Description
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Transfection Reagent for SK-BR3 Cells (Breast Adenocarcinoma Cells, HTB-30)
- Proprietary cationic lipids formulation
- High transfection efficiency of small RNA (siRNA, shRNA, miRNA), mRNA, pDNA
- Effective and robust intracellular delivery
- Work in the presence of serum
- Download in vitro SK-BR3 transfection protocol: [PDF]
- Download SK-BR3 CRISPR/Cas9 transfection protocol: [PDF]
- Download PowerPoint presentation for SK-BR3 cells transfection kit: [PPT]
- Developed and manufactured by Altogen Biosystems
Transfection Efficiency:
Reagent exhibits at least 94% transfection efficiency of siRNA delivery. Transfection efficiency was determined by qRT-PCR.
Transfection Protocol and MSDS:
Download Altogen Biosystems SK-BR3 Transfection Protocol: [PDF]
Download MSDS: [PDF]
SK-BR3 Cell Line:
Breast cancer is considered the most common malignancy in females as well as a significant public health issue. The SK-BR-3 tumorigenic cell line was established in 1970 by G. Trempe and L. J. Old from the mammary gland of a 43-year-old Caucasian female with breast adenocarcinoma. The SK-BR-3 cells were derived from a metastatic site by pleural effusion. Many of these tumorigenic cells exhibit polyploidy or an increased number of chromosomes. The SK-BR-3 cell line is considered a hypertriploid cell line with a very complex chromosome composition. The HER2/c-erb-2 gene product is overexpressed, and the modal chromosome number of 84 occurs in approximately 34% of cells. The SK-BR-3 cell line includes microvilli and desmosomes as well as glycogen granules. The SK-BR3 cell line is useful for studying antibody resistance in some breast cancer cells. Altogen Biosystems provides high-efficiency transfection kits for this cell line.
Data:
Figure 1. Cyclophilin B silencing efficiency was determined by qRT-PCR in the SKBR3 cells transfected by Cyclophilin B siRNA or non-silencing siRNA control following the recommended transfection protocol. Cyclophilin mRNA expression levels were measured 48 hours post-transfection. 18S rRNA levels were used to normalize the Cyclophilin B data. Values are normalized to untreated sample. Data are presented as means ± SD (n=6).
Figure 2. Protein expression of Cyclophilin B in SK-BR-3 cells. DNA plasmid expressing Cyclophilin B or siRNA targeting Cyclophilin B were transfected into SK-BR-3 cells following Altogen Biosystems transfection protocol. At 72 hours post-transfection the cells were analyzed by Western Blot for protein expression levels (normalized by total protein, 10 µg of total protein loaded per each well). Untreated cells used as a negative control.
Selected in vivo transfection product citations (ALTOGEN® IN VIVO Transfection Kits used in the following publications):
- 2008 454(7203):523-7. Innate immunity induced by composition-dependent RIG-I …Saito et al [PDF]
- Am J Pathology. 2010 177(4):1870-80. Role of ocular complement factor H in a murine model … Lyzogubov et al [PDF]
- Nature Biotechnology. 2011 29(4):341-5. Delivery of siRNA to the mouse brain by … Alvarez-Erviti et al [PDF]
- Cancer Research. 2011 71(15):5144-53. Inhibition of miR-193a expression by… Iliopoulos et al [PDF]
- 2010 16(11):2108-19. RNase L releases a small RNA from HCV RNA that refolds … Malathi et al [PDF]
- 2012 55(7):2069-79. The p47phox- and NADPH oxidase organiser 1 … Youn et al [PDF]
- British Journal of Cancer. 2012 107(3):516-26. TIGAR induces p53-mediated cell-cycle … Madan et al [PDF]
- 2014 63(2):353-61. Tissue transglutaminase contributes to … Liu et al [PDF]
- Circulation Research. 2010 15;107(8). Kruppel-like factor-4 transcriptionally regulates … Cowan et al [PDF]
- 2012 59(1):158-66. Role of uncoupled endothelial nitric oxide synthase … Gao et al [PDF]
- Jounal of Biological Chemistry. 2012 287(4):2907. Chaperoning of mutant p53 protein … Gogna et al [PDF]
- PLoS Pathogens. 2012 8(8) Uridine composition of the poly-U/UC tract of HCV RNA … Schnell et al [PDF]
- J Proteome Res. 2012(11) Retinal proteome analysis in a mouse model of oxygen-induced … Kim et al [PDF]
- 2011 141(2) Differential type I interferon-mediated autophagic trafficking … Desai et al [PDF]
- PLoS Pathog. 2014 10(10) Exosomes from hepatitis C infected patients transmit HCV … Bukong et al [PDF]
SK-BR3 Transfection Kit
Altogen Biosystems:
Altogen Biosystems provides pre-optimized transfection kits and electroporation products for life science research. Transfection products are developed for individual cancer cell line and transfection protocols are optimized to enable high transfection efficiency of biomolecules. Altogen Biosystems developed in vivo delivery products for small animal research, mouse and rat targeted tissue delivery: liver targeted, pancreas targeted, kidney targeted, PEG-Liposome-, Nanoparticle-, Lipid-, and Polymer-based in vivo transfection kits. Advanced formulation of reagents and optimized transfection protocols provide efficient intracellular delivery of biomolecules. Read more about transfection technology at Altogen’s Transfection Resource.
