
Universal Gamma Probe Cover
- Sized with tapered tip to fit both straight and flexible probes
- Low density, soft Polyethylene
- Telescopically folded w/ rubber bands and medical grade tape strips
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核酸扩增是核酸分子诊断的关键技术。根据核酸扩增反应中温度变化要求,可以将核酸扩增技术分为两大类:一类是PCR核酸扩增技术,另一类是核酸恒温扩增技术。
PCR技术是指通过控制温度的变化来实现DNA扩增的三个步骤:模板变性(如95℃)-引物杂交(如58℃)-DNA合成(如72℃)。这种温度变化的循环重复(如重复35次)过程通常由精密而复杂的仪器(PCR仪)来控制。核酸恒温扩增技术(NucleicAcidIsothermalAmplification,NAIA)则是扩增反应的全过程均在同一温度下进行,不须象PCR反应那样需要经历几十个温度变化的循环过程。这一特点使得它们对扩增所需仪器的要求大大简化,反应时间大大缩短,因而具有巨大的应用价值,成为分子诊断行业发展中的热点。
目前的NAIA技术主要有滚环扩增技术(RollingCircleAmplification,RCA)、转录酶扩增技术(TranscriptionMediatedAmplification,TMA)、依赖核酸序列扩增技术(NucleicAcidSequenceBasedAmplification,NASBA)、链置换扩增技术(stranddisplacementamplification,SDA)、环介导的等温扩增技术(Loop-MediatedIsothermalAmplification,LAMP)、解链酶扩增技术(HelicaseDependentAmplification,HDA)。上述各种核酸扩增技术均由国外公司所拥有。
交叉引物扩增技术(CrossingPrimingAmplification,CPA)是完全由优思达公司独立研发成功的一种新的核酸恒温扩增技术,也是中国首个具有自主知识产权的核酸扩增技术。CPA与优思达公司其他技术相结合(如快速核酸提取技术、核酸试纸条检测技术等),形成一个完整的现场快速分子检测平台,可以开发出众多恒温扩增检测试剂盒,广泛应用于分子诊断、防疫检疫、生物医学研究、个体化治疗等领域。该技术已申请中国和美国发明专利,在美国《MolecularDiagnostics》等杂志发表论文二篇,并通过了比尔?盖茨基金会资助申请。
CPA扩增体系中除包含具有链置换功能的BstDNA聚合酶外,还主要包括扩增引物和两条交叉引物。这些寡聚核苷酸链能依靠BstDNA聚合酶的高活性的链置换特性,使DNA的循环扩增能不断的实现。CPA扩增主要包含以下几个步骤:
交叉正向引物CPF中的PFs与模板DNA中PFa互补,启动DNA合成,使得PRa被引入到所扩增的产物中;
外围引物DP1s与PFa前端DP1a序列互补,通过链置换型DNA聚合酶向前延伸,一边置换CPF合成的能与CPR和DP2a结合的单链产物(结构3),一边与模板DNA形成双链产物(结构2);
在结构3中,DP2a通过链置换型DNA聚合酶向前延伸,置换出由CPR所延伸的单链产物(结构5),同时合成与步骤2中由CPF延伸所产生单链DNA形成双链产物(结构4),而结构5相对起始的DNA模板,多了PRs和PFs两个片段序列;
单链结构5中的3’端的PFa和PRs可分别与CPF中的PFs和CPR中的PRa互补结合,可在链置换型DNA聚合酶的作用下延伸和置换出相应的单链产物。延伸产物相对结构5来说又增加了一个PFs区域(结构8);
因此,扩增引物CPF和CPR的不断杂交和延伸,不仅使得结构5的长度不断的加长,从而引入更多CPF和CPR3’端互补区域,同时也置换出了各种可与CPF和CPR3’端互补的单链产物;
通过CPF和CPR的不断杂交延伸和DNA聚合酶的链置换作用,使得DNA拷贝数不断的增加,从而达到基因扩增的效果。
使用本装置提取临床生物样品的核酸成本低廉,只需几分钟,可以应用于现场检测或实验资源较少的基层医院和经济不发达地区;同时也可以满足大医院特定情况下的需求,如急诊或床边的核酸快速诊断。该技术已申请发明专利,并取得盖茨基金会研发资助。
CPA基本原理如下:
图2CPA扩增的反应原理图
与目前广泛使用的荧光PCR技术相比较,CPA技术有以下几个优点:
反应速度快:反应时间约1小时,使试剂盒可用于检验检疫、突发性传染病的检测与监控现场检测或医院的床边诊断(Point-of-Testing,POCT);
检测成本低:目前荧光光定量PCR仪价格昂贵,无法在很多中小医院普及。CPA扩增只需要离心机和一台简单的恒温装置,如普通的水浴锅、金属浴,即可进行扩增。
操作简单:对操作人员的技能要求不高,绝大多数人通过简单培训或自学都可掌握,为核酸检测试剂的广泛应用创造了条件。
这里所说的一个碱基的差异该怎么检测?如何理解?
