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Kapa biosystems/Library Preparation for Illumina/KK8712/12 adapters x 40 µl each
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Description:
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It’scomplex,butwehaveitcovered.
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KitsareoptimizedtoachievesignificantlyhigherlibraryyieldsandcontainKAPAHiFiforhigh-fidelity,high-efficiencyandlow-biaslibraryamplification.Thisensuresthehighestlibraryandsequencedataquality,particularlyfromlow-inputanddifficultsamplessuchasFFPEandChIPDNA.
NEW!KAPADual-IndexedAdapterKitsarenowavailable.FormoreinformationonKAPAAdapterKits,scrolldowntotheOrderingsection,ordownloadtheKAPAAdapterandBeadCalculator.
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ForResearchUseOnly.Notforuseindiagnosticprocedures.
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- Fewercyclesofamplificationareneeded,whichresultsinlowerPCRduplicationrates
- PCR-freeworkflowspossIBLefrominputs≥100ng*
Reduceamplificationbiasandimprovecoverage
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- ImprovescoverageuniformityofGC-andAT-richregions,promoters,lowcomplexityandotherchallengingregions*
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- Routinelibraryconstructionfrom≥100pgChIPDNA*
Automatewithpre-validatedscripts
- PerkinelmerSciclone®NGSandNGSx
- BeckmanCoulter®Biomek™FXpandFXdual-pod
- Agilent®TechnologiesNGSWorkstationOptionB
- Eppendorf®epMotion™ 5075TMX
*Dataonfile.
Applications:
Applications- WholeGenomeSequencing
- ChIPSequencing
- WholeExomeSequencing
- AmpliconSequencing
- TargetedSequencing(Capture)
- MethylSequencing
KitSpecificationsandContents/Storage:
KitSpecificationsandContents/StorageKitscanbestoredforupto18months at-20˚C.
Kitsincludereagentsforendrepair,A-tailing,ligationandlibraryamplification.PCR-freeversions(withoutlibraryamplificationreagent)arealsoavailable.“With-bead”kitsincludePEG/NaClsolutionforSPRIbeadcleanups.
All96-librarykitsareautomationfriendly.
Components
Specifications
- SpecDescription
- CompatiblePlatformIlluminaHiSeq,MiSeq,NextSeqandGAIIx
- LibraryTypeDNA
- StartingMaterialFragmentedDNAorPCRamplicons
- InputAmount100pg–5µg
- SequencingApplicationsWholeGenomeSequencingWholeExomeSequencingTargetedSequencing(custompanels)ChIP-SeqAmpliconSequencingMethyl-Seq
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2018-12-26
Cleaning Worm Stocksby Michael Koelle4/6/94There are two kinds of contaminants on worm plates:1. Fungi: these contaminants can come from the plates or bacteria 查看更多
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Assessment of Magnaporthe grisea mating type by spore PCRJin-Rong Xu and John E. Hamer - Department of Biological Sciences Purdue University, West Lafayette, I 查看更多
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2018-12-26
差减cDNA文库法[第一条链cDNA合成]1．合成第一条cDNA链时，所有试剂应按下列顺序依次加入：10×第一条链合成缓冲液 5.0μl10mM dNTP Mix(1.4μg/μl) 2.5μl(终浓度1.25mM)Linker primer(1.4μl，终浓度100μg/μl)DEPc H2ORNase block 查看更多
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2021-08-02
