酶活性的测定实验_实验⽅法_
实验材料 | ATPGTP质粒DNA肌酸磷酸激酶10%SDS胶肌酸磷酸激酶核酸酶tRNAHeLaS3细胞TgSVA细胞Lx细胞来源于表达人脊髓灰质炎病毒受体的Ltk细胞NS20Y细胞人肝癌来源的HepG2细胞 试剂、试剂盒 | HEPES-KOHTris-HCl等渗溶液低渗溶液10X盐溶液裂解溶液磷酸肌酸尚铁血红素亚精胺EGTADNaseILiC1沉淀溶液TES10翻泽混合物[32S]Met电泳缓冲液L2X上样缓冲液凝胶固定液 仪器、耗材 | 高速离心机Dounce匀浆器SDS凝胶电泳装置 实验步骤 | ―、材料与设备 (一)细胞 1)HeLaS3细胞在含5%新生牛血清(NCS)和0.15%NaHCO3的RPMI1640培养基中于37℃转瓶培养,每天进行细胞传代以维持细胞密度为每毫升2〜5X105个细胞 2)TgSVA细胞来源于表达脊髓灰质炎病毒受体的转基因小鼠肾,用含5%胎牛血清和0.15%NaHCO3的DMEM培养基维持单层培养 3)Lx细胞来源于表达人脊髓灰质炎病毒受体的Ltk细胞,用含5%胎牛血清、104mol/L次黄嘌呤、4×10-3mol/L氨基嘌呤,8×10-4mol/L胸腺嘧啶脱氧核苷和0.15%NaHCO3的DMEM培养基维持单层培养 4)NS20Y细胞(鼠成神经细胞瘤)在含10%胎牛血清和0.15%NaHCO3的高糖DMKM培养基中维持培养 5)人肝癌来源的HepG2细胞用含10%胎牛血清和15%NaHCO3的DMEM培养基培养。 (二)制备S10抽提物 所用试剂和水均无RNase,耗材为一次性使用 1)lmol/LHEPES-KOH(PH7.5),高压灭菌,室温保存 2)lmol/LTris-HCl(pH7.5),高压灭菌,室温保存 3)等渗溶液:35mmol/LHEFESKOH(pH7.5),146mmol/LNaCl,11mmol/L葡萄糖。高压灭菌,4℃保存 4)低渗溶液:l0mmol/LHEPES-KOH(pH7.5),15mmol/LKC1,1.5mmol/LMgAC2,6mmol/L巯基乙醇,-20℃保存 5)10X盐溶液:200mmol/LHEPESKOH(pH7.5),1.2mol/LKC1,50mmol/LMgAc2,6mmol/L疏基乙醇。-20℃保存 6)裂解溶液:l0mmol/LHEPES-KOH(pH7.5),120mmol/LKC1,1.5mmol/LMgAc2,lmmol/L二硫苏糖醇- 7)0.2mol/L磷酸肌酸(CP):磷酸肌酸溶于无RNase的水中,按0.2〜0.3ml分装,一20°C保存 8)10mg/ml肌酸磷酸激酶(CPK):CPK溶于20mmol/LHEPES,pH7.5和50%甘油溶液中,按0.2rnl分装,一20℃保存 9)15OOOU/ml核酸酶:lml无RNase的水中溶解15000U(=0.667mg)核酸酶S1,—20℃保存 10)15mg/mltRNA:溶解ISmgtRNA在lml水中,酚抽提数次,乙醇沉淀。再用无RNase的水溶解沉淀,浓度为15mg/ml,—20℃保存 11)lmmol/L尚铁血红素:6.5mg高铁血红紊溶解在0.5ml1mol/LKOH,加0.5mLTris-HCl(pH7.5),用lmol/LHCl调至ph7.8,加8.5ml己二醇。18000g离心5min,收集上清,一20°C保存 12)l00mmol/L亚精胺:溶解在无RNase的水中,一20℃保存。 13)0.2mol/LEGTA:溶解在无RNase的水中,用5mol/LKOH调整至PH7.5,4℃保存 14)20mmol/LATP:溶解122mgATP在10ml无RNasc的水中,用lmol/LNaOH调整至pH7.0,按0.2〜0.5ml分装于—20℃保存 15)20mmol/LGTP:溶解96mgGTP在10ml无RNase的水中,用lmol/LNaOH调整至pH7.0,按0.2〜0.5ml分装,一20℃保存 16)高速离心机。 17)Dounce匀浆器。 (二)体外转录 1)质粒DNA:包含T7或T3启动子的质粒DNA和来源于脊髓灰质炎病毒或HCV的IRES。 