原理?(没有就算了...)
答的好的提高悬赏50分
有原理的追加50分
谢谢啊~~~~
(2)操作多份样品时,应先配制反应混合液并分装,减少操作,避免污染,同时增加反应的精确度。试剂的配置和分装应在装有紫外灯的超净工作台或负压工作台操作。
(3)移液器和吸头需专用。由于移液器极易受气溶胶或模板核酸的污染,移液器应尽可能使用可替换或可高压处理的,吸头尽可能使用带滤芯的吸头。
(4)防止操作人员污染,使用一次性手套,EP管与吸头应一次性使用,吸头不要长时间暴露于空气中,避免气溶胶的污染。
(5)加样或吸取模板核酸时要十分小心,吸样要缓慢,防止样品进入移液器内;吸样时尽量一次性完成,忌多次抽吸,以免交叉污染或产生气溶胶污染。
(6)EP管打开应先离心,将管壁及管盖上的液体甩至管底部。开管动作要轻,以防管内液体溅出。若不小心溅到手套或桌面上,应立刻更换手套并用稀酸擦拭桌面。
(7)模板核酸应密封保存,防止外溢及外来核酸的进入。
(8)设立适当的阴阳性对照及重复实验,既可验证LAMP反应的准确性,又可以协助判断扩增系统的可信性。
(9)扩增产物应妥善处理,尽量避免开盖检测,开盖极易产生气溶胶污染。本公司的试剂均采用闭管检测,有效防止污染发生。展开
1.目的
学会PCR操作的基本技术。
2.原理
是将待扩增的DNA模板加热变性,与其两侧互补的寡聚核苷酸引物复性,然后经过耐热的DNA聚合酶延伸。再进入下一轮变性—复性—延伸的循环,n次循环后DNA可被扩增(1+X)n倍。其中<25nt的引物退火温度Tm=2(A+T)+4(G+C)。
3.器材
旋涡混合器,微量移液取样器,移液器吸头,0.2mlPCR微量管,双面微量离心管架,PCR仪,台式离心机,琼脂糖凝胶电泳系统,水漂,恒温水浴。
4.试剂
5U/μlTaqDNA聚合酶,PCR缓冲液(10×,MgCl2free),25mMMgCl2,dNTP,引物,模板质粒pBS-CHI,无菌ddH2O。
5.实验准备
dNTP混合液(每种25mM),TAE电泳缓冲液,荧光染料,10´加样缓冲液,1.5ml离心管装入铝制饭盒(灭菌)、移液器吸头装入相应的吸头盒(灭菌)。合成的引物:Senseprimer5'-GGATCCACAATGATGAGAGCC-3'
Antisenseprimer5'-GATATCATGGTGAGGTAGCTAGCTT-3'
目的基因模板质粒:已经克隆在pBS载体上的1128bp几丁质酶(chitinase,CHI)基因。
待扩增的CHI片段长度:996bp。
6.操作步骤
(1)在0.2mlPCR微量离心管中配制50μl反应体系。(以下加样量供参考,括号内是最终需要量,实验时需参照Taq酶说明书计算)
ddH2O32μl
10×PCRbuffer(不含MgCl2)5μl
25mMMgCl23μl
2.5mmol/LdNTP4μl(每种dNTP终浓度0.2mM)
10μmol/LPrimer12μl(12.5~25pmoles)
10μmol/Lprimer22μl(12.5~25pmoles)
模板质粒1μl(1×10-3pmoles)
5U/μlTaq酶1μl(5U)
总体积50μl
(2)根据厂商的操作手册设置PCR仪的循环程序:
①94℃5min
②94℃1min
③54℃1min
④72℃1min50s
⑤goto②29times
⑥72℃10min
(3)PCR结束后,取10μl产物进行琼脂糖凝胶电泳。观察胶上是否有预计的主要产物带。
(4)清理桌面,撰写实验报告。
(5)PCR产物可以直接与T载体连接(见实验五),然后转化感受态细胞(见实验八)。
7.思考
(1)复性温度如何确定?
(2)为什么要在最后延伸10min?
(3)是否有非特异性扩增产物(或引物二聚体),如何才能消除?
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