1. 做实验要按规程，减压一定要用园底瓶，不可用锥形瓶，容易内吸爆炸，如果仅仅是回收溶剂，尚无大碍，如果是旋去溶剂得样品，萃取 查看更多
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2018-12-26
OverviewMatirgel is considered as basement membrane and generated from EHS sarcoma. Matrigel contains not only basement membrane components (collagens, laminin 查看更多
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2018-12-26
相关文件如下： 点击浏览该文件 查看更多
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2018-12-26
Note: All volumes are calculated to cater for four plates per point.Base Agar1. Melt 1% Agar (DNA grade) in microwave, cool to 40 in a waterbath. Warm 2X RPMI 查看更多
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Arshad DesaiNotes:The key variable in MT spindown experiments is ATP. Under high ATP conditions,conventional MAPs are selectively co-sedimented with microtubul 查看更多
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2021-07-27
Preparation of Fluorescent DNA Probe from mRNA: YeastLast updated: 3/29/99 Materials for 2 reactions (Cy3 & Cy5) Qty Order info Heat blocks, 42C & 70C 查看更多
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2018-12-26
一、核酸分子杂交技术1961年Hall开拓了液相核酸杂交技术的研究，其基本原理是利用核酸分子单链之间有互补的碱基顺序，通过碱基对之间非共价键的形成，出现稳定的双链区，形成杂交的双链。自此以后，由于分子生物学技术的迅猛发展，特别是70年代末到80年代初，分子克隆、质粒和噬菌体DNA的构建成 查看更多
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2018-12-26
Cell Isolation Techniques Methods and MaterialsWorking With EnzymesAll of the enzymes Worthington offers for tissue dissociation applications are available as 查看更多
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2018-12-26
General comments: Antibodies, like most proteins, do not like to be freeze-thawed. Avoid repetitive freezing of your solution. The best way to store your antib 查看更多
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SiRNA高通量筛选123
夏夏xr142017-11-05
Small interfering RNA (siRNA)：是一种小RNA分子（~21-25核苷酸）,由Dicer（RNAase Ⅲ家族中对双链RNA具有特异性的酶）加工而成.SiRNA是siRISC的主要成员,激发与之互补的目标mRNA的沉默.
RNA干涉(RNAinterference,RNAi)是指内源性或外源性双链RNA(dsRNA)介导的细胞内mRNA发生特异性降解,从而导致靶基因的表达沉默,产生相应的功能表型缺失的现象.
RNA干涉（RNAi）在实验室中是一种强大的实验工具,利用具有同源性的双链RNA（dsRNA）诱导序列特异的目标基因的沉寂,迅速阻断基因活性.siRNA在RNA沉默通路中起中心作用,是对特定信使RNA（mRNA）进行降解的指导要素.siRNA是RNAi途径中的中间产物,是RNAi发挥效应所必需的因子.siRNA的形成主要由Dicer和Rde-1调控完成.由于RNA 病毒入侵、转座子转录、基因组中反向重复序列转录等原因,细胞中出现了dsRNA,Rde-1(RNAi缺陷基因-1)编码的蛋白质识别外源dsRNA,当dsRNA达到一定量的时候,Rde-1引导dsRNA与Rde-1编码的Dicer（Dicer是一种RNaseIII 活性核酸内切酶,具有四个结构域：Argonaute家族的PAZ结构域,III型RNA酶活性区域,dsRNA结合区域以及DEAH/DEXHRNA解旋酶活性区）结合,形成酶-dsRNA复合体.Dicer 切割后形成siRNA,然后,在ATP的参与下,细胞中存在的一种RNA诱导的沉默复合体RNA-induced silencing complex RNAi干涉的关键步骤是组装RISC和合成介导特异性反应的siRNA蛋白.siRNA并入RISC中,然后与靶标基因编码区或UTR区完全配对,降解靶标基因,因此说siRNA只降解与其序列互补配对的mRNA.其调控的机制是通过互补配对而沉默相应靶位基因的表达,所以是一种典型的负调控机制.siRNA识别靶序列是有高度特异性的,因为降解首先在相对于siRNA来说的中央位置发生,所以这些中央的碱基位点就显得极为重要,一旦发生错配就会严重抑制RNAi的效应.
RNAi在基因沉默(silent gene)方面具有高效性和简单性,所以是基因功能研究的重要工具.
大多数药物属于标靶基因（或疾病基因）的抑制剂,因此RNAi 模拟了药物的作用,这功能丢失（LOF)的研究方法比传统的功能获得（GOF)方法更具优势.因此, RNAi 在今天的制药产业中是药物靶标确认的一个重要工具.同时,那些在靶标实验中证明有效的siRNA/shRNA本身还可以被进一步开发成为RNAi药物.
在药物标靶发现和确认方面,RNAi技术已获得了广泛的应用.生物技术公司或制药公司通常利用建立好的RNAi文库来引入细胞,然后通过观察细胞的表型变化来发现具有功能的基因.如可通过RNAi文库介导的肿瘤细胞生长来发现能抑制肿瘤的基因.一旦所发现的基因属于可用药的靶标（如表达的蛋白在细胞膜上或被分泌出细胞外）,就可以针对此靶标进行大规模的药物筛选.此外,被发现的靶标还可用RNAi技术在细胞水平或动物体内进一步确认.
