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Kapa biosystems/KAPA Library Quantification Kits/KK4906/1 x 80 µL
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Kapa biosystems/KAPA Library Quantification Kits/KK4906/1 x 80 µL
品牌 / 
kapabiosystems
货号 / 
KK4906
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Description:

InternalControl

KAPALibraryQuantificationKits

forNext-GenerationSequencing

Ourstandardsdon’tchange.Neithershouldyours.

KAPALibraryQuantificationKitscontainallthereagentsneededfortheaccurate,reliableandreproducIBLeqPCR-basedquantificationofNGSlibrariespriortopoolingforcaptureorflowcellamplification.KitscontainKAPASYBR®FASTqPCRMasterMix,optimizedforhigh-performanceSYBRGreenI-basedqPCR.TheengineeredKAPASYBRFASTDNAPolymerasecontainedintheMasterMixamplifiesGC-andAT-richDNAfragmentsofdifferentlengthswithsimilarefficiency,makingittheonlyqPCRMasterMixcapableofaccurateqPCR-basedquantificationofNGSlibraries.*Thepre-dilutedsetofDNAStandardscontainedineachkitiscarefullyquality-controlledtoensurelot-to-lotconsistencyandavoiddatadriftovertime.OptimizedPrimerPremixesensureoptimalPCRefficiency.

KitswithDNAStandardsandPrimerPremixesforIllumina® andIonTorrent™sequencers areavailable.Pleasereferencethe InstrumentCompatibilityChart forguidanceoncompatibleplatforms.

NEW!ImproveexperimentaldesignswithourTechnicalGuideforIlluminaPlatforms


*Dataonfile.

ForResearchUseOnly.Notforuseindiagnosticprocedures.

ProductHighlights

AccuratelyquantifyPCR-competentsequencingtemplates

  • qPCRonly“counts”thoselibrarymoleculesthatcanbesequenced
  • Moreconsistentclusterdensitiesortemplate-to-beadratiosenableoptimalutilizationofsequencingresources
Equimolar pooling of indexed libraries. Eleven indexed Illumina TruSeq libraries were quantified by qPCR using the KAPA Library Quantification Kit, and then combined to achieve equal final concentrations in two separate pools for multiplexed sequencing on different flow-cell lanes. The eleven libraries ranged ~11-fold in concentration from 0.67 pM to 7.65 pM, while representation of each index varied between 90% and 127% of expected assigned reads per lane. Data on file.

Improvepoolingformultiplexedsequencing

  • LibraryconcentrationsdeterminedbyqPCRaremorereliablecomparedtoothermethods*
  • TheengineeredKAPASYBRFASTqPCRMasterMixenablesaccuratepoolingoflibrarieswithextremeGC-contentsorlongerinserts*
Nine human DNA libraries and two microbial DNA libraries (Rhodococcus sp. ~70% GC and Staphylococcus sp. ~35% GC) were used to compare quantification results obtained with distinct lots (”Lot 1” and “Lot 2”), and distinct sets of reagents from the same lot (”Set 1” and “Set 2”) of KAPA Library Quantification Kits for Illumina platforms. Data on file.

Eliminatedriftwithcarefullyquality-controlledDNAStandards

  • PredilutedDNAStandardseliminatequantificationerrorsassociatedwithpreparationofstandardcurvesusingin-housestandards*
  • KAPADNAStandardsundergostrictqualitycontroltoensurelot-to-lotconsistencyandeliminatedatadriftovertime
KAPA Library Quantification methods (96- and 384-well) format are available for the Sciclone NGS and NGSx workstation (PerkinElmer) and other instruments used in high-throughput NGS sample preparation pipelines.

Improvethroughputwithautomation

  • Libraryquantificationassayiscompatiblewith96-and384-wellformat
  • Librarydilution,reactionsetupanddataanalysiscanbeautomatedforHTPpipelines
  • LearnMore aboutKAPAAutomatedSolutions

*Dataonfile.

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KAPAhgDNAQuantificationandQCKit

Library Amplification

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KAPA Stranded mRNA-Seq Kits

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Applications:

Applications
  • Quantificationoflibrariespriortopoolingformultiplexedsequencing
  • QuantificationofindividuallibrariesorlibrarypoolspriortoclusteramplificationoremPCR
  • Quantificationoflibrariespriortoandafterhybridizationcapture
  • Qualitycontrol,optimizationandtroubleshootingoflibraryconstructionprocessesorworkflows

KitSpecificationsandContents/Storage:

KitSpecificationsandContents/Storage

Kitscanbestoredforupto12months at-20˚C.

