| Formulation | 10mMNaPO4,0.3MNaCl,pH6.5 |
| Storage | -80°C |
| Purity | >95%bySDS-PAGE |
| ActivityDetermination | Fibrinogenclottingassay |
| ShelfLife(properlystored) | 12months |
Thedegradationpatternofhumanα-thrombintolessactiveformsisillustratedabove.β-thrombinisgeneratedbycleavageoftheintactB-chainattheArg106-Tyr107bondtoyieldtheB1andB2fragments.γ-thrombinisgeneratedbyfurthercleavageoftheβ-thrombinB2-chainattheLys190-Gly191bondtoyieldtheB4andB5fragments.Althoughnotillustrated,theB3fragmentisapotentialintermediatethatisderivedbycleavageoftheintactB-chainattheLys190-Gly191bond,resultinginaproductthatisoftenreferredtoasβ"-thrombin.(TheaminoacidnumberingusedherebeginsattheNH2-terminalendoftheA-chainandcontinuesthroughtheB-chain).
SampleGelInformation:

| Gel | Novex4-12%Bis-Tris |
|---|---|
| Load | HumanBeta&GammaThrombin,1µgperlane |
| Buffer | MES |
| Standard | SeeBluePlus2;Myosin(188kDa),PhosphorylaseB(98kDa),BSA(62kDa),GlutamicDehydrogenase(49kDa),AlcoholDehydrogenase(38kDa),CarbonicAnhydrase(28kDa),MyoglobinRed(17kDa),Lysozyme(14kDa),Aprotinin(6kDa),Insulin,Bchain(3kDa). |
| Note | Othercontaminantsareofthrombinorigin,andmaymakeupto~5%oftheadditionalbandmass. |
Overview:
Alpha-thrombinisahighlyspecificserineproteasegeneratedbyproteolyticactivationofthezymogenprothrombin(1).Purifiedformsofα-thrombinhavebeenshown(2-4)toundergoautolysisuponlongtermstoragetolessactiveforms.Similarinactivationwasobserveduponlimiteddigestionofa-thrombinwithtrypsin(5).Theseproteolyzedformsofα-thrombinhavebeentermedβ-thrombinandγ-thrombin.Humanβ-thrombinisgeneratedbycleavageoftheB-chainattheArg106-Tyr107bond.γ-thrombinisgeneratedbyfurthercleavageoftheβ-thrombinB2-chainattheLys190-Gly191bond.Anotherformofproteolyzedthrombin,termedβ"-thrombinisformedbythesinglecleavageofthrombinatArg-154.γ-thrombinisproducedbyproteolyticcleavageatbothofthesesites(Arg70/73andArg-154)intheB-chain.Thesecleavagescausereleaseofpeptidesthatarenolongercovalentlyattachedtothethrombinmolecule,butremainassociatedthroughionexchangeandgelfiltrationchromatography.TheseproteolyzedformsofthrombinretaintheirABIlitytocleavesmallsyntheticsubstrates(6,7)andsomeproteinsubstratessuchasfactorXIII(8),antithrombinIII(9)andprothrombin(10).Theirabilitytoclotfibrinogen(11),cleavethrombospondin(12)oractivateproteinC(9)havebeenmarkedlydecreased.
Humanβ-thrombinandγ-thrombinarepreparedfrompurifieda-thrombinbylimitedproteolysiswithTPCK-treatedtrypsin,essentiallybythemethodofBraunetal.(5).Theproteolyzedformsofa-thrombinaresuppliedin100mMNaH2PO4,pH6.5bufferandshouldbestoredat-20ºC.PurityisassessedbySDS-PAGEandactivityisassessedusingafibrinogenclottingassay.
Properties:
| Modeofaction | Proteolyzedformsof-thrombinwhichretainactivitytowardsmallsubstrates,factorXIIIandprothrombin,buthavereducedactivitytowardfibrinogen,proteinCactivationandantithrombinIIIbinding. | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Molecularweight | 36,700(b-thrombin) 36,700(g-thrombin) 4,000(Achain)* 34,300(Bchain)* 6,000(B1chain)* 10,400(B5chain)* 11,800(B4chain)* *ApparentmolecularweightasdeterminedbySDS-PAGEanalysis | |||||
| Extinctioncoefficient |
| |||||
| Structure | b-thrombin:threechains(A,B1,B2),disulfidelinkbetweentheAandtheB2chains.g-thrombin:fourchains(A,B1,B5,B4)withadisulfidelinkbetweentheApeptideandtheB5peptide. |
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一、机械裂解法主要有以下两中:
1.热休克(Thermal shock),既反复冻溶法,是一种常用的机械裂解方式比,通常由冷冻和解冻两部分组成(freezing and thawing),.原理:由于细胞内冰粒形成和剩余细胞液的盐浓度增高引起溶胀,使细胞结构破碎.冷冻通常在液氮或-20°C冰上进行,解冻可以在37、50、65 或100℃水浴中进热休克比化学裂解温和,但是很有效,有资料表明用热休克和溶菌酶与SDS的方法获得了90%的细胞裂解率.
2.超声波处理(Ultrasonication)既利用超声加热的方法,把细胞破碎.但这种处理会导致DNA 的断裂,所以加热不宜过剧烈,要设定好超声时间和间隙时间,一般超声时间不超过5秒,间隙时间最好大于超声时间,这些都有利于保护酶的活性.bead-beating 也是常用的机械处理方式,有报道指出bead-beating 比热休克和化学裂解的细胞裂解效果更好 虽然DNA产量较高,但通常得到的DNA片段较小.
