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PK120cDNA克隆实验
来自 : 蚂蚁淘
实验方法原理
实验材料
试剂、试剂盒
仪器、耗材
实验步骤

实验所需「试剂」具体见「其他」


1.杂交反应


抽提出的50bp的PCR产物用PCRII载体亚克隆,大量制备,用限制性消化酶EcoRI将50bp的插入片段切下,用[α-32P]dCTP标记已克隆的50bpDNA,并作为探针筛选人肝脏λgt11cDNA文库,获得11个阳性克隆,测定最长的阳性克隆λPK5序列,这个克隆(1.7kb)编码的PK-120的碳末端,为了获得编码PK-120其余部分的克隆,用[32PdCTP]标记的λPK5插入片段作为探针筛选人肝脏λgt10cDNA文库,在杂交液中60℃预杂交,65℃杂交过夜,然后在60℃用0.1%SDS的2×SSC溶液30min洗4次,洗净。将阳性克隆的插入片段进一步亚克隆,插入BluescriptIISK-vector载体,获得106个阳性克隆,测定阳性克隆λPK67(3.0kb)序列,λPK67编码PK-120的非5"端密码子区域及PK-120氮末端,并含有信号肽序列。


2.cDNA推测PK-120一级结构的特征


PK-120的核苷酸序列据此推导的氨基酸序列见图。PK-120的cDNA。编码区为开放阅读框,有2790bp,以密码ATG为起始,以密码TAG为结尾,从而推测出PK-120蛋白质氨基酸序列。它含有28个氨基酸组成的信号肽,成熟蛋白有902个氨基酸组成,20%序列为蛋白质测序所证明。有四个N-糖基化部位,有三个半胱氨酸残疾,这和PK-120的氨基酸组成测定结果一致。Cys719和Cys892在35kDa片段内形成二硫键,Cys186以游离状态存在。PK的酶切位点附近的序列是-Phe-Arg-Xaa-Arg455,Arg633和Arg660是PK的切断部分。


据同源性分析表明:PK-120氨基酸序列和人胰蛋白酶抑制剂(inter-α-trypsininhibitor,ITI)超家族的重链HCs有关,和HC1,HC2分别具有34%,31%的同源性,和人前α胰蛋白酶抑制剂HC3有38%的同源性。已有的研究表明,PK-120和ITI一样,是一种主要急性相蛋白,这为研究炎症产生的复杂过程打开了新的大门。

注意事项
其他

试剂:

Ready-To-GoDNA标记试剂盒

人肝脏λgt11cDNA文库

人肝脏λgt10cDNA文库

杂交溶液:7%(w/v)聚乙二醇6000,10%SDS,100ug/ml酵母tRNA

SSC溶液:15mmol/L枸橼酸钠,15mmol/LNaCl,pH7.0

pBluescriptIISK载体

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