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TheNativeAntigenCompany/Rabbit Anti-Borrelia burgdorferi sensu stricto (B31) OspC Antibody/100ug/PAB21455-100_蚂蚁淘,【正品极速】生物医学科研用品轻松购|ebiomall 蚂蚁淘商城
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TheNativeAntigenCompany/Rabbit Anti-Borrelia burgdorferi sensu stricto (B31) OspC Antibody/100ug/PAB21455-100
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RABBIT ANTI-BORRELIA BURGDORFERI SENSU STRICTO (B31) OSPC ANTIBODY

Rabbit Anti-Borrelia burgdorferi OspC antibody, is a polyclonal suitable for use in ELISA and Western blotting applications.

PRODUCT DETAILS – RABBIT ANTI-BORRELIA BURGDORFERI SENSU STRICTO (B31) OSPC ANTIBODY

  • Rabbit anti-B. burgdorferi sensu stricto OspC polyclonal IgG antibody (strain B31).
  • Greater than 95% purity by SDS-PAGE and buffered in 0.02 M Potassium Phosphate, 0.15 M Sodium Chloride, pH 7.2.

BACKGROUND

Strain B31 is the type strain (ATCC 35210) for this organism and was derived by limited dilutional cloning from the original Lyme-disease tick isolate obtained by A. Barbour (Johnson, et al., 1984).

Outer Surface Protein C, or OspC, is a 22 kDa immunogenic protein on the outer surface of the spirochete, B. burgdorferi (Caine, et al., 2017). OspC’s function is not known, but it is located by lipid-anchoring sites on the outer cell membrane, although it is not believed to be associated with lipid rafts (Grimm, et al., 2004; Toledo, et al., 2014).

OspC has been shown to be a requisite for B. burgdorferi to establish mammalian infection as well as for spirochaetal transmission from ticks to mammals. Expression begins during blood feeding by the nymphal tick and continues to be produced in the early stages of infection in the mammal host and is highly immunogenic in mice. As one of the strategies to evade host humoral responses, spirochetes downregulate OspC production in response to anti-OspC antibodies within 2 to 3 weeks after infection in mice (Grimm, et al., 2004).

OspC also has been proposed to play roles in promoting survival and/or dissemination of spirochetes within the mammalian host. For example, OspC binds to a tick salivary protein, Salp15, which can protect spirochetes from complement- and antibody-mediated killing (Hovius, et al., 2008). OspC also binds host plasminogen and this phenotype correlates with invasiveness of spirochetes in mice (Tilly, et al., 2006) and has antiphagocytic properties, aiding spirochete evasion of mononuclear phagocytes during early infection in mammals (Carrasco, et al., 2015).

OspC is required for B. burgdorferi infection in both immunocompetent and SCID mice (lacking B and T cells) and has been proposed to facilitate evasion of innate immune defences. An OspC knockout mutant was cleared within the first 48 h of infection in a murine host, suggesting a protective role of OspC against innate defences. Constitutive expression of heterologous lipoproteins in the OspC mutant was shown to restore infection in SCID mice, suggesting that OspC may also play a nonspecific structural role for B. burgdorferi (Smith, et al., 2018).

REFERENCES

  • Caine, J. A. et al., 2017. Borrelia burgdorferi outer surface protein C (OspC) binds complement component C4b and confers bloodstream survival. Cell Microbiol., Volume 12, p. 19.
  • Carrasco, S. E. et al., 2015. Outer Surface Protein OspC Is an Antiphagocytic Factor That Protects Borrelia burgdorferi from Phagocytosis by Macrophages. Infection and Immunity, Volume 83.
  • Grimm, D. et al., 2004. Outer-surface protein C of the Lyme disease spirochete: a protein induced in ticks for infection of mammals. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., Volume 10.
  • Hovius , J. W. et al., 2008. Preferential protection of Borrelia burgdorferi sensu stricto by a Salp15 homologue in Ixodes ricinus saliva. J Infect Dis., 198(8), pp. 1189-97.
  • Johnson, R.C., et al. 1984. Borrelia burgdorferi sp. nov.: etiologic agent of Lyme disease. Int J Syst Bacteriol, 34, pp. 496–497.
  • Smith, T. C. et al., 2018. Borrelia host adaptation Protein (BadP) is required for the colonization of a mammalian host by the agent of Lyme disease. Infect Immun. .
  • Tilly, K. et al., 2006. Borrelia burgdorferi OspC protein required exclusively in a crucial early stage of mammalian infection. Infect. Immun. , Volume 74, p. 3554–3564.
  • Toledo, A. et al., 2014. Selective Association of Outer Surface Lipoproteins with the Lipid Rafts of Borrelia burgdorferi. mBio, 5(2).

