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来自 : 蚂蚁淘
试剂、试剂盒
仪器、耗材
实验步骤
一、材料

1.缓冲液、溶液和试剂

ddH20

2.酶和酶缓冲液

10XVent缓冲液

VentDNA聚合酶

3.核酸和寡核苷酸

dNTP,各20mmol/L

引物,可以与合成的DNA文库克隆位点两侧的载体序列退火

质粒DNA(见下面第1步)

4.特殊设备

琼脂糖凝胶电泳所需的试剂和设备,包括溴化乙锭(见第5步)

热循环仪

二、方法

1.在细菌中扩增后,用随机多肽文库制备的质粒进行下面的反应。

10~50ng的质粒DNA

50pmol的各引物

5ul的10XVent缓冲液

dATP、dCTP、dTTP和dGTP,各0.5ul

1U的VentDNA聚合酶

用ddH20定容至50ul

下面的各种质粒载体,应该分别进行反应:

表达载体,没有文库DNA插入

DNA文库的混合物

少量DNA,由DNA文库的单个细菌克隆制备

2.在一个热循环仪中,94°C将混合物预热20s。

3.按下面的参数进行30轮PCR循环。

94°C10s

55°C10s(或用引物的合适退火温度)

72°C15s

将最后一个循环的延伸时间延长至30s。

4.冷却至4°C。

5.取25ul的各反应产物,跑4%的琼脂糖凝胶电泳,并用溴化乙锭染色分析(Sam-brookandRussell2001)

三、分析

在图26-4所示的例子中,用12个核苷酸的随机文库混合物作为模板,分析PCR产物显示,



文库的大部分都含有正确大小的插入(图26-4,第2泳道)。而且,检测不到与原始载体对应的PCR产物(比较图26-4第1泳道和第2泳道)。用PCR分析随机选择的文库中的单个克隆,证实绝大部分插入片段大小是正确的,而且文库中没有原始载体的污染(图26-4,第3~20泳道)。分析DNA的序列证实,这些PCR产物正是12个核苷酸随机文库的正确成员(数据没有列出)。因此,对反应中间产物(方案2图26-3)进行PCR分析后估计,已经获得了高质量的最终文库(图26-4)。
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