二、 化学裂解和酶裂解法(在提核酸时联合使用)
主要是裂解液处理法,细胞裂解液的主要目的有以下几种:(1)利用去污剂破坏脂质双分子层,破裂细胞;(2)溶解蛋白;(3)蛋白变性使其稳定;(4)抑制蛋白酶活性.
主要根据不同的目的,裂解液的组成有所不同,主要有提取核酸和蛋白两中.在提取RNA或DNA时,我们主要是要充分裂解细胞,得到更多的核酸;如果我们的目的是蛋白,那要根据蛋白的位置、特性等因素考虑裂解液,在提取蛋白后,再根据实验需要复性蛋白等.以下是细胞裂解中常用试剂和其作用:
50 mM Tris-HCl pH 7.4(缓冲体系),150 mM NaCl(等渗体系),1 mM PMSF (强大的蛋白酶抑制剂),1 mM EDTA(变性剂和稳定剂),5 μg/ml Aprotinin(蛋白酶抑制剂),5 μg/ml Leupeptin(蛋白酶抑制剂),1% Triton x-100(破坏细胞),1% Sodium deoxycholate(中度变性剂和蛋白溶解剂),0.1% SDS(强变性剂和蛋白溶解剂).7M 尿素,2M硫脲(可以提高膜蛋白的融解),蛋白酶K等.
【2】加入裂解液后可以加用超声破碎细胞。
【3】提完细胞的器具可以在显微镜下看一下,剩余的细胞还多不多。如果还多,说明细胞提取的不彻底,还要改进方法,争取提取的细胞彻底一些。
(仅供参考)
样品处理:
a. 植物组织:取新鲜或-70℃冻存100mg组织在液氮中研磨,把粉末加入到1ml裂解液中混匀。
b. 动物组织:取新鲜或-70℃冻存100mg组织加1ml裂解液,用组织研磨杵或匀浆器匀浆处理。
c. 贴壁细胞:直接在培养板中加入裂解液裂解细胞,每106细胞加1ml 裂解液。用取样器吹打混匀。
d. 细胞悬液:离心收集细胞。每106动物、植物和酵母细胞或每107细菌细胞加1ml裂解液混匀。
e. 血液处理:取0.2-1ml新鲜血液加3倍体积红细胞裂解液,混匀后室温放置10分钟,10000rpm离心1分钟。弃上清,若沉淀含有红细胞,可加入2倍体积红细胞裂解液重复裂解步骤。离心后沉淀加入1 ml裂解液混匀。
将处理后的样品在室温放置5分钟,使得核酸蛋白复合物完全分离。
向匀浆样品中加0.2ml氯仿,盖好管盖,剧烈振荡15秒,室温放置3-5分钟。
2-8℃ 12000 rpm离心10分钟。RNA主要在上层无色的水相中,把水相转移到新管中,不要吸到沉淀。
吸附柱前处理:在吸附柱中加入500ul 洗柱液,室温放置2分钟,2-8℃ 12,000 rpm离心2min,弃废液。6. 第4步收集的上清中加入200ul无水乙醇混匀,加入吸附柱静置2分钟,2-8℃ 12000rpm离心2min,弃废液。7. 向吸附柱中加入600ul漂洗液(使用前请先检查是否已加入无水乙醇),2-8℃ 12,000 rpm离心2min,弃废液。8. 向吸附柱中加入600ul漂洗液,2-8℃ 12,000 rpm离心2min,弃废液。9. 12000rpm离心2min,弃掉收集管,将吸附柱置于室温放置数分钟将吸附柱中残余的漂洗液去除。10. 将吸附柱放入新管中,向膜中央滴加50-100ul RNase free ddH2O,室温放置5min,12000rpm室温离心2min即得到RNA。
注意事项:
所有相关器皿耗材都应为RNase-free产品,操作过程要小心,带口罩、手套避免环境中RNA酶污染样品。
RNA在水溶液中OD值可能在1.5-1.9之间,但这并不表示RNA不纯,需电泳检测。
1细胞用冷PBS洗两遍,离心,去除上清;
2加50~100ul三去污细胞裂解液;
3加PMSF,AP各1ul;
4用100ulTIp头吹打数次;
5置冰上15分钟
612000rpm,15min,4度
7取上清。这时,上清呈黏液状,用枪头吸时会将细胞碎片一起吸出。拉丝度很长,测蛋白浓度显示有,各位,这是怎么回事?做WB会影响结果吗?这种蛋白质在保存过程中会容易降解吗?
有的资料上显示第四步,不是用Tip头吹打,而是将EP管在桌上猛敲击几下,这个方法我也试过,但是结果蛋白浓度很低,没有出现上述现象,这是怎么回事呀?
裂解液裂解是一种比较温和的红细胞去除方法,主要用于经酶消化分散的组织细胞的分离纯化,淋巴细胞的分离纯化以及组织细胞蛋白与核酸提取等实验中红细胞的去除。经红细胞裂解液裂解得到的组织细胞中不含红细胞,可进一步用于原代培养、细胞融合、流式细胞分析、核酸与蛋白的分离和提取等。
我的邮箱:maoyuanqing@citiz.net

