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Kapa biosystems/KAPA Library Quantification Kits/KK4943/500 x 20 µL reactions_蚂蚁淘,【正品极速】生物医学科研用品轻松购|ebiomall 蚂蚁淘商城
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Kapa biosystems/KAPA Library Quantification Kits/KK4943/500 x 20 µL reactions
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Kapa biosystems/KAPA Library Quantification Kits/KK4943/500 x 20 µL reactions
品牌 / 
kapabiosystems
货号 / 
KK4943
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Description:

qPCRMasterMix(Bio-Rad)andPrimerPremixonly

KAPALibraryQuantificationKits

forNext-GenerationSequencing

Ourstandardsdon’tchange.Neithershouldyours.

KAPALibraryQuantificationKitscontainallthereagentsneededfortheaccurate,reliableandreproducIBLeqPCR-basedquantificationofNGSlibrariespriortopoolingforcaptureorflowcellamplification.KitscontainKAPASYBR®FASTqPCRMasterMix,optimizedforhigh-performanceSYBRGreenI-basedqPCR.TheengineeredKAPASYBRFASTDNAPolymerasecontainedintheMasterMixamplifiesGC-andAT-richDNAfragmentsofdifferentlengthswithsimilarefficiency,makingittheonlyqPCRMasterMixcapableofaccurateqPCR-basedquantificationofNGSlibraries.*Thepre-dilutedsetofDNAStandardscontainedineachkitiscarefullyquality-controlledtoensurelot-to-lotconsistencyandavoiddatadriftovertime.OptimizedPrimerPremixesensureoptimalPCRefficiency.

KitswithDNAStandardsandPrimerPremixesforIllumina® andIonTorrent™sequencers areavailable.Pleasereferencethe InstrumentCompatibilityChart forguidanceoncompatibleplatforms.

NEW!ImproveexperimentaldesignswithourTechnicalGuideforIlluminaPlatforms


*Dataonfile.

ForResearchUseOnly.Notforuseindiagnosticprocedures.

ProductHighlights

AccuratelyquantifyPCR-competentsequencingtemplates

  • qPCRonly“counts”thoselibrarymoleculesthatcanbesequenced
  • Moreconsistentclusterdensitiesortemplate-to-beadratiosenableoptimalutilizationofsequencingresources
Equimolar pooling of indexed libraries. Eleven indexed Illumina TruSeq libraries were quantified by qPCR using the KAPA Library Quantification Kit, and then combined to achieve equal final concentrations in two separate pools for multiplexed sequencing on different flow-cell lanes. The eleven libraries ranged ~11-fold in concentration from 0.67 pM to 7.65 pM, while representation of each index varied between 90% and 127% of expected assigned reads per lane. Data on file.

Improvepoolingformultiplexedsequencing

  • LibraryconcentrationsdeterminedbyqPCRaremorereliablecomparedtoothermethods*
  • TheengineeredKAPASYBRFASTqPCRMasterMixenablesaccuratepoolingoflibrarieswithextremeGC-contentsorlongerinserts*
Nine human DNA libraries and two microbial DNA libraries (Rhodococcus sp. ~70% GC and Staphylococcus sp. ~35% GC) were used to compare quantification results obtained with distinct lots (”Lot 1” and “Lot 2”), and distinct sets of reagents from the same lot (”Set 1” and “Set 2”) of KAPA Library Quantification Kits for Illumina platforms. Data on file.

Eliminatedriftwithcarefullyquality-controlledDNAStandards

  • PredilutedDNAStandardseliminatequantificationerrorsassociatedwithpreparationofstandardcurvesusingin-housestandards*
  • KAPADNAStandardsundergostrictqualitycontroltoensurelot-to-lotconsistencyandeliminatedatadriftovertime
KAPA Library Quantification methods (96- and 384-well) format are available for the Sciclone NGS and NGSx workstation (PerkinElmer) and other instruments used in high-throughput NGS sample preparation pipelines.

Improvethroughputwithautomation

  • Libraryquantificationassayiscompatiblewith96-and384-wellformat
  • Librarydilution,reactionsetupanddataanalysiscanbeautomatedforHTPpipelines
  • LearnMore aboutKAPAAutomatedSolutions

*Dataonfile.

