Description:
qPCRMasterMix(ABIPrism)andPrimerPremixonlyKAPALibraryQuantificationKits
forNext-GenerationSequencing
Ourstandardsdon’tchange.Neithershouldyours.
KAPALibraryQuantificationKitscontainallthereagentsneededfortheaccurate,reliableandreproducIBLeqPCR-basedquantificationofNGSlibrariespriortopoolingforcaptureorflowcellamplification.KitscontainKAPASYBR®FASTqPCRMasterMix,optimizedforhigh-performanceSYBRGreenI-basedqPCR.TheengineeredKAPASYBRFASTDNAPolymerasecontainedintheMasterMixamplifiesGC-andAT-richDNAfragmentsofdifferentlengthswithsimilarefficiency,makingittheonlyqPCRMasterMixcapableofaccurateqPCR-basedquantificationofNGSlibraries.*Thepre-dilutedsetofDNAStandardscontainedineachkitiscarefullyquality-controlledtoensurelot-to-lotconsistencyandavoiddatadriftovertime.OptimizedPrimerPremixesensureoptimalPCRefficiency.
KitswithDNAStandardsandPrimerPremixesforIllumina® andIonTorrent™sequencers areavailable.Pleasereferencethe InstrumentCompatibilityChart forguidanceoncompatibleplatforms.
NEW!ImproveexperimentaldesignswithourTechnicalGuideforIlluminaPlatforms
*Dataonfile.
ForResearchUseOnly.Notforuseindiagnosticprocedures.
ProductHighlights
AccuratelyquantifyPCR-competentsequencingtemplates
- qPCRonly“counts”thoselibrarymoleculesthatcanbesequenced
- Moreconsistentclusterdensitiesortemplate-to-beadratiosenableoptimalutilizationofsequencingresources
Improvepoolingformultiplexedsequencing
- LibraryconcentrationsdeterminedbyqPCRaremorereliablecomparedtoothermethods*
- TheengineeredKAPASYBRFASTqPCRMasterMixenablesaccuratepoolingoflibrarieswithextremeGC-contentsorlongerinserts*
Eliminatedriftwithcarefullyquality-controlledDNAStandards
- PredilutedDNAStandardseliminatequantificationerrorsassociatedwithpreparationofstandardcurvesusingin-housestandards*
- KAPADNAStandardsundergostrictqualitycontroltoensurelot-to-lotconsistencyandeliminatedatadriftovertime
Improvethroughputwithautomation
- Libraryquantificationassayiscompatiblewith96-and384-wellformat
- Librarydilution,reactionsetupanddataanalysiscanbeautomatedforHTPpipelines
- LearnMore aboutKAPAAutomatedSolutions
*Dataonfile.
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Normalizinglibrariesforpoolingandclusteramplification?CheckouttheseKapaNGSproductstoimproveyourworkflowandresults:
Applications:
Applications- Quantificationoflibrariespriortopoolingformultiplexedsequencing
- QuantificationofindividuallibrariesorlibrarypoolspriortoclusteramplificationoremPCR
- Quantificationoflibrariespriortoandafterhybridizationcapture
- Qualitycontrol,optimizationandtroubleshootingoflibraryconstructionprocessesorworkflows
KitSpecificationsandContents/Storage:
KitSpecificationsandContents/StorageKitscanbestoredforupto12months at-20˚C.
CompletekitsincludeKAPASYBRFASTqPCRMasterMix(2X),PrimerPremix(10X)andasetof6DNAStandards.ReagentsforqPCR(KAPASYBRFASTqPCRMasterMixandPrimerPremix)andDNAStandards(1–6)arealsosoldseparately.Wherenoted,MasterMixescontaininstrument-specificreferencedyes,whiletheUniversalkitincludesROXHighandROXLow(both50X)separately.
Components–Illumina®Platform
Components–IonTorrent™Platform
Specifications
- SpecDescription
- CompatiblePlatformsIlluminaHiSeq,NextSeq,MiSeq,andGAIIxIonTorrentProtonandPGM454GSFLX+andGSJuniorSOLiD5500series
- LibraryTypeAny
- StartingMaterialAnyNGSlibraryreadyforclusteramplificationoremPCR
- Standardcurveconcentrationrange20–0.0002pMforIlluminalibraries83–0.00083pMforIonTorrentand454libraries10–0.0001pg/µLforSOLiDlibraries
- SequencingApplicationsWholeGenomeSequencingWholeExomeSequencingTargetedSequencing(custompanels)RNA-SeqChIP-SeqAmpliconSequencingMethyl-Seq
ebiomall.com
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①些物,RNA病毒没DNA,能用cDNA克隆;
②cDNA克隆易筛选,cDNA库包含非结构基克隆,且每cDNA克隆含mRNA信息;
③cDNA能细菌表达.cDNA仅代表某发育阶段表达遗传信息,基文库才包含物完整遗传信息.
