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【讨论】慢病毒载体 感染 目的细胞[精华]
2009-07-03
问题描述:

用三质粒系统构建慢病毒颗粒,如附件;

问题
1AmpR是在筛选阳性质粒时发挥作用;
2氨卞青霉素只对原核生物起作用;
3在病毒颗粒感染目的细胞后,AmpR并未在目的细胞中表达(或者说没整合入目的细胞基因组)
4如果有整合入目的细胞基因组,那么可以起到药物筛选的作用吗?

慢病毒系统构建.doc(182.0k)

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aaron928
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楼主看来是需要先好好补习一下分子生物学的基础,分清楚针对不同细胞的不同耐药基因(比如像Amp,Kana对原核;Neo, Puro对真核等等,推荐好好看看分子克隆,呵呵)。根据你的实验目的,如果要筛选整合到基因组的细胞,你可以利用Neo,Puro的药物筛选,也可以利用GFP,YFP,m-Cherry的荧光筛选!关于慢病毒包装过程,现在iPSC研究如火如荼,随便一篇好的paper都会提到Lenti/Retroviral转染系统,个人推荐好好看看最先发在Nat. Biotech那篇详细介绍lentiviral的文章。大概的过程gongtj战友已经介绍过了,补充几点:1.转染细胞推荐用293T/FT,方法用脂质体或磷酸钙皆可;2. 细胞接种密度过大或过稀皆不好;3. Transfection过程最好在8-16小时之间,千万不能太长,否则滴度直线下降;4. 换液时需特别小心,尽可能轻柔且迅速,经过transfection后的细胞非常脆弱,稍不留神很容易detach,这是我血的经验和教训;5. 收集上清时间因人而异,我一般是收转染后48和64小时2次,结果不错,当然有的人可以从24一直收到72,这需要你自己摸索;6.是否需要超速离心浓缩病毒取决于你的目的,浓缩可以提高滴度,但步骤麻烦且需特别小心,不提倡初学者使用,我一般不经浓缩的病毒上清最后也能接近10的7次方左右,做绝大部分的实验已经绰绰有余了,一味盲目地追求滴度最终来可能两手空空;7.关于滴度的检测,比较精确的就是用不同稀释比例的病毒上清去感染(infection)293T/FT细胞(这个质粒需要带荧光标记),24-48小时上流式检测,再根据公式计算。说了这么多,都是自己做病毒1年多的一些心得体会,以求抛砖引玉,版上肯定还有很多高人,只是没有露面而已,祝你好运,呵呵!
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zx_0504
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楼上说的很明白了。我再罗嗦几句。公司做好的质粒你回来要在原核中(E.coli)扩增备份的,否则几次就用完了啊!AmpR是为了让你在原核里面扩增质粒时候用的筛选抗性。扩增好留有备份后就可以转染目的细胞了。这时候需要有Neo,Puro或荧光表达进行筛选。这是两类不同目的的和用途的筛选。
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gongtj
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我想lz是搞错了一个问题:在慢病毒包装的过程中,不需要通过AmpR来筛选阳性颗粒。AmpR的作用仅是AllowsselectionoftheplasmidinE.coli。AmpR不会被重组到Lentiviralvector中,后面如果要检测是否整合到细胞基因组,可以通过GFP。以(pMDL,pRevandpVSVG)系统为例,病毒包装的过程大概如下:Day1:SeedcellsDay2:TransfectcellsDay3:ChangemediaDays4and5:CollectsupernatantDay6:ConcentratetheviralpreparationDay7:PurifytheviralpreparationthroughasucrosecushionDays8–11:TitertheviralsUSPension
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aaron928
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楼主看来是需要先好好补习一下分子生物学的基础,分清楚针对不同细胞的不同耐药基因(比如像Amp,Kana对原核;Neo,Puro对真核等等,推荐好好看看分子克隆,呵呵)。根据你的实验目的,如果要筛选整合到基因组的细胞,你可以利用Neo,Puro的药物筛选,也可以利用GFP,YFP,m-Cherry的荧光筛选!关于慢病毒包装过程,现在iPSC研究如火如荼,随便一篇好的paper都会提到Lenti/Retroviral转染系统,个人推荐好好看看最先发在Nat.Biotech那篇详细介绍lentiviral的文章。大概的过程gongtj战友已经介绍过了,补充几点:1.转染细胞推荐用293T/FT,方法用脂质体或磷酸钙皆可;2.