Product datasheet – PAB21455-25Product datasheet – PAB21455-100Safety datasheet

Western blot showing detection of 0.1µg of recombinant OspC protein. Lane 1: Molecular weight markers. Lane 2: MBP-OspC fusion protein (arrow; expected MW: 63.1 kDa). Lane 3: MBP alone. Protein was run on a 4-20% gel, then transferred to 0.45 µm nitrocellulose. After blocking with 1% BSA-TTBS overnight at 4°C, primary antibody was used at 1:1000 at room temperature for 30 min. HRP-conjugated Goat-Anti-Rabbit secondary antibody was used at 1:40,000 in HiGlo Blocking Buffer and imaged on the VersaDoc™ MP 4000 imaging system (Bio-Rad).

Dry ice – PAB21455-25Ambient – PAB21455-100

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一、实验目的 掌握植物总DNA的抽提方法和基本原理。学习根据不同的植物和实验要求设计和改良植物总DNA抽提方法。 二、实验原理 通常采用机械研磨的方法破碎植物的组织和细胞,由于植物细胞匀浆含有多种酶类(尤其是氧化酶类)对DNA的抽提产生不利的影响,在抽提缓冲液中需加入抗氧化剂或强还原剂( 查看更多>
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细菌RNA试剂盒提完后有DNA污染,去除DNA的方法:做普通pcr,看看条带对不对。DNase I 处理,酚氯仿抽,然后isopropanol沉淀,DEPC水溶。 不需专门灭火,因为在反转录前有一个步骤是加热变性。一般是75度5min 后面取不超过40%反转录体积的RNA用于反转录,但反转录前最好检测一下RNA质量,免得浪费反转录酶。
但是,这样做的前提的,RNA提得要好,浓度要高,这样免得RNA降解到不能用了。因为在有二价阳离子的(DNAseI buffer含有)情况下,RNA在60度以上时必然发生非酶促降解。
接下来的实验需要用石蜡切片组织提取DNA用于测序判断基因突变,请问各位经验人士是否可行?
先谢了

用takara的in-fusion方法做了个重组质粒,如左图PCR验证,右起第二道是空载质粒为模板的对照。右图是酶切验证,两个图片结合起来觉得除了第四个单克隆外,其他几个应该都可能是阳性克隆。结果送了1,2两个样品后测序的结果都不对。为什么会这样。

我用的是华美生物工程公司全血基因组DNA纯化系统试剂盒,说明书上说利用A260光吸测定浓度对该方法制备的基因组DNA是不适用的,产量可达1ug/20ul全血,5-10ul上清液可以直接用于PCR扩增。
我分别用3ul、5ul、8ul都试过了,没有任何条带,用别人别的方法提好的DNA做,却能出现结果,不知道是自己提取的DNA浓度不够,还是根本没有提取出来。
不知道谁用过,或者有更好的全血提取NDA的试剂盒推荐呢?
本人刚刚开始做PCR,谢谢各位高手!
二代测序总结 123
liuygi2021-07-25

二代测序技术给生命科学领域带来了彻底的改变,而NGS领域本身也在经历着某种意义上的变革。本文对二代测序领域的最新进展做了小结,其涉及的公司包括454LifeSciences,Illumina,LifeTechnologies,PacificBiosciences,OxfordNanopore等。

