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真菌RNA提取实验_实验⽅法_
来自 : 蚂蚁淘
实验方法原理
液氮研磨可裂解细胞,促使核蛋白体的解离,使RNA与蛋白质分离,并将RNA释放到溶液中。当加入氯仿时,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚可促使RNA进入水相,离心后可形成水相层和有机层,这样RNA与仍留在有机相中的蛋白质和DNA分离开。
 
实验材料
试剂、试剂盒
仪器、耗材
实验步骤
一、实验试剂准备
 
1. RNA提取缓冲液(CTAB):2%CTAB(W/V),2%聚乙烯吡咯烷酮PVP(W/V),100mMTris-HCl(pH8.0,DEPC处理的水配置),25mMEDTA,0.5g/L亚精胺Spermidine,2.0MNaCl,2%巯基乙醇(V/V,使用前加入)。由于在高温灭菌条件下,Tris-HCl要和DEPC发生反应,所以配RNA提取缓冲液时直接用DEPC处理的水配制即可。
 
2. SSTE:1MNaCl,0.5%SDS(W/V),10mMTris-HClpH8.0,1.0mMEDTA。
 
3. 10MLiCl直接用蒸馏水配10MLiCl,加1‰的DEPC过夜后,高温灭菌。

4. DEPC处理水用1‰的DEPC处理蒸馏水过夜,高温灭菌。
 
5. 3MNaAc,氯仿:异戊醇(24:1),酚(pH4.5):氯仿:异戊醇(25:24:1),无水乙醇,70%酒精。

 
二、实验步骤
 
1. 实验开始前将RNA提取液于65℃水浴锅中预热,离心管中加入ME(巯基乙醇),(10mL加80ul,50mL中加入300ul)。
 
2. 取约0.8g菌丝体(液体培养获得的菌丝用真空抽滤即可,固体培养就更好说了),在液氮中迅速磨成精细粉末,装入50mL离心管,按1g材料8mL的量加入预热的RNA提取液,颠倒混匀。
 
3. 65℃水浴3-10min,期间混匀2-3次。
 
4. 加入等体积的酚(注意是酸酚pH4.5):氯仿:异戊醇(25:24:1)抽提(10000rpm,4℃,5min)。
 
5. 取上清,等体积的氯仿:异戊醇(24:1)抽提(10000rpm,4℃,5min)。
 
6. 加入1/4V体积10MLiCl溶液,4℃放置6h以上(或过夜)。
 
7. 10000rpm,4℃离心20min。

8. 弃上清,用500ulSSTE溶解沉淀。
 
9. 酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)抽提两次,氯仿:异戊醇(24:1)抽提1次(10000rpm,4℃,5min)。
 
10. 加2V体积的无水乙醇,在-70℃冰箱沉淀30min以上。
 
11. 12000rpm,4℃离心20min。
 
12. 弃上清。沉淀用70%酒精漂洗一次,干燥。
 
13. 加200ul的DEPC处理水溶解。
 
14. 用非变性琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计扫描检测RNA的质量。
(在抽提过程中,若蛋白质含量或其它的杂质还较多,可以增加抽提次数。)
 
注意事项
1. 提取RNA请尽量在低温下操作,如果条件不容许,在室温下操作的时间要尽可能的短。
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