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IMPACTCitationspTXB1isanE.coliexpressionvectorintheIMPACT™Kit(NEB#E6901)(1,2).Itisdesignedforthein-frameinsertionofatargetgeneintothepolylinkerupstreamoftheMxeintein/chitinbindingdomain(27kDa)(2,3,4,5).Thefusionproteinisboundtochitinbeadsandthethiol-inducedcleavageactivityoftheinteinreleasesthetargetprotein.pTXBvectorsarerecommendedforuseinintein-mediatedproteinligationandC-terminallabeling(2).Thisdoublestrandedvectoris6,706basepairsinlength.

DNASUandAddgenearecentralrepositoriesforplasmidclonesandcollectionsthatmayalsobehelpful.
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一种限制酶切断目的基因,使其产生相同的黏性末端(部分限制性内切酶可切割出平末端,拥有相同效果)。将切下的目的基因的片段插入质粒的切口处,首先碱基互补配对结合,两个黏性末端吻合在一起,碱基之间形成氢键,再加入适量DNA连接酶,催化两条DNA链之间形成磷酸二酯键,从而将相邻的脱氧核糖核酸连接起来,形成一个重组DNA分子。如人的胰岛素基因就是通过这种方法与大肠杆菌中的质粒DNA分子结合,形成重组DNA分子(也叫重组质粒)的。
目标基因全长1800bp,通过重叠延伸的方式获得的自杀敲除组件,左右同源序列均为500bp左右,构建自杀载体(确认载体没有问题),期望进行目标基因的失活处理,但将近1个月的时间,不见任何目的克隆,故在此请各位战友指点。
采用电转的方式将自杀载体(约6700bp)导入黄色短杆菌,感受态的细胞制备采用相关文献方式,甘氨酸和吐温-30的方式进行摇菌并制备电转感受态,1800v电转(电压进行过梯度,1200、1500、1800、2200、2500。1800v效果相对较好,故选之),但电转效率仍是较低,复苏2h,浓缩涂板LBG+kan(kan浓度20ug/ml),平板克隆很少,几次都只有20个左右的克隆。
1)克隆很少,原因可能跟菌株的电转效率有关,不知战友有没有谷氨酸棒杆菌或黄色短杆菌相关较好的电转经验,还请指教?
2)抗性平板克隆很少,还可能和重组效率有关,但根据pk18mobsacB质粒的特性,既然能在抗性平板生长,理论上应该是已经进行了一次重组了,但结果是不管我用pk18载体本身的Kan序列引物还是最终诱导进行PCR验证,均未证实到一次重组的发生,更不要说获得敲除失活的目的菌株了。问题是这个带有抗性的克隆到底是携带了什么使其同样具有抗性(显微检验不是杂菌)?如何有效提高或促进自杀载体在宿主内的重组效率呢?或是更有效的准确的检测验证手段??
3)利用自杀载体的方式进行黄色短杆菌(或谷氨酸棒杆菌)的基因敲除缺失比较不易,不知有没有正在做这方面相关研究的战友,希望能够多多交流和学习。。。
不知道我的疑惑讲清楚了没有,若哪里不清楚还请指出,我再细说。。。期望xdjm们的帮助啊。。。先谢过了。。
第二个问题是不是构建的启动子区均要有一个TATA盒的结构在里面,不然构建的启动子如何就能驱动LUC的表达呢?
第三个问题是,如果我们在构建时长度延至ATG之后100-200BP的启动子是否会影响LUC的表达呢?
谢谢!
Adeasy系统:通过原核重组极大提高了腺病毒的重组效率。其具体的构建步骤如下图。
AdMax系统:Cre/LoxP体系改造后的真核腺病毒包装体系,进一步增加的操作的便捷,同时滴度较Adeasy有进一步提高。步骤如图所示。
下面是一些经典的AdMax系统质粒图谱:
人基因组十分庞大,约含4×109bp,建立和筛选人的基因组文库,要求有容量更大的载体,酵母人工染色体(yeast artificial chromosome,YAC)载体应运而生。YAC含有酵母染色体端粒(telesome)、着丝点(centromere)及复制起点等功能序列,可插入长度达200-500kb的外源DNA,导入酵母细胞可以随细胞分裂周期复制繁殖供作克隆,成为人基因组研究计划的重要向左转|向右转
标记基因通常用来检验重组DNA载体转化成功与否,或者检测目的基因在植物细胞或组织中的定位。常用的标记基因是一些抗生素抗性基因,如卡那霉素抗性基因、潮霉素标记基因等。
如:某种具有氨苄抗性基因质粒(该基因即可认为标记基因),与外源DNA片段组合形成重组质粒,并被转入受体细胞后,就可以根据受体细胞是否具有氨苄抗性来判断受体细胞是否获得了目的基因。当用选择培养基(比如含有氨苄的培养基),来培养受体细胞时,能够在培养基中存活下来的受体细胞就可以认为是成功的导入了外源DNA,标记基因就起作用了。
作为报告基因,在遗传选择和筛选检测方面必须具有以下几个条件:(1)已被克隆和全序列已测定;(2)表达产物在受体细胞中不存在,即无背景,在被转染的细胞中无相似的内源性表达产物;(3)其表达产物能进行定量测定。目前常用的报告基因有氯霉素乙酰转移酶基因(cat)、荧光素酶基因(luc)、β-葡萄糖苷酸酶基因(gus)、分泌型碱性磷酸酶基因(seap)、绿色荧光蛋白基因(gfp)等。
如:
绿色荧光蛋白(gfp)基因。绿色荧光蛋白来源于海洋生物水母,其基因可在异源组织中表达并产生光,GFP
Cdnad开放阅读框架长度约740bp,编码238个氨基酸残基,其肽链内部第65-67位丝氨酸-脱氢酪氨酸-甘氨酸通过自身环化和氧化形成一个发色基因,在长紫外波长或蓝光照射下发出绿色荧光。转染后的细胞可在荧光显微镜或流式细胞仪(FACS)中直接观察基因的表达。