细胞接种密度过大或过稀皆不好;3.Transfection过程最好在8-16小时之间,千万不能太长,否则滴度直线下降;4.换液时需特别小心,尽可能轻柔且迅速,经过transfection后的细胞非常脆弱,稍不留神很容易detach,这是我血的经验和教训;5.收集上清时间因人而异,我一般是收转染后48和64小时2次,结果不错,当然有的人可以从24一直收到72,这需要你自己摸索;6.是否需要超速离心浓缩病毒取决于你的目的,浓缩可以提高滴度,但步骤麻烦且需特别小心,不提倡初学者使用,我一般不经浓缩的病毒上清最后也能接近10的7次方左右,做绝大部分的实验已经绰绰有余了,一味盲目地追求滴度最终来可能两手空空;7.关于滴度的检测,比较精确的就是用不同稀释比例的病毒上清去感染(infection)293T/FT细胞(这个质粒需要带荧光标记),24-48小时上流式检测,再根据公式计算。说了这么多,都是自己做病毒1年多的一些心得体会,以求抛砖引玉,版上肯定还有很多高人,只是没有露面而已,祝你好运,呵呵!
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emerling6821
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谢谢楼上的回复。我确实是在恶补分子生物学知识;另外,我所用的病毒颗粒是公司已构建好的,用于感染成纤维细胞,苦于不明白AmpR的具体作用。那么,根据楼上所说,我所有的目的基因过表达病毒颗粒不带有GFP,又无抗性基因,那就无法对感染后的细胞进行筛选了。
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aaron928
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哎!汗啊~!你用来做transfection的plasmid怎么去amplify呢?还不是要先在菌里面扩起来嘛!没有荧光标记,又没有抗性基因,貌似是不好筛选。。。你自己就不会插一个进去啊?!这么简单的事情,两顿饭的功夫而已嘛!罚你,每晚上床之前,捧着分子克隆,面壁思过一小时!以后就不会再问这些问题了:)
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emerling6821
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晕菜!!!我是说,病毒已包装构建好,公司做的。那我现在能做什么?越来越糊涂了。
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gongtj
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lz,如果公司已帮你包装好病毒,那你可以直接拿去用了呗,感染目的细胞啊。
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erenren
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就三张图谱啊?
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gladys1986
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第一,你载体够好了,应该放在受体菌里面扩大,提取质粒。第二,那个amp是为了让你在原核里面扩增质粒时候用的抗性。第三,抽取好的质粒,就可以包装病毒了,需要荧光标记来检测转染情况,如果没有,需要对载体再进行改造。
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zx_0504
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楼上说的很明白了。我再罗嗦几句。公司做好的质粒你回来要在原核中(E.coli)扩增备份的,否则几次就用完了啊!AmpR是为了让你在原核里面扩增质粒时候用的筛选抗性。扩增好留有备份后就可以转染目的细胞了。这时候需要有Neo,Puro或荧光表达进行筛选。这是两类不同目的的和用途的筛选。
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melodyzhm
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楼主放在附件里的载体貌似和我刚刚构建好的病毒是一个系统!请问楼主是哪家公司构建的?看时间,2009,那么楼主现在实验做的如何?这个病毒系统怎么样?我正准备后天开始摸条件呢?有很多问题!!我觉得上面讨论的内容,大家重点不太相同,楼主估计是问,载体里面的AmpR是何作用,但其实他的病毒已经是成品啦,直接可以用来转染目的细胞,而下面回答的好像是关于构建病毒过程中的问题,楼上说的对,以我的理解,应该是:AmpR是在包装病毒过程中用来筛选的,而已经够好的病毒在转染目的细胞时没有抗性基因,也不能在大肠杆菌里扩增,但是有荧光GFP可以用来看转染率,若要筛选,可以用流式筛!不知道对不对哦,刚接触,还是菜鸟级!大家多多讨论!