自从哈佛大学遗传学家GeorgeChurch和454LifeSciences公司JonathanRothberg掀起二代测序NGS的**以来,已经过去了将近十年。毫不夸张地说,这段时间以来NGS技术已经发生了翻天覆地的变化,在测序通量突飞猛进的同时,测序成本直线下降。
想当年454LifeSciences公司测序580-kb的细菌基因组,需要四小时的工作循环。而今年一月份Illumina公司发布的HiSeqX?Ten测序系统,能够以千元成本测序完整的人类基因组,最多每天能测序600billionbp。
如今,二代测序技术给生命科学领域带来了彻底的改变。而NGS领域本身也在经历着某种意义上的变革。正因如此,基因组学ArchonX奖(ArchonGenomicsXPrize)不得不于去年八月宣布取消,因为测序成本的直线下降已经使竞赛变得毫无意义。
Church的团队是该竞赛仅有的两只报名队伍之一,他认为参赛者们是否能够完成竞赛任务还很难预料。但无论如何,既然竞赛已经启动,总得让人家比完吧。
言归正传,二代测序领域的2013年既忙碌又喧嚣,在开年之际让我们对这一领域发生的最新进展做个小结吧。
454LifeSciences
去年十月,454LifeSciences宣布将于2016年中旬逐步淘汰其焦磷酸测序仪器,GSJunior和GSFLX+。据该公司介绍,从扩展性和成本角度看,454平台作为首个商业化的NGS系统已经基本上走到尽头,很难再对其进行升级和改良。Roche的BethButton指出,公司正在寻求新的测序合作伙伴。2013年9月,该公司宣布与昔日的竞争对手PacificBiosciences合作,拟基于PacBio公司的SMRT技术进行诊断产品的开发。
Illumina
今年一月Illumina公司发布了两个以Solexa测序技术为基础的新测序平台,HiSeqXTen和NextSeq?500。
据该公司的新闻稿介绍,定价$250,000的台式NextSeq500兼具了样品制备和测序功能。“它按钮式的操作,可以在许多常见测序应用之间切换。该系统能够在一天内测序整个人类基因组和多达16个外显子组。”NextSeq500运行75个测序循环只需12小时。
HiSeqXTen系统以10台仪器为单位销售,据称可以实现千元成本的人类基因组测序。该系统现定价1000万美元,能够在三天时间内生成1.8terabases的数据,相当于每天约600Gb,比HiSeq2500强十倍。
华盛顿大学的ElaineMardis表示,HiSeqXTen系统针对的应该是提供人类基因组测序的服务产业,因为很少有研究机构能用到如此高的通量。“要想实现千元成本,就需要正确的样本量,”她说。当然,高通量还意味着更为复杂的数据分析。
Mardis的团队曾作过计算,为了跟上HiSeqXTen他们可能需要花费八百万美元在信息学设施上。此外,实现千元成本意味着每年需要测序18,000到20,000个基因组。“我要测序许多肿瘤基因组,”她说。“但数量还远远不够。”
LifeTechnologies
已被ThermoFisher收购的LifeTechnologies拥有两款NGS平台,SOLiD和IonTorrent。据Thermo的AndyFelton介绍,公司已经将工作的重心放在后者身上。“绝大多数研发工作已经转移到Ion上,”他说。
目前的IonPGM系统可使用最新的Ion318芯片,产出多达6million400bp的读取,也就是说四小时运行的产量能达到2Gb。而新IonProton?使用IonPI?芯片,能够产出80million200bp的读取,即每次运行产量达到10Gb至14Gb。
据介绍,今年公司将会推出用于转录组测序的新IonPII芯片,每张这样的芯片可产出300million100bp的读取,随着系统改良甚至可能达到200bp。
此外,LifeTechnologies公司正在研发一种新的聚合酶,Hi-Q。据Felton介绍,Hi-Q能“显著提高精确性”,减少90%的插入/缺失误差。这种酶将于今年的中旬实现全面商业化。
PacificBiosciences
PacificBiosciences公司以长读取的二代测序技术著称。据该公司的创始人SteveTurner介绍,在新测序化学P5-C3的帮助下,如今PacificBio的测序读长已经达到了8.5kb。P5-C3“提供了一个保护性的支架”,可以阻止酶和荧光团之间发生身体接触,避免酶受到潜在的光学损伤。
“我们已经很大程度上减少了系统中的光学损伤,我们相信现在测序读长受到的限制,只来自于样品本身,”Turner说。样品本身的限制是指,读长越长就越难生成不含损伤位点或缺口的测序模板,而这样的缺口会导致测序过早中止。
目前PacBio®RSII和SMRTCell系统,每次运行可产出50,000个读取(约400millionbp)。这一数字会在接下来的一年中继续增涨,Turner说。“我们预计在2014年内,令测序读长再增加50%,并于2015年达到20,000bp。”