在疾病治疗方面,双链小分子RNA或siRNA已被用于临床测试用于几种疾病治疗,如老年视黄斑退化、肌肉萎缩性侧索硬化症、类风湿性关节炎、肥胖症等.在抗病毒治疗方面,帕金森病等神经系统疾病已经开始初步采用RNA干扰疗法.肿瘤治疗方面也已经取得了一些成果.
RNA干涉(RNAinterference,RNAi)是指内源性或外源性双链RNA(dsRNA)介导的细胞内mRNA发生特异性降解,从而导致靶基因的表达沉默,产生相应的功能表型缺失的现象.
RNA干涉（RNAi）在实验室中是一种强大的实验工具,利用具有同源性的双链RNA（dsRNA）诱导序列特异的目标基因的沉寂,迅速阻断基因活性.siRNA在RNA沉默通路中起中心作用,是对特定信使RNA（mRNA）进行降解的指导要素.siRNA是RNAi途径中的中间产物,是RNAi发挥效应所必需的因子.siRNA的形成主要由Dicer和Rde-1调控完成.由于RNA 病毒入侵、转座子转录、基因组中反向重复序列转录等原因,细胞中出现了dsRNA,Rde-1(RNAi缺陷基因-1)编码的蛋白质识别外源dsRNA,当dsRNA达到一定量的时候,Rde-1引导dsRNA与Rde-1编码的Dicer（Dicer是一种RNaseIII 活性核酸内切酶,具有四个结构域：Argonaute家族的PAZ结构域,III型RNA酶活性区域,dsRNA结合区域以及DEAH/DEXHRNA解旋酶活性区）结合,形成酶-dsRNA复合体.Dicer 切割后形成siRNA,然后,在ATP的参与下,细胞中存在的一种RNA诱导的沉默复合体RNA-induced silencing complex RNAi干涉的关键步骤是组装RISC和合成介导特异性反应的siRNA蛋白.siRNA并入RISC中,然后与靶标基因编码区或UTR区完全配对,降解靶标基因,因此说siRNA只降解与其序列互补配对的mRNA.其调控的机制是通过互补配对而沉默相应靶位基因的表达,所以是一种典型的负调控机制.siRNA识别靶序列是有高度特异性的,因为降解首先在相对于siRNA来说的中央位置发生,所以这些中央的碱基位点就显得极为重要,一旦发生错配就会严重抑制RNAi的效应.
RNAi在基因沉默(silent gene)方面具有高效性和简单性,所以是基因功能研究的重要工具.
大多数药物属于标靶基因（或疾病基因）的抑制剂,因此RNAi 模拟了药物的作用,这功能丢失（LOF)的研究方法比传统的功能获得（GOF)方法更具优势.因此, RNAi 在今天的制药产业中是药物靶标确认的一个重要工具.同时,那些在靶标实验中证明有效的siRNA/shRNA本身还可以被进一步开发成为RNAi药物.
在药物标靶发现和确认方面,RNAi技术已获得了广泛的应用.生物技术公司或制药公司通常利用建立好的RNAi文库来引入细胞,然后通过观察细胞的表型变化来发现具有功能的基因.如可通过RNAi文库介导的肿瘤细胞生长来发现能抑制肿瘤的基因.一旦所发现的基因属于可用药的靶标（如表达的蛋白在细胞膜上或被分泌出细胞外）,就可以针对此靶标进行大规模的药物筛选.此外,被发现的靶标还可用RNAi技术在细胞水平或动物体内进一步确认.
在疾病治疗方面,双链小分子RNA或siRNA已被用于临床测试用于几种疾病治疗,如老年视黄斑退化、肌肉萎缩性侧索硬化症、类风湿性关节炎、肥胖症等.在抗病毒治疗方面,帕金森病等神经系统疾病已经开始初步采用RNA干扰疗法.肿瘤治疗方面也已经取得了一些成果.
如何根据真核蛋白的氨基酸序列获得其cDNA_问答详情_文库_其他分...123
ni林BA872021-08-15
真核物基组DNA十庞,其复杂程度蛋白质mRNA100倍左右,且含量重复序列采用电泳离杂交都难直接离目基其含内含等用序列染色体DNA发材料直接克隆目基主要困难.