基因组酶切后,切胶回收浓度大概为多少才可以进行下一步实验?为什么二十几的浓度和载体连不上呢?载体也明明去磷酸化了,单连载体的时候也不会自连。那为什么把载体和酶切后的基因组连起来转化后挑菌做PCR验证却有很多空载呢?我的基因组酶切大小为2kb~4kb。上面那排7kb~10kb的带是什么东西呢?
(1)人的免疫球蛋白细胞 cDNA文库(cDNA 文库是把内含子去除后的裸DNA,人的和牛的DNA是不能识别的就是因为内含子的缘故,cRNA反转录后的是去除后的)。
将某种生物的基因组DNA切割成一定大小的片段,并与合适的载体重组后导入宿主细胞进行克隆。这些存在于所有重组体内的基因组DNA片段的集合,即基因组文库,它包含了该生物的所有基因。
以mRNA为模板,经反转录酶催化,在体外反转录成cDNA,与适当的载体(常用噬菌体或质粒载体)连接后转化受体菌,则每个细菌含有一段cDNA,并能繁殖扩增,这样包含着细胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合称为该组织细胞的cDNA文库。
二、 DNA文库和cDNA文库的构建原理
DNA文库:用限制性内切酶切割细胞的整个基因组DNA,可以得到大量的基因组DNA片段,然后将这些DNA片段与载体连接,再转化到细菌中去,让宿主菌长成克隆。这样,一个克隆内的每个细胞的载体上都包含有特定的基因组DNA片段,整个克隆群体就包含基因组的全部基因片段总和称为基因组文库。
cDNA文库:以mRNA为模板,经反转录酶催化,在体外反转录成cDNA,与适当的载体常用噬菌体或质粒载体连接后转化受体菌,则每个细菌含有一段cDNA,并能繁殖扩增,这样包含着细胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合称为该组织细胞的cDNA文库。
三、DNA文库和cDNA文库的用途
基因组含有的基因在特定的组织细胞中只有一部分表达,而且处在不同环境条件、不同分化时期的细胞其基因表达的种类和强度也不尽相同,所以cDNA文库具有组织细胞特异性。cDNA文库显然比基因组DNA文库小得多,能够比较容易从中筛选克隆得到细胞特异表达的基因。但对真核细胞来说,从基因组DNA文库获得的基因与从cDNA文库获得的不同。DNA文库所含的是带有内含子和外显子的基因组基因,而从cDNA文库中获得的是已经过剪接、去除了内含子的cDNA展开
cDNA文库显然比基因组DNA文库小得多,能够比较容易从中筛选克隆得到细胞特异表达的基因。但对真核细胞来说,从基因组DNA文库获得的基因与从cDNA文库获得的不同,基因组DNA文库所含的是带有内含子和外显子的基因组基因,而从cDNA文库中获得的是已经过剪接、去除了内含子的cDNA。
真核生物基因组DNA十分庞大,其复杂程度是蛋白质和mRNA的100倍左右,而且含有大量的重复序列. 采用电泳分离和杂交的方法,都难以直接分离到目的基因.这是从染色体DNA为出发材料直接克隆目的基因的一个主要困难。
高等生物一般具有10^5种左右不同的基因,但在一定时间阶段的单个细胞或个体中,都仅有15%左右的基因得以表达,产生约15000种不同的mRNA分子.可见,由mRNA出发的cDNA克隆,其复杂程度要比直接从基因组克隆简单得多。
cDNA文库在研究具体某类特定细胞中基因组的表达状态及表达基因的功能鉴定方便具有特殊的优势,从而使它在个体发育、细胞分化、细胞周期调控、细胞衰老和死亡调控等生命现象的研究中具有更为广泛的应用价值,是研究工作中最常使用到的基因文库。
酵母单杂交技术最早是1993年由Li等从酵母双杂交技术发展而来,通过对报告基因的表型检测,分析DNA与蛋白之间的相互作用,以研究真核细胞内的基因表达调控。由于酵母单杂交方法检测特定转录因子与顺式作用元件专一性相互作用的敏感性和可靠性,现已被广泛用于克隆细胞中含量微弱的、用生化手段难以纯化的特定转录因子。
酵母单杂交(Yeast one-hybrid)是根据DNA结合蛋白(即转录因子)与DNA顺式作用元件结合调控报道基因表达的原理,克隆与靶元件特异结合的转录因子基因(cDNA)的有效方法。其理论基础是:许多真核生物的转录激活子由物理和功能上独立的DNA结合区(DNA-binding domain BD)和转录激活区(Activation domain AD)组成,因此可构建各种基因与AD的融合表达载体,在酵母中表达为融合蛋白时,根据报道基因的表达情况,便能筛选出与靶元件有特异结合区域的蛋白。理论上,在单杂交检测中,任何靶元件都可被用于筛选一种与之有特异结合区域的蛋白。