支原体菌株来源:M.ArgininiATCC23838精氨酸支原体M.FermentaneATCC19989发酵支原体M.SalivariumATCC23064唾液支原体M.HominisATCC23114人型支原体M.OraleATCC23714口腔支原体M.HyorhinisATCC29052猪鼻支原体其共同引物序列来自16s和23s保守区域外部引物为F15′-ACACCATGGGAGCTGGTAAT-3′R15′-GTTCATCGACTTTCAGACCCAAGGCAT-3′;内部引物为F25′-GTTCTTTGAAAACTGAAT-3′R25′-GCATCCACCAAAAACTCT-3′PCR反应体系和条件:10×缓冲液(10mMTris-HCl、500mMKCl、20mMMgCl2、0.01%明胶)、PrimerF1、R1、F2、R2的浓度为2nmol/μL、2.5mMdNTPs、Taq酶、H2O、石蜡油覆盖反应温度和时间为:94℃/2min预变性、94℃/30s变性、55℃/1min退火、72℃/1min延伸循环30次后72℃延伸5min第1次PCR反应取模板10μL,第2次PCR反应以第1次PCR扩增产物为模板取1μL。下面是更详细的:污染测试——支原体:PCR方法原理:利用具特殊专一性之primers,经由PCR反应来复制mycoplasmaDNA。所用之primers来自mycoplasma之conserved16S-23SrRNA序列,由于此段spacer之序列依mycoplsma种类不同而不同,因此可依所复制之DNA大小及其restrictionfragment大小差异来作侦测与鉴定。特点:灵敏(e.g.0.1~1.6CFU/5ulsample)与快速(一天)。可侦测不易培养之mycoplasma(e.g.M.hyorhinis)。不需培养mycoplasma作为正反应对照组,避免可能之污染。缺点:PCR反应很灵敏,易有伪阳性结果。此方法尚在评估中,故结果仅作为参考和内部品管之一部份。材料与设备:ATCCmycoplasmadetectionkit:可作50~100reactions.提供1ststageprimermixture与2ndstageprimermixturepositivecontrolDNA(A.laidlawii;M.pirum)PCRreagents:Taqpolymerase(5U/ul)dNTP(dGTP,dCTP,dTTP,dATP,1.25mMeach)10xPCRbuffer(with1.5mMMgCl2)25mMMgCl2sterileddH2OMachine/Equipment:PCRthermalcycleragarose电泳设备DNA电泳胶体观察设备无菌PCR反应管无菌1.5ml微量离心管无菌2ul,20ul,200ul,1000ulTips/Pipetmans方法:此PCR反应是一种nestedPCR,包括2阶段PCR反应,1ststagePCR结束后,取其反应物作2ndstagePCR,然后取2ndPCR产物作agarosegelelectrophoresis,依DNAband之有无及片段大小来分析结果。结果:使用UVlight观察,并照相记录。不过应用较多还是巢式PCR方法:此PCR反应是一种nestedPCR,包括2阶段PCR反应,1ststagePCR结束后,取其反应物作2ndstagePCR,然后取2ndPCR产物作agarosegelelectrophoresis,依DNAband之有无及片段大小来分析结果。结果:使用UVlight观察,并照相记录。方法再详尽点:1ststagePCRreaction(totalvolume25ul):测试样品(2ul/each)直接取样测试细胞之培养液。Positivecontrol:mycoplasmaDNA(A.laidlawii;M.pirum)Negativecontrol:ddH2OReactionmixture(23ul/each)10xPCRbuffer(含1.5mMMgCl2)2.5ul1ststageprimermixture0.5uldNTP(1.25mMeach)1.0lMgCl2(25mM)0.5ulTaqDNApolymerase(5U/ul)0.1ulddH2O18.4ulPCRprogram(1stPCR与2ndPCR相同):使用PCRthermalcyclerstep1:denaturation:94℃30secstep2:denaturation:94℃30secstep3:annealing:55℃2minstep4:extension:72℃2min重复3.1.3.2至3.1.3.4步骤30cyclesstep5:finalextension72℃5min2ndstagePCRreaction(totalvolume25ul)测试样品:1ststagePCRproduct(1ul/each)。Reactionmixture(24ul/each)10xPCRbuffer(含1.5mMMgCl2)2.5ulndstageprimermixture0.5uldNTP(1.25mMeach)1.0ulMgCl2(25mM)0.5ulTaqDNApolymerase(5U/ul)0.1ulddH2O19.4ulPCRprogram同3.1.3;使用PCRthermalcycler胶片电泳分析胶片(2.0%)置备:将2gagarose溶于100ml(1x)TAEbuffer。电泳液:(1x)TAEbuffer(Tris-acetate/EDTAelectropheresisbuffer)选择100~500bpDNAsizeMarker:取100bpladderMarker5ul(25ng/ul)取10ul2ndstagePCR产物分析,各加入2ul(6x)loADIngdye。进行电泳分离100V,25min。胶片染色:ethidiumbromide染色10min,H2O退染10mim。(EtBr为致癌物质,请戴手套并小心操作)结果:使用UVlight观察,并照相记录。FigureAgarosegelelectrophoresisofthe2nd-stagePCRProductsfromeightcommonlyencounteredMycoplasmaandA.laidlawiiSpecies.(fromATCCmycoplasmadetectionkit)