| UK 383367BMP-1/PCP inhibitor,potent and selective |

Sample solution is provided at 25 µL, 10mM.
Nature.2017 Jan 19;541(7637):417-420.
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Cell Stem Cell.2017 Nov 20. pii: S1934-5909(17)30375-2.Quality Control & MSDS
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Chemical structure

| Description | UK 383367 is a potent and selective inhibitor of BMP-1 with IC50 value of 44 nM. | |||||
| Targets | BMP-1 | |||||
| IC50 | 44 nM | |||||

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| Cas No. | 348622-88-8 | SDF | Download SDF |
| Synonyms | UK383367, UK-383367 | ||
| Chemical Name | 5-[(3R)-6-cyclohexyl-1-(hydroxyamino)-1-oxohexan-3-yl]-1,2,4-oxadiazole-3-carboxamide | ||
| Canonical SMILES | C1CCC(CC1)CCCC(CC(=O)NO)C2=NC(=NO2)C(=O)N | ||
| Formula | C15H24N4O4 | M.Wt | 324.38 |
| Solubility | Soluble in DMSO | Storage | Store at -20°C |
| Physical Appearance | A solid | Shipping Condition | Evaluation sample solution : ship with blue ice.All other available size:ship with RT , or blue ice upon request |
| General tips | For obtaining a higher solubility , please warm the tube at 37 ℃ and shake it in the ultrasonic bath for a while.Stock solution can be stored below -20℃ for several months. | ||
UK 383367 is a novel procollagen C-protein (PCP) inhibitor being investigated for the treatment of post-surgical dermal scarring, which potently inhibits the activity of PCP with the value of 50% inhibition concentration IC50 of 44 nM, as well as a selective inhibitor of matrix metalloproteinases (MMPs) with values of IC50 >60,000 nM for MMP-2 and >10,000 nM for MMP-1, MMP-3, MMP-9 and MMP-4. Although the mechanism is not clear yet, UK 383367 also exhibits weak inhibitory effects against phosphodiesterase-4 (PDE-4) enzyme, including PDE-4a, PDE-4b, PDE-4c and PDE-4d, with values of IC50 of 1.8 μM, 1.5 μM, 2.4 μM and 0.9 μM respectively.
Reference
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①些物,RNA病毒没DNA,能用cDNA克隆;
②cDNA克隆易筛选,cDNA库包含非结构基克隆,且每cDNA克隆含mRNA信息;
③cDNA能细菌表达.cDNA仅代表某发育阶段表达遗传信息,基文库才包含物完整遗传信息.
基因组文库是一个比较笼统的概念。这个文库可以指某种真核生物的基因组,也可以指某种原核生物的基因组。实质是将某种生物的全部遗传信息贮存在一个受体菌群体中,做为目的基因的来源。
CDNASizeFractionation做完后的电泳检测,发现条带的大小都在5000bp左右,感觉是哪里有问题。前面步骤检测很好。不知道有问题没有?请哪位高人指点一下。
将某种生物的基因组DNA切割成一定大小的片段,并与合适的载体重组后导入宿主细胞进行克隆。这些存在于所有重组体内的基因组DNA片段的集合,即基因组文库,它包含了该生物的所有基因。
以mRNA为模板,经反转录酶催化,在体外反转录成cDNA,与适当的载体(常用噬菌体或质粒载体)连接后转化受体菌,则每个细菌含有一段cDNA,并能繁殖扩增,这样包含着细胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合称为该组织细胞的cDNA文库。
二、 DNA文库和cDNA文库的构建原理
DNA文库:用限制性内切酶切割细胞的整个基因组DNA,可以得到大量的基因组DNA片段,然后将这些DNA片段与载体连接,再转化到细菌中去,让宿主菌长成克隆。这样,一个克隆内的每个细胞的载体上都包含有特定的基因组DNA片段,整个克隆群体就包含基因组的全部基因片段总和称为基因组文库。
cDNA文库:以mRNA为模板,经反转录酶催化,在体外反转录成cDNA,与适当的载体常用噬菌体或质粒载体连接后转化受体菌,则每个细菌含有一段cDNA,并能繁殖扩增,这样包含着细胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合称为该组织细胞的cDNA文库。
三、DNA文库和cDNA文库的用途
基因组含有的基因在特定的组织细胞中只有一部分表达,而且处在不同环境条件、不同分化时期的细胞其基因表达的种类和强度也不尽相同,所以cDNA文库具有组织细胞特异性。cDNA文库显然比基因组DNA文库小得多,能够比较容易从中筛选克隆得到细胞特异表达的基因。但对真核细胞来说,从基因组DNA文库获得的基因与从cDNA文库获得的不同。DNA文库所含的是带有内含子和外显子的基因组基因,而从cDNA文库中获得的是已经过剪接、去除了内含子的cDNA展开
已经在mirbase数据库下载水稻的所有miRNA序列,可以比对某种昆虫的转录组文库寻找靶基因吗?
可以用targetscan或者miRwalk网站吗?有什么方法吗?
(1)人的免疫球蛋白细胞 cDNA文库(cDNA 文库是把内含子去除后的裸DNA,人的和牛的DNA是不能识别的就是因为内含子的缘故,cRNA反转录后的是去除后的)。
限制性内切酶:酶切目的基因和载体,使其产生相同的粘性末端。
DNA连接酶:连接目的基因和载体。