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xiaoxin34999
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好东西啊期待更完善更全面的过程,包括前期的工作和后期的应用,能举例就更好了
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xiaoxin34999
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maker真的要好好咋么咋么,刚入道的新选手,莫怪
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0318_duyanyan
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我也是做慢病毒,病毒已经让公司包好了,现在准备转染目的细胞,今天打算摸个MOI值,希望成功。
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0318_duyanyan
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我也是新手,心里特别没底。
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0318_duyanyan
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以后希望各位高手多多指点!
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chenghong4321
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你们都是公司包的啊?大概多少费用啊?我已有病毒质粒,准备自己包,不知有没人做过?病毒上清液浓缩时用的过滤器啊过滤管啊什么的,是不是要特殊买的啊?求解。
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invabio
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为了让客户体验我们公司的慢病毒产品,最近我公司推出了GFP/RFP慢病毒试用装的免费申请活动。活动详情请见丁香通试用中心有奖试用专区http://www.biomart.cn/info/try.htm,名额有限,先到先得。您也可直接与我公司联系,公司名称:上海英为信生物科技有限公司,咨询电话021-51507117-805。
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jjyx5
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根据有关专家论证,慢病毒和腺相关病毒,将是未来最有前途的病毒载体
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xujian2004265
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我们的滴度还挺高的,还和转染试剂的效率有关
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Emmanuelle
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VSVGenvelop的病毒很容易做,titer会非常高,肯定107以上,也比较稳定,transfection基本可以达到100%的,楼上的照片很漂亮,不过细胞再多一点就好了,这样titer可以更理想
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xujian2004265
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还有照片比这更好的
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20060806
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各位前辈,我刚刚开始做慢病毒,想请教一下,一般病毒液感染目的细胞后多长时间可以看见荧光啊?目前我已经感染48小时了,只有个别细胞可以看到,大部分都看不到荧光
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BSZLY2003
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目前我也在做慢病毒这块,公司包装的过表达慢病毒颗粒,按照以往的MOI值加的病毒,从感染后48小时到96小时每天都镜下观察荧光,感染率不到5%。可是对照空载组在48小时同样的MOI值下,荧光镜下感染率已经能达到80%,不知道问题出在哪里,我是怀疑公司给的滴度不够,请高手指点一二,最好能给个感染细胞的具体步骤。
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gangster2008
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好像许多只是收集一次的上清
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keliny
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BSZLY2003你好,我的实验也出现了和你类似的问题,慢病毒感染一种细胞时,空病毒的感染率也有90%以上,但含目的基因的病毒感染后只有百分之几,另外,感染目的细胞(鼻咽癌细胞)一周后两种病毒液感染后都未见荧光出现,想请教下问题可能在哪,希望帮忙解决下了,谢谢
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laoguaihb
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慢病毒腺病毒群:182509118慢病毒腺病毒,干扰,过表达,细胞转染,细胞功能实验,动物实验………大家一起来相互学习相互讨论。
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bianyueyue
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请问一下,我在包装慢病毒过程中发生了污染,会是什么原因导致的啊。谢谢。我是初学者
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zhanghao8
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喜欢这样的帖子,给我们新手创造了很多财富,顶一个
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zrw11
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mark
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293bbs
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我用了很多年的病毒载体,各种病毒也包过非常多,欢迎大家来我的病毒包装与质粒转染精华答疑贴答疑,基本秒回复!贴子链接:腺相关病毒包装(AAV)、慢病毒包装、腺病毒包装、细胞转染、病毒在体转染【技术答疑】
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