
Description:

The NEBNext® Fast DNA Fragmentation & Library Prep Set for Ion Torrent™ contains enzymes and buffers in convenient master mix formulations that are ideally suited for sample preparation for next-generation sequencing on the Ion Torrent Sequencer (Life Technologies, Inc.). Each of these components must pass rigorous quality control standards and are lot controlled, both individually and as a set of reagents.
Functional Validation
Each set of reagents is functionally validated together through construction and sequencing of a DNA library on the Ion Torrent platform.


0.5 µg of DNA from 3 different genomes with varying GC content were used to construct 200 bp and 400 bp libraries using the NEBNext Fast DNA Fragmentation and Library Prep Set for Ion Torrent, analyzed by the Agilent® Bioanalyzer®.




Lot Control
The lots provided are managed separately and qualified by additional functional validation. Individual reagents undergo standard enzyme activity and quality control assays, and also meet stringent criteria in the additional quality controls listed on each individual component page
Reagents Supplied
The following reagents are supplied with this product:
Store at (°C) | Concentration | |
NEBNext DNA Fragmentation Master Mix | -20 | |
T4 DNA Ligase | -20 | |
NEBNext DNA Library Primers for Ion Torrent™ | -20 | 1X |
Magnesium Chloride (MgCl2) (200 mM) | -20 | |
NEBNext DNA Library Adaptors for Ion Torrent | -20 | |
NEBNext DNA Fragmentation Reaction Buffer | -20 | 10X |
Bst 2.0 WarmStart® DNA Polymerase | -20 | |
NEBNext Stop Buffer | -20 | 10X |
NEBNext Q5 Hot Start HiFi PCR Master Mix | -20 | 2X |
T4 DNA Ligase Buffer for Ion Torrent | -20 | 10X |
TE Buffer | -20 | 0.1X |
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多谢了!
文库数据可以用excel表格打开,具体格式如下:
>zsbca0_007230.z1.scf
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
>zsbca0_001638.z1.scf
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
>zsbca0_010217.z1.scf
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
………………
cDNA是DNA转录成RNA再逆转录获得的,而在转录时,原DNA上的内含子和非编码区都会被加工切掉,只剩下原DNA编码区上的外显子对应的RNA片段,再逆转录的话,得到的cDNA就跟原DNA不同了。
所以要基因组测序,提供cDNA文库是不够的
1、属性自定义
作为筛选的内容,完全自定义的属性,满足您快速查询的特殊要求,新建栏目、新增分类,通过设置属性的使用状况和显示顺序,编辑符合您企业需求的最佳属性配置。
2、多标签自定义
在进行客户分类管理时,可添加多个自定义标签,分门别类后根据客户重要性选择标签颜色。方便您的产品经理进行一对一需求分析和功能规划,针对不同类型客户进行差异化服务。
3、庞大的数据分析
回头客提供销售统计、订单统计、产品统计和员工绩效统计的四大图表,分别从销售全局、客户消费情况、产品销售情况、员工绩效四大维度全方位展示销售深度数据。
4、详细的联系记录
详细记录每一次与客户的互动,并可自行制定联系计划,查询时可按下一次计划联系时间或最近一次联系时间自选排序,保证与客户保持周期性的联系。
5、岗位层级显示
默认通过岗位层级展示相应数据,如部门主管可查看部门全部联系记录、组长可查看小组全部联系记录,层级管理,简单便捷。
网站在线客服是网络营销的基础,企业上网首先要做的就是网络营销,然后通过在线客服来实现上网的最终目的。网络营销手段层出不穷的今天,如何实实在在的留住网站访问者才是根本所在,发掘潜在用户、维护现有客户,才能实现网络营销的最终目的。在线客服系统的建设,应引起广大企业的关注。基于这种思路,我们的企业才能有付出必有回报。 目前,做得最好的网站在线客服系统是乐盈通客服系统。
MicroRNA(miRNA,微RNA):即为长度为22nt左右的5′端带磷酸基团、3′端带羟基的非蛋白编码的调控小RNA家族。
小的干涉RNA(siRNA):是在RNA干涉过程中人工体外合成的小片段RNA,由约20个碱基对组成,包括5个磷酸盐,2个核苷和3个悬臂。
miRNA与siRNA之间有许多相同之处:1.二者的长度都约在22nt左右。2.二者都依赖Dicer酶的加工,是Dicer的产物,所以具有Dicer产物的特点。3.二者生成都需要Argonaute家族蛋白存在。4.二者都是RISC组分,所以其功能界限变得不清晰,如二者在介导沉默机制上有重叠。5.miRNA和siRNA合成都是由双链的RNA或RNA前体形成的。
miRNA与siRNA的不同点:1.根本区别是miRNA是内源的,是生物体的固有因素;而siRNA是人工体外合成的,通过转染进入人体内,是RNA干涉的中间产物。2.结构上,miRNA是单链RNA,而siRNA是双链RNA。3.Dicer酶对二者的加工过程不同,miRNA是不对称加工,miRNA仅是剪切pre-miRNA的一个侧臂,其他部分降解;而siRNA对称地来源于双链RNA的前体的两侧臂。4.在作用位置上,miRNA主要作用于靶标基因3′-UTR区,而siRNA可作用于mRNA的任何部位。5.在作用方式上,miRNA可抑制靶标基因的翻译,也可以导致靶标基因降解,即在转录水平后和翻译水平起作用,而siRNA只能导致靶标基因的降解,即为转录水平后调控。6.miRNA主要在发育过程中起作用,调节内源基因表达,而siRNA不参与生物生长,是RNAi的产物,原始作用是抑制转座子活性和病毒感染。
miRNA分离纯化测序
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siRNA转染阴性对照
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分子生物学常规技术帖子整理(长期有效)——有奖征集-蚂蚁淘论坛
供参阅,大家可以多多参与交流!
限制性内切酶:酶切目的基因和载体,使其产生相同的粘性末端。
DNA连接酶:连接目的基因和载体。
酵母单杂交技术最早是1993年由Li等从酵母双杂交技术发展而来,通过对报告基因的表型检测,分析DNA与蛋白之间的相互作用,以研究真核细胞内的基因表达调控。由于酵母单杂交方法检测特定转录因子与顺式作用元件专一性相互作用的敏感性和可靠性,现已被广泛用于克隆细胞中含量微弱的、用生化手段难以纯化的特定转录因子。
酵母单杂交(Yeast one-hybrid)是根据DNA结合蛋白(即转录因子)与DNA顺式作用元件结合调控报道基因表达的原理,克隆与靶元件特异结合的转录因子基因(cDNA)的有效方法。其理论基础是:许多真核生物的转录激活子由物理和功能上独立的DNA结合区(DNA-binding domain BD)和转录激活区(Activation domain AD)组成,因此可构建各种基因与AD的融合表达载体,在酵母中表达为融合蛋白时,根据报道基因的表达情况,便能筛选出与靶元件有特异结合区域的蛋白。理论上,在单杂交检测中,任何靶元件都可被用于筛选一种与之有特异结合区域的蛋白。
已经在mirbase数据库下载水稻的所有miRNA序列,可以比对某种昆虫的转录组文库寻找靶基因吗?
可以用targetscan或者miRwalk网站吗?有什么方法吗?