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KAPA Stranded mRNA-Seq Kits

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Applications:

Applications
  • Quantificationoflibrariespriortopoolingformultiplexedsequencing
  • QuantificationofindividuallibrariesorlibrarypoolspriortoclusteramplificationoremPCR
  • Quantificationoflibrariespriortoandafterhybridizationcapture
  • Qualitycontrol,optimizationandtroubleshootingoflibraryconstructionprocessesorworkflows

KitSpecificationsandContents/Storage:

KitSpecificationsandContents/Storage

Kitscanbestoredforupto12months at-20˚C.

CompletekitsincludeKAPASYBRFASTqPCRMasterMix(2X),PrimerPremix(10X)andasetof6DNAStandards.ReagentsforqPCR(KAPASYBRFASTqPCRMasterMixandPrimerPremix)andDNAStandards(1–6)arealsosoldseparately.Wherenoted,MasterMixescontaininstrument-specificreferencedyes,whiletheUniversalkitincludesROXHighandROXLow(both50X)separately.

Components–Illumina®Platform

Components–IonTorrent™Platform

LQK-Ion_Component Chart

Specifications

Spec
Description
CompatiblePlatforms
IlluminaHiSeq,NextSeq,MiSeq,andGAIIxIonTorrentProtonandPGM454GSFLX+andGSJuniorSOLiD5500series
LibraryType
Any
StartingMaterial
AnyNGSlibraryreadyforclusteramplificationoremPCR
Standardcurveconcentrationrange
20–0.0002pMforIlluminalibraries83–0.00083pMforIonTorrentand454libraries10–0.0001pg/µLforSOLiDlibraries
SequencingApplications
WholeGenomeSequencingWholeExomeSequencingTargetedSequencing(custompanels)RNA-SeqChIP-SeqAmpliconSequencingMethyl-Seq
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The scanning translation initiation model suggests that 40S ribosomal subunit preloaded with factors bind to the 5’ end of the mRNA near the cap. The 48S subu 查看更多>
差异显示法[原理]:该实验方法是针对从特定细胞或组织类型的mRNA池来源的样品用PCR技术对其中许多的cDNA基因一起进行扩增和显示的实验方法。该实验方法倚赖两套不同类型的合成寡核苷酸引物:一套锚定反义引物与一套随机正义引物。锚定反义引物是与mRNA的poly(A)尾及3’-非翻译区的连接处相复性结合 查看更多>
2021-08-12
色谱法分类   色谱法有多种类型,也有多种分类方法。 (一)按两相所处的状态分类   液体作为流动相,称为“液相色谱”(liquid chromatograp-hy);用气体作为流动相,称为“气相色谱”(gas chromatogr-aphy)。固定相也有两种状态,以固体吸附剂作为固定相和以附载在固体上的液体作为固定 查看更多>
Culturing Wormsby Michael Koelle1. Bacterial strain for feeding worms: OP50, a uracil auxotroph. Streak OP50 out on a 9 cm NGM agar plate , grow overnight at 3 查看更多>
Growth hormone plays a major role in regulating growth during childhood and adolescence and also regulates metabolism. Defects in growth hormone signaling can 查看更多>
重量换算 7. 重量换算 (一) 公 制 英 制 美 制 中国市制 英 制 港 制 公 制 中国市制 英美制 公 吨 长 吨 短 吨 担 英 查看更多>
2018-12-26
When we first started using X. tropicalis, in vitro fertilization had an extremely poor efficiency. However, with the careful selection of a mature male and th 查看更多>
General comments: Antibodies, like most proteins, do not like to be freeze-thawed. Avoid repetitive freezing of your solution. The best way to store your antib 查看更多>
这里是一份GIBCO的低糖DMEM粉剂配制说明(普通高糖的DMEM培养基配法是一样的):TO PREPARE 1*LIQUID 1. Measrue out 5% less distilled water than desired total volume of medium using a mixing conta 查看更多>
厌氧菌在有氧的情况下不能生长。要培养厌氧菌,必须创造一个无氧的环境。通常用培养基中加入还原剂,或用物理、化学方法去除环境中的游离氧,以降低氧化还原电势。如疱肉培养基、硫 查看更多>
血清热灭活―您是否在浪费时间?血清的热灭活是很多培养者感兴趣的话题,价格不菲的血清中含有诸如生长因子,维生素,氨基酸等珍贵物质,而将它们置于50℃以上的温度长达30分钟是完全没有必要的。尽管如此,在大多数实验室之中血清的热灭活还是作为常规来执行,多数实验者并没有考虑热处理对 查看更多>
For amplification of cognate sequences from different organisms, or for "evolutionary PCR", one may increase the chances of getting product by designing 查看更多>
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商品咨询
我们建立了一个CDNA文库,有8000多条有效的EST序列,希望用条已知序列对这个文库进行blast比对,以找出所有的相似序列。请问有什么现成的工具可以实现这个功能呢?