Altogen Research Services:
Altogen Labs provides GLP-compliant contract research studies for pre-clinical research, IND applications, and drug development. Biology CRO services include: Xenograft models (30+), development of stable cell lines, ELISA assay development, cell-based and tissue targeted RNAi studies, safety pharm/tox assays, and other studies (visit AltogenLabs.com).
Volume Options:
- 0.5 ml (Catalog #6905)
- 1.5 ml (Catalog #6906)
- 1.5 ml CRISPR (Catalog #2192)
- 8.0 ml (Catalog #7085)
AltogenBiosystems是一家开发和制造用于生命科学研究，药物发现和开发的转染试剂盒的生物技术公司。转染试剂盒针对特定癌细胞系和原代细胞培养进行了优化，可将生物分子有效递送到靶组织中。通过先进的试剂配方和优化的转染方案实现体外（癌细胞系）和体内（动物组织靶向试剂、癌细胞系）递送货物分子，包括质粒DNA，各种类型的RNA（mRNA，siRNA，shRNA，microRNA），蛋白质和小分子研究。
Altogen生命科学公司致力于研发，生产和销售特定细胞系的转染试剂，用于细胞间生物分子的传递，并通过对转染试剂类型的设计将siRNA和质粒DNA有效地转入不同的细胞系和原代细胞内。Altogen公司开发的聚合物，脂质体，纳米粒子为基础的转染技术分别针对分子生物学，组合化学，和细胞生物学而分别应用。Altogen定制服务提供符合GLP要求定制研究服务，包括代稳定的细胞系，细胞银行和冷冻保存，焦磷酸测序，克隆，RNA干扰（RNAi）和基因沉默服务，发展分析，siRNA文库筛选，并转染服务。稳定的肿瘤细胞株和原代细胞的产生，可以是非常昂贵和费时。该公司的细胞培养科学家的细胞株的选择，无论是利息或shRNA表达载体的稳定表达的基因改造。标准的RNAi技术服务，包括设计与合成的siRNA的利益，验证siRNA的沉默效率，siRNA转染条件的优化，使高效的基因沉默细胞系或原代培养细胞的靶基因。转染培养细胞的瞬时或稳定的引入外源性分子和遗传物质（即RNA或DNA），通常是在生物实验室用来研究基因功能，基因表达的调节，生化映射，突变分析，和蛋白质的生产。科学家利用各种载体分子，这种分子，使质粒DNA（PDNA），信使RNA（mRNA），短干扰RNA（siRNA），小分子RNA（miRNA）的，并进入肿瘤细胞株和原代细胞的蛋白质的基因交付。不幸的是，无单提货的方法或转染试剂，可以适用于所有类型的细胞，细胞的细胞毒性和转染效率显着不同，取决于试剂，协议，并正在利用细胞类型。Altogen生物系统公司提供超过60种类型的细胞的预优化转染试剂盒。纳米粒子，脂质和聚合物基ALTOGEN®在体内转染试剂，使交付功能的RNA和DNA分子在体内。PEG脂质体在体内输送系统减少由于PEG修饰的先天免疫反应，并提供高效的siRNA转染的DNA，并在体内的蛋白质。由科学“杂志（2010年12月17日）：PEG脂质体在体内转染试剂盒siRNA的特色Altogen生物系统功能的特定细胞系转染试剂盒
