| Product Name | Kinase Substrates Library, Group II, biotinylated, 18 distinct peptide mixtures |
| Size | 1 Set |
| Catalog # | AS-62335 |
| US$ | $1720 |
| Purity | Unpurified |
This positional scanning synthetic peptide combinatorial library (PS-SPCL) has been used in rapid identification of serine/threonine kinase phosphorylation motif. The use of this Group II of distinct 18 peptide mixtures, in combination with Group I of 180 distinct peptide mixtures (cat# AS-62017-1), can provide sequence preference information of different kinases. Amount provided is 1 mg of peptide mixture x 18 vials.Sequences:Y-A-pT-X-X-X-X-S/T-X-X-X-X-A-G-K-K(LC-biotin)-NH2 Y-A-X-pT-X-X-X-S/T-X-X-X-X-A-G-K-K(LC-biotin)-NH2 Y-A-X-X-pT-X-X-S/T-X-X-X-X-A-G-K-K(LC-biotin)-NH2 Y-A-X-X-X-pT-X-S/T-X-X-X-X-A-G-K-K(LC-biotin)-NH2 Y-A-X-X-X-X-pT-S/T-X-X-X-X-A-G-K-K(LC-biotin)-NH2 Y-A-X-X-X-X-X-S/T-pT-X-X-X-A-G-K-K(LC-biotin)-NH2 Y-A-X-X-X-X-X-S/T-X-pT-X-X-A-G-K-K(LC-biotin)-NH2 Y-A-X-X-X-X-X-S/T-X-X-pT-X-A-G-K-K(LC-biotin)-NH2 Y-A-X-X-X-X-X-S/T-X-X-X-pT-A-G-K-K(LC-biotin)-NH2 Y-A-pY-X-X-X-X-S/T-X-X-X-X-A-G-K-K(LC-biotin)-NH2 Y-A-X-pY-X-X-X-S/T-X-X-X-X-A-G-K-K(LC-biotin)-NH2 Y-A-X-X-pY-X-X-S/T-X-X-X-X-A-G-K-K(LC-biotin)-NH2 Y-A-X-X-X-pY-X-S/T-X-X-X-X-A-G-K-K(LC-biotin)-NH2 Y-A-X-X-X-X-pY-S/T-X-X-X-X-A-G-K-K(LC-biotin)-NH2 Y-A-X-X-X-X-X-S/T-pY-X-X-X-A-G-K-K(LC-biotin)-NH2 Y-A-X-X-X-X-X-S/T-X-pY-X-X-A-G-K-K(LC-biotin)-NH2 Y-A-X-X-X-X-X-S/T-X-X-pY-X-A-G-K-K(LC-biotin)-NH2 Y-A-X-X-X-X-X-S/T-X-X-X-pY-A-G-K-K(LC-biotin)-NH2 X = degenerate mixture of the 17 natural amino acids excluding cysteine, serine, and threonine.LC = "long chain" version with an additional aminohexanoic acid spacer between the biotin and lysine side chain. S/T = equimolar mixture of serine and threonine.pT is phosphothreonine, and pY is phosphotyrosine. | |
| Detailed Information | |
| Storage | -20°C |
| References | Turk, BB. et al. Nature Protocols 1, 375 (2006); Hutti, JE. et al. Nature Methods 1, 27 (2004); Pinilla, C. et al. Biotechniques 13, 901 (1992). |
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引物是一小段单链DNA或RNA,引物可以做为DNA复制开始时DNA聚合酶的结合位点,在细胞外的条件下,只有通过引物,DNA才可以开始进行复制。
引物是人工合成的两段寡核苷酸序列,一个引物与感兴趣区域一端的一条DNA模板链互补,另一个引物与感兴趣区域另一端的另一条DNA模板链互补。
启动子和引物两者的区别:
启动子是DNA分子上能与RNA聚合酶结合并形成转录起始复合体的区域,在许多情况下,还包括促进这一过程的调节蛋白的结合位点,决定RNA聚合酶转录起始位点的DNA序列。引物是一小段单链DNA或RNA,引物可以做为DNA复制开始时DNA聚合酶的结合位点,在细胞外的条件下,只有通过引物,DNA才可以开始进行复制。引物是人工合成的两段寡核苷酸序列,一个引物与感兴趣区域一端的一条DNA模板链互补,另一个引物与感兴趣区域另一端的另一条DNA模板链互补。
启动子是位于结构基因前的非编码区对转录起调控作用的一段DNA序列。引物则是游离于DNA复制的模板链之外的对DNA复制起调控作用的一小段单链DNA或RNA。
在这里我向大家隆重推荐一个在线的引物设计软件,是斯坦福大学的,我认为是最好的在线引物设计软件,我用它设计接近100多对引物,可以说是屡试不爽。它用起来也很简单,最重要的是效果非常好,考虑的因素也非常的多。
先不说那么多了:网址:http://www.yeastgenome.org/cgi-bin/web-primer
下面我继续图示。
帖子发表之后很多战友PM我,让我帮设计引物,其实这很让我失望的,我的本意是让大家掌握这种方法,而不是告诉大家我是一个专家,其实我水平也有限,所以我不会帮大家设计引物,我认为这是科研工作的一部分、基本功,祝大家好运、实验顺利。
帮忙设计这段DNA序列的2个引物,forwardprimer还有reverseprimer,要只含有6个bp
麻烦写详细3端和5端,可以的话写下设计方法,感激不尽啊
刚开始学很是困惑,老师也没详细讲。。。
新手一枚,看到论坛里也有许多人问过,但没找到比较确切的回答,还是不是很理解,做芯片给出的lncRNA的名字是XLOC_009167,这个名字在ncbi里面都找不出来,我该怎么样去获得这个rna的信息呢?
需要在片段5‘端和3’端分别设计引物去扩增。
所以,对应的上游5‘端,我们习惯叫做”上游引物“,即forward primer,简称for;
对应序列的3’端,我们叫做下游引物,reverse primer,简称rev。
非要说差别,可能就在测序引物是让片段线性增加,PCR引物是让片段指数增加。
请教各位高手:
1.本人最近用权威文献中的引物PCR,使用前在NCBI上BLAST了一下,可是并没有结果。这个引物可用吗?
2.自己用OLIGO7设计了一对引物,评分良好,BLAST特异性好。可是实际一直P出某条非目的条带。退火温度也按TM值调节过了。实在想不出什么原因。
3.使用NCBI上的PRIMER-BLAST设计的引物,在NCBI自己的BLAST却找不到目的片段,这是为啥?引物可用吗?
谢谢!