多谢了!

文库数据可以用excel表格打开,具体格式如下:
>zsbca0_007230.z1.scf
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
>zsbca0_001638.z1.scf
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
>zsbca0_010217.z1.scf
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
………………
真核物基组DNA十庞,其复杂程度蛋白质mRNA100倍左右,且含量重复序列采用电泳离杂交都难直接离目基其含内含等用序列染色体DNA发材料直接克隆目基主要困难.
高等物般具105种左右同基,定间阶段单细胞或体,都尽15%左右基表达,产约15000种同mRNAcDNA文库通RNA反转录由mRNA发cDNA克隆,其复杂程度要比直接基组克隆简单.

我用PCR扩增sgRNA文库oligo片段,胶回收,浓度约16ng/ul。载体用BsmBI酶切,55度过夜,胶回收,浓度19ng/ul。然后用T4连接酶22度连接1小时,电转2ul连接产物至感受态细胞,37度摇1小时,然后涂15cmLB板过夜。正常应该长至少一万克隆,可是我的板只有一两千。怎么办?挑了几个克隆做一代测序测不出信号。

我用感受态附带的质粒做了质控,可以长七八千克隆,说明感受态和电转程序都没有问题。用过NEB的Gibson连接酶,长的克隆反而更少。

做了两个多月一直是这样,急求帮助啊!能帮忙找到问题的可以有额外红包奖励~~谢谢了!

正如科学家们想象的那样,通过基因调控的主要机制,可以使得基因沉默,也就是CaenorhaBDitiselegans提出的可行的RNA干扰技术,通过促进RNA降解来实现基因沉默。科学家们在不同生物系统中业已发现了控制干扰RNA的途径,以对基因进行调控。同时,科学家们也在努力实现通过利用干扰RAN技术来阻断疾病(比如HIV-1,肝炎病毒,流感病毒的感染)的发展。

TherapeuticPotentialofRNAInterference
MarioStevenson,Ph.D.
nengljmed351;17www.nejm.orgoctober21,2004

Justwhenscientiststhoughttheyhadfiguredoutthefundamentalmechanismsthroughwhichgeneexpressionisregulated,studiesofthenematodeCaenorhabditiselegansrevealedtheexistenceofapathway,nowknownasRNAinterference(RNAi),thatsilencesgeneexpressionbypromotingdegra-dationofRNA.ScientistshavediscoveredwaystocontrolRNAiinordertoregulategeneexpressioninavarietyofBIOLOGicsystems,andtheyareresearchingwaystohar-nessRNAitointerruptdiseaseprocessessuchasthosecausedbyhumanimmunodefi-ciencyvirustype1(HIV-1),hepatitisviruses,andinfluenzavirus.

中英双语微生物学术语对照.pdf(676.0k)
转录组即某个物种或特定细胞在某一功能状态下产生的所有RNA(包括mRNA,smallRNA及non-coding RNA等)的总和。转录组测序是指利用第二代高通量测序技术进行cDNA测序,全面快速地获取某一物种特定器官或组织在某一状态下的几乎所有转录本。相对于传统芯片而言,转录组测序无需预先设计探针,即可对任意物种的任意细胞类型的转录组进行检测,能够提供更精确的数字化信号,更高的检测通量以及更广泛的检测范围,是目前深入研究转录组复杂性的强大工具。