最近研究人员发表文章向人们展示,在新装配方法HGAP的帮助下(hierarchicalgenome-assemblyprocess),可以实现只利用PacBio化学法对真核基因组进行从头装配。一月份,该公司公布了对黑腹果蝇(Drosophilamelanogaster)进行的完整二倍体基因组装配,生成了长达24.6Mb的重叠群(contigs),N50值为15.2Mb(N50值反映了重叠群的长度)。就在上周,PacBio公司又公布了一个54x覆盖度的单倍体人类基因组装配,生成了“3.25Gb的基因组装配,重叠群N50值为4.38Mb,其中最长的重叠群达到44Mb。”
OxfordNanopore
OxfordNanopore公司无疑是纳米孔测序的领导者,这一技术也被称为第三代测序。该公司去年十月份宣布,将在2014年年初推出USB大小的MinION?测序仪,为客户提供先期体验(early-access)。
与其他类似先期体验项目不同的是,OxfordNanopore公司不会局限于传统的测序中心,而是向广大的个人用户敞开大门。该公司准备在接下来的一周发出邀请。
OxfordNanopore公司强调,不是每个MinIONAccessProgram(MAP)申请者都会在第一轮受到邀请,而且公司提供的MinION数量也可能少于申请者的要求。这些仪器将在六周内进行发送。
2012年,OxfordNanopore公司在AGBT上描述了两个测序系统,MinION就是其中之一,另一个产品是GridION?。据公司发言人称,MinION的大小使其更容易受到人们的关注,它的灵活性和测序能力将推动NGS进一步迈向普罗大众。
OxfordNanopore公司希望通过MinIONAccessProgram评估测序系统的实用性、对不同应用的适应性、数据分析、以及公司的物流运输和试剂分配等。这些数据将有助于未来开展的GridION先期体验项目,不过该公司还未公布这一项目的具体启动时间。
广泛的应用前景
在二代测序技术不断进步的同时,它的应用也越来越广泛。据Mardis介绍,二代测序在临床领域的应用快速增涨。越来越多的研究者选择二代测序的多基因panel对肿瘤进行研究,或者通过外显子测序鉴定潜在的药物靶点。在诊断儿童遗传学疾病时,人们也逐渐抛开了传统的诊断方法,转而使用全外显子组测序。
Mardis补充到,NGS检测有两大优势,它既可以帮助人们确定治疗方案,也可以为患儿父母评估他们未来子女患同样疾病的风险。实际上Church认为,用二代测序进行(致病基因)携带者筛查,是NGS的“杀手锏”。
“任何考虑使用辅助生殖手段的人…都应当知道精子捐献者是否携带与严重疾病有关的隐性等位基因,”他说。“人们已经发现了数百个能够预测疾病的基因,现在也有不少服务可以对它们进行准确的检测。”
最近,Church作为共同作者发表了一项新研究。据他介绍,这是首次发表用NGS进行携带者筛查的文章,他们的方法“充分提高了质量并且降低了成本”。研究团队使用padlock探针,在194个细胞系中抽出并测序了15个有临床意义的基因,其中55个细胞系来自于携带上述基因突变的个体。
二代测序的另一个新兴的应用领域是单细胞RNA测序。“单细胞RNA测序能向我们展示,相同细胞中RNA表达的天然随机性,这一点非常吸引人。”Mardis说。
Church介绍到,他即将发表的一篇文章描述了一种新的测序方案,称为荧光原位测序(fluorescentinsitusequencing)。这一技术将荧光原位杂交和RNA-Seq结合起来,能够计数并确定不同转录本在组织切片中的空间定位。
Church的团队通过荧光原位测序证实,转录本会依据伤口的愈合情况在成纤维细胞中呈不对称分布。(Science禁止透露进一步的细节)
这样的数据在十年前简直难以想象。同样,我们也很难想象NGS在未来十年又会发生怎样的翻天覆地的变化。
来源:生物探索
天跟试剂盒提取多糖多酚植物总rna浓度一直很低是什么原因
用醌指纹法描述微生物群落的参数[7]有:(1)醌的类型和不同类型的醌的数目;(2)占优势的醌及其摩尔分数含量;(3)总的泛醌和总的甲基萘醌的摩尔分数之比;(4)醌的多样性和均匀性;(5)醌的总量等。对两个不同的群落,由上述分析所得数据可以计算出另一个参数____非相似性指数(D),用于定量比较两个群落结构的差异。
醌指纹法具有简单快速的特点,近几年来广泛用于各种环境微生物样品(如土壤,活性污泥和其它水生环境群落)的分析。
全长cDNA文库的构建方法123
doublehorses2021-08-08
我想构建一个细胞的全长CDNA文库,不知哪位大虾用过Clontech公司的SMARTcDNALibraryConstructionKit。效果怎么样?价位大约多少?还有无其它试剂盒?谢谢!!!
BigDye Terminator v3.1简称BDT,是ABI公司的测序专用kit,成分包含了taq酶,标记了大荧光染料的ddNTP等,是类似PCR扩增试剂的Mix,进行的是线性扩增得到碱基的排序。