高等物般具105种左右同基,定间阶段单细胞或体,都尽15%左右基表达,产约15000种同mRNAcDNA文库通RNA反转录由mRNA发cDNA克隆,其复杂程度要比直接基组克隆简单.
高等物般具105种左右同基,定间阶段单细胞或体,都尽15%左右基表达,产约15000种同mRNAcDNA文库通RNA反转录由mRNA发cDNA克隆,其复杂程度要比直接基组克隆简单.
cDNA文库的构建方法与原理 123
Onobel2021-08-23
不知道大家做过人的retina的CDNA文库构建吗？
我从未做过，不知道以下四种：
StandardcDNALibraries
LargeinsertcDNALibraries
NormalizedcDNALibraries
SubtractedcDNALibraries
其中StandardcDNALibraries和NormalizedcDNALibraries，SubtractedcDNALibraries有啥区别阿？
我只是想构建文库，以后可以用来做southern的probe，或者以后可以拿来做做蛋白方面的等等。
还有两个问题：
1.大家cDNA文库构建的时候都是先直接提取mRNA的吧？大家推荐以下用什么kit？
2.先提取总RNA然后再提取mRNA；直接从组织中提取mRNA.这两者有什么主要区别？
不好意思，如果提的问题是有错误，多多包涵。。。
我从未做过，不知道以下四种：
StandardcDNALibraries
LargeinsertcDNALibraries
NormalizedcDNALibraries
SubtractedcDNALibraries
其中StandardcDNALibraries和NormalizedcDNALibraries，SubtractedcDNALibraries有啥区别阿？
我只是想构建文库，以后可以用来做southern的probe，或者以后可以拿来做做蛋白方面的等等。
还有两个问题：
1.大家cDNA文库构建的时候都是先直接提取mRNA的吧？大家推荐以下用什么kit？
2.先提取总RNA然后再提取mRNA；直接从组织中提取mRNA.这两者有什么主要区别？
不好意思，如果提的问题是有错误，多多包涵。。。
【求助】关于cDNA文库构建测序问题 核酸基因技术讨论版...123
yudandan_19802021-08-26
CDNA文库筛选 实验方法 123
小柒pfum2021-07-22
1 核酸杂交
用,靠.规模析文库克隆.
1)同源探针:至少含所需cDNA克隆部确切序列.用于部克隆离cDNA文库全克隆.
2)部同源探针:探针序列与所要筛选cDNA克隆序列相关相同.用于克隆家族基.
3)总cDNA探针:
通反转录酶均匀掺入放射性核苷酸或通总或级离poly(A)+mRNA进行末端标记获cDNA探针.
cDNA扣除探针:
第种mRNA制备cDNA探 针, 连续与20倍量第二种mRNA杂交;
收未杂交cDNA探针, 再与100倍量第种mRNA杂交, 使原mRNA些特异序列高度富集.
* 主要用于探测cDNA文库与调节水平所差别mRNA克隆.
5)合寡核苷酸探针
2 特异性免疫检测
cDNA表达文库,目基表达产 物能与特异性抗体发免疫反应,通酶加检测
3 cDNA克隆同胞检测
cDNA文库若干组含10-100克隆易于处理亚cDNA文库,每组亚cDNA文库进行检测,鉴定阳性库再断其更细库进行检测,直获阳性单克隆.
4 cDNA克隆确证
cDNA克隆含编码某特定蛋白质完整氨基酸序列放读框.
第四节 目基离
外源基:
插入载体内特定片段基.
目基:
些已或者准备要离,改造,扩增或表达特定基或DNA片段.图" class="ikqb_img_alink">
用,靠.规模析文库克隆.
1)同源探针:至少含所需cDNA克隆部确切序列.用于部克隆离cDNA文库全克隆.
2)部同源探针:探针序列与所要筛选cDNA克隆序列相关相同.用于克隆家族基.
3)总cDNA探针:
通反转录酶均匀掺入放射性核苷酸或通总或级离poly(A)+mRNA进行末端标记获cDNA探针.
cDNA扣除探针:
第种mRNA制备cDNA探 针, 连续与20倍量第二种mRNA杂交;
收未杂交cDNA探针, 再与100倍量第种mRNA杂交, 使原mRNA些特异序列高度富集.