基因表达谱指通过构建处于某一特定状态下的细胞或组织的非偏性cDNA文库,大规模cDNA测序,收集cDNA序列片段、定性、定量分析其mRNA群体组成,从而描绘该特定细胞或组织在特定状态下的基因表达种类和丰度信息,这样编制成的数据表就称为基因表达谱。
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4、详细的联系记录
详细记录每一次与客户的互动,并可自行制定联系计划,查询时可按下一次计划联系时间或最近一次联系时间自选排序,保证与客户保持周期性的联系。
5、岗位层级显示
默认通过岗位层级展示相应数据,如部门主管可查看部门全部联系记录、组长可查看小组全部联系记录,层级管理,简单便捷。
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目的基因来自真核生物,受体细胞为原核细胞,需要用CDNA文库。

基因组文库是一个比较笼统的概念。这个文库可以指某种真核生物的基因组,也可以指某种原核生物的基因组。实质是将某种生物的全部遗传信息贮存在一个受体菌群体中,做为目的基因的来源。
反义RNA是指能和mRNA完全互补的一段小分子RNA或寡聚核苷酸片段,反义DNA是指能与基因DNA双链中的有义链互补结合的短小DNA分子。反义RNA和反义DNA主要是通过mRNA的翻译和基因DNA的转录而发挥作用[10]:1)抑制翻译。反义核酸一方面通过与靶mRNA结合形成空间位阻效应,阻止核糖体与mRNA结合,另一方面其与mRNA结合后激活内源性RNase或ribozyme,降解mRNA[3];2)抑制转录。反义DNA与基因DNA双螺旋的调控区特异结合形成DNA三聚体(triplex),或与DNA编码区结合,终止正在转录的mRNA链延长[3]。此外,反义核酸还可抑制转录后mRNA的加工修饰,如5'端加帽、3'端加尾(poly a)、中间剪接和内部碱基甲基化等,并阻止成熟mRNA由细胞核向细胞浆内运输。向左转|向右转
我正在用clontech公司的SMART技术构建CDNA文库,我RNA提取用的TRIZOL,取的癌组织,标本离体后放冰盒,一小时后按比例加TRIZOL用剪刀剪碎,放-20过夜,其他步骤完全按说明进行.提的RNA跑胶还可以,ss-cDNA也还可以,可LD-PCR时就出不来.想请高手帮帮小弟.现附上电泳图.


各位大侠帮帮忙
指点一些关于全长CDNA文库构建的知识

看了一些论文和文章还是挺迷惑的,希望有人指点一下各个步骤有什么要注意的,难点是什么

cDNA文库构建过程中,由总RNA反转录得cDNA和走mRNA路线得cDNA有什么影响吗?
哪个公司的试剂盒比较好?
(我做的是苔藓植物)
cDNA文库的用途 123
sjg百合2021-08-07
cDNA文库是以特定的组织或细胞mRNA为模板,逆转录形成的互补DNA(cDNA)与适当的载体(常用噬菌体或质粒载体)连接后转化受体菌形成重组DNA克隆群,这样包含着细胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合称为该组织或细胞的cDNA文库。cDNA文库特异地反映某种组织或细胞中,在特定发育阶段表达的蛋白质的编码基因,因此cDNA文库具有组织或细胞特异性。
cDNA文库显然比基因组DNA文库小得多,能够比较容易从中筛选克隆得到细胞特异表达的基因。但对真核细胞来说,从基因组DNA文库获得的基因与从cDNA文库获得的不同,基因组DNA文库所含的是带有内含子和外显子的基因组基因,而从cDNA文库中获得的是已经过剪接、去除了内含子的cDNA。
真核生物基因组DNA十分庞大,其复杂程度是蛋白质和mRNA的100倍左右,而且含有大量的重复序列. 采用电泳分离和杂交的方法,都难以直接分离到目的基因.这是从染色体DNA为出发材料直接克隆目的基因的一个主要困难。
高等生物一般具有10^5种左右不同的基因,但在一定时间阶段的单个细胞或个体中,都仅有15%左右的基因得以表达,产生约15000种不同的mRNA分子.可见,由mRNA出发的cDNA克隆,其复杂程度要比直接从基因组克隆简单得多。
cDNA文库在研究具体某类特定细胞中基因组的表达状态及表达基因的功能鉴定方便具有特殊的优势,从而使它在个体发育、细胞分化、细胞周期调控、细胞衰老和死亡调控等生命现象的研究中具有更为广泛的应用价值,是研究工作中最常使用到的基因文库。