2)DNaseI:无RNase的DNaseI(2U/ul)。 3)LiC1沉淀溶液:7.5mol/L,LiC1,50mmol/LEDTA。 4)TE:10mmol/LTris-HCl(pH7.6),lmmol/LEDTA (四)体外翻译 1)S10翻泽混合物;4ul0.5mol/LHEPESKOH(pH7.5),26UL15mol/LKAc,0.8ulMgAc2,50ul20mmol/LATP,2.7UL20mmol/LGTP,45ul0.2mol/LCP.2ul1mol/LDTT,2ul0.1mol/L亚精胺,11ullmmol/L氨基酸混合物(无甲硫氨酸)。加无RNase的水至I8Oul,30〜50ul分装,一80℃保存 2)[32S]Met:10mCi/ml的[32S]Met(120Ci/mmol)(翻译级),一80℃保存 3)肌酸磷酸激酶(CPK):0.5ug/ul的CPK,用10mg/mlCPK和无RNase的水新鲜配制 4)SDS凝胶电泳装置 5)10%SDS胶:9.8%丙烯酰胺,0.2%亚甲双丙烯酰胺,1%SDS,0.375mol/LTris-HCl(pH8.8) 6)电泳缓冲液:3gTris碱,14.4g甘氨酸,lgSDS,加水至1L 7)2X上样缓冲液:100mmol/:LTris-HCKpH6.8),200mmol/LDTT,4%SDS,0.2%溴酚蓝,20%甘油 8)凝胶固定液:50%甲醇,10%HAc溶在水中。 二、操作方法 (-)体外翻译抽提物的制备 1.未感染的HeLa细胞 除非特殊说明,所有的步骤均须在0〜4℃进行。 1)用低温离心机于300g离心7min,收集大于2L的悬浮培养液中的HeLa细胞 2)等渗溶液洗3次。此后步骤感染的与未感染的HeLa细胞一样。 3)在小体积等渗溶液中重悬细胞,并转移至一带刻度的锥形离心管中 4)于300g离心而后调整细胞密度至2X109/7〜8ml,重悬细胞于1.5倍细胞体积(10ml)的低渗溶液中,(TC静置10min) 5)冰冷的Dounce匀浆器匀浆50次,显微镜下检査匀浆物屮细胞是否完全裂解。 6)加5/18体积的10X盐溶液,18000g离心弃去沉淀沉淀包含细胞核、线粒体、膜结构样细胞组分),上清即为粗制的S10抽提物 7)加入ATP至终浓度为lmmol/L,加入GTP至终浓度为0.2nnnol/L,加入CP至终浓度为8mmol/L,加入CPK至终浓度(0.2mg/ml,于37℃C温育30min,以除去核糖体上结合的内源mRNA。 8)100倍体积的裂解溶液于4°C温育lh,或者将抽提物过G-25柱以代替裂解。 9)如果S10抽提物变得浑浊,于6600g离心5min,收集乳白色上清进行以下步骤。 10)将0.2mllmmol/L高铁血红素,50ul10mg/mlCPK,0,lml0.1mol/LCaCl2,0.lml15000U/ml核酸酶S7于15〜20℃温育5〜15min,以破坏内源mRNA 11)加入0.lml0.2mol/LEGTA,40uL15mg/mltRNA将停止核酸酶反应。如果必要,于6600g离心5min,0.2〜0.3ml分装冻存于-80℃ 2.脊髄灰质炎病毒感染的HeLa细胞 1)收集HeLa细胞(5L,2X109个细胞),悬浮在1/20体积(250ml)的无血清RPM11640中。 2)感染脊髓灰质炎病毒,感染复数MOI为20(4Xl010pfu)(pfu空斑形成单位) 3)室温吸收20min,然后37°C温育40min 4)加3倍体积(750ml)包含7.5%NCS的RPMI1640。在转瓶中37℃温育感染细胞4h。以下制备S10的方法同未感染病毒的Hela细胞。 3.感染和非感染的单层细胞 1)用来制备S10抽提物的单层细胞(TgSVA、Lx、NS20Y和HepG2)的生长状态应保持良好。经0.02mol/LEDTA和0.1%胰蛋白酶消化后,从60〜100个培养皿(直径150mm)中收集2X109个细胞,悬浮在含血清的DMEM培养液中在转瓶中继续培养5〜8h。 