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查询RNA的基本信息来引物设计求助!
2017-07-26
问题描述:

新手一枚,看到论坛里也有许多人问过,但没找到比较确切的回答,还是不是很理解,做芯片给出的lncRNA的名字是XLOC_009167,这个名字在ncbi里面都找不出来,我该怎么样去获得这个rna的信息呢?

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Fubio-GG
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LNCipedia transcript ID:lnc-AP000769.1-1:1Alternative gene names:XLOC_009167; linc-SCYL1-3RNA:GTGAGGAGCGCCTGGGCCGGGCAGCGACCCCGTCTGGGAGGATAATGAACTCCAGCTGCATCCACTTGCTGCAAAGGACGTGATTTCATTCTTTATGGAAGAGCCCCACCCCTACACCCCATGGTCCGCTGCGTCCGACTGGTGGAAGCAGGATCTGTGGTGAGATACCTCAGCACAAGCATATGCAGGCCTGTGGTAGACGCCGGAAGTAGGGCCCTTTGTCTCCAAGAATGGGCAGACTCTCAACAGGTGAAAGAAAAACAGTACTCCAGGTAGGGGCCAAGCAGAAGCAACAGGTCAAAGAAAGGCCTGGAAGTGGAAAAGCCCTGGGTTCAGTTTGCTAAGAGCCCAGGAGACTAGCTGGATACAAGGCCGGAAGAAGGGTGGGGCTCTGATGCACCAGCTTCTCCAATCTTCCTGGCTCCAGGGAGGAGATGCATTTGAACAATCCTGAAAAACTTTTGGATCCCAAGTCTGACTCAACATTGTGACTTGCTTACTCCGTGTCACTCTTCTAGATGCTTTTGAAATATATTATCATAACAATGAGTAAGTTCTATTTCCATTCTCAGAAAAGAAAACTGATTCAAGATTGTGTAACTTGCTGCTTCTGGTTGGTGAGATTTAAAAAAAAAAAAAAGATTATGTAACTTGTTCAAAGTCATATGGATTACAAACTATAGCGCAGGGACTTAATTTCAGTCTGGC
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sunset96
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@Fubio-GG谢谢!不过这是从哪里查出来的啊
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Fubio-GG
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sunset96@Fubio-GG谢谢!不过这是从哪里查出来的啊lncRNA数据库,后面做过表达还是沉默,研究这个lncRNA
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夏1234567890
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@Fubio-GG请问查出来的是这条RNA反转后的CDNA是吗?因为我看到有T,默认的是丛5到3是吗?