* 主要用于探测cDNA文库与调节水平所差别mRNA克隆.
5)合寡核苷酸探针
2 特异性免疫检测
cDNA表达文库,目基表达产 物能与特异性抗体发免疫反应,通酶加检测
3 cDNA克隆同胞检测
cDNA文库若干组含10-100克隆易于处理亚cDNA文库,每组亚cDNA文库进行检测,鉴定阳性库再断其更细库进行检测,直获阳性单克隆.
4 cDNA克隆确证
cDNA克隆含编码某特定蛋白质完整氨基酸序列放读框.
第四节 目基离
外源基:
插入载体内特定片段基.
目基:
些已或者准备要离,改造,扩增或表达特定基或DNA片段.图" class="ikqb_img_alink">
【求助】请教个基因组文库构建的问题 核酸基因技术讨论版...123
zyism_2021-07-23
基因组酶切后，切胶回收浓度大概为多少才可以进行下一步实验？为什么二十几的浓度和载体连不上呢？载体也明明去磷酸化了，单连载体的时候也不会自连。那为什么把载体和酶切后的基因组连起来转化后挑菌做PCR验证却有很多空载呢？我的基因组酶切大小为2kb~4kb。上面那排7kb~10kb的带是什么东西呢？
miRNA 在植物病毒基因组中的靶基因预测及分析123
dxy_6zlecemq2021-08-28
已经在mirbase数据库下载水稻的所有miRNA序列，可以比对某种昆虫的转录组文库寻找靶基因吗？
可以用targetscan或者miRwalk网站吗？有什么方法吗？
全长cDNA文库的构建——SMART技术 实验方法123
feeling2021-07-25
为什么要构建cdna文库_为什么真核生物需要构建cDNA文库_完美...123
中国装电视台2021-08-27
最好详细一点
建立cDNA文库最重要的酶是（ ）。_123
我是涂涂00572017-12-02
反转录酶：以mRNA为模板反转录合成DNA。
限制性内切酶：酶切目的基因和载体，使其产生相同的粘性末端。
DNA连接酶：连接目的基因和载体。
限制性内切酶：酶切目的基因和载体，使其产生相同的粘性末端。
DNA连接酶：连接目的基因和载体。
白介素1β(IL1β)ELISA试剂盒说明书和原理_123
liuzeyi20022018-01-22
RNA干扰（RNAi）：近年来的研究表明，将与mRNA对应的正义RNA和反义RNA组成的双链RNA(dsRNA)导入细胞，可以使mRNA发生特异性的降解，导致其相应的基因沉默。这种转录后基因沉默机制(post-transcriptionalgenesilencing,PTGS)被称为RNA干扰（RNAi）。
MicroRNA（miRNA,微RNA）：即为长度为22nt左右的5′端带磷酸基团、3′端带羟基的非蛋白编码的调控小RNA家族。
小的干涉RNA（siRNA）：是在RNA干涉过程中人工体外合成的小片段RNA，由约20个碱基对组成，包括5个磷酸盐，2个核苷和3个悬臂。
miRNA与siRNA之间有许多相同之处：1.二者的长度都约在22nt左右。2.二者都依赖Dicer酶的加工，是Dicer的产物，所以具有Dicer产物的特点。3.二者生成都需要Argonaute家族蛋白存在。4.二者都是RISC组分，所以其功能界限变得不清晰，如二者在介导沉默机制上有重叠。5.miRNA和siRNA合成都是由双链的RNA或RNA前体形成的。
miRNA与siRNA的不同点：1.根本区别是miRNA是内源的，是生物体的固有因素；而siRNA是人工体外合成的，通过转染进入人体内，是RNA干涉的中间产物。2.结构上，miRNA是单链RNA，而siRNA是双链RNA。3.Dicer酶对二者的加工过程不同，miRNA是不对称加工，miRNA仅是剪切pre-miRNA的一个侧臂，其他部分降解；而siRNA对称地来源于双链RNA的前体的两侧臂。4.在作用位置上，miRNA主要作用于靶标基因3′-UTR区，而siRNA可作用于mRNA的任何部位。5.在作用方式上，miRNA可抑制靶标基因的翻译，也可以导致靶标基因降解，即在转录水平后和翻译水平起作用，而siRNA只能导致靶标基因的降解，即为转录水平后调控。6.miRNA主要在发育过程中起作用，调节内源基因表达，而siRNA不参与生物生长，是RNAi的产物，原始作用是抑制转座子活性和病毒感染。
miRNA分离纯化测序
miRNA和RNA干扰相关资料
miRNA和RNA干扰-蚂蚁淘论坛
miRNA功能分析
miRNAPPT（我下载了一下很不错）
miRNA的加工
miRNA作用机理图（实验方法）
miRNA切较回收
回复：【求助】miRNA切胶回收-蚂蚁淘论坛
siRNA和miRNA区别
小分子量的RNA怎么证明就是miRNA?