120+细胞转染试剂和活体组织靶向试剂盒制造商AltogenBiosystems是一家生物技术公司，开发和制造用于生命科学研究、药物发现和开发的转染试剂盒。Altogen®体内转染试剂可有效地将生物分子导入靶组织。细胞转染试剂盒针对特定的癌细胞系和原代细胞进行了优化。通过先进的试剂配方和优化的转染方案实现货物分子（DNA、RNA、蛋白质）的高效传递。AltogenBiosystems利用高分子化学、分子和细胞生物学的专业知识，开发了新的体内外给药技术。转染是将外源分子导入培养细胞中，常用于研究基因功能、基因表达调控、生化定位和蛋白质生产。不幸的是，由于细胞毒性和转染效率的差异很大，并且取决于所使用的试剂、方案和细胞类型，因此没有一种单一的传递方法或转染试剂可应用于所有类型的细胞。AltogenBiosystems为120多个癌细胞系和原代细胞类型提供优化的转染试剂盒和电穿孔产品。体内转染试剂可实现组织靶向给药。Altogen的转染试剂盒包括用于体外（癌细胞系）和体内（用于动物研究的组织靶向试剂）转染的转染增强剂试剂和转染复合物冷凝器。Altogen实验室提供符合GLP的实验室合同研究服务。我们的生物CRO服务包括异种移植物的疗效、IND应用的pharm/tox研究和安全性测试、分析开发（ELISA、IC-50、qPCR）、90多个异种移植物动物模型、RNAi和基因沉默服务。Altogen的细胞培养科学家通过在28天内培育出稳定的细胞系，将选择的细胞系转化为稳定表达感兴趣的基因。
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不知单纯使用冰浴中超声裂解够了吗？还是说要选用裂解液呢？最主要的就是我不知道该怎么赔这个裂解液，使其COX活性不产生影响
裂解液裂解是一种比较温和的红细胞去除方法,主要用于经酶消化分散的组织细胞的分离纯化，淋巴细胞的分离纯化以及组织细胞蛋白与核酸提取等实验中红细胞的去除。经红细胞裂解液裂解得到的组织细胞中不含红细胞，可进一步用于原代培养、细胞融合、流式细胞分析、核酸与蛋白的分离和提取等。
(1)1×107细胞重悬,其来源可为新鲜样品或贮存于-80℃1mol冰冻清洗缓冲液中
的无DMSO的样品,冰冻缓冲液包括10mMHEPES(pH7.5),1.5mMMgCl2,10mMKCl,
1mM二硫苏糖醇(DTT),然后离心(16000rpm、4℃、1min)。
(2)重悬细胞团于100ul冰冻裂解缓冲液,其包含10mMTris-HCl(pH7.5),1mMMgCl2,1mMEGTA,0.1mM苯甲基磺酰氟(DMSF),5mMB2巯基乙醇,0.5%CHAPs(Pierce)和10%甘油。
(3)冰育30分,然后在超速离心机中离心30分钟。
(4)去上清,液氮速冻沉淀,裂解细胞于-80℃保存。
二、扩增
(1)在微量管中冻干0.1ug荧光标记的cx反转引物,蜡封(5′CCCTTACCCTTACCC
TTACCCTTA3′)。
(2)于蜡界之上加50ulTRAP反应物,包括Tris-Cl(pH8.3)20mM,1.5mMMgCl2,
63mMKCl,0.005%,TWeen20,1mMEGTA,50mM三磷酸脱氧核苷,0.1ug荧光标记
TS前导引物(5′AATCCGTCGAGCAGAGTT3′),1ugT4基因32蛋白,牛血清白蛋白0.1mg/ml,2UTaqNDA聚合酶(Takara,shyzou)和5ugCHAPs细胞提取液。荧光标记TS引物可由市场购得。扩增前5ug提取物与1ugRNA酶37℃水浴20分钟,为了端粒酶活性的标准化,运用体内端粒酶活性标准(TTAS):TS重叠引物和CX重叠引物(TS:5′AATCCGTCGAGCAGAGTTGTGAATGAGGCCTTC3′及CX:5′CCCTTACCCTTACCCTTACCCTTATAGGCGCTCAATGTA3′)TS(18bp)和CX(24bp)序列为普通型,下划线标出的为成肌素序列(每个15bp)。成肌素CDNA通过这些引物扩
增产生了150bp的产物,它可用与ITAS扩增端粒酶梯度相同的TS引物和CX引物进行