CompletekitsincludeKAPASYBRFASTqPCRMasterMix(2X),PrimerPremix(10X)andasetof6DNAStandards.ReagentsforqPCR(KAPASYBRFASTqPCRMasterMixandPrimerPremix)andDNAStandards(1–6)arealsosoldseparately.Wherenoted,MasterMixescontaininstrument-specificreferencedyes,whiletheUniversalkitincludesROXHighandROXLow(both50X)separately.

Components–Illumina®Platform

Components–IonTorrent™Platform

LQK-Ion_Component Chart

Specifications

Spec
Description
CompatiblePlatforms
IlluminaHiSeq,NextSeq,MiSeq,andGAIIxIonTorrentProtonandPGM454GSFLX+andGSJuniorSOLiD5500series
LibraryType
Any
StartingMaterial
AnyNGSlibraryreadyforclusteramplificationoremPCR
Standardcurveconcentrationrange
20–0.0002pMforIlluminalibraries83–0.00083pMforIonTorrentand454libraries10–0.0001pg/µLforSOLiDlibraries
SequencingApplications
WholeGenomeSequencingWholeExomeSequencingTargetedSequencing(custompanels)RNA-SeqChIP-SeqAmpliconSequencingMethyl-Seq
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SNP的检测知识:人类基因组中存在着广泛的多态性,最简单的多态形式是发生在基因组中的单个核苷酸的替代,即单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)。SNP通常是一种二等位基因的 查看更多>
差异显示法[原理]:该实验方法是针对从特定细胞或组织类型的mRNA池来源的样品用PCR技术对其中许多的cDNA基因一起进行扩增和显示的实验方法。该实验方法倚赖两套不同类型的合成寡核苷酸引物:一套锚定反义引物与一套随机正义引物。锚定反义引物是与mRNA的poly(A)尾及3’-非翻译区的连接处相复性结合 查看更多>
等电点聚焦就是在电泳槽中放入载体两性电解质,当通以直流电时,两性电解质即形成一个由阳极到阴极逐步增加的pH梯度,当蛋白质放进此体系时,不同的蛋白质即移动到或聚焦于与其等电点相当的pH位置上,电聚焦的优点是:有很高的分辨率,可将等电点相差0.01-0.02pH单位的蛋白质分开;一般电泳由于 查看更多>
For amplification of cognate sequences from different organisms, or for "evolutionary PCR", one may increase the chances of getting product by designing 查看更多>
2018-12-26
The tubby gene product is expressed in the brain and has been implicated by mouse genetics in obesity and other disorders such as blindness. Structural analys 查看更多>
Presentation at the World Veterinary Poultry Association, Cairo, Egypt, January 2002 p.200Introduction: Mycoplasma infection continues to be an important cause 查看更多>
RNA-protein interactions play important roles within the cell. Using a variation of the widely-used chromatin immunoprecipitation (ChIP) assay, the potential a 查看更多>
1。细菌保存于穿刺培养物中:一般细菌保存于穿刺培养物可以维持两年。具体方法如下:用灭菌接种针挑取分散良好的单菌落,针缓慢穿过琼脂到达瓶底,连续几次,盖上瓶盖拧紧,做好标记 查看更多>
I. Solutions & SuppliesBRB80 (1X): 80 mM PIPES, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, pH 6.8 with KOH (generally made as a 5X stock and stored at 4¡C) 100 mM GTP 10 查看更多>
Reagents and MaterialsPBSPBS: 0.05M EDTAPBS: 0.01 thimerosalConjugate Storage BufferSATADMFHydroxylamine hydrochlorideNaOH PelletsPD10 Column or Sephadex G25Su 查看更多>
General comments: Antibodies, like most proteins, do not like to be freeze-thawed. Avoid repetitive freezing of your solution. The best way to store your antib 查看更多>
2018-12-26
When we first started using X. tropicalis, in vitro fertilization had an extremely poor efficiency. However, with the careful selection of a mature male and th 查看更多>
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网站在线客服是网络营销的基础,企业上网首先要做的就是网络营销,然后通过在线客服来实现上网的最终目的。网络营销手段层出不穷的今天,如何实实在在的留住网站访问者才是根本所在,发掘潜在用户、维护现有客户,才能实现网络营销的最终目的。在线客服系统的建设,应引起广大企业的关注。基于这种思路,我们的企业才能有付出必有回报。 目前,做得最好的网站在线客服系统是乐盈通客服系统。
cDNA克隆mRNA原材料,经体外反转录合互补DNA(cDNA),再与载体DNA连接引入寄主细胞.每cDNA反映种mRNA结构,cDNA克隆布反映mRNA布.特点:
①些物,RNA病毒没DNA,能用cDNA克隆;
②cDNA克隆易筛选,cDNA库包含非结构基克隆,且每cDNA克隆含mRNA信息;
③cDNA能细菌表达.cDNA仅代表某发育阶段表达遗传信息,基文库才包含物完整遗传信息.
目的基因来自真核生物,受体细胞为原核细胞,需要用CDNA文库。