2)如果要感染脊髓灰质炎病毒,加入病毒感染复数MOI为20并在悬浮培养液中培养5h,吸收方法同HeLa细胞。 3)感染后在悬浮培养液屮继续培养4h,准备S10柚提物方法同HeLa细胞。 (二)体外RNA合成 1)合适的内切酶线性化基因,酚:氯仿纯化。DNA片段不必进行分离,通过标准的体外转朵方法制备转录子,或采用商品化试剂盒制备。 2)RNA被转录后消化模板DNA,加入1U/样品的无RNase的DNaseI于37℃温育15min 3)加入1/2体积的7.5mol/LLiCl,一20℃放置30min。 4)10000g离心10min,用80%乙醇洗RNA沉淀,风干沉淀并溶于0.5ml无RNase的TE(终浓度1ug/ul)。通常1ug模板DNA对转录5o〜100ugRNA,按10〜20ul分装并储存于-80℃ 5)通过琼脂糖凝胶电泳分析RNA产物大小,分光光度计分析产量。 (三)无细胞翻译 储存于一8O℃的S10抽提物只能冻融一次,而11对于每一个抽提物和每一个mRNA,其合适的K+,Mg2+离子浓度是不同的。 1)将所冇的组分加至管中,最终反应包含20ul(或l0ul)SlO翻泽混合物和RNA模板,加无RNase的水至终体积25ul(或12.5ul) 例如,脊髓灰质炎病毒mRNA在HeLaS10屮的反应混合物:13.5ulS10,4.5ul翻译混合物,1ul0.5ug/uLCPK,0.1ulRNasin,0.5uCi[32S]Met,模板RNA(0.5ug),加无RNasin水至25ul,每个试剂的终浓度为:1.0mmol/LATP,57umol/LGTP,9mmol/L酸肌酸(CP),0.02ug/ul肌酸磷酸激酶(CPK),2mmol/LDTT,0.2mmol/L亚精胺,20mmol/LHEPES,120mmol/L(HCVmRNA是150mmol/L)KAc,0,8mmol/L(HCVmRNA是1.5mmol/L)MgAc2,19种氨基酸每种60umol/L,0.5pCi[32S]Met和0.5ugRNA 2)于30〜32°C温育(通常为60min),加样品缓冲液至翻译混合物,煮沸2min,10%SDS-PAGE分析。 3)如果必要,在曝光时可采用放射性自显影增感屏(autorADIographyenhancer)。 注意事项 | 1)S10和S100分別是将细胞质于18000g离心和100000g离心20minn所获得的上清。 2)应采用无RNase的和高等级的试剂,玻璃器皿用2mpL/LNaOH洗3次或浸泡在0.05moL/LNaOH中过夜,然后用新鲜的去离子水完全漂洗。 3)高铁血红素用来阻止elF2α的磷酸化,应仔细调整pH且应无RNaSe。 4)自TgSVA细胞制备S10抽提物,需匀浆80次以上以裂解细胞。细胞匀浆物制备随细胞类型而异。 5)核酸酶处理会降低S10抽提物的活性。EGTA和Ca2+的浓度,温育时间(5〜l5min)和温度(15〜20°C)都是非常重要的,EGTA和CaCl2浓度的不合理常常是失败的主要原因,因为游离的钙将允许核酸酶保侍活性。 6)生长状态良好的细胞对于冇效制备S10抽提物至关重要,对于单层细胞可釆用胰酶消化,再转至转瓶中继续培养5〜8h 7)制备有活性的S10抽提物成功率为70%,从感染病毒的HeLa细胞中制备S10抽提物成功率比较高,从非感染的单层细胞制备冇翻译活性的抽提物成功率则只有30%〜50%. 8)在无细胞翻译体系中,K+,Mg2+离子浓度随抽提物和mRNA的种类而变。例如:在HeLaS10中,对于脊髓灰质炎病毒mRNA采用100mmol/LK+和0,8mmol/LMg2+,而对于HCV病毒mRNA则采用176mmol/LK+和1.6mmol/LMg2+,此时合适的脊髓灰质炎病毒mRNA的量为0.5ug |
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发布于 : 2018-08-05
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