再扩增。每一项测定用25attogram以显现I-TAS,它并不干扰TRAP测量。
(3)置于22℃10分钟,作为TS引物由端粒酶介导的延伸。90℃热灭活反应物90秒。
(4)PCR扩增,条件94℃30S,50℃30S,72℃1.5min;共27循环。
三、分析
(1)制备8%的变性胶(longRanger,ATBiochem)含6M尿素。
(2)加电泳缓冲液(1×TBE)于电泳槽。
(3)上样缓冲液与产物各1ul混合后上样,上样缓冲液含90%甲酰胺和10%蓝葡聚
糖(Bluedertian)。
(4)95℃预发性4分钟,速冷,上样,运用100bp,150bp,200bp大小荧光标记物。
(5)测序
(6)测序结果由FiagmuntManager程序自动分析,每一荧光峰根据大小、高度、面积定
量。因为过量扩增的产物会产生不可信的面积值,一部分PCR产物应在蒸馏水稀释后再分析
1细胞用冷PBS洗两遍，离心，去除上清；
2加50～100ul三去污细胞裂解液；
3加PMSF，AP各1ul;
4用100ulTIp头吹打数次；
5置冰上15分钟
612000rpm,15min,4度
7取上清。这时，上清呈黏液状，用枪头吸时会将细胞碎片一起吸出。拉丝度很长，测蛋白浓度显示有，各位，这是怎么回事？做WB会影响结果吗？这种蛋白质在保存过程中会容易降解吗?
有的资料上显示第四步，不是用Tip头吹打，而是将EP管在桌上猛敲击几下，这个方法我也试过，但是结果蛋白浓度很低，没有出现上述现象，这是怎么回事呀?
样品处理：
a. 植物组织：取新鲜或-70℃冻存100mg组织在液氮中研磨，把粉末加入到1ml裂解液中混匀。
b. 动物组织：取新鲜或-70℃冻存100mg组织加1ml裂解液，用组织研磨杵或匀浆器匀浆处理。
c. 贴壁细胞：直接在培养板中加入裂解液裂解细胞，每106细胞加1ml 裂解液。用取样器吹打混匀。
d. 细胞悬液：离心收集细胞。每106动物、植物和酵母细胞或每107细菌细胞加1ml裂解液混匀。
e. 血液处理：取0.2-1ml新鲜血液加3倍体积红细胞裂解液，混匀后室温放置10分钟，10000rpm离心1分钟。弃上清，若沉淀含有红细胞，可加入2倍体积红细胞裂解液重复裂解步骤。离心后沉淀加入1 ml裂解液混匀。
将处理后的样品在室温放置5分钟，使得核酸蛋白复合物完全分离。
向匀浆样品中加0.2ml氯仿，盖好管盖，剧烈振荡15秒，室温放置3-5分钟。
2-8℃ 12000 rpm离心10分钟。RNA主要在上层无色的水相中，把水相转移到新管中，不要吸到沉淀。
吸附柱前处理：在吸附柱中加入500ul 洗柱液，室温放置2分钟，2-8℃ 12,000 rpm离心2min，弃废液。6. 第4步收集的上清中加入200ul无水乙醇混匀，加入吸附柱静置2分钟，2-8℃ 12000rpm离心2min，弃废液。7. 向吸附柱中加入600ul漂洗液(使用前请先检查是否已加入无水乙醇)，2-8℃ 12,000 rpm离心2min，弃废液。8. 向吸附柱中加入600ul漂洗液，2-8℃ 12,000 rpm离心2min，弃废液。9. 12000rpm离心2min，弃掉收集管，将吸附柱置于室温放置数分钟将吸附柱中残余的漂洗液去除。10. 将吸附柱放入新管中，向膜中央滴加50-100ul RNase free ddH2O，室温放置5min，12000rpm室温离心2min即得到RNA。
注意事项：
所有相关器皿耗材都应为RNase-free产品，操作过程要小心，带口罩、手套避免环境中RNA酶污染样品。
RNA在水溶液中OD值可能在1.5-1.9之间，但这并不表示RNA不纯，需电泳检测。
这样可不可以？
另还有几个问题：1、这样的裂解液裂解线粒体提蛋白可不可以
2、裂解液加多少剂量
3、12000g离心10min和30分钟有没有区别