基因组文库是一个比较笼统的概念。这个文库可以指某种真核生物的基因组,也可以指某种原核生物的基因组。实质是将某种生物的全部遗传信息贮存在一个受体菌群体中,做为目的基因的来源。
附件里是我反转录的CDNA片段,过柱后,基本上去除了500bp以下的小片段。我用的是BDclontechCo的libraryconstructKit,我不是很清楚该选择哪几个管子的cDNA去装载体比较好?
DNAmark是TakaraCo的DL2000(2000,1000,750,500,200,100)。
谢谢各位用过此kit的战友指点!
cDNA文库构建SMART法 123
2519455062021-08-18

CDNASizeFractionation做完后的电泳检测,发现条带的大小都在5000bp左右,感觉是哪里有问题。前面步骤检测很好。不知道有问题没有?请哪位高人指点一下。
cDNA文库是通过RNA反转录得来的,真核生物含有内含子(即转录为RNA后会被剪掉不表达的部分),而原核生物不含内含子,所以cDNA文库适用于真核生物,基因组文库适用于原核生物
基因组dna文库和cdna文库的区别 123
流泪的魔术师2017-12-07
一、 DNA文库和cDNA文库的概念
将某种生物的基因组DNA切割成一定大小的片段,并与合适的载体重组后导入宿主细胞进行克隆。这些存在于所有重组体内的基因组DNA片段的集合,即基因组文库,它包含了该生物的所有基因。
以mRNA为模板,经反转录酶催化,在体外反转录成cDNA,与适当的载体(常用噬菌体或质粒载体)连接后转化受体菌,则每个细菌含有一段cDNA,并能繁殖扩增,这样包含着细胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合称为该组织细胞的cDNA文库。
二、 DNA文库和cDNA文库的构建原理
DNA文库:用限制性内切酶切割细胞的整个基因组DNA,可以得到大量的基因组DNA片段,然后将这些DNA片段与载体连接,再转化到细菌中去,让宿主菌长成克隆。这样,一个克隆内的每个细胞的载体上都包含有特定的基因组DNA片段,整个克隆群体就包含基因组的全部基因片段总和称为基因组文库。
cDNA文库:以mRNA为模板,经反转录酶催化,在体外反转录成cDNA,与适当的载体常用噬菌体或质粒载体连接后转化受体菌,则每个细菌含有一段cDNA,并能繁殖扩增,这样包含着细胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合称为该组织细胞的cDNA文库。
三、DNA文库和cDNA文库的用途
基因组含有的基因在特定的组织细胞中只有一部分表达,而且处在不同环境条件、不同分化时期的细胞其基因表达的种类和强度也不尽相同,所以cDNA文库具有组织细胞特异性。cDNA文库显然比基因组DNA文库小得多,能够比较容易从中筛选克隆得到细胞特异表达的基因。但对真核细胞来说,从基因组DNA文库获得的基因与从cDNA文库获得的不同。DNA文库所含的是带有内含子和外显子的基因组基因,而从cDNA文库中获得的是已经过剪接、去除了内含子的cDNA展开
cDNA文库需要由总RNA反转录而来,cDNA文库的构建需要反转录法。反转录紧紧是一种方法,cDNA文库是一种资源。
基因的表达是DNA-RNA-蛋白,期间有转录水平调控、转录后调控、翻译后调控等多种调控机制影响该基因的表达.所以蛋白水平高低的原因就可能是多方面的.蛋白表达多,可能是mRNA多,也可能mRNA变化不大,而是翻译多了;蛋白表达少,原因亦然.从2个水平检测一个基因的表达,可以更全面地了解该基因在该组织某个时期或某种条件下的变化受到什么水平的调控.

已经在mirbase数据库下载水稻的所有miRNA序列,可以比对某种昆虫的转录组文库寻找靶基因吗?

可以用targetscan或者miRwalk网站吗?有什么方法吗?

这种题要根据题干内容来定。
(1)人的免疫球蛋白细胞 cDNA文库(cDNA 文库是把内含子去除后的裸DNA,人的和牛的DNA是不能识别的就是因为内含子的缘故,cRNA反转录后的是去除后的)。
反转录酶:以mRNA为模板反转录合成DNA。
限制性内切酶:酶切目的基因和载体,使其产生相同的粘性末端。
DNA连接酶:连接目的基因和载体。