各位战友好,因实验要求需要提取人的唾液DNA,但因标本需要在临床采集,无法做到当天就提取DNA,因此天根等漱口水提DNA的试剂盒都不满足实验需求。

之前一直在用艾德莱的唾液DNA保存运输提取试剂盒,但是这段时间下来感觉提取效率太低,而且特别不稳定,经常50%以上的标本都提不出来DNA,或者浓度特别低,完全崩溃的感觉!所以想更换试剂盒或者直接提供唾液DNA的保存液。另国外的这种试剂盒太贵了,因经费问题无法承受,所以希望战友们能够推荐一家效率高些的试剂盒,小女子不胜感激!!

肺癌靶向药基因测序需要多长时间
1.TaqMan探针法 针对染色体上的不同SNP位点分别设计PCR引物和TaqMan探针,进行实时荧光PCR扩增。探针的5’-端和3’-端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。当溶液中存在PCR产物时,该探针与模板退火,即产生了适合于核酸外切酶活性的底物,从而将探针5’-端连接的荧光分子从探针上切割下来,破坏两荧光分子间的PRET,发出荧光。通常用于少量SNP位点分析。
2.SNaPshot法 该技术由美国应用生物公司(ABI)开发,是基于荧光标记单碱基延伸原理的分型技术,也称小测序,主要针对中等通量的SNP分型项目。在一个含有测序酶、四种荧光标记ddNTP、紧临多态位点5’-端的不同长度延伸引物和PCR产物模板的反应体系中,引物延伸一个碱基即终止,经ABI测序仪检测后,根据峰的移动位置确定该延伸产物对应的SNP位点,根据峰的颜色可得知掺入的碱基种类,从而确定该样本的基因型。对于PCR产物模板可通过多重PCR反应体系来获得。通常用于10-30个SNP位点分析。
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