1,RNA抽提(同RT)
2,逆转录,使用合成的oligo
3,p内参
4,使用根据已知序列设计的上游引物和提供下游引物做PCR,注意设计上游引物是退火温度与下游引物相差不大。
5,产物切胶回收,TA克隆测序
这个oligo和下游引物是我根据Takara和BD公司的manual自己设计的,经过我的使用效果很好。具体操作参照takara的3-racemanual。你先做3-race,了解熟悉下,成功后再做5-race。5-race要买试剂盒做,较为复杂!
3′-Full RACE Core Set Ver.2.0D314 20 次 1,800 元
5′-Full RACE Kit D315 RT反应10次 PCR反应50 次 3,980 元
我也想问一下。