miRNA的RT-PCR
回复：【交流】关于miRNA的RT-PCR-蚂蚁淘论坛
miRNA和siRNA的PDF文献
两个miRNA的序列数据库
2个miRNA的数据库-蚂蚁淘论坛
MicroRNAProtocols
RNA干扰技术
MicroRNA重要文献
小RNA，siRNA，miRNA研究进展
siRNA转染操作讨论
siRNA转染浓度问题-蚂蚁淘论坛
回复：【求助】siRNA转染的疑问-蚂蚁淘论坛
回复：【求助】siRNA转染的两个问题，请教过来人-蚂蚁淘论坛
siRNA转染阴性对照
magiclyj战友整理的关于siRNA资料
分子生物学常规技术帖子整理(长期有效）——有奖征集-蚂蚁淘论坛
供参阅，大家可以多多参与交流！
MicroRNA（miRNA,微RNA）：即为长度为22nt左右的5′端带磷酸基团、3′端带羟基的非蛋白编码的调控小RNA家族。
小的干涉RNA（siRNA）：是在RNA干涉过程中人工体外合成的小片段RNA，由约20个碱基对组成，包括5个磷酸盐，2个核苷和3个悬臂。
miRNA与siRNA之间有许多相同之处：1.二者的长度都约在22nt左右。2.二者都依赖Dicer酶的加工，是Dicer的产物，所以具有Dicer产物的特点。3.二者生成都需要Argonaute家族蛋白存在。4.二者都是RISC组分，所以其功能界限变得不清晰，如二者在介导沉默机制上有重叠。5.miRNA和siRNA合成都是由双链的RNA或RNA前体形成的。
miRNA与siRNA的不同点：1.根本区别是miRNA是内源的，是生物体的固有因素；而siRNA是人工体外合成的，通过转染进入人体内，是RNA干涉的中间产物。2.结构上，miRNA是单链RNA，而siRNA是双链RNA。3.Dicer酶对二者的加工过程不同，miRNA是不对称加工，miRNA仅是剪切pre-miRNA的一个侧臂，其他部分降解；而siRNA对称地来源于双链RNA的前体的两侧臂。4.在作用位置上，miRNA主要作用于靶标基因3′-UTR区，而siRNA可作用于mRNA的任何部位。5.在作用方式上，miRNA可抑制靶标基因的翻译，也可以导致靶标基因降解，即在转录水平后和翻译水平起作用，而siRNA只能导致靶标基因的降解，即为转录水平后调控。6.miRNA主要在发育过程中起作用，调节内源基因表达，而siRNA不参与生物生长，是RNAi的产物，原始作用是抑制转座子活性和病毒感染。
miRNA分离纯化测序
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siRNA和miRNA区别
小分子量的RNA怎么证明就是miRNA?
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小RNA，siRNA，miRNA研究进展
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老师您好,最近在做干扰,说SiRNA起效需46小时,那我认为在某一...123
蚂蚁囊浇312021-08-22
基因的表达是DNA-RNA-蛋白,期间有转录水平调控、转录后调控、翻译后调控等多种调控机制影响该基因的表达.所以蛋白水平高低的原因就可能是多方面的.蛋白表达多,可能是mRNA多,也可能mRNA变化不大,而是翻译多了；蛋白表达少,原因亦然.从2个水平检测一个基因的表达,可以更全面地了解该基因在该组织某个时期或某种条件下的变化受到什么